[[Doktor]] [[Julian Subatoi Bashir]], ist [[Chefarzt]] auf [[Deep Space 9]] und dem auf DS9 Deep Space 9 stationierten [[Raumschiff|Schiff]] [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'']] und dessen Nachfolger.

Jules Bashir wird gegen Ende des Jahres [[2341]] als Sohn von [[Amsha Bashir|Amsha]] und [[Richard Bashir]] geboren. Aber der Junge Allerdings ist Jules Bashir unterentwickelt. Im und im Alter von sechs Jahren kann der junge Bashir noch nicht einmal einen [[Hund]] von einer [[Katze]] unterscheiden, während Gleichaltrige schon lesen oder am [[Computer]] arbeiten können. Seinen Eltern fällt es schwer ihr unterentwickeltes Kind zu sehen und schließlich fassen die beiden den Entschluss ihr Kind genetisch aufwerten zu lassen. ({{DS9|Dr. Bashirs Geheimnis}})

Im Jahr [[2348]] kurz vor Jules siebten Geburtstag bringen ihn seine Eltern mit nach [[Adigeon Prime]], einem [[Planet]]en, auf dem die [[Genmanipulation]] nicht verboten ist. Dort wird seine genetische Struktur derart verändert, dass sein [[IQ]] über zwei Wochen lang täglich um fünf Punkte ansteigt. Auch seine körperlichen Fähigkeiten, z.B. die [[Hand-Augen-Koordination]], werden dabei verbessert. Kurz darauf beginnt für Jules Bashir ein neues Leben. Er zieht in eine neue [[Stadt ]] und besucht eine neue [[Schule]]. ({{DS9|Dr. Bashirs Geheimnis}})

Aufgrund seines Krankenhaus Aufenthalts auf Adigeon Prime hat der junge Bashir immer Angst vor Ärzten, aber später wächst sein Respekt für den [[Beruf ]] des Arzt und er will selbst Arzt werden. ({{DS9|Das Equilibrium}})

[[2351]] ist Jules Vater [[Diplomat]] der [[Föderation ]] auf [[Invernia II]]. Jules begleitet seinen Vater im Alter von zehn Jahren auf diesen Planeten. Als die beiden sich in einem entlegenen Gebiet des Planeten befinden, werden sie von einem starken [[Sturm ]] überrascht. Während die beiden warten, dass sich der Sturm verzieht, finden sie ein krankes [[Invernianer|invernianisches]] Mädchen. Nachdem sich der Sturm legt, versucht Richard Bashir Hilfe zu holen, aber diese kommt für das Mädchen zu spät und sie stirbt. Als sein Vater mit Hilfe zurückkommt, sagt einer der Führer, dass sie mit einfachen [[Kraut|Kräutern ]] hätte behandelt werden können und so überlebt hätte. Aufgrund dieser Ereignisse entscheidet sich der junge Jules Bashir später Arzt zu werden. ({{DS9|Das Melora-Problem}})

Aber auch auf der [[Medizinische Fakultät der Sternenflotte|Medizinischen Fakultät der Sternenflotte]] ist der junge Bashir sportlich sehr aktiv. Bashir spielt dort aktiv [[Racquetball]]. Bashir wird Teamcaptain der Racquetballmannschaft der Akademie. Dabei wird er sogar Sektorenmeister. Das entscheidende Spiel gewinnt er gegen einen [[Vulkanier]]. ({{DS9|Rivalen}})

Während seiner Zeit auf der Akademie verliebt sich Bashir in [[Palis Delon]]. Ihr Vater leitet eine medizinische Abteilung in [[Paris]] und bietet Bashir den Posten als Chef der Chirurgie an. Bashir überlegt lange diesen Posten anzunehmen und die Sternenflotte zu verlassen. Schließlich entscheidet sich Bashir dafür die Sternenflotte Sternenflottenakademie abzuschließen und lehnt das Angebot ab. Kurz darauf trennen sich Bashir und Delon. ({{DS9|Das Harvester-Desaster}})

Bei seiner Abschlussprüfung hat Bashir einige Probleme. Er braucht sehr lange um seine Aufgaben zu lösen und gehört mit zu den letzten, die welche die Prüfung abschließen. Aber trotz dieser kleinen Probleme besteht Bashir die Abschlussprüfung erfolgreich. Bashir wird beinahe Klassenbester, aber er verwechselt während der Abschlussprüfung eine [[präganglionische Faser]] mit einem [[postganglionischer Nerv|postganglionischen Nerv]]. Doch er gibt später zu, die Frage absichtlich falsch beantwortet zu haben, um die Klasse nicht als Klassenbester abzuschließen. ({{DS9|Q – Unerwünscht|Ferne Stimmen|Die Erforscher}})

Als Zweitbester seiner Klasse hält Bashir die [[Rede|Eröffnungsrede]], während [[Elizabeth Lense]] als Klassenbeste der [[Medizinische Fakultät der Sternenflotte|medizinischen Fakultät]] die [[Rede|Abschlussrede]] hält. Elizabeth Lense nimmt als Klassenbeste den Posten als Mediziner auf der [[USS Lexington (NCC-61832)|USS ''Lexington'']] an. Bashir kann sich dafür jeden weiteren freien Posten selbst auszusuchen. Er entscheidet sich für Deep Space 9, weil er die Herausforderung liebt. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil I|Die Erforscher}})

Wenig später untersuchen [[Commander]] [[Benjamin Sisko]] und Dax eine [[Anomalie]] im [[Denorios-Gürtel]]. Die beiden entdecken bei dieser Forschung das erste stabile [[Wurmloch]]. Während des Durchfluges nehmen fremde Wesen Kontakt mit Sisko auf. Dax wird zwar darauf von den Fremden dort auf die Station zurück transportiert, allerdings bleibt Sisko im Wurmloch verschwunden. Kira, Dax, [[Odo]] und Bashir begeben sich mit der [[USS Yangtzee Kiang|USS ''Yangtzee Kiang'']] auf der Suche nach Sisko in den Denorios-Gürtel. Plötzlich taucht [[Gul]] [[Dukat]] mit seinem Schiff auf und er zeigt großes Interesse an der Anomalie, welche sich als ein [[dem Wurmloch]] entpuppt. Kira warnt Dukat davor, mit seinem Schiff in das Wurmloch zu fliegen, doch Dukat ignoriert die Warnungund fliegt hinein. Plötzlich verschwindet die Anomalie das Wurmloch mitsamt dem [[Galor-Klasse|cardassianischen Schiff]]. Wenig später tauchen weitere Schiffe der [[Cardassianer]] auf und bedrohen die Station, da die Cardassianer die Sternenflotte für das Verschwinden ihres Schiffes verantwortlich machen. Die Cardassianer greifen die Station an und Bashir kümmert sich um die Verletzten. Bashir bekommt dabei Hilfe von Odo bei der Behandlung der Patienten. In der Zwischenzeit gelingt es Sisko mit den [[Wurmlochwesen]] in Kontakt zu treten. Diese geben darauf die Passage durch das [[Bajoranisches Wurmloch|bajoranische Wurmloch]] frei. Als Sisko mit dem cardassianischen Schiff zurückkehrt, brechen die Cardassianer den Angriff auf die Station ab. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil II}})

Bashir lebt sich schnell ein auf der Station. Als Bashir einmal im [[Replimat]] sitzt, stellt sich ihm unerwartet der cardassianische [[Schneider]] [[Elim Garak]] ihm vor. Garak sieht in Bashir einen interessanten Freund, doch Bashir vermutet, dass Garak ihn [[Spion|ausspionieren]] will und Bashir meldet dies Sisko. Doch Sisko sieht keine Gefahr in Garak, dennoch rät Sisko Bashir bei Garak vorsichtig zu sein. Plötzlich taucht ein bajoranisches Schiff auf, welches von den Cardassianern verfolgt wird. Der Bajoraner [[Tahna Los]] wird auf die Station gebeamt, bevor die Cardassianer sein Schiff vernichten und Bashir kümmert sich um die medizinische Versorgung von Tahna. Die Cardassianer fordern darauf die Auslieferung von Tahna, doch Sisko weigert sich ihn auszuliefern. Von den Cardassianern und Kira erfährt Sisko, dass Tahna zur [[Kohn-Ma]], einer bajoranischen Terroristengruppe gehört. Wenig später tauchen die beiden [[Klingone]]n [[Lursa]] und [[B'Etor]] aus dem [[Haus des Duras]] an Bord der Station auf und sie treten in Kontakt mit Tahna und auch mit Garak. Doch Garak traut den beiden Klingonen nicht und er bittet Bashir ihn abends in seinem Geschäft zu besuchen. Bei dem Besuch in Garaks Laden erfährt Bashir von den illegale Geschäfte illegalen Geschäften zwischen den [[Duras-Schwestern]] und Tahna. Es stellt sich schließlich heraus, dass Tahna das Wurmloch vernichten will, damit sich die Föderation von [[Bajor ]] zurück zieht. Doch Kira und Sisko gelingt Tahna aufzuhalten und er wird schließlich verhaftet. ({{DS9|Die Khon-Ma}})

Wenig später wird der Bajoraner [[Ibudan]] tot in der [[Holosuite]] aufgefunden. Bashir leitet die medizinische Untersuchung in dem Fall und Odo beginnt mit den Ermittlungen. Mit der Zeit führen die [[Indiz]]ien auf Odo und dieser wird [[Verdacht|verdächtigt]] Ibudan [[Mord|ermordet]] zu haben. Bashir sammelt inzwischen [[Gen|Gen-Proben]] vom Tatort und untersucht diese. Bashir und Dax forschen gemeinsam und mit der Zeit entwickelt sich eine [[Zelle (Biologie)|Zellkultur]] die zu wachsen beginnt. Schließlich erkennt Bashir, dass sich aus dieser Zellkultur ein [[Klon]] von Ibudan entwickelt. Es stellt sich dadurch heraus, dass Ibudan in Wirklichkeit gar nicht ermordet worden ist, sondern das sein Klon getötet wurde. Später kann Odo den echten Ibudan für den Mord an seinem Klon verhaften. Ibudan wollte diesen Mord Odo in die Schuhe schieben, um sich an Odo zu rächen, da Odo ihn vor Jahren verhaften lassen hat. Zu dieser Zeit ist Bashir ziemlich [[Eifersucht|eifersüchtig]] auf Sisko in Bezug auf Dax. Bashir denkt, Sisko und Dax könnten eine Beziehung beginnen, aber nach einem Gespräch mit diesem erfährt Bashir, dass Sisko kein Interesse an ihr Dax hat und die beide nur Freunde sind. ({{DS9|Unter Verdacht}})

Nach einer [[Expedition ]] in den Gamma-Quadranten, wird eine junge Frau namens [[Vash]] mit nach Deep Space 9 gebracht. Die [[Offizier]]e an Bord der Station können sich nicht erklären, wie sie ohne das Wissen über das Wurmloch in den Gamma-Quadrant gekommen ist. Bashir untersucht sie diese nach Krankheiten, stellt aber fest, dass sie absolut gesund ist. Bei der Untersuchung von Vash [[flirt]]et Bashir mit ihr. Später stellt sich heraus, dass Vash mit [[Q]] zusammen im Gamma-Quadrant gewesen ist, allerdings will Vash nichts mehr mit Q zu tun haben. Als Vash gerade mit Q [[streit]]et, besucht Bashir sie in ihrem [[Quartier]] und Q verschwindet. Bashir will sich mit ihr im Replimat verabreden. Bei dem Gespräch erscheint Q heimlich hinter Bashir und schneidet Grimassen ohne dass es Bashir bemerkt. Wenig später wartet Bashir auf Vash im Replimat und bestellt einen [[Pfefferminztee]]. Da erscheint Q als [[Kellner]] und will ihm die Verabredung ausreden. Als sich Bashir dies nicht ausreden lässt, wird Bashir durch den Einfluss von Q müde und legt sich schlafen. Bashir verschläft die darauf folgenden Ereignisse, die beinahe zur Vernichtung der Station geführt hätten. Wenig später verschwindet Q wieder und Bashir erkundigt sich bei Dax ob er in der Zwischenzeit etwas verpasst hat. ({{DS9|Q – Unerwünscht}})

[[Datei:Data und Bashir.jpg|thumb|Data und Bashir arbeiten untersuchen zusammendie fremde Technologie.]]

Bei Wenig später wird bei einer [[Expedition]] in den Gamma-Quadranten wird eine fremde Technologie mitgebracht. Bashir hält dieses Gerät für einen medizinischen [[Scanner]] und möchte diesen untersuchen. Zu der Zeit dockt die [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-D)]] an Deep Space 9 an. Da die Station noch nicht über die geeigneten Mittel verfügt, untersucht Bashir das Gerät an Bord der ''Enterprise''. Er untersucht es unerlaubt auf der Krankenstation und [[Lieutenant Commander]] [[Data]] stellt ihn deswegen zur Rede. Bashir entschuldigt sich bei ihm und Data unterstützt Bashir darauf bei seiner Forschung. Bashir ist von Data fasziniert und erkundigt sich über Datas persönliche Funktionsweise. Bei den dem [[Experiment]] mit dem Gerät geht aber etwas schief und Data wird von einen Plasmastrahl getroffen und verliert sein Bewusstsein. In diesem Zustand [[Traum|träumt]] Data zum ersten Mal und er will diesen Zustand weiter Erforschen. Bashir ist von diesen Ereignissen begeistert und hilft Data weitere Träume zu erleben. Nachdem das Experiment erfolgreich verlaufen ist und Data weitere Träume erlebt hat, erlaubt Data Bashir für seine Hilfe einen Bericht von diesen Ereignissen für das [[Kybernetik-Journal]] der Sternenflotte zu schreiben. Bashir bedankt sich dafür bei Data und wünscht angenehme Träume. ({{TNG|Der Moment der Erkenntnis, Teil I}})

Während einer Mission mit der [[USS Rio Grande|USS ''Rio Grande'']] erhalten Bashir und Kira einen [[Notruf]] von einem [[Kobliade|kobliadischen]] [[Frachter]]. Die beiden gehen den Notruf nach und begeben sich auf dem Frachter. Dort hilft Bashir den Kobliaden, aber [[Ty Kajada]] warnt Bashir davor, den in einem versiegelten Bereich befindlichen Verbrecher [[Rao Vantika]] zu helfen. Als Arzt hilft er ihm aber trotzdem. Bashir kann aber nicht mehr viel für ihn tun und Vantika stirbt. Bashir bemerkt nicht, dass Vantika seinen Geist in seinen [[Körper]] transferiert, als Vantika Bashir unerwartet [[Würgen|würgt]]. Vantika hat nun die Kontrolle über Bashirs Körper. Mit Hilfe von [[Quark]] und einigen Mittelsmännern gelingt es Vantika im Körper von Bashir die Kontrolle über den [[Deuridium]]-Frachter [[Norkova|''Norkova'']], der sich auf dem Weg vom Gamma-Quadranten zu Deep Space Nine 9 befindet, zu übernehmen. Bashir versucht zu mit den Frachter zu fliehen, doch mit einem modifizierten Traktorstrahl, den Commander Sisko auf den den [[Frachter]] schießt, gelingt es Sisko, den fliehenden Vantika aufzuhalten. Vantika droht den Frachter zu vernichten und somit auch Bashir zu töten. Doch inzwischen erlangt Bashir durch den modifizierten Traktorstrahl kurzzeitig die Kontrolle über den Körper und deaktiviert die [[Schutzschild]]e des Frachters. Bashir wird auf Deep Space 9 zurück gebeamt und dort von Vantika befreit. Die Überreste von Vantika werden durch Kajada vernichtet. Nach diesen Ereignissen kann sich Bashir an nichts erinnern, was Vantika mit seinem Körper getan hat. ({{DS9|Der Parasit}})

[[Datei:uebernahme_schiff.jpg|thumb|Bashir unter der Kontrolle von Rao Vantika.]]

Nur wenige Wochen später kommt eine [[Delegation]] der [[Wadi]] an Bord von Deep Space 9. Bashir bekommt mit Sisko Ärger, da dieser keine [[Galauniform]] dabei hat. Aber Als die Wadi ankommen, wollen nur diese sofort ins [[QuarksQuark's]] , um dort zu spielen. Als Quark die Wadi beim [[Dabo]] betrügt, wollen die Wadi mit Quark ein neues Spiel spielen. Das Spiel heißt [[Chula]]. Ohne Quarks Wissen werden Sisko, Kira, Bashir und Dax Spielfiguren in diesem Spiel. Bashir wacht in einem Raum auf und denkt, dass es sich um einen [[Albtraum]] handelt. Bashir schreit laut los, um so aus seinem Traum wach zu werden. Durch die Schreie von Bashir finden die anderen ihn. Bashir wird nun klar, dass es sich nicht um einen Traum handelt. Die vier Offiziere müssen unwissend das Spiel spielen und mehrere Aufgaben lösen. Eine davon ist die [[Chandra (Wadi)|Chandra]], die durch ein [[Kraftfeld]] springt. Bashir findet einen Lösungsansatz, aber dieser funktioniert nicht ganz und er wird von dem Kraftfeld getroffen. Erst Dax findet die Lösung und die Offiziere gelangen durch das Kraftfeld. Danach werden die Offiziere in einen Raum geführt, indem giftiges [[Gas]] austritt. Bashir findet hier die Lösung und trinkt das [[Getränk]] der Wadi und kann die anderen damit retten. Währenddessen bemerkt Quark, dass seine Spielfiguren die vier Offiziere sind und versucht diese sicher durch das Spiel zu bringen. Der nächste Spielzug verläuft schlecht für Quark; er verliert eine Figur. Im Spiel wird Bashir von einer Energieentladung getroffen und löst sich vor den Augen der anderen auf. Das Spiel läuft für Quark weiter schlecht und er muss eine Figur opfern. Da sich Quark nicht entscheiden kann, wählt das Spiel Dax aus. Doch Sisko will Kira und Dax durchbringen und dabei verlieren sie und stürzen in einen Abgrund. Quark hat somit das Spiel verloren, doch die vier Offiziere erscheinen wieder gesund im Quarks, da sich das ganze ja nur um ein Spiel gehandelt hat. ({{DS9|Chula – Das Spiel}})

Wenig später besucht der [[Großer Nagus|große Nagus]] [[Zek]] die Station, um dort eine wichtige [[Konferenz ]] über die neuen Profitquellen im Gamma-Quadrant zu halten. Während der Konferenz ernennt Zek Quark zu seinem Nachfolger. Wenig später sieht es so aus als sei Zek verstorben und Quark übernimmt seinen neuen Posten als Nagus. Kurz darauf wird ein Anschlag auf Quark verübt. Bashir behandelt danach den verletzten Quark. Später stellt sich heraus, dass [[Krax]] der Sohn des Nagus für die Anschläge verantwortlich ist. Doch in Wirklichkeit ist Zek nicht Tod, dieser hat seinen Tod vorgetäuscht, um zu sehen ob sein Sohn Krax ein guter Nagus ist und von Quark die Macht ergreift. Doch in Zeks Augen hat sein Sohn versagt und Zek übernimmt wieder seinen Posten als Nagus. ({{DS9|Die Nachfolge}})

Nach einem Zwischenfall in der Holosuite wird der [[Miradorn|Zwillingsmiradorn]] [[Ro-Kel]] von dem [[Rakhari]] [[Croden]] erschossen. Doktor Bashir kann nur noch den Tod feststellen und Croden wird von Odo verhaftet. Croden stammt aus dem Gamma-Quadranten und er erzählt Odo, dass er weitere Formwandler im Gamma-Quadranten kennt. Doch Aber Odo glaubt ihn nicht. Doch Croden versucht Odo seine Geschichte zu beweisen und übergibt ihn ein [[Amulett]], welches ähnliche wandlerische Fähigkeiten wie Odo hat. Bashir untersucht das Amulett und stellt, dass es Ähnlichkeiten zwischen dem Amulett und der [[Spezies]] von Odo gibt. Odo vermutet darauf, dass das Amulett ein Hinweis für seine [[Heimatwelt]] ist. Doch später stellt sich heraus, dass dieses Amulett nur als Schlüssel dient und nichts mit Odos Volk zu tun hat. ({{DS9|Der Steinwandler}})

Kurz darauf besucht [[Kai]] [[Opaka]] die Station. Sisko lädt die Kai zu einem Flug durch das Wurmloch in den Gamma-Quadrant ein. Bashir und Kira begleiten die beiden. Im Gamma-Quadrant erhält die USS ''Yangtzee Kiang'' einen Notruf und Sisko geht diesem Notruf nach. Im [[Orbit]] eines [[Mond (Satellit)|Mondes]], von dem der Notruf stammt, wird die ''Yangtzee Kiang'' angegriffen und stürzt ab. Sisko, Kira und Bashir überstehen den Absturz unverletzt, jedoch wird Opaka tödlich verletzt und Bashir kann nichts mehr für sie tun. Die überlebenden Offiziere werden in einem Konflikt zwischen den [[Ennis]] und den [[Nol-Ennis]] verwickelt. Die Offiziere werden von den Ennis gefangen genommen und dort erfahren sie von den Konflikt zwischen beiden Völkern. Plötzlich greifen die Nol-Ennis an, aber der Angriff wird schnell abgewehrt. Nach dem Kampf kümmert sich Bashir um die Verletzten. Einige Augenblicke später taucht Opaka lebendig auf und Bashir kann sich dies nicht erklären und auch die toten Ennis erwachen plötzlich wieder zum Leben. Bashir will diesen Vorfall untersuchen und begibt sich zur abgestürzten ''Yangtzee Kiang''. Dort findet Bashir heraus, dass die beiden verfeindeten Gruppen durch eine [[Mikrobe]] in der [[Atmosphäre]] wiederbelebt werden. Bashir stellt auch fest, dass die Mikroben nur auf diesem Mond überleben können. Währenddessen versucht Sisko zwischen den Ennis und den Nol-Ennis zu vermitteln, doch er scheitert und beide Gruppen bekämpfen sichweiter. Als Sisko angegriffen wird, rettet Bashir Sisko, damit dieser nicht auch getötet wird. Bashir will versuchen die Mikroben deaktivieren, damit die Personen in Frieden sterben können und nicht mehr dieses grausame Leben führen müssen. Doch als Bashir sieht, dass die Ennis dies zu ihrem Vorteil im Kampf gegen die Nol-Ennis nutzen wollen, lässt er davon ab. Die Offiziere können schließlich von Dax und O'Brien gerettet werden und beamen auf die USS ''Rio Grande''. Kai Opaka bleibt auf dem Mond zurück, um den Ennis und den Nol-Ennis bei der Beendigung ihres Konfliktes zu helfen. ({{DS9|Die Prophezeiung}})

Nach diesen Ereignissen wird Doktor Bashir in ein [[Dorf ]] nach Bajor gerufen. Die Dorfbewohner benötigen dringend die Hilfe des Arztes. Chief O'Brien soll Bashir nach Bajor fliegen, aber O'Brien wünscht, dass jemand anderes Bashir nach Bajor fliegt, da der Chief Bashir ziemlich nervig findet. Doch Sisko befiehlt O'Brien Bashir nach Bajor zu fliegen. Auf den Flug nach Bajor wechselt O'Brien kein Wort mit Bashir. Schließlich bricht Bashir das [[Eis]] und fängt ein Gespräch mit O'Brien an. Bashir bietet O'Brien an ihn "Julian" zu nennen, doch O'Brien hat damit Schwierigkeiten. Auf Bajor erfährt Bashir, dass er in dem Dorf den [[Sirah (Titel)|Sirah]] retten muss, damit dieser das Dorf vor dem [[Dal'Rok]] retten kann. Aber Bashir kann nicht viel für den Sirah tun. Als das Dal'Rok wieder auftaucht , rettet der Sirah das Dorf, doch dies ist zu viel den alten Mann und er bricht zusammen. Kurz vor seinem Tod ernennt der Sirah O'Brien zu seinem Nachfolger. Bashir unterstützt O'Brien in seiner Rolle als Sirah, obwohl sich O'Brien sehr unwohl dabei fühlt. [[Hovath]] der eigentlich der neue Sirah werden sollte, ist auf O'Brien eifersüchtig und versucht diesen sogar zu töten. Aber O'Brien und Bashir können ihn jedoch aufhalten. Die beiden erfahren von Hovath, dass die Bewohner ihm nicht mehr vertrauen, nachdem er einmal versagt hat. Am nächsten Abend muss O'Brien als Sirah das Dal'Rok aufhalten. Doch O'Brien scheitert bei dieser Aufgabe. Bashir erkennt sofort, dass es sich um eine List des alten Sirah handelt. O'Brien soll als Sirah versagen, damit die Bewohner Hovath wieder vertrauen. Bashir überzeugt Hovath seine Aufgabe als Sirah wahr zu nehmen. Hovath kann das Dorf retten und wird nun als neuer Sirah akzeptiert. Bashir und O'Brien kehren darauf nach Deep Space Nine 9 zurück. ({{DS9|Die Legende von Dal'Rok}})

Wenige Wochen später hilft Bashir den verletzten [[Mullibok]], auf dem bajoranischen Mond [[Jeraddo]] zu behandeln. Bashir will Mullibok mit nach Deep Space 9 mitnehmen, doch dieser weigert sich. Darauf erklärt sich Kira bereit sich um Mullibok zu kümmern und Bashir Kira, erklärt ihr wie sie Mullibok pflegen soll. ({{DS9|Mulliboks Mond}})

Einige Zeit später erscheint eine Anomalie bei Deep Space 9, welche verursacht, das Gedanken Wirklichkeit werden. Zu dieser Zeit hat Bashir wieder eine Verabredung mit Dax. Bashir wird aber wieder von ihr abgewiesen. Als Bashir sich später in seinem Quartier befindet, erscheint Dax und will ihn [[Kuss|küssen]]. Bashir hält dies erst für einen [[Scherz]], aber er gibt sich ihr hin. Die beiden werden wenige Augenblicke später auf die [[Operations Center|OPS]] gerufen. Dort präsentiert Sisko einige Phantasiegestalten darunter auch [[Rumpelstilzchen]] und [[Buck Bokai]], welche plötzlich aufgetaucht sind. Dax soll darauf die Anomalie analysieren, als plötzlich eine zweite Dax erscheint. Es stellt sich heraus, dass die eine [[Jadzia Dax (Alien)|Dax ]] eine Phantasiegestalt von Bashir ist. Allerdings stellt Bashir fest, dass all diese Phantasiegestalten real sind. Bashir ist seine Phantasiegestalt von Dax sehr peinlich, doch Dax nimmt ihm das nicht übel, schließlich ist sie auch mal ein junger Mann gewesen. Bashir und Dax untersuchen weiter die Anomalie und erkennen Ähnlichkeiten mit einer Anomalie, welche im [[23. Jahrhundert]] das [[Hanoli-System]] vernichtet hat. Die Anomalie wird zu einer Bedrohung für die Station und das gesamte [[Bajoranisches System|bajoranische System]]. Durch die Erschütterungen, welche durch die Anomalie ausgehen, wird die Phantasie Dax verletzt und Bashir kümmert sich um sie. Die Anomalie droht zu kollabieren und alles zu vernichten, doch Sisko erkennt, dass es sich bei der Anomalie auch um ein Produkt der Phantasie handelt. Sisko befiehlt allen so zu tun, als würde diese Anomalie nicht existieren und plötzlich löst sich diese ausauf. Auch die Phantasiegestalten verschwinden plötzlich. Es stellt sich heraus, dass eine fremde Spezies aus dem Gamma-Quadranten in Form dieser Phantasiegestalten in Kontakt mit der Föderation getreten sind und sie auch weiterhin Kontakt mit der Föderation haben wollen. ({{DS9|Macht der Phantasie}})

Als eine Delegation von [[Botschafter]]n der Föderation an Bord der Station kommt, hat Bashir die Aufgabe den Botschaftern die Station zu zeigen. Bashir hat Probleme mit ihnen, da die Botschafter ihn nicht respektieren. Botschafterin [[Taxco]] will sich sogar beim Sternenflottenkommando über Bashir beschweren, da ein so ein unerfahrener Offizier sie durch die Station führt. Bashir bittet Sisko ihn von dieser Aufgabe abzuziehen, aber Sisko lässt das dies nicht zu. Während Bashir die Botschafter durch einen [[Korridor ]] führt, bricht durch eine Fehlfunktion des Computers ein [[Feuer]] aus, welches Bashir und die Botschafter einschließt. Bashir handelt schnell und bringt die Botschafter in einen Schacht in Sicherheit. Wenig später werden Bashir und die Botschafter von einem Rettungstrupp befreit. Die Botschafter sind von Bashirs schneller Reaktion begeistert und schlagen ihn für eine [[Auszeichnung ]] vor. ({{DS9|Persönlichkeiten}})

Wenig später kommt das klingonische Schiff [[IKS Toh'Kaht|IKS ''Toh'Kaht'']] früher als erwartet aus dem Gamma-Quadranten zurück. Nachdem das Schiff das Wurmloch passiert hat, explodiert dieses. Nur ein Überlebender kann sich auf die Station beamen. Doch Bashir kann nichts für den Klingonen [[Hon'Tihl]] tun und dieser stirbt. Bashir stellt fest, dass der Klingone an den Folgen schwerer Phaserverbrennungen gestorben ist. Während sich der Klingone an Bord beamt, werden die [[Führungsoffizier]]e von Deep Space 9 durch eine [[Telepathie|telepathische]] [[Matrix]] der [[Saltah'na]] infiziert und diese beginnen sich seltsam zu Verhalten. Es kommt durch den Einfluss der Matrix zu einem Machtkampf zwischen Kira und Sisko auf der Station. Die Offiziere stellen sich entweder auf die Seite von Sisko oder Kira. Obwohl auch Bashir infiziert ist, verhält sich dieser in diesem Konflikt neutral. Auch Odo bemerkt diese Vorgänge und berichtet dieses Bashir. Da Bashir in seinen Wahn eine Gefahr für die Station sieht, beginnt dieser nach einem Heilmittel zu forschen. Er findet schließlich nach langer Forschung ein Gegenmittel. Inzwischen eskaliert der Streit zwischen Kira und Sisko und es kommt zum Kampf. Doch Odo gelingt es die OffizierOffiziere, da diese ihn noch immer vertrauen, in [[Andockschleuse|Andockschleuse 4]] zu locken. Bashir gelingt es dort die Offiziere von der Matrix zu befreien und Odo lässt diese Matrix in den [[Weltraum]] entweichen. ({{DS9|Meuterei}})

Gegen Ende des Jahres behandelt Bashir den Cardassianer [[Aamin Marritza]] gegen die Symptome des [[Kalla-Nohra-Syndrom]]. Marritza gibt sich zu dieser Zeit als Gul [[Darhe'el]] aus. Kira erkennt Darhe'el sofort und lässt diesen sofort verhaften. Bashir und Odo finden jedoch heraus, dass es sich bei Darhe'el sich um den Datenverwalter Marritza handelt. Marritza hat sich als Darhe'el ausgegeben, um eine [[Strafe]] für die Gräueltaten, welche die Cardassianer den Bajoranern angetan haben, zu verbüßen. Marritza wird darauf freigesprochen, da er nichts mit Darhe'els Verbrechen zu tun hat. Wenig später wird Marritza von den dem Bajoraner [[Kainon]] ermordet. ({{DS9|Der undurchschaubare Marritza}})

Anfang [[2370]] behandelt Bashir [[Li Nalas]], nachdem er und einige Bajoraner von Kira und O'Brien aus einem Cardassianischen cardassianischen [[Arbeitslager]] befreit worden sind. Zu der Zeit wird die [[Allianz für globale Einheit]] auf Bajor und Deep Space Nine 9 aktiv. Diese Organisation wird auch <q>Der Kreis</q> genannt und hat das Ziel Bajor von allen Nichtbajoranern zu befreien. Einige Mitglieder des Kreises greifen kurz darauf Quark an. Bashir behandelt darauf den verletzten Quark und ,doch Odos Ermittlungen diesbezüglich laufen ins Leere. Um über die eskalierende Situation Herr zu werden benötigt Commander Sisko die Hilfe des Volkshelden Li Nalas. Wenig später wird Li Nalas nach Deep Space 9 versetzt und übernimmt dort , auf Befehl von Minister [[Jaro Essa]] den Posten von Major Kira ein. Kira wird dafür nach Bajor versetzt. ({{DS9|Die Heimkehr}})

Da Kira die Station verlassen muss, verabschieden sich die Freunde, darunter auch Bashir, von Kira. Bashir wünscht Kira für die Zukunft alles Gute. Auf Bajor wird Kira vom wenig später vom Kreis entführt und gefoltert. Sisko startet darauf eine Befreiungsaktion, bei der sich Bashir auch freiwillig meldet und fliegt nach Bajor. Mit Quarks Hilfe findet Sisko das Versteck des Kreises. Es kommt in dem Versteck zu kämpfen gegen die Anhänger des Kreises. Bashir findet bei den Kämpfen die schwer verletzte Kira und kann mit ihr an Bord des [[Runabout ]]s [[beamen]]. Doch dabei wird auch Bashir leicht verletzt. Odo gelingt es inzwischen zu Beweisen, dass der Kreis seine Waffen von den Cardassianern erhält. Zur selben Zeit hat der Kreis die Regierungsgewalt über Bajor übernommen und die Föderation wird aufgefordert sich von Deep Space 9 zurückzuziehen. Doch dadurch können die Cardassianer wieder die Kontrolle über Bajor erlangen. Sisko will dies verhindern undbleibt und bleibt deswegen mit einigen Offizieren auf Deep Space 9 zurück um die Übernahme des Kreises zu verhindern. ({{DS9|Der Kreis}})

Bashir bleibt mit auf der Station, um diese gegen den Kreis zu verteidigen. Kira und Dax versuchen währenddessen den Beweis nach Bajor zu bringen, welcher Beweist, dass die Bajoraner der Kreis von den Cardassianern mit Waffen beliefert werdenwird. Wenige Einige Zeit später übernimmt eine militärische Einheit der Bajoraner die Station. Die Bajoraner such die Station ab, da diese vermuten das einige Offiziere der Sternenflotte sich noch versteckt halten. Während die Offiziere warten verpflegt O'Brien die seine Kameraden mit [[Kampfration]]en, doch Bashir und die anderen sind nicht besonders begeistert davon. Als sich eine Gruppe bajoranische Soldaten sich in einen Frachtraum begebenbegibt, nimmt Bashir mit seiner Gruppe diese Gefangen. Die Sternenflottenoffiziere sorgen weiterhin für genügend Ablenkung und es gelingt ihnen genügend Zeit zu verschaffen, so dass Kira und Dax den Beweis überbringen können. Als die Bajoraner sehen, dass die Cardassianer hinter all dem stecken, wird der [[Putsch]] des Kreises beendet und die Föderationsangehörigen kehren nach Deep Space 9 zurück. Trotz des Siegs wird Li Nalas von [[Colonel]] [[Day Kannu]] erschossen. Bashir kann nichts für ihn tunund er stirbt. ({{DS9|Die Belagerung}})

Kurz darauf wird Deep Space 9 aufgrund eines [[Plasmasturm]]s vollständig evakuiert. Nur eine Notbesatzung, darunter auch Bashir bleibt zurück. Auch Quark bleibt wegen seinem Latinum auf der Station zurück. Quark versucht weiter Geschäfte zu machen und hat mit einem Söldner namens [[Yeto]] Kontakt. Quark manipuliert für ihn die [[Andockrampe]]n. Kurz darauf erhält die Station einen Notruf von einem Schiff und Sisko lässt es an die Station andocken. Aufgrund von Quarks Manipulation können die Söldner, welche von dem Trill [[Verad]] angeführt werden, bewaffnet auf die Station eindringen. Bashir wird gezwungen Odo in einem Behälter zu sperren und in die [[Stasiskammer]] einzuschließen. Verad befiehlt Bashir den Symbionten von Jadzia zu entfernen und in Verad einzusetzen. Doch Bashir weigert sich, da er Jadzia nicht töten will. Darauf schießt Verad auf O'Brien und droht alle anderen zu töten. Da Jadzia nicht möchte, dass jemand wegen ihr stirbt, bittet sie Bashir den Symbionten zu entfernen. Die Operation verläuft zwar erfolgreich, aber aufgrund des Verlustes des Symbionten liegt Jadzia im Sterben. Bashir tut alles um sie am Leben zu erhalten, doch er macht sich schwere Vorwürfe. Quark, der wie die anderen Offiziere gefangen gehalten wird, erkennt seinen Fehler und dass er für den Tod von Jadzia verantwortlich sein wird. Er greift darauf den Klingonen [[T'Kar]] an und wird beim Angriff leicht verletzt. Auf der Krankenstation tut Quark, so als ob er schwer verletzt ist und so gelingt es ihm und Bashir den Klingonen Yeto zu überwältigen und Odo zu befreien. Odo und Sisko gelingt es schließlich Verad und seine Söldner aufzuhalten. Im letzten Moment kann Bashir Jadzia ihren Symbionten zurückgeben und sie wird gerettet. ({{DS9|Der Symbiont}})

Als sich Bashir und Garak im Replimat treffen, wird Garak von dem cardassianischen Jungen [[Rugal]] angegriffen. Der Junge ist eine cardassianische Kriegswaise, welche auf Bajor zurückgeblieben ist. Plötzlich meldet sich [[Gul]] [[Dukat]] und zeigt großes Interesse an dem Jungen. Dukat ist besorgt, dass die cardassianischen Waisen auf Bajor dazu erzogen werden ihr eigenes Volk zu hassen. Garak vermutetjedoch, dass da etwas mit Rugal nicht stimmt und dieser erklärt Bashir, dass Cardassianer niemals Kinder zurück lassen würden. Garak erklärt auch das Dukat auch den Rückzug von Bajor überwacht hat. Als sich später Dukat meldet, wirft Bashir Dukat vor, dass er absichtlich die Kinder zurück gelassen hat. Sisko ist über Bashir verärgert, da er Dukat diese Vorwürfe gemacht hat, obwohl es sich nur um Vermutungen handelt. Bashir und Garak forschen darauf wegen den Kriegswaisen auf Bajor nach. In der Zwischenzeit stellt sich heraus, dass Rugal der Sohn von [[Kotan Pa'Dar]] , einem hohen Politikers, ist. Garak und Bashir finden heraus, dass Dukat hinter einer Konspiration steckt, welche Kotan Pa'Dar entmachten soll. Rugal ist das Opfer dieser Konspiration und verschwindet während der [[Cardassianische Besetzung von Bajor|Cardassianischen Besetzung von Bajor]] und wird für tot erklärt. Später soll er laut Dukat als Kriegswaise auftauchen und Kotan Pa'Dar als verantwortungslosen Vater darstellen. Damit hätte Kotan Pa'Dar seine Position in der Regierung verloren. Als Bashir Dukat dieses alles vorwirft, verlässt Dukat den Raum und gibt somit indirekt seine Schuld zu. Rugal kehrt zu seinem Vater nach Cardassia zurück. ({{DS9|Die Konspiration}})

[[Datei:Bashir und Dukat.jpg|thumb|Bashir legt sich mit Gul Dukat an.]]

Bashir und O'Brien arbeiten die nächsten Wochen lange zusammen , um alles für [[Melora Pazlar]], welche von einem Planeten mit niedriger [[Schwerkraft]] stammt, auf Deep Space Nine 9 vorzubereiten. Melora Pazlar will aufgrund ihr Behinderung in normaler Schwerkraft keine Hilfe von Fremden. Da Bashir ihr helfen will, ist sie auch zu ihm anfangs feindselig. Wenig später entschuldigt sich Pazlar für ihr Verhalten bei Bashir. Die beiden verabreden sich darauf im [[Klingonisches Restaurant auf Deep Space 9|klingonischen Restaurant]]. Doch , doch Bashir hat etwas Schwierigkeiten bei der Bestellung und Pazlar hilft ihm bei der Bestellung des Essens. Mit der Zeit kommen sich die beiden näher und Pazlar zeigt Bashir wie es ist mit geringer Schwerkraft zu leben. Bashir schwebt in ihrem Quartier und darauf küssen die beiden sich. Wenig später findet Bashir eine Methode, wie sich Pazlar auch bei normaler Schwerkraft bewegen kann. Sie stimmt dieser Behandlung zu. Pazlar macht Fortschritte und kann sich mit der Zeit normal bewegen. Doch mit der Zeit kommen bei Pazlar Zweifel auf, da sie dadurch nie wieder in ihre Heimatwelt zurück kehren kann. Kurz darauf wir das Runabout, auf dem Pazlar arbeitet von dem Verbrecher [[Fallit Kot]] entfürt entführt und dieser nimmt Pazlar, Dax und Quark als Geiseln. Mit einem Traktorstrahl versucht Sisko das Runabout festzuhalten, doch um seine Macht zu demonstrieren, schießt Kot auf Pazlar. Bashir muss mit ansehen wie sie zusammen bricht. Das Runabout flieht in den Gamma-Quadrant und Sisko verfolgt dieses mit einem weiteren Runabout. Doch durch die Behandlung von Bashit Bashir hat der Schuss keine Folgen für Pazlar und sie deaktiviert die Schwerkraft und Kot verliert die Kontrolle über das Runabout. Pazlar setzt diesen außer Gefecht und Sisko und Bashir beamen auf das Runabout und brinegen bringen Kot in den Arrest. Auf Deep Space 9 erklärt Pazlar Bashir, dass sie die Behandlung abzubrechen will, da sie so nicht mehr auf ihrer Heimatwelt leben kann. Kurz darauf verlässt Melora Pazlar wieder die Station. ({{DS9|Das Melora-Problem}})

[[Datei:Bashir und Melora Pazlar.jpg|thumb|left|Bashir und Melora Pazlar im klingonischen Restaurant.]]

Kurz darauf wird Bashir mit den Führungsoffizieren von Deep Space 9 von [[Professor]] [[Gideon Seyetik]] auf die [[USS Prometheus (NCC-71201)|USS ''Prometheus'']] zum Essen eingeladen. Bashir ist von Seyetik sehr beeindruckt ist, da er auch vor Jahren auf einer Austellung Ausstellung von Seyetik auf [[Ligobis X]] gewesen ist. ({{DS9|Rätselhafte Fenna}})

Um sich mit O'Brien besser anzufreunden, lädt Bashir ihn zu einem Racquetballmatch ein. O'Brien nimmt wiederwillig widerwillig an, verliert aber gegen den überlegenen Bashir. O'Brien fühlt sich in seiner [[Ehre]] verletzt und fordert Bashir einige weitere Male heraus. Obwohl O'Brien weiterhin verliert, versucht er weiter gegen den Arzt zu spielen. Bashir macht sich inzwischen Sorgen um den Chief, da er nicht mehr der jüngste ist. Um O'Brien nicht zu überfordern , gelingt es Bashir mit einigen Tricks die Spiele vorzeitig abzubrechen. Zu der Zeit befindet sich der [[El-Aurianer]] [[Martus Mazur]] an Bord der Station. Dieser besitzt ein außerirdisches [[Glücksspiel|Glücksspielgerät]]. Zu der Zeit weiß niemand, dass seine Spielgeräte das Glück jeder Person auf der Station beeinflussen. Mazur eröffnet sein eigenes Lokal und wird somit einen direkter Konkurrent von Quark. Um sein Geschäft wieder aufleben zulassen, lässt Quark ein Racquetballmatch zwischen Bashir und O'Brien veranstalten. Doch beide weigern sich daran an diesem Spiel teilzunehmen. Doch Allerdings erklärt Quark erklärt, dass er einen teil der Wetteinsätze für bajoranische Kriegswaisen zu spenden. Nun haben die beiden keine andere Wahl sie nehmen das Spiel an. Quark nimmt die Wetteinsätze auf den Sieger entgegen, um aber selbst zu gewinnen, versucht Quark Bashir mit einem Trank außer Gefecht zu setzen. Bashir durchschaut aber Quark und somit findet das Spiel zwischen O'Brien und Bashir ohne Quarks Manipulation statt. Obwohl Bashir wieder überlegen ist, scheint er in diesem Spiel nur Pech zu haben, während O'Brien jeden Ball trifft. Anhand dieses Spiels finden die Führungsoffiziere heraus, dass die Glücksspielgeräte von Mazur für den ganzen Zustand verantwortlich sind. Darauf vernichten Sisko und Dax die Geräte. ({{DS9|Rivalen}})

Bashir behandelt Jadzia Dax, [[Mora Pol]] und [[Weld Ram]], nach dem diese durch den Einfluss eines [[Gas]]es auf [[L-S VI]] verletzt worden sind. Wenig später wird das Labor auf Deep Space 9 verwüstet, die . Die Offiziereglauben, dass eine Lebensform, welche das Forschungsteam mitgebracht haben, für diese verwüstung Verwüstung verantwortlich ist. Es wird fieberhaft nach dieser Kreatur gesucht, doch O'Brien findet die Lebensform tot vor. Bashir untersucht die Überreste und stellt fest, dass diese Lebensform in Folge an [[Kohlendioxid]]mangel gestorbenist. Plötzlich taucht wieder eine Kreatur auf und greift den verletzten Mora und Bashir an. Bashir kann sich gerade so noch mit einem [[Laserskalpell]] schützen und die Kreatur vertreiben. Später stellt sich heraus, dass Odo diese Kreatur ist. Durch den Einfluss des Gases von L-S VI verwandelt sich Odo unbewusst in diese Kreatur. Sisko und ein Sicherheitsteam jagen nun Odo und nutzen Mora als Köder, um Odo in ein Kraftfeld zu sperren. Bashir und Mora entfernen danach die Spuren des Gases aus dem Körper von Odo. ({{DS9|Metamorphosen}})

Kurz darauf werden Bashir und O'Brien von den [[T'Lani]] und [[Kelleruner]]n, gebeten bei der Vernichtung einer [[biologische Waffe|biologischen Waffe]], genannt [[Harvester]], zu helfen. Nach einer Woche harter Arbeit gelingt es den Wissenschaftlern diese Waffe zu vernichten. Nachdem die Harvester fast vollständig vernichtet worden ist, werden die Forscher angegriffen und getötet. Als Bashir angegriffen wird, rettet O'Brien das Leben. Alle Forscher kommen ums Leben und die Angreife ziehen sich zurück. Doch da die beiden nicht auf ihr Runabout zurück beamen, können beamen sie auf den Planeten [[T'Lani III]], um sich dort in Sicherheit zu bringen. Die Botschafter der T'Lani und der Kelleruner erklären die beide Offiziere für tot und übermitteln dies Commander Sisko. Siskio Sisko will darauf eine [[Gedenkfeier ]] für die beiden veranstalten. Zur selben Zeit versucht O'Brien auf der Planetenoberfläche Kontakt mit der Station herzustellen, allerdings störrt stört ihn Bashir dabei. Darauf bittet O'Brien Bashir ihn erstmal in Ruhe zu lassen. Wenig später fühlt sich O'Brien erschöpft und matt. Bashir stellt darauf fest, dass sich O'Brien mit der Harvester infiziert hat und droht daran zu sterben Auf dem Planeten hatdroht. Bashir tut alles um seinen Freund zu retten und versucht eine Nachricht nach Deep Space Nine 9 zu schicken, in der Hoffnung, dass beide gerettet werden. Auf Deep Space 9 erkennt [[Keiko O'Brien]], dass es sich bei der Aufzeichnung um eine Fälschung handelt, da sich ihr Mann anders Verhält als üblich. Sisko geht dem Verdacht von Keiko O'Brien nach und fliegt mit einem Runabout zu dem Planeten T'Lani III. Auf der Oberfläche geht es O'Brien immer schlechter, doch plötzlich tauchen die Botschafter beider Völker auf. Bashir glaubt an ihrer Rettung, doch die Botschafter erklären, dass die beiden getötet werden müssen, da die beiden über die Harvester Bescheid wissen. Als die beiden erschossen werden sollen, werden O'Brien und Bashir von Sisko auf das Runabout gebeamt. Die T'Lani und die Kelleruner greifen das Runabout zwar an, aber Sisko kann mit einer List entkommen. Auf Deep Space 9 kann Bashir O'Brien behandeln und rettet ihn somit das Leben. Nach diesen Ereignissen, bemerken die beiden das dieses Erlebnis sie zusammen geschweißt hat und sie nun Freunde geworden sind. ({{DS9|Das Harvester-Desaster}})

Während einer Mission wird O'Brien durch einen [[Replikant]]en von [[Parada II]] ersetzt. Dieser O'Brien weiß aber nicht das er ein Replikant ist und später als Attentäter fungieren soll. Bashir bekommt von Sisko den Auftrag O'Brien vollständig zu untersuchen, doch Bashir kann an O'Brien vorläufig nichts finden. Dem falschen O'Brien fällt inzwischen auf, dass sich alle seltsam Benehmen. O'Brien glaubt an eine Verschwörung und flieht von der Station zurück nach Parada II, um dort die Wahrheit raus zu finden. Sisko verfolgt O'Brien in einem Runabout und Bashir begleitet ihn dabei. Auf Parada II gelingt es den Offizieren den richtigen O'Brien ausfindig zu machen und Bashir behandelt diesen. Allerdings kommt dabei der Replikant ums Leben. ({{DS9|O'Briens Identität}})

Auf einen Transport lernt Bashir wenig später den jungen Trill-Kandidaten [[Arjin]] kennen. Er erzählt dem nervösen Trill alles über Jadzia Dax, welche Arjin zur Vereinigung mit dem Symbionten vorbereitet soll. Arjin macht sich sorgen, da Dax dafür bekannt ist, dass Trill-Kandidaten aus dem Trainingsprogramm fliegen, doch zu lassen. Doch Bashir erklärt ihm das Jadzia Dax völlig anders als ihre vorigen Wirte ist. Später hilft Bashir bei der Erforschung eines [[Protouniversum]]s. Doch dieses wird zu einer Bedrohung, als sich das Protouniversum beginnt auszudehenauszudehnen. Später bringen Dax und Arjin das Protouniversum zurück in den Gamma-Quadranten. ({{DS9|Der Trill-Kandidat}})

Wenig später explodiert der cardassianische [[Frachter]] [[Bok'Nor|''Bok'Nor'']], als dieser Deep Space 9 verlässt. Es gibt keine Überlebenden. Die Führungsoffiziere beginnen sofort zu ermitteln, was die [[Explosion ]] auf den Frachter ausgelöst hat. Zu dieser Zeit haben die Föderation und die Cardassianer einen neuen Vertrag abgeschlossen und es wurde eine [[Entmilitarisierte Zone]] gegründet, allerdings müsse beide Großmächte einige Kolonien aufgeben. Sisko beginnt mit Commander [[Calvin Hudson]] weiter zu dieser Explosion zu ermitteln, da beide den neuen Friedensvertrag in Gefahr sehen. Schließlich mischen sich auch die Cardassianer in diese Ermittlung ein und Gul Dukat wendet sich an Sisko. Es kommt inzwischen zu Konflikten zwischen den Cardassianern und den Kolonisten in der Entmilitarisierten Zone und auch diese stellt sich heraus, dass die Kolonisten sind für den Anschlag auf die ''Bok'Nor'' verantwortlichsind. Wenig später wird auch Dukat von diesen Kolonisten entführt. Siko Sisko will diese Kolonisten, welche sich [[Maquis]] nennen, aufsuchen und verfolgt die Spur von Dukats Entführern in die [[Badlands]] und nimmt dafür auch Bashir und Kira mit. Auf einen Asteroiden [[Asteroid]]en trifft Sisko auf den Maquis und unter den Anhängern befindet sich auch Siskos Freund Hudson. ({{DS9|Der Maquis, Teil I}})

Hudson erklärt Sisko, dass die Föderation die Kolonisten aufgegeben hat und das die Cardassianer Waffen in die Entmilitarisierte Zone schmuggeln. Sisko versucht Hudson zu überzeugen zur Sternenflotte zurück zu kehren, doch Hudson setzt Sisko, Kira und Bashir außer Gefecht. Die drei Offiziere kehren darauf auf die Station zurück. Inzwischen verhaftet Odo Quark, da er festgestellt hat, dass Quark Waffen an den Maquis verkauft. Sisko und Odo verhören darauf Quark und Quark verrät seine Geschäftspartner beim Maquis. Wenig später spührt spürt Sisko die Maquis-Basis auf, wo Dukat gefangen gehalten wird. Sisko, Bashir und Odo gelingt es Dukat aus der Gewalt des Maquis zu befreien und einige Anhänger des Maquis zu verhaften. Später ist Sisko gezwungen eine Waffenlieferung des Maquis zu stoppen und es kommt zu einem Kampf im [[Weltraum]]. Mit O'Brien befindet sich Bashir auf der [[USS Mekong|USS ''Mekong'']] und greift die Maquis-Schiffe an. Sisko muss bei diesem Kampf wieder gegen seinen Freund Hudson kämpfen. Zwar kann der Maquis aufgehalten werden, aber Sisko weiß das die Lage in der Entmilitarisierte Zone angespannt bleiben wird. ({{DS9|Der Maquis, Teil II}})

Als sich Garak und Bashir über cardassianische Literatur unterhalten, zeigt Garak SchmerzsymthomeSchmerzsymptome. Bashir wil will Garak auf die Krankenstation bringen und ihn dort untersuchen, doch Garak verweigert dies. Bashir versteht nicht, warum sich Garak nicht von ihn ihm helfen lassen will. Wenig später sieht Bashir Garak bei Quark. Als sich Bashir bei Quark über Garak erkundigt, erklärt Quark das Garak nur Material für sein Geschäft kaufen wollte. Doch Bashir glaubt Quark nicht und forscht weiter. Wenig später findet Bashir Garak betrunken bei Quark vor. Bashir will nun Garak untersuchen, doch er weigert sich. Plötzlich bricht Garak zusammen und Bashir bringt diesen in auf die Krankenstation. Dort stellt Bashir fest, dass in Garak ein Implantat implantiert ist, welches ausgefallen ist. Durch Odo erfährt Bashir, dass Quark im Auftrag Kontakt mit einigen cardassianischen Offizieren hat, um an ein neues Implantat zu gelangen. Bashir erfährt auch etwas über die Vergangenheit von Garak und das dieser etwas mit dem [[Obsidianischer Orden|Obsidianischen Orden]] zu tun hat. Als Bashir auf die Krankenstation zurück kehrt, ist Garak verschwunden und Bashir findet diesen in seinem Quartier vor. Von Garak erfährt Bashir, dass das Implantat [[Endorphin]]e frei setzt und er mittlerweile davon abhängig ist. Um Garaks Leben zu retten , deaktiviert Bashir das Implantat. Garak erzählt Bashir mehrere Lügengeschichten, wie er dieses Implantat erhalten hat. Als Garak allerdings unter Entzugserscheinungen leidet beschimpft er Bashir und erzählt wie er sein Leben hasst. Doch um Garaks Leben zu retten, begibt sich Bashir zu [[Enabran Tain]], dem ehemaligen Chef des Obsidianischen Ordens. Von ihm bekommt Bashir ein neues Implantat und kann damit Garaks Leben retten. Garak entschuldigt sich daraufhin für sein Verhalten und er ist Bashir sehr dankbar, dass dieser sein Leben gerettet hat. ({{DS9|Das Implantat}})

Bashir und Kira helfen wenige Wochen später bei der Einrichtung eines Krankenhauses auf [[Neu Bajor]] im Gamma-Quadranten. Auf dem Rückflug zum Wurmloch nervt Bashir Kira mit seinem Verhalten. Als die beiden mit dem Runabout durch das Wurmloch zurückfliegen, gelangen sie durch einen Unfall in das [[Spiegeluniversum]]. Die beiden werden dort gefangen genommen und zur Raumstation [[Terok Nor (Spiegeluniversum)|Terok Nor]] gebracht. Da Bashir ein Terraner ist, muss er in die Erzverarbeitung, welche unter der Aufsicht von [[Odo (Spiegeluniversum)|Odo]] steht. Als Bashir Odo erklärt, dass dieser ein Arzt ist, sclägt schlägt Odo diesen, da er Bashir nicht glaubt. Kira wird währenddessen zur [[Intendant]]in [[Kira Nerys (Spiegeluniversum)|Kira]] gebracht. Bashir hat zur selben Zeit schwer unter dem sadistischen Odo zu leiden und muss unter seiner Aufsicht hart Arbeiten. Während der Arbeit freundet Bashir sich mit [[Miles O'Brien (Spiegeluniversum)|Miles "Smiley" O'Brien]] an. Als eine Leitung bricht, nutzen Bashir und die anderen Terraner das Chaos zur Flucht, dabei erschießt Bashir Odo. Doch die Flucht scheitert und Bashir wird verhaftet und die Intendantin Kira befiehlt [[Elim Garak (Spiegeluniversum)|Garak]] Bashir qualvoll hinzurichten. Doch plötzlich greift [[Benjamin Sisko (Spiegeluniversum)|Benjamin Sisko]] aus dem Spiegeluniversum und seine verbündeten ein und bedrohen die Intendantin. Darauf können die Terraner, Kira und Bashir von der Station fliehen. Schließlich gelingt es Bashir und Kira durch das Wurmloch, wieder in unser Universum zurück zu kehren. ({{DS9|Die andere Seite}})

Während der [[Zeit der Abrechnung]] zwischen den Propheten und den Pah-Geistern, bemerkt Bashir die ersten Anzeichen als er sich mit seinen Freunden unterhält und die Station plötzlich erschüttert wird. Später findet der Kampf zwischen den Propheten und den Pah-Geist in den Körper von Kira und Jake Sisko auf dem Promenadendeck auf Deep Space 9 statt, aber und Sisko lässt die Station evakuieren. Aber Kai Winn hält den Kampf auf, indem sie die Station mit [[Chronotonpartikel]]n überflutet. Bashir behandelt darauf die leicht verletzte Kira und Jake Sisko. ({{DS9|Zeit der Abrechnung}})

Bashir behandelt Quarks Mutter, nachdem sie durch einen Streit mit Quark einen Herzanfall bekommen hat. Da Quarks Mutter dadurch außer Gefecht gesetzt worden ist, muss Quark für die darauf folgende Verhandlungen ihre Rolle übernehmen. Um dies zu bewerkstelligen führt Bashir bei Quark eine [[Geschlechtsumwandlung ]] durch, damit Quark eine Frau wird. Nachdem Quark als [[Lumba]] die Verhandlungen durchgeführt hat, macht Bashir die Geschlechtsumwandlung rückgängig. ({{DS9|Die Beraterin}})

Nachdem [[Molly O'Brien]] durch ein Zeitportal auf [[Golana]] in Vergangenheit versetzt worden ist, versucht die Crew der ''Defiant'' sie zu retten. Es gelingt ihr zwar, aber in der Zwischenzeit hat Molly zehn Jahre auf Golana verbracht und ist dort erwachsen geworden. Da sie dort allein ohne Gesellschaft aufgewachsen ist, reagiert sie auf Fremde panisch. Bashir untersucht Molly und erklärt sie für körperlich gesund, aber sie hat Schwierigkeiten sich der Gesellschaft anzupassen. Da sich Molly O'Brien nicht anpassen kann , bringen ihre Eltern sie zum ein Zeitportal auf Golana, damit sie in der Vergangenheit leben kann. Als Molly durchs Portal tritt, trifft sie auf ihr jüngeres Ich und schickt das Kind wieder zu ihren Eltern zurück. ({{DS9|Das Zeitportal}})