Wenig später bekommt die ''Enterprise'' den Auftrag eine Ladung [[Quadrotriticale]] auf der [[Raumstation]] [[K-7]] vor Sabotageakten der Klingonen schütze. Diese seltene [[Getreide]]sorte wird dringend für den [[Sherman-Planet]]en benötigt. Zu der Zeit verkauft der Händler [[Cyrano Jones]] einige [[Tribble]]s auf der Station. Doch binnen kürzester Zeit beginnen sich die Tribbles rasant zu vermehren und McCoy untersucht dies. McCoy kann sich vorerst nicht erklären wie sich die Tribbles so schnell vermehren. Währenddessen werden einige Tribbles tot im Getreide aufgefunden und McCoy findet heraus, dass das Getreide von irgend jemanden vergiftet worden ist. Als sich die Tribbles seltsam gegenüber den Föderationsoffiziellen [[Arne Darvin]] verhalten, lässt Kirk Darvin von McCoy untersuchen. Dabei stellt McCoy fest, dass Darvin in Wirklichkeit ein klingonischer Agent ist, der den Auftrag hat die Mission mit dem vergifteten Getreide zu sabotieren. Nachdem Darvin entarnt worden ist, kann nun das übrige Getreide zum Sherman-Planeten gebracht werden. ({{TOS|Kennen Sie Tribbles?}})

Auf den Planeten [[892-IV]] gehört McCoy zu dem Außenteam , welches nach Überlebenden der [[SS Beagle|SS ''Beagle'']] sucht. Auf dem Planet besteht eine Gesellschaft ähnlich dem [[Römisches Reich|Römischen Reich]] auf der Erde. Allerdings werden Kirk, Spock und McCoy von der dort lebenden Bevölkerung gefangen genommen. Captain [[R.M. Merik]] von der SS ''Beagle'' hat auf diesen Planeten eine hohe Position inne. Merik versucht Kirk zu überzeugen, seine Mannschaft auf dem Planeten zu beamen, damit diese in die Gesellschaft integriert wird. Als Kirk sich weigert, werden Spock und McCoy gezwungen in [[Gladiator]]enspielen zu kämpfen. Allerdings ist McCoy bei diesem Kampf unterlegen. Kurz bevor McCoy im Kampf getötet wird, kommt Spock hin zu und rettet ihn. Da Spocks Verhalten gegen die Regeln verstößt, wird der Kampf verschoben und Spock un McCoy müssen ins Gefängnis. Zur selben Zeit gelingt es Scott die Stromversorgung auf dem Planeten zu unterbrechen. Durch diese Ablenkung können Kirk, Spock und McCoy entkommen. Merik, der Kirk nun hilft, sendet das Notsignal an die ''Enterprise''. Merik wird zwar für diesen Verrat von [[Prokonsul]] [[Claudius Marcus (Prokonsul)|Claudius Marcus]] getötet, jedoch können durch diese Tat Kirk, Spock und McCoy zurück auf die ''Enterprise'' gebeamt werden. ({{TOS|Brot und Spiele}})

Kurz darauf transportiert die ''Enterprise'' 115 [[Botschafter|Delegierte]] zum [[Planetoid]]en [[Babel (Planet)|Babel]]. Unter den Botschaftern befindet sich auch Spocks Vater [[Sarek]] mit seiner Ehefrau [[Amanda Grayson]]. McCoy erkundigt sich bei Amanda Grayson über Spocks Kindheit. Amanda Grayson berichtet das Spock als Kind ein [[Sehlat]] gehabt hat und vergleicht dieses [[Haustier]] mit einem [[Teddybär]]en. McCoy amüsiert es, dass Spock einen Teddybären gehabt hat. Später wird Sarek verdächtigt den [[Tellarit|tellarischen]] Botschafter [[Gav]] getötet zu haben. Doch während des Mordes leidet Sarek an einem Herzinfarkt und er kann für diesen Mord nicht verantwortlich gewesen sein. Es stellt sich heraus, dass ein [[Spion]] von [[Orion (Planet)|Orion]], welcher als [[Andorianer]] verkleidet ist für den Mord verantwortlich gewesen ist. McCoy muss eine komplizierte Operation an Sarek durchführen und da Sarek dabei an hohem Blutverlust leiden wird, muss während der Spock sein [[Blut]] spenden, um seinen Vater zu retten. Zur selben Zeit wird die Enterprise von einem unbekannten Schiff verfolgt und angegriffen. Kirk wird dabei von dem Spion angegriffen und schwer verletzt und ist nun nicht mehr in der Lage das Kommando über die ''Enterprise'' zu führen. Da die ''Enterprise'' einen Kommandanten benötigt will Spock die Operation abbrechen, obwohl er weiß das sein Vater dann sterben wird. Kirk nimmt gezwungener Maßen das Kommando wieder auf, damit McCoy seine Operation durchführen kann. Während des Kampfes gegen das Schiff der Orioner kommt es zu schweren Erschütterungen, welche McCoy bei seiner Operation stören. Kirk gelingt es jedoch die [[Orioner]] zu besiegen und der Spion begeht darauf [[Selbstmord]]. Die Operation von Sarek verläuft erfolgreich und Kirk begibt sich darauf in die Krankenstation um sich wieder von McCoy behandeln zu lassen. ({{TOS|Reise nach Babel}})

Einige Zeit später gehört McCoy zu dem Außenteam, welches sich auf den Planeten [[Neural]] beamt. Das Außenteam wird von Dorfbewohnern mit primitiven Steingeschosswaffen angegriffen, obwohl sie von ihren technologischen Stand diesen Waffen nicht besitzen können. Dabei wird Spock schwer verletzt und das Außenteam beamt zurück auf die ''Enterprise''. McCoy behandelt an Bord Spock, allerdings will Kirk auf die Oberfläche zurückkehren, um heraus zu finden voher die Dorfbewohner diese Waffen haben. McCoy begleitet Kirk auf die Oberfläche. Wenig später wird Kirk von einem [[Mugato]] angegriffen und schwer verletzt. McCoy bringt den verletzten Kirk zu [[Tyree]], welcher ein alter Freund von Kirk ist, und seinem Stamm. Tyrees Frau [[Nona]] behandelt Kirk und befreiht ihm von den Gift des Mugatos. Als Nebeneffekt dieser Heilung wird Kirk gegenüber Nona unterwürfig und verliebt sich in sie. Wenig später finden Kirk und McCoy heraus, dass die Klingonen den Dorfbewohnern die Waffen liefern. Um ein Gleichgewicht der Kräfte zu wahren bringt Kirk Tyrees Stamm das schießen mit Steingeschosswaffen. McCoy hegt schwere Vorwürfe gegen Kirk, da Kirk so einen Krieg zwischen den Stämmen auslösen wird. McCoy mit Tyrees Frau für Kirks seltsames Verhalten verantwortlich. Später gelingt es Nona Kirk seinen Phaser zu stehlen, sie will diese den Dorfbewohnern übergeben. Doch die Dorfbewohner greifen Nona an und da sie nicht mit dem Phaser umgehen kann, wird sie getötet. Darauf verlangt Tyree, um Rache an den Dorfbewohnern auszuüben weitere Waffen von Kirk und dieser liefert sie, obwohl er weiß das der Frieden auf dem Planeten nun zu Ende ist. ({{TOS|Der erste Krieg}})

Auf einen unbekannten Planeten erhält die ''Enterprise'' einen Notruf von den [[Kelvaner]]n. Doch dieser Notruf entpuppt sich als Falle und die Kelvaner nehmen das Außenteam gefangen. Wenig später gelingt es den Kelvanern die ''Enterprise'' zu übernehmen. Später tut Spock so, als währe er Krank und so dürfen McCoy und Spock zurück auf die ''Enterprise''. An Bord behandelt McCoy den scheinbar kranken Spock. Die Kelvaner fliegen wenig später mit der ''Enterprise'' zur [[Galaktische Barriere|Galaktischen Barriere]] und Spock und Scott wollen die ''Enterprise'' sabotieren, doch dies schlägt fehl. Nachdem die Enterprise die Barriere durchflogen verwandeln die Kelvaner fast die gesamte Crew in Kristallblöcke. McCoy muss mit ansehen wie sein gesamter Medizinischer Stab in Kristallblöcke verwandelt wird. Die einzigen die ihre normale Gestalt behalten sind Kirk, Spock, McCoy und Scott. Die ''Enterprise'' fliegt nun zur [[Andromeda-Galaxie]]. Spock erkennt das die Kelvaner [[Emotion]]en nicht verstehen und darauf versuchen die Vier Offiziere die Kelvaner zu verwirren. McCoy spritzt einen der Kelvaner ständig [[Formazin]] und dieser wird mit der Zeit immer nervöser. Auch bei den anderen Kelvanern zeigt diese List Wirkung. Die Kelvaner erkennen das sie in ihren menschlichen Körpern nicht mit Emotionen klar kommen und sie geben die ''Enterprise'' wieder frei und kehren auf den Planeten zurück, um sich dort eine neue Heimat zu errichten. ({{TOS|Stein und Staub}})

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