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Einige Zeit darauf kommen einige cardassianische Wissenschaftlerinnen an Bord der Station, um eine [[Relaisstation]] zu installieren, welche eine direkte Kommunikation in den Gamma-Quadranten ermöglicht. Vedek [[Yarka]] warnt Sisko davor mit den Cardassianern zusammen zu arbeiten, da in der [[Trakors drittes Buch|dritten Prophezeiung von Trakor]] es Hinweise gibt, dass durch diese Zusammenarbeit der Himmlische Tempel, also das Wurmloch zerstört wird. Sisko nimmt diese Warnung nicht ernst, da dies nur Zufall ist und Kira schließt sich der Meinung von Sisko. Yarka bemerkt, dass Kira Sisko als Abgesandten ebenfalls verehrt, allerdings zeigt sie dies ihm nicht, um das gute berufliche Verhältnis zwischen den beiden zu stören. Als aber weitere Ereignisse aus der Prophezeiung geschehen, beginnt Kira langsam zu zweifeln und glaubt das Yarka Recht hat. Als Sisko dies bemerkt, stellt er Kira zur Rede und Kira erklärt, dass immer mehr Hinweise mit der Prophezeiung übereinstimmen und Sisko als Abgesandter handeln muss. Beim Test des Relais kommt es zu einem Unfall und dadurch wird ein [[Komet]] umgelenkt, welcher nun auf das Wurmloch zu fliegt und wie in der Prophezeiung droht das Wurmloch zu vernichten. Mit den Phasern der ''Defiant'' versucht Sisko den Kometen zu vernichten, aber die Sabotage von [[Dejar]] verhindert dies und der Komet zerspringt in drei große Stücke. Mit einem Shuttle will Sisko nun zwischen den Fragmenten fliegen und mit einem [[Subraumfeld]] verhindern, dass das [[Silizium]] des Kometen das Wurmloch zerstörrt. Kira begleitet Sisko und beide bringen die Fragmente durch das Wurmloch. Da etwas Silizium in das Wurmloch eingedrungen ist, ist dieses nun minimal geöffnet und kann dadurch das Relais im Gamma-Quadranten perfekt empfangen. Kira erkennt, dass sich die Prophezeiung komplett erfüllt hat, aber von Yarka falsch interpretiert wurde. ({{DS9|Trekors Prophezeiung}})
Als später Bashir für den [[Carrington-Preis]] nominiert wird, gartuliert Kira diesen und wünscht ihn viel Glück. Am Ende gewinnt Bashir diesen Preis nicht. ({{DS9|Das Motiv der Propheten}})
=== 2372 ===
Wenig später stehen die Führungsoffiziere der Station unter dem Einfluss der Matrix der Saltah'na. Kira glaubt in dieser Zeit an eine Verschwörung der Sternenflotte gegen die Bajoraner und bekämpft Sisko und seine Kollegen. Obwohl Dax zur Sternenflotte ghört, schließt sie sich Kira an und unterstützt sie beim Kampf gegen Sisko. Erst durch die Hilfe von Odo werden die Offiziere von der Matrix befreit. ({{DS9|Meuterei}})
Anfang 2370 versuchen Kira und Dax Beweise an die bajoranische Regierung zu bringen, dass der <q>Der Kreis</q> Waffen von den Cardassianern erhalten. Bei dieser Mission müssen beide mit einem alten Schiff fliegen. Während Dax mit sowas ihre Probleme hat, kommt Kira damit gut zurecht und amüsiert sich dabei ein wenig über Dax. ({{DS9|Profit oder Partner!}}) Obwohl Kira mit Dax befreundet ist, versteht sie nicht wie Dax so gut mit den Ferengi zurecht kommt, da Kira die Ferengi nur als wiederliche Kreaturen betrachtet. ({{DS9|Die Belagerung}}) Einige Zeit darauf will Dax ihren Blutschwur mit Kor, Koloth und Kang erfüllen, um den Albino zu ermorden, welcher für den Tod von Dax ihren Patenkind verantwortlich ist. Kira warnt Dax davor, dass man sich verändert, wenn man jemanden ermordet. Trotz der Warnung von Kira nimmt Dax am Kampf gegen den Albino teil. ({{DS9|Der Blutschwur}}) Neben Dax seltsamen Freundschaften zu den Ferengi wundert sich Kira auch zu den seltsamen Verabredungen von Dax. Kira wundert sich, dass Dax mit den [[Gallamit]] [[Boday]] verabredet. Kira versteht nicht wie Dax sich mit jemanden der einen transparenten Schädel hat verabreden kann. ({{DS9|Der Maquis, Teil I}})
==== Benjamin Sisko ====
[[Datei:Benjamin_Sisko_2374.jpg|thumb|Benjamin Sisko im Jahr 2374.]]
[[Benjamin Sisko]] wird 2369 der neue Kommandant von Deep Space 9. Als Kira das erste mal Sisko trift reagiert sie sehr feindseelig gegenüber ihren neuen Kommandierenden Offizier, da sie der Meinung ist, dass die Sternenflotte nicht nach Bajor gehört. Allerdings entdeckt Sisko wenig später das bajoranische Wurmloch und wird zukünftigt von den Bajoranern als Abgesandten der Propheten verehrt. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil I}|Der Abgesandte, Teil II}})
Obwohl Sisko von den Bajoranern als religiöse Figur verehrt wird, haben Kira und er noch einige Differenzen. Als Sisko den Terroristen und Kiras Freund Tahna Los vorerst kein Asyl gewähren will, wendet sie sich heimlich an Admiral Rollman und erlangt so Asyl für Tahna. Sisko ist verärgert, dass er von Kira übergangen wurde und droht ihr wenn sowas noch einmal passiert, dass er sie versetzen lassen wird. ({{DS9|Die Kohn-Ma}})