Die Klingonen traten zum ersten Mal in [[TOS]]: "[[Kampf um Organia]]" auf und kehrten in der [[Star Trek: The Original Series|Originalserie]] noch sechsmal wieder, deutlich häufiger als die [[Romulaner]]. Zu jener Zeit waren die Klingonen praktisch gesehen [[Mensch]]en mit einem dunklen Make-up und Bärten. In "[[Star Trek: Der Film]]" wurde zum ersten Mal ein verbessertes Make-up verwendet, was durch das Filmbudget möglich war. Der Unterschied zwischen den beiden Klingonentypen und seine Ursache wurde lange Zeit im Dunkeln gelassen und erst von [[Worf]] wurde dazu in [[DS9]]: "[[Immer die Last mit den Tribbles]]" lediglich ein ironischer Spruch in den Mund gelegt (''"Wir sprechen nicht mit Außenstehenden darüber."''). Noch komplizierter wurde es durch das Auftreten von [[Kor]], [[Koloth]] und [[Kang]], die alle in der Originalserie mit dem Original-Make-Up aufgetreten waren und nun mit den neumodischen Stirnwölbungen in DS9 auftraten. Mit der [[ENT]]-Episode "[[Die Abweichung]]" wurde schließlich eine [[canon|kanonische]] Erklärung geliefert.

Im [[1989]] erschienenen Buch "[[Die Welten der Föderation]]" wird die Theorie aufgestellt, dass die Veränderungen der Klingonen auf Genmanipulationen zurückzuführen seien, bei denen es darum ging, klingonisch-menschliche Hybriden zu erzeugen, die fortan an der Grenze stationiert wurden. Die Aufklärung dieses Phänomens fand schließlich erst in [[ENT]]: "[[Die Heimsuchung]]" statt, in der klar wird, dass die Klingonen versuchten die [[DNS]] von [[Augment]]s zu kopieren und in das eigene Genom zu integrieren.