Nach seinem Abschluss an der Sternenflottenakademie, lässt sich Bashir im [[Rang]] eines [[Lieutenant Junior Grade]] auf den neuen Sternenflottenaußenposten auf Deep Space 9 versetzen. Er möchte auf diesem entlegenen Außenposten neue Abenteuer erleben. [[2369]] wird er mit einem [[Weitere Schiffe der Oberth-Klasse|Föderationsraumschiff]] zur Station gebracht. Auf den Flug zur Station lernt er [[Jadzia Dax]] kennen, welche ebenfalls nach Deep Space 9 versetzt wird. Bashir freundet sich mit ihr an und ist fasziniert davon, dass diese ein [[Trill]] mit einem [[Trill-Symbiont|Symbionten]]en ist. Er versucht sich zwar mit Dax zu verabreden, aber Bashir bekommt dies nicht richtig zustande. Auf der Station zeigt ihm [[Major]] [[Kira Nerys]] die [[Krankenstation]]. Obwohl die Krankenstation schwer beschädigt ist, ist Bashir davon begeistert. Genau das hat sich Bashir erhofft; etwas Neues auzufbauen aufzubauen und den 'armen' [[Bajoraner]]n zu helfen. Doch Kira fühlt sich etwas [[Beleidigung|beleidigt ]] von Bashirs Aussage, da die Bajoraner kein einfaches primitives Volk sind, so wie es von Bashir rüber gekommen ist. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil I}})

Wenig später untersuchen [[Commander]] [[Benjamin Sisko]] und Dax eine [[Anomalie]] im [[Denorios-Gürtel]]. Dax wird zwar von dort auf die Station zurück transportiert, allerdings bleibt Sisko verschwunden. Kira, Dax, [[Odo]] und Bashir begeben sich mit der [[USS Yangtzee Kiang|USS ''Yangtzee Kiang'']] auf der Suche nach Sisko in den Denorios-Gürtel. Plötzlich taucht [[Gul]] [[Dukat]] mit seinem Schiff auf und er zeigt großes Intresse Interesse an der Anomalie, welche sich als ein [[Wurmloch]] entpuppt. Kira warnt Dukat davor , mit seinem Schiff in das Wurmloch zu fliegen, doch Dukat ignoriert die Warnung. Plötzlich verschwindet die Anomalie mitsamt dem [[Galor-Klasse|cardassianischen Schiff]]. Wenig später tauchen weitere Schiffe der [[Cardassianer]] auf und bedrohen die Station, da sie diese die Cardassianer die Sternenflotte für das Verschwinden ihres Schiffes verantwortlich machen. Die Cardassianer greifen die Station an und Bashir kümmert sich um die Verletzten. Bashir bekommt dabei Hilfe von Odo bei der Behandlung der Patienten. In der Zwischenzeit gelingt es Sisko mit den [[Wurmlochwesen]] in Kontakt zu treten. Diese geben darauf die Passage durch das [[Bajoranisches Wurmloch|bajoranische Wurmloch]] frei. Als Sisko mit dem cardassianischen Schiff zurückkehrt, brechen die Cardassianer den Angriff auf die Station ab. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil II}})

Bashir lebt sich schnell ein auf der Station. Als Bashir einmal im [[Replimat]] sitzt, stellt sich unerwartet der cardassianische [[Schneider]] [[Elim Garak]] ihm vor. Garak sieht in Bashir einen interesanten interessanten Freund, doch Bashir vermutet, dass Garak ihn [[Spion|ausspionieren]] will und Bashir meldet dies Sisko. Doch Sisko sieht keine Gefahr in Garak, dennoch rät Sisko Bashir bei Garak vorsichtig zu sein. Plötzlich taucht ein bajoranisches Schiff auf, welches von den Cardassianern verfolgt wird. Der Bajoraner [[Tahna Los]] wird auf die Station gebeamt, bevor die Cardassianer sein Schiff vernichten und Bashir kümmert sich umd um die medizinische Versorgung von Tahna. Die Cardassianer fordern die Auslieferung von Tahna, doch Sisko weigert sich ihn auszuliefern. Von den Cardassianern und Kira erfährt Sisko, dass Tahna zur [[Kohn-Ma]], einer bajoranischen Terroristengruppe gehört. Wenig später tauchen die beiden [[Klingone]]n [[Lursa]] und [[B'Etor]] aus dem [[Haus des Duras]] an Bord der Station auf und sie treten in Kontakt mit Tahna und auch mit Garak. Doch Garak traut den beiden Klingonen nicht und er bittet Bashir ihn abends in seinem Geschäft zu besuchen. Bei dem Besuch in Garaks Laden erfährt Bashir von den illegale Geschäfte zwischen den [[Duras-Schwestern]] und Tahna. Es stellt sich schließlich heraus, dass Tahna das Wurmloch vernichten will, damit sich die Föderation von Bajor zurück zieht. Doch Kira und Sisko gelingt Tahna aufzuhalten und er wird schließlich verhaftet. ({{DS9|Die Khon-Ma}})

[[Datei:Bashir und QIbudans Klon.jpg|thumb|Q macht sich über Bashir lustiguntersucht den Klon von Ibudan.]]

Wenig später wird der Bajoraner [[Ibudan]] tot in der [[Holosuite]] aufgefunden. Bashir leitet die medizinische Untersuchung in dem Fall und Odo beginnt mit den Ermittlungen. Mit der Zeit führen die [[Indiz]]ien auf Odo und dieser wird [[Verdacht|verdächtigt]] Ibudan [[Mord|ermordet]] zu haben. Bashir sammelt inzwischen [[Gen|Gen-Proben]] vom Tatort und untersucht diese. Bashir und Dax forschen gemeinsam und mit der Zeit entwickelt sich eine [[Zelle (Biologie)|Zellkultur]] die zu wachsen beginnt. Schließlich erkennt Bashir, dass sich aus dieser Zellkultur ein [[Klon]] von Ibudan entwickelt. Es stellt sich dadurch heraus, dass Ibudan in Wirklichkeit gar nicht ermordet worden ist, sondern das sein Klon getötet wordewurde. Später kann Odo den echten Ibudan für den Mord an seinem Klon verhaften. Ibudan wollte den diesen Mord an sich Odo in die Schuhe schieben, um sich zu rächen, da Odo ihn vor Jahren verhaften lassen hat. Zu dieser Zeit ist Bashir ziemlich [[Eifersucht|eifersüchtig]] auf Sisko in Bezug auf Dax. Bashir denkt, Sisko und Dax könnten eine Beziehung beginnen, aber nach einem Gespräch mit diesem erfährt Bashir, dass Sisko kein Interesse an ihr hat und die beide nur Freunde sind. ({{DS9|Unter Verdacht}})

Wenige Wochen später löst [[Chief]] [[Miles O'Brien]] bei der Reparatur eines [[Replikator]]s eine Vorrichtung aus, durch die ein [[Aphasie|Aphasie-Virus]] über die Station verbreitet wird. Durch die Benutzung des Replikators wird der Virus verbreitet und O'Brien ist der erste Infizierte dieser Krankheit. Durch den [[Virus]] werden die neuralen und visuellen Reize vom [[Gehirn]] falsch verarbeitet. Bashir untersucht O'Brien und versucht heraus zu finden, was diese seltsame Aphasie auslöst. Doch Bashir findet keine Hinweise was diese Aphasie auslöst. Als Bashir erste Erkenntnisse über diese Krankheit Sisko erläutern will, erkrankt auch Dax an dieser Krankheit. Durch diese plötzliche Erkrankung findet Bashir heraus, dass ein Virus für diese Aphasie verantwortlich ist. Da immer mehr Personen an dieser Krankheit erkranken, wird die Station unter [[Quarantäne]] gestellt. Bei seinen Forschen Forschungen erkennt Bashir, dass sich der Virus mittlerweile über die [[Luft ]] verbreitet. Während Bashir versucht ein Heilmittel zu finden, wird auch er infiziert. Major Kira gelingt es später zusammen mit dem Bajoraner [[Surmak Ren]], der Mitentwickler des Virus gewesen ist, ein Heilmittel zu finden. Surmak Ren bewundert den Erfolg von Julian Bashir und knüpft daran an. Mit dem Heilmittel können die kranken Bewohner der Station behandelt werden. ({{DS9|Babel}})

[[Datei:Data Bashir und BashirQ.jpg|thumb|left|Data und Q macht sich über Bashir arbeiten zusammenlustig.]]

Als ein [[Tosk]] aus dem [[Gamma-Quadrant]] auftaucht und auf Deep Space 9 herum geführt wird, ist dieser erstaunt eine Krankenstation vor zu finden. O'Brien stellt Tosk Bashir als Chefarzt vor. Später kehrt Tosk in den Gamma-Quadrant zurück. ({{DS9|Tosk, der Gejagte}})

Nach einer Expedition in den Gamma-Quadranten, wird eine junge Frau namens [[Vash]] mit nach Deep Space 9 gebracht. Die [[Offizier]]e an Bord der Station können sich nicht erklären, wie sie ohne das Wissen über das Wurmloch in den Gamma-Quadrant gekommen ist. Bashir untersucht sie nach Krankheiten, stellt aber fest, dass sie absolut gesund ist. Bei der Untersuchung von Vash [[flirt]]et Bashir mit ihr. Später stellt sich heraus, dass Vash mit [[Q]] zusammen im Gamma-Quadrant gewesen ist, allerdings will Vash nichts mehr mit Q zu tun haben. Als Vash gerade mit Q streitet[[streit]]et, besucht Bashir sie in ihrem [[Quartier]] und Q verschwindet. Bashir will sich mit ihr im Replimat verabreden. Bei dem Gespräch erscheint Q heimlich hinter Bashir und schneidet Grimassen ohne dass es Bashir bemerkt. Wenig später wartet Bashir auf Vash im Replimat und bestellt einen [[Pfefferminztee]]. Da erscheint Q als [[Kellner]] und will ihm die Verabredung ausreden. Als sich Bashir dies nicht ausreden lässt, wird Bashir durch den Einfluss von Q müde und legt sich schlafen. Bashir verschläft die darauf folgenden Ereignisse, die beinahe zur Vernichtung der Station geführt hätten. Wenig später verschwindet Q wieder und Bashir erkundigt sich bei Dax ob er in der Zwischenzeit etwas verpasst hat. ({{DS9|Q – Unerwünscht}})

[[Datei:uebernahme_schiffData und Bashir.jpg|thumb|Data und Bashir unter der Kontrolle von Rao Vantikaarbeiten zusammen.]]

Einige Zeit später verabreden sich Bashir und Dax im Replimat. Bashir möchte nach der Verabredung Dax in ihr Quartier begleiten, doch Dax lehnt dies ab und sie macht ihm klar, dass sie kein romantisches Interesse an ihm hat und geht. Bashir folgt ihr aber zu ihrem Quartier und sieht wie Dax von Fremden angegriffen und [[Entführung|entführt]] wird. Bashir versucht ihr zu helfen, aber die Angreifer können mit ihr entkommen. Bashir gelingt es mit letzter Kraft die Sicherheit zu rufen, doch die Entführer können mit ihrem Schiff entkommen. Mit dem [[Traktorstrahl]] von Deep Space 9 kann das fliehende Schiff jedoch aufgehalten werden. Die Entführer sind [[Klaestroner]]. [[Ilon Tandro]], welcher Dax entführt hat, hat einen Haftbefehl gegen sie und macht den vorherigen Wirt von Jadzia [[Curzon Dax]] für den Verrat an seinem [[Ardelon Tandro|Vater]] verantwortlich und will sie dafür anklagen. Sisko will dies aber nicht zulassen, da Curzon und Jadzia zwei unterschiedliche Personen sind. Es kommt zu einer [[Verhandlung ]] wegen der [[Auslieferung ]] von Dax. Bashir macht dort seine Aussage zu diesem Fall aus der medizinischen Sicht. Inzwischen findet Odo auf [[Klaestron IV]] [[Beweis]]e, dass Dax unschuldig ist. Durch die Beweise ist die Unschuld von Curzon Dax erwiesen und Ilon Tandro zieht seinen Haftbefehl zurück. ({{DS9|Der Fall Dax}})  [[Datei:Bashir hat eine Verabredung mit Dax.jpg|thumb|left|Bashir scheitert bei seiner Verabredung mit Dax.]] Während einer Mission mit der [[USS Rio Grande|USS ''Rio Grande'']] erhalten Bashir und Kira einen [[Notruf]] von einem [[Kobliade|kobliadischen]] [[Frachter]]. Die beiden gehen den Notruf nach und begeben sich auf dem Frachter. Dort hilft Bashir den Kobliaden, aber [[Ty Kajada]] warnt Bashir davor, den in einem versiegelten Bereich befindlichen Verbrecher [[Rao Vantika]] zu helfen. Als Arzt hilft er ihm aber trotzdem. Bashir kann aber nicht mehr viel für ihn tun und Vantika stirbt. Bashir bemerkt nicht, dass Vantika seinen Geist in seinen [[Körper]] transferiert, als Vantika Bashir unerwartet [[Würgen|würgt]]. Vantika hat nun die Kontrolle über Bashirs Körper. Mit Hilfe von [[Quark]] und einigen Mittelsmännern gelingt es Vantika im Körper von Bashir die Kontrolle über den [[Deuridium]]-Frachter [[Norkova|''Norkova'']], der sich auf dem Weg vom Gamma-Quadranten zu Deep Space Nine befindet, zu übernehmen. Bashir versucht zu mit den Frachter zu fliehen, doch mit einem modifizierten Traktorstrahl, den Commander Sisko auf den den [[Frachter]] schießt, gelingt es Sisko, den fliehenden Vantika aufzuhalten. Vantika droht den Frachter zu vernichten und somit auch Bashir zu töten. Doch inzwischen erlangt Bashir durch den modifizierten Traktorstrahl kurzzeitig die Kontrolle über den Körper und deaktiviert die [[Schutzschild]]e des Frachters. Bashir wird auf Deep Space 9 zurück gebeamt und dort von Vantika befreit. Die Überreste von Vantika werden durch Kajada vernichtet. Nach diesen Ereignissen kann sich Bashir an nichts erinnern, was Vantika mit seinem Körper getan hat. ({{DS9|Der Parasit}}) [[Datei:uebernahme_schiff.jpg|thumb|Bashir unter der Kontrolle von Rao Vantika.]] Nur wenige Wochen später kommt eine [[Delegation]] der [[Wadi]] an Bord von Deep Space 9. Bashir bekommt mit Sisko Ärger, da dieser keine [[Galauniform]] dabei hat. Aber die Wadi wollen nur ins [[Quarks]] um dort zu spielen. Als Quark die Wadi beim [[Dabo]] betrügt, wollen die Wadi mit Quark ein neues Spiel spielen. Das Spiel heißt [[Chula]]. Ohne Quarks Wissen werden Sisko, Kira, Bashir und Dax Spielfiguren in diesem Spiel. Bashir wacht in einem Raum auf und denkt, dass es sich um einen [[Albtraum]] handelt. Bashir schreit laut los, um so aus seinem Traum wach zu werden. Durch die Schreie von Bashir finden die anderen ihn. Bashir wird nun klar, dass es sich nicht um einen Traum handelt. Die vier Offiziere müssen unwissend das Spiel spielen und mehrere Aufgaben lösen. Eine davon ist die [[Chandra (Wadi)|Chandra]], die durch ein [[Kraftfeld]] springt. Bashir findet einen Lösungsansatz, aber dieser funktioniert nicht ganz und er wird von dem Kraftfeld getroffen. Erst Dax findet die Lösung und die Offiziere gelangen durch das Kraftfeld. Danach werden die Offiziere in einen Raum geführt, indem giftiges [[Gas]] austritt. Bashir findet hier die Lösung und trinkt das [[Getränk]] der Wadi und kann die anderen damit retten. Währenddessen bemerkt Quark, dass seine Spielfiguren die vier Offiziere sind und versucht diese sicher durch das Spiel zu bringen. Der nächste Spielzug verläuft schlecht für Quark; er verliert eine Figur. Im Spiel wird Bashir von einer Energieentladung getroffen und löst sich vor den Augen der anderen auf. Das Spiel läuft für Quark weiter schlecht und er muss eine Figur opfern. Da sich Quark nicht entscheiden kann, wählt das Spiel Dax aus. Doch Sisko will Kira und Dax durchbringen und dabei verlieren sie und stürzen in einen Abgrund. Quark hat somit das Spiel verloren, doch die vier Offiziere erscheinen wieder gesund im Quarks, da sich das ganze ja nur um ein Spiel gehandelt hat. ({{DS9|Chula – Das Spiel}})

Während einer Mission mit Wenig später besucht der [[USS Rio GrandeGroßer Nagus|USS ''Rio Grande''große Nagus]] erhalten Bashir und Kira einen [[Notruf]] von einem [[Kobliade|kobliadischen]] [[FrachterZek]]die Station, um dort eine wichtige Konferenz über die neuen Profitquellen im Gamma-Quadrant zu halten. Während der Konferenz ernennt Zek Quark zu seinem Nachfolger. Die beiden gehen den Notruf nach Wenig später sieht es so aus als sei Zek verstorben und begeben sich Quark übernimmt seinen neuen Posten als Nagus. Kurz darauf wird ein Anschlag auf dem FrachterQuark verübt. Bashir hilft behandelt danach den Kobliadenverletzten Quark. Später stellt sich heraus, aber dass [[Ty KajadaKrax]] warnt Bashir davor, den in einem versiegelten Bereich befindlichen Verbrecher [[Rao Vantika]] zu helfen. Als Arzt hilft er ihm aber trotzdem. Bashir kann aber nicht mehr viel der Sohn des Nagus für ihn tun und Vantika stirbtdie Anschläge verantwortlich ist. Bashir bemerkt Doch in Wirklichkeit ist Zek nichtTod, dass Vantika dieser hat seinen Geist Tod vorgetäuscht, um zu sehen ob sein Sohn Krax ein guter Nagus ist und von Quark die Macht ergreift. Doch in Zeks Augen hat sein Sohn versagt und Zek übernimmt wieder seinen [[Körper]] transferiert, Posten als Vantika Julian Bashir unerwartet Nagus. ({{DS9|Die Nachfolge}})  Nach einem Zwischenfall in der Holosuite wird der [[WürgenMiradorn|würgtZwillingsmiradorn]]. Vantika hat nun die Kontrolle über Bashirs Körper. Mit Hilfe von [[QuarkRo-Kel]] und einigen Mittelsmännern gelingt es Vantika im Körper von Bashir die Kontrolle über den dem [[DeuridiumRakhari]]-Frachter [[Norkova|''Norkova''Croden]], der sich auf erschossen. Doktor Bashir kann nur noch den Tod feststellen und Croden wird von Odo verhaftet. Croden stammt aus dem Weg vom Gamma-Quadranten zu Deep Space Nine befindetund er erzählt Odo, zu übernehmendass er weitere Formwandler im Gamma-Quadranten kennt. Doch Odo glaubt ihn nicht. Bashir Doch Croden versucht Odo seine Geschichte zu mit den Frachter zu fliehen, doch mit einem modifizierten Traktorstrahl, den Commander Benjamin Sisko auf den den beweisen und übergibt ihn ein [[FrachterAmulett]] schießt, gelingt es Sisko, den fliehenden Vantika aufzuhaltenwelches ähnliche wandlerische Fähigkeiten wie Odo hat. Vantika droht den Frachter zu vernichten Bashir untersucht das Amulett und somit auch Bashir zu töten. Doch inzwischen erlangt Bashir durch den modifizierten Traktorstrahl kurzzeitig die Kontrolle über den Körper stellt, dass es Ähnlichkeiten zwischen dem Amulett und deaktiviert die der [[SchutzschildSpezies]]e des Frachters. Bashir wird auf Deep Space 9 zurück gebeamt und dort von Vantika befreitOdo gibt. Die Überreste von Vantika werden durch Kajada vernichtetOdo vermutet darauf, dass das Amulett ein Hinweis für seine [[Heimatwelt]] ist. Nach diesen Ereignissen kann Doch später stellt sich Bashir an heraus, dass dieses Amulett nur als Schlüssel dient und nichts erinnern, was Vantika mit seinem Körper getan Odos Volk zu tun hat. ({{DS9|Der ParasitSteinwandler}})

Nur wenige Wochen später kommt eine Delegation der Kurz darauf besucht [[WadiKai]] an Bord von Deep Space 9. Bashir bekommt mit Sisko Ärger, da dieser keine [[GalauniformOpaka]] dabei hatdie Station. Aber Sisko lädt die Wadi wollen nur ins [[Quarks]] um dort Kai zu spieleneinem Flug durch das Wurmloch in den Gamma-Quadrant ein. Als Quark Bashir und Kira begleiten die beiden. Im Gamma-Quadrant erhält die Wadi beim USS ''Yangtzee Kiang'' einen Notruf und Sisko geht diesem Notruf nach. Im [[DaboOrbit]] betrügt, wollen die Wadi mit Quark ein neues Spiel spielen. Das Spiel heißt eines [[ChulaMond (Satellit)|Mondes]], von dem der Notruf stammt, wird die ''Yangtzee Kiang'' angegriffen und stürzt ab. Ohne Quarks Wissen werden Sisko, Kiraund Bashir überstehen den Absturz unverletzt, jedoch wird Opaka tödlich verletzt und Bashir und Dax Spielfiguren in diesem Spielkann nichts mehr für sie tun. Bashir wacht Die überlebenden Offiziere werden in einem Raum auf Konflikt zwischen den [[Ennis]] und denkt, dass es sich um einen den [[AlbtraumNol-Ennis]] handeltverwickelt. Bashir schreit laut los, um so aus seinem Traum wach zu Die Offiziere werdenvon den Ennis gefangen genommen und dort erfahren sie von den Konflikt zwischen beiden Völkern. Durch Plötzlich greifen die Schreie von Nol-Ennis an, aber der Angriff wird schnell abgewehrt. Nach dem Kampf kümmert sich Bashir finden um die anderen ihnVerletzten. Einige Augenblicke später taucht Opaka lebendig auf und Bashir wird nun klar, dass es kann sich dies nicht um einen Traum handelt. Die vier Offiziere müssen unwissend das Spiel spielen erklären und mehrere Aufgaben lösen. Eine davon ist auch die [[Chandra (Wadi)|Chandra]], die durch ein [[Kraftfeld]] springttoten Ennis erwachen plötzlich wieder zum Leben. Bashir findet einen Lösungsansatz aber dieser funktioniert nicht ganz will diesen Vorfall untersuchen und wird von dem Kraftfeld getroffenbegibt sich zur abgestürzten ''Yangtzee Kiang''. Erst Dax Dort findet Bashir heraus, dass die Lösung und die Offiziere gelangen beiden verfeindeten Gruppen durch das Kraftfeld. Danach werden die Offiziere in einen Raum geführt, indem giftiges eine [[GasMikrobe]] austritt. Bashir findet hier die Lösung und trinkt das in der [[GetränkAtmosphäre]] der Wadi und kann die anderen damit rettenwiederbelebt werden. Währenddessen bemerkt QuarkBashir stellt auch fest, dass seine Spielfiguren die vier Offiziere sind Mikroben nur auf diesem Mond überleben können. Währenddessen versucht Sisko zwischen den Ennis und versucht diese sicher durch das Spiel den Nol-Ennis zu bringen. Der nächste Spielzug verläuft schlecht für Quark; vermitteln, doch er verliert eine Figurscheitert und beide Gruppen bekämpfen sich. Im Spiel Als Sisko angegriffen wird, rettet Bashir Sisko, damit dieser nicht getötet wird . Bashir von einer Energieentladung getroffen will versuchen die Mikroben deaktivieren, damit die Personen in Frieden sterben können und löst sich vor den Augen der anderen aufnicht mehr dieses grausame Leben führen müssen. Das Spiel läuft für Quark schlecht und er muss einen OpfernDoch als Bashir sieht, da sich Quark nicht entscheiden kanndass die Ennis dies zu ihrem Vorteil im Kampf gegen die Nol-Ennis nutzen wollen, wählt das Spiel Dax auslässt er davon ab. Doch Sisko will Kira und Die Offiziere können schließlich von Dax durchbringen und dabei verlieren sie O'Brien gerettet werden und stürzen in einen Abgrundbeamen auf die USS ''Rio Grande''. Quark hat somit das Spiel verlorenKai Opaka bleibt auf dem Mond zurück, doch die vier Offiziere erscheinen wieder gesund im Quarks, da sich das ganze ja nur um ein Spiel gehandelt hatden Ennis und den Nol-Ennis bei der Beendigung ihres Konfliktes zu helfen. ({{DS9|Chula – Das SpielDie Prophezeiung}})

Wenig später besucht der [[Großer Nagus|große Nagus]] [[Zek]] die Station, um dort eine wichtige Konferenz über die neuen Profitquellen im Gamma-Quadrant zu halten. Während der Konferenz ernennt Zek Quark zu seinem Nachfolger. Wenig später sieht es so aus als sei Zek verstorben und Quark übernimmt seinen neuen Posten als Nagus. Kurz darauf Nach diesen Ereignissen wird Doktor Bashir in ein Anschlag auf Quark verübtDorf nach Bajor gerufen. Die Dorfbewohner benötigen dringend die Hilfe des Arztes. Chief O'Brien soll Bashir behandelt danach den verletzten Quark. Später stellt sich herausnach Bajor fliegen, aber O'Brien wünscht, dass Krax jemand anderes Bashir nach Bajor fliegt, da der Sohn des Nagus für die Anschläge verantwortlich istChief Bashir ziemlich nervig findet. Doch in Wirklichkeit ist Zek nicht Tod, dieser hat seinen Tod vorgetäuscht, um Sisko befiehlt O'Brien Bashir nach Bajor zu sehen ob sein Sohn Krax ein guter Nagus ist und von Quark die Macht ergreiftfliegen. Doch in Zeks Augen hat sein Sohn versagt und Zek übernimmt wieder seinen Posten als NagusAuf den Flug nach Bajor wechselt O'Brien kein Wort mit Bashir. ({{DS9|Die Nachfolge}})  Nach einem Zwischenfall in der Holosuite wird der Schließlich bricht Bashir das [[Miradorn|ZwillingsmiradornEis]] [[Ro-Kel]] von dem [[Rakhari]] [[Croden]] erschossenund fängt ein Gespräch mit O'Brien an. Doktor Bashir kann nur noch den Tod feststellen und Croden wird von Odo verhaftet. Croden stammt aus dem Gamma-Quadranten und er erzählt Odo, dass er im Gamma-Quadranten kennt. Doch Odo glaubt bietet O'Brien an ihn nicht. Doch Croden versucht Odo seine Geschichte "Julian" zu beweisen und übergibt ihn ein Amulettnennen, welches ähnliche wandlerische Fähigkeiten wie Odo doch O'Brien hatdamit Schwierigkeiten. Auf Bajor erfährt Bashir untersucht das Amulett und stellt, dass es Ähnlichkeiten zwischen er in dem Amulett und der Dorf den [[SpeziesSirah (Titel)|Sirah]] von Odo gibt. Odo vermutet daraufretten muss, dass damit dieser das Amulett ein Hinweis für seine Dorf vor dem [[HeimatweltDal'Rok]] istretten kann. Aber Bashir kann nicht viel für den Sirah tun. Doch später stellt sich herausAls das Dal'Rok wieder auftaucht rettet der Sirah das Dorf, dass dieses Amulett nur als Schlüssel dient doch dies ist zu viel den alten Mann und nichts mit Odos Volk zu tun hater bricht zusammen. ({{DS9|Der Steinwandler}})  Kurz darauf besucht [[Kai]] [[Opaka]] die Station. Sisko lädt die Kai vor seinem Tod ernennt der Sirah O'Brien zu einem Flug durch das Wurmloch in den Gamma-Quadrant einseinem Nachfolger. Bashir und Kira begleiten die beiden. Im Gamma-Quadrant erhält die USS unterstützt O'Brien in seiner Rolle als Sirah, obwohl sich O'Yangtzee Kiang'' einen Notruf und Sisko geht diesem Notruf nachBrien sehr unwohl dabei fühlt. Im Orbit des [[Mond (Satellit)|MondesHovath]], von dem der Notruf stammteigentlich der neue Sirah werden sollte, wird die ist auf O''Yangtzee Kiang'' angegriffen Brien eifersüchtig und stürzt abversucht diesen sogar zu töten. Sisko, Kira Aber O'Brien und Bashir überstehen den Absturz unverletzt, können ihn jedoch wird Opaka tödlich verletzt und Bashir kann nichts mehr für sie tunaufhalten. Die überlebenden Offiziere werden in einem Konflikt zwischen den [[Ennis]] und den [[Nol-Ennis]] verwickelt. Die Offiziere werden von den Ennis gefangen genommen und dort beiden erfahren sie von den Konflikt zwischen beiden Völkern. Plötzlich greifen die Nol-Ennis anHovath, aber der Angriff wird schnell abgewehrt. Nach dem Kampf kümmert sich Bashir um dass die Verletzten. Einige Augenblicke später taucht Opaka lebendig auf und Bashir kann sich dies Bewohner ihm nicht erklären und auch die toten Ennis erwachen plötzlich wieder zum Lebenmehr vertrauen, nachdem er einmal versagt hat. Bashir will diesen Vorfall untersuchen und begibt sich zur abgestürzten Am nächsten Abend muss O'Brien als Sirah das Dal'Yangtzee Kiang'Rok aufhalten. Doch O'Brien scheitert bei dieser Aufgabe. Dort findet Bashir herauserkennt sofort, dass die beiden verfeindeten Gruppen durch es sich um eine [[Mikrobe]] in der [[Atmosphäre]] wiederbelebt werdenList des alten Sirah handelt. Bashir stellt auch festO'Brien soll als Sirah versagen, dass damit die Mikroben nur auf diesem Mond überleben könnenBewohner Hovath wieder vertrauen. Währendessen versucht Sisko zwischen den Ennis und den Nol-Ennis Bashir überzeugt Hovath seine Aufgabe als Sirah wahr zu vermitteln, doch er scheitert nehmen. Hovath kann das Dorf retten und beide Gruppen bekämpfen sich. Als Sisko angegriffen wird, rettet Bashir Sisko, damit dieser nicht getötet wird. Bashir will versuchen die Mikroben deaktivieren, damit die Personen in frieden sterben können und nicht mehr dieses grausame Leben führen müssennun als neuer Sirah akzeptiert. Doch als Bashir sieht, dass die Ennis dies zu ihrem Vorteil im Kampf gegen die Nol-Ennis nutzen wollen, lässt er davon ab. Die Offiziere können schließlich von Dax und O'Brien gerettet werden und beamen auf die [[USS Rio Grande|USS ''Rio Grande'']]. Kai Opaka bleibt auf dem Mond kehren darauf nach Deep Space Nine zurück, um den Ennis und den Nol-Ennis bei der Beendigung ihres Konfliktes zu helfen. ({{DS9|Die ProphezeiungLegende von Dal'Rok}})

Nach diesen Ereignissen wird Doktor Wenige Wochen später hilft Bashir in ein Dorf nach Bajor gerufen. Die Dorfbewohner benötigen dringend die Hilfe des Arztes. Chief O'Brien soll Bashir nach Bajor fliegen, aber O'Brien wünscht, dass jemand anderes Bashir nach Bajor fliegt, da der Chief Bashir ziemlich nervig findet. Doch Sisko befiehlt O'Brien Bashir nach Bajor zu fliegen. Auf den Flug nach Bajor wechselt O'Brien kein Wort mit Bashir. Schließlich bricht Bashir das [[Eis]] und fängt ein Gespräch mit O'Brien an. Bashir bietet O'Brien an ihn "Julian" zu nennen, doch O'Brien hat damit Schwierigkeiten. Auf Bajor erfährt Bashir, dass er in dem Dorf den verletzten [[Sirah (Titel)|SirahMullibok]] retten muss, damit dieser das Dorf vor auf dem bajoranischen Mond [[Dal'RokJeraddo]] retten kannzu behandeln. Aber Bashir kann nicht viel für den Sirah tun. Als das Dal'Rok wieder auftaucht rettet der Sirah das Dorfwill Mullibok mit nach Deep Space 9 mitnehmen, doch dies ist zu viel den alten Mann und er bricht zusammen. Kurz vor seinem Tod ernennt ernennt der Sirah O'Brien zu seinem Nachfolger. Bashir unterstützt O'Brien in seiner Rolle als Sirah, obwohl dieser weigert sich O'Brien sehr unwohl dabei fühlt. [[Hovath]] der eigentlich der neue Sirah werden sollte, ist auf O'Brien eifersüchtig und versucht diesen sogar zu töten. Aber O'Brien und Darauf erklärt Bashir können ihn jedoch aufhalten. Die beiden erfahren von Hovath, dass die Bewohner ihm nicht mehr vertrauenKira, nachdem er einmal versagt hat. Am nächsten Abend muss O'Brien als Sirah das Dal'Rok aufhalten. Doch O'Brien scheitert bei dieser Aufgabe. Bashir erkennt sofort, dass es sich um eine List des alten Sirah handelt. O'Brien wie sie Mullibok pflegen soll als Sirah versagen, damit die Bewohner Hovath wieder vertrauen. Bashir überzeugt Hovath seine Aufgabe als Sirah wahr zu nehmen. Hovath kann das Dorf retten und wird nun als neuer Sirah akzeptiert. Bashir und O'Brien kehren darauf nach Deep Space Nine zurück. ({{DS9|Die Legende von Dal'RokMulliboks Mond}})

Wenige Wochen Einige Zeit später hilft erscheint eine Anomalie bei Deep Space 9, welche verursacht, das Gedanken Wirklichkeit werden. Zu dieser Zeit hat Bashir den verletzten wieder eine Verabredung mit Dax. Bashir wird aber wieder von ihr abgewiesen. Als Bashir sich später in seinem Quartier befindet, erscheint Dax und will ihn [[Kuss|küssen]]. Bashir hält dies erst für einen [[MullibokScherz]], aber er gibt sich ihr hin. Die beiden werden wenige Augenblicke später auf dem bajoranischen Mond die [[Operations Center|OPS]] gerufen. Dort präsentiert Sisko einige Phantasiegestalten darunter auch [[Rumpelstilzchen]] und [[Buck Bokai]], welche plötzlich aufgetaucht sind. Dax soll darauf die Anomalie analysieren, als plötzlich eine zweite Dax erscheint. Es stellt sich heraus, dass die eine Dax eine Phantasiegestalt von Bashir ist. Allerdings stellt Bashir fest, dass all diese Phantasiegestalten real sind. Bashir ist seine Phantasiegestalt von Dax sehr peinlich, doch Dax nimmt ihm das nicht übel, schließlich ist sie auch mal ein junger Mann gewesen. Bashir und Dax untersuchen weiter die Anomalie und erkennen Ähnlichkeiten mit einer Anomalie, welche im [[23. Jahrhundert]] das [[JeraddoHanoli-System]] vernichtet hat. Die Anomalie wird zu behandelneiner Bedrohung für die Station und das gesamte [[Bajoranisches System|bajoranische System]]. Durch die Erschütterungen, welche durch die Anomalie ausgehen, wird die Phantasie Dax verletzt und Bashir will Mullibok mit nach Deep Space 9 mitnehmenkümmert sich um sie. Die Anomalie droht zu kollabieren und alles zu vernichten, doch dieser weigert Sisko erkennt, dass es sich bei der Anomalie auch um ein Produkt der Phantasie handelt. Sisko befiehlt allen so zu tun, als würde diese Anomalie nicht existieren und plötzlich löst sichdiese aus. Darauf erklärt Bashir KiraAuch die Phantasiegestalten verschwinden plötzlich. Es stellt sich heraus, wie dass eine fremde Spezies aus dem Gamma-Quadranten in Form dieser Phantasiegestalten in Kontakt mit der Föderation getreten sind und sie Mullibok pflegen sollauch weiterhin Kontakt mit der Föderation haben wollen. ({{DS9|Mulliboks MondMacht der Phantasie}})

Einige Zeit später erscheint eine Anomalie bei Deep Space 9, welche verurschacht, das Gedanken Wirklichkeit werden. Zu dieser Zeit hat Bashir wieder Als eine Verabredung mit Dax. Bashir wird aber wieder Delegation von ihr abgewiesen. Als Bashir sich später in seinem Quartier befindet, erscheint Dax und will ihn [[Kuss|küssenBotschafter]]n der Föderation an Bord der Station kommt, hat Bashir die Aufgabe den Botschaftern die Station zu zeigen. Bashir hält dies erst für einen [[Scherz]]hat Probleme mit ihnen, aber er gibt sich ihr hin. Die beiden werden wenige Augenblicke später auf da die [[Operations Center|OPS]] gerufenBotschafter ihn nicht respektieren. Dort präsentiert Sisko einige Phantasiegestalten darunter auch Botschafterin [[RumpelstilzchenTaxco]] und [[Buck Bokai]], welche plötzlich aufgetaucht sind. Dax soll darauf die Anomalie analysieren, als plötzlich eine zweite Dax erscheint. Es stellt will sich heraussogar beim Sternenflottenkommando über Bashir beschweren, dass da so ein unerfahrener Offizier sie durch die eine Dax eine Phantasiegestalt von Bashir istStation führt. Allerdings stellt Bashir fest, dass all diese Phantasiegestalten real sind. Bashir st seine Phantasiegestalt bittet Sisko ihn von Dax sehr peinlichdieser Aufgabe abzuziehen, doch Dax nimmt ihm aber Sisko lässt das nicht übel, schließlich ist sie auch mal ein junger Mann gewesenzu. Während Bashir und Dax untersuchen weiter die Anomalie und erkennen Ähnlichkeiten mit einer AnomalieBotschafter durch einen Korridor führt, welche im bricht durch eine Fehlfunktion des Computers ein [[23. JahrhundertFeuer]] das [[Hanoli-System]] vernichtet hat. Die Anomalie wird zu einer Bedrohung für aus, welches Bashir und die Station und das gesamte bajoranische SystemBotschafter einschließt. Durch die Erschütterungen, welche durch die Anomalie ausgehen, wird die Phantasie Dax verletzt und Bashir kümmert sich um sie. Die Anomalie droht zu kollabieren handelt schnell und alles zu vernichten, doch Sisko erkennt, dass es sich bei der Anomalie auch um ein Produkt der Phantasie handeltbringt die Botschafter in einen Schacht in Sicherheit. Sisko befiehlt allen so zu tun, als würde diese Anomalie nicht existieren Wenig später werden Bashir und plötzlich löst sich diese aus. Auch die Phantasiegestalten verschwinden plötzlichBotschafter von einem Rettungstrupp befreit. Es stellt sich heraus, dass Die Botschafter sind von Bashirs schneller Reaktion begeistert und schlagen ihn für eine fremde Spezies aus dem Gamma-Quadranten in Form dieser Phantasiegestalten in Kontakt mit der Föderation getreten ist und sie auch weiterhin Kontakt mit der Föderation haben wollenAuszeichnung vor. ({{DS9|Macht der PhantasiePersönlichkeiten}})

Als eine Delegation von Wenig später kommt das klingonische Schiff [[BotschafterIKS Toh'Kaht|IKS ''Toh'Kaht'']]n der Föderation an Bord der Station kommtfrüher als erwartet aus dem Gamma-Quadranten zurück. Nachdem das Schiff das Wurmloch passiert hat, hat Bashir die Aufgabe den Botschaftern explodiert dieses. Nur ein Überlebender kann sich auf die Station zu zeigenbeamen. Doch Bashir hat Probleme mit ihnen, da die Botschafter ihn nicht respektieren. Botschafterin kann nichts für den Klingonen [[TaxcoHon'Tihl]] will sich sogar beim Sternenflottenkommando über Bashir beschweren, da so ein unerfahrener Offizier sie durch die Station führttun und dieser stirbt. Bashir bittet Sisko ihn von dieser Aufgabe abzuziehenstellt fest, aber Sisko lässt das nicht zudass der Klingone an den Folgen schwerer Phaserverbrennungen gestorben ist. Während Bashir sich der Klingone an Bord beamt, werden die Botschafter durch einen Korridor führt, bricht [[Führungsoffizier]]e von Deep Space 9 durch eine Fehlfunktion des Computers ein [[FeuerTelepathie|telepathische]] [[Matrix]] der [[Saltah'na]] ausinfiziert und diese beginnen sich seltsam zu Verhalten. Es kommt durch den Einfluss der Matrix zu einem Machtkampf zwischen Kira und Sisko auf der Station. Die Offiziere stellen sich entweder auf die Seite von Sisko oder Kira. Obwohl auch Bashir infiziert ist, welches verhält sich dieser in diesem Konflikt neutral. Auch Odo bemerkt diese Vorgänge und berichtet dieses Bashir. Da Bashir und in seinen Wahn eine Gefahr für die Botschafter einschließtStation sieht, beginnt dieser nach einem Heilmittel zu forschen. Er findet schließlich nach langer Forschung ein Gegenmittel. Bashir handelt schnell Inzwischen eskaliert der Streit zwischen Kira und Sisko und bringt es kommt zum Kampf. Doch Odo gelingt es die Botschafter Offizier, da diese ihn noch immer vertrauen, in einen Schacht in Sicherheit[[Andockschleuse|Andockschleuse 4]] zu locken. Wenig später werden Bashir und gelingt es dort die Botschafter Offiziere von einem Rettungstrupp befreit. Die Botschafter sind von Bashirs schneller Reaktion begeistert der Matrix zu befreien und schlagen ihn für eine Auszeichnung vorOdo lässt diese Matrix in den [[Weltraum]] entweichen. ({{DS9|PersönlichkeitenMeuterei}})

Wenig später kommt das klingonsche Schiff [[IKS Toh'Kaht|IKS ''Toh'Kaht'']] früher als erwartet aus dem Gamma-Quadranten zurück. Nachdem das Schiff das Wurmloch passiert hat, explodiert dieses. Nur ein überlebender kann sich auf die Station beamen. Doch Bashir kann nichts für den Klingonen [[Hon'Tihl]] tun und dieser stirbt. Bashir stellt fest, dass der Klingone an den Folgen schwerer Phaserverbrennungen gestorben ist. Während sich der Klingone an Bord beamt werden die [[Führungsoffizier]]e von Deep Space 9 durch eine [[Telepathie|telepathische]] [[Matrix]] der [[Saltah'na]] infiziert und diese beginnen sich seltsam zu Verhalten. Es kommt es durch den Einfluss der Matrix zu einem Machtkampf zwischen Kira und Sisko auf der Station. Die Offiziere stellen sich entweder auf die Seite von Sisko oder Kira. Obwohl auch Bashir infiziert ist, verhält sich dieser in diesem Konflikt neutral. Auch Odo bemerkt diese Vorgänge und berichtet dieses Bashir. Da Bashir in seinen Wahn eine Gefahr für die Station sieht, beginnt dieser nach einem Heilmittel zu forschen. Er findet schließlich nach langer Forschung ein Gegenmittel. Inzwischen eskaliert der Streit zwischen Kira und Sisko und es kommt zum Kampf. Doch Odo gelingt es die Offizier, da diese ihn noch immer vertrauen, in [[Andockschleuse|Andockschleuse 4]] zu locken. Bashir gelingt es dort die Offiziere von der Matrix zu befreien und Odo lässt diese Matrix in den [[Weltraum]] entweichen. ({{DS9|Meuterei}}) Gegen Ende des Jahres behandelt Bashir den Cardassianer [[Aamin Marritza]] gegen die Symptome des [[Kalla-Nohra-Syndrom]]. Marritza gibt sich zu dieser Zeit als [[Gul]] [[Darhe'el]] aus. Kira erkennt Darhe'el sofort und lässt diesen sofort verhaften. Bashir und Odo finden jedoch heraus, dass es sich bei Darhe'el sich um den Datenverwalter Marritza handelt. Marritza hat sich als Darhe'el ausgegeben, um eine [[Strafe ]] für die Gräueltaten, welche die Cardassianer den Bajoranern angetan haben, zu verbüßen. Marritza wird darauf freigesprochen. Wenig später wird Marritza von den Bajoraner [[Kainon]] ermordet. ({{DS9|Der undurchschaubare Marritza}})  Ende des Jahres kommt es durch [[Vedek]] [[Winn Adami]] zu einem Konflikt zwischen der Föderation und den Bajoranern auf der Station. Zu dieser Zeit wird [[Fähnrich]] [[Aquino]] von der Bajoranerin [[Neela]] getötet. Bashir untersucht die Überreste von Aquino. Kurz darauf kann Sisko mit Hilfe von Vedek [[Bareil Antos]] diesen Konflikt beilegen. ({{DS9|Blasphemie}})

Kurz darauf werden Bashir und O'Brien von den [[T'Lani]] und [[Kelleruner]]n, gebeten bei der Vernichtung einer [[biologische Waffe|biologischen Waffe]], genannt [[Harvester]], zu helfen. Nach einer Woche harter Arbeit gelingt es den Wissenschaftlern diese Waffe zu vernichten. Nachdem die Harvester fast vollständig vernichtet worden ist, werden die Forscher angegriffen und getötet. Bashir und O'Brien gelingt es im letzten Moment zu entkommen und auf den Planeten [[T'Lani III]] zu beamen. Die Botschafter der T'Lani und der Kelleruner erklären die beide Offiziere für tot und schicken eine Botschaft nach Deep Space Nine. Auf dem Planeten hat sich O'Brien mit der Harvester infiziert und droht zu sterben. Bashir tut alles um seinen Freund zu retten und versucht eine Nachricht nach Deep Space Nine zu schicken, in der Hoffnung, dass beide gerettet werden. Sisko glaubt, dass an der Botschaft der T'Lani und der Kelleruner etwas faul ist und fliegt zu dem Planeten T'Lani III. Auf der Oberfläche werden Bashir und O'Brien von den Botschaftern beider Völker gefunden. Diese wollen sie töten, da die beiden über die Harvester bescheid Bescheid wissen. Im letzten Moment könne beide gerettet werden und werden von Sisko an Bord des Shuttles gebeamt. Die T'Lani und die Kelleruner greifen das Shuttle zwar an, aber Sisko kann entkommen. Nachdem Bashir und O'Brien fast gestorben wären, bemerken sie das dieses Erlebnis sie zusammen geschweißt hat und die beiden werden Freunde. ({{DS9|Das Harvester-Desaster}})

Nachdem O'Brien von den Cardassianern verhaftet worden ist, wird er auf [[Cardassia]] wegen des [[Schmuggel|Waffenschmuggels]] für den Maquis ageklagtangeklagt. Bashir hilft auf Deep Space 9 nachzuweisen, dass O'Brien unschuldig ist. Ihm gelingt es schließlich auch nachzuweisen, dass O'Brien unschuldig ist und die Cardassianer hinter der ganzen Sache stecken. ({{DS9|Das Tribunal}})

Kurz vor Bashirs 30. Geburtstag erscheint Quark mit einem [[Letheaner]] namens [[Altovar]]. Dieser möchte von Bashir [[biomimetisches Gel]] kaufen. Da dies aber illegal ist, verweigert Bashir den Verkauf. Später erwischt der Doktor Altovar auf der Krankenstation beim Versuch, das Gel zu stehlen. Der Letheaner versucht daraufhin Bashir mittels eines [[Telepathie|telepathischen]] Angriffs zu töten. Er setzt Bashir außer Gefecht und rennt aus der Krankenstation, wo er von Odo festgenommen wird. Bashir kömpft kämpft unterdessen auf der Krankenstation gegen den telepatischen telepathischen Angreifer, der ihm vorspielt, er würde selbst altern. Bashir überlebt den Angriff, indem er den seinen [[Verstand]] von dem telepathischen Eindringling [[Sterilisation|sterilisiert]] und kommt in der Krankenstation wieder zu Bewusstsein. ({{DS9|Ferne Stimmen}})

Die Führer der Cardassianischen Regierung fliehen von Cardassia und sie bitten Sisko um Hilfe. Sisko fliegt mit der ''Defiant'' in den cardassianischen Raum um sich dort mit den Cardassianischen cardassianischen Führen zu treffen. Auf den Weg dort hin trifft die ''Defiant'' auf die Überreste der Cardassianischen cardassianischen Flotte, welche von den Klingonen angegriffen worden ist. Bashir will den Verwundeten helfen, aber Worf und Sisko lehnen dies ab, da es sich um eine Falle der Klingonen handeln könnte. Die ''Defiant'' erreicht das Schiff der Cardassianer, aber diese werden von den Klingonen angegriffen. Die ''Defiant'' greift die Klingonen an und es gelingt Sisko die Cardassianer an Bord der ''Defiant'' zubeamenzu beamen. Die ''Defiant'' flieht zurück nach Deep Space 9 und dort wird das Schiff bereits von der Klingonischen klingonischen Flotte erwartet. Die Klingonen greifen die Station an und Bashir bereitet sich auf der Krankenstation auf die Verletzten vor. Er muss auch einige Klingonenangriffe abwehren. Bashir gelingt es sogar Odo vor einem Klingonenangriff zu retten. Schließlich können die Klingonen von der Station zurückgedrängt werden und sie ziehen sich schließlich zurück. Zwar haben die Klingonen den Angriff auf die Station abgebrochen aber nun herrscht Krieg zwischen der Föderation und den Klingonen. ({{DS9|Der Weg des Kriegers, Teil II}})

Schließlich wird Siskos Schiff vom Dominion entdeckt und Angegriffen. Sisko gelingt es zwar zu entkommen, aber das Schiff stürzt auf einen Planeten. Während des Angriffs wurde Jadzia Dax verletzt und auf der Planetenoberfläche kümmert sich Bashir um ihre Verletzungen. Währenddessen erkunden Nog und Garak die Gegend, als sie plötzlich von Jem'Hadar gefangen genommen werden. Die Jem'Hadar und ihr Vorta [[Keevan]] sind ebenfalls auf dem Planeten gestrandet. Keevan ist schwer verletzt und verlangt für die Freilassung von Nog und Garak Sisko und einen Arzt als Austausch. Sisko stimmt den Gefangenenaustausch zu, um seine Männer zu retten. Sisko und Bashir werden zu Keevan gebracht und dort muss Bashir den schwer verletzten Keevan behandeln. Da Keevan kaum noch Ketracel-White Vorräte hat und bald nicht mehr seine Jem'Hadar kontrollieren kann, verrät Keevan diese an Sisko. Keevan will damit erreichen, dass er so gerettet wird. Bei den darauffolgenden Kampf werden alle Jem'Hadar getötet und Kevean Keevan liefert sich freiwillig an Sisko aus. ({{DS9|Entscheidungen}})

Als Morn scheinbar ums Leben gekommen ist, besucht Bashir die Gedenkfeier von Morn. Da Bashir die [[Lurianer|lurianischen]] Bräuche kennt, bringt er zu Ehren von Morn ein [[Getränk]] mit, damit Morn dieses symbolisch mit ins Nachleben nehmen kann. Später stellt sich heraus, dass Morn seinen tod Tod nur vorgetäuscht hat. ({{DS9|Wer trauert um Morn?}})

Bashir wird für eine medizinischen [[Konferenz]] auf [[Casperia Prime]] eingeladen und Bashir freut sich sehr auf diese Konferenz. Bevor er aufbricht behandelt er die ausgerenkte Schulter von O'Brien. Bashir legt sich schlafen und wird kurz darauf geweckt. Obwohl Bashir um diese Uhrzeit aufstehen wollte, kommt ihm die Nacht ziemlich kurz vor. Er und sämtliche Führungsoffiziere werden auf die OPS gerufen. Dort angekommen erfährt Bashir, dass er nicht nach Casperia Prime fliegt, sondern an einer Befragung von [[Vizedirektor]] [[Luther Sloan]] aus der [[Abteilung für Interne Angelegenheiten]] des [[Sternenflottengeheimdienst]]es teilnimmt. Sloan befragt später Bashir vor allem wegen der Gefangenschaft beim Dominion ein Jahr zuvor. Die Befragung verläuft freundlich und Bashir ist erleichtert, dass er es hinter sich hat. Später meldet sich O'Brien bei Bashir, er erwähnt, dass Solan Bashir Verdächtigt ein Spion des Dominions zu sein. Kurz darauf wird Bashir wieder von Sloan verhört, aber diesmal ist der Ton schärfer. Solan wirft Bashir vor für das Dominion arbeitet. Bashir wird von Sloan verhaftet und in den Arrest gebracht. Sisko verspricht Bashir, ihn wieder herauszuholen. Als Bashir sich in der Arrestzelle befindet, wird er plötzlich fortgebeamt fort gebeamt und er wird von Weyoun empfangen. Weyoun freut sich seinen besten Spion wieder zu haben, aber Bashir streitet dies ab. Schließlich wird Bashir von der Crew der ''Defiant'' gerettet. Als sich Bashir wieder an Bord der ''Defiant'' befindet, glaubt ihn keiner mehr, selbst Sisko hält Bashir für einen Spion des Dominions. Als Bashir aus Versehen O'Briens Schulter berührt, hat dieser keine Schmerzen und er spricht O'Brien auf seine Schulter an. Schließlich merkt Bashir das etwas faul ist und er stellt O'Brien eine Fangfrage, auf die O'Brien herein fällt. Bashir will bei dem Spiel nicht mehr mitmachen und er bemerkt, dass er sich auf einem [[Holodeck]] befindet. Plötzlich erscheint Solan und klärt Bashir auf. Solan wollte mit diesem Programm die Loyalität von Bashir testen. Solan will Bashir für [[Sektion 31]], einem inoffiziellem [[Geheimdienst]] der Sternenflotte rekrutieren. Da diese Organisation illegal ist, lehnt Bashir ab und er wird nach Deep Space 9 zurück gebracht. Nach dem Julian Bashir dem Führungsstab von Deep Space 9 Bericht erstattet, schlägt Captain Sisko vor, weitere Versuche zu akzeptieren, um so als Spion in der Sektion 31 zu dienen. ({{DS9|Inquisition}})

Bashirs Trick geht schließlich auf und eines Nachts taucht Sloan auf und fordert das Heilmittel von ihm. Da Bashir mit Sloans erscheinen gerechnet hat, gelingt es ihm Sloan gefangen zu nehmen. Sloan bemerkt den Trick mit Bashirs Heimittel Heilmittel und gibt zu, überrascht zu sein. Bashir und O'Brien versuchen mit [[Romulanischer Gedächtnisscanner| romulanischen Gedächtnisscanner]] in seinen Geist einzudringen, um so an die Informationen für das Heilmittel zu gelangen. Aber mit Hilfe einer [[Neurodepolarisationsvorrichtung]] begeht Sloan Selbstmord und er droht innerhalb einer Stunde zu sterben. Mit Hilfe einer [[Multitronischer engrammatischer Übersetzer|multitronischen engramatischen Übersetzers]] dringen die beiden in das Gehirn und den Geist von Sloan ein, um so an die Information zu gelangen. Bashir und O'Brien wissen das sie nur wenige Zeit haben, um an die Informationen in Sloans Geist heranzukommen und Sloan tut alles um dies zu verhindern. Schließlich gelingt es den beiden die Information zu bekommen. Sloan versucht Bashir mit in den Tod zu reißen und bietet ihn noch viele weitere Informationen über Sektion 31 an. Bashir kann dieser Falle nicht widerstehen und will noch mehr Information, aber O'Brien kann Bashir davon überzeugen den sterbenden Geist von Sloan zu verlassen. Den beiden gelingt es noch rechtzeitig Sloan zu verlassen und mit dem Heilmittel gelingt es Bashir Odo zu heilen. ({{DS9|Extreme Maßnahmen}})

Als Julian Bashir erkennt, dass er von seinen genetisch Aufgewertet worden ist, kühlt sich seine Beziehung zu seinem Vater ab und schließlich bricht der Kontakt zwischen den beiden komplett ab. Julian Bashir ist entäuscht enttäuscht über seinen Vater, da dieser außer ihm, seinen Sohn nichts richtiges zu stande Stande gebracht hat und ständig die Berufe wechselt. ({{DS9|Dr. Bashirs Geheimnis}})

2373 lädt Doktor Lewis Zimmerman Bashirs Eltern auf die Station Deep Space 9 ein, damit Zimmerman soviel wie möglich Informationen über Julian Bashir bekommt. Dabei kommt auch herrausheraus, dass Richard Bashir für die genetische Aufwertung seines Sohnes verantwortlich ist. Um seinen Sohn zu schützen, damit dieser nicht aus der Sternenflotte entlassen wird, nimmt Richard Bashir die gesamte Schuld, für die genetische Aufwertung seines Sohnes, auf sich. Richard Bashir kommt darauf für einige Monate in eine Strafkolonie. Nach diesen Ereignissen versöhnen sich Vater und Sohn wieder. Julian Bashir verspricht seinen Vater, ihn regelmäßig zu besuchen. ({{DS9|Dr. Bashirs Geheimnis}})

Als [[Miles O'Brien]] 2369 das erste mal auf Julian Bashir trifft, hält er ihn für einen jungen arroganten Offizier. O'Brien versucht jeden Kontakt mit Bashir zu vermeiden, da ihn Bashir ziemlich auf die Nerven geht. Aufgrund von Bashirs arroganten Verhalten, beginnt O'Brien Bashir zu hassen. Als Sisko die beiden auf eine gemeinsame Mission nach Bajor schickt, versucht O'Brien sich vor dieser Mission zu drücken. Er bittet Sisko jemand anderen zu schicken, aber Sisko lehnt dies ab. Aber der Chief hat Schwierigkeiten mit dem Arzt und nimmt wiederwillig widerwillig die Mission an. Während der Mission versucht sich Bashir mit O'Brien anzufreunden. Bashir bietet O'Brien an, ihn Julian zu nennen, da es ihm unangenehm ist, dass O'Brien ihn Sir nennt. Während der gemeinsamen Mission auf Bajor beginnt O'Brien langsam zu akzeptieren. ({{DS9|Die Legende von Dal'Rok|Die Erforscher}})

2370 toleriert O'Brien mittlerweile Bashir, obwohl er ihn noch immer für Arrogant hält. Als die beiden zusammen Racquetball spielen, geht ihn Bashirs Verhalten wieder ziemlich auf die Nerven und dieser beschwert sich sogar bei seiner Frau über das arogante arrogante Verhalten von Bashir. Doch O'Brien will eine Revanche und spielt wieder gegen Bashir. Als jedoch Bashir O'Brien absichtlich gewinnen lässt, regt sich dieser noch mehr über Bashir auf. Später nutzt Quark die Rivalität der beiden aus, um ein Spiel zu veranstalten, auf den Wetten laufen sollen von denen Quark profitiert. Doch die beiden wollen sich darauf nicht einlassen. ({{DS9|Rivalen}})

Nachdem O'Briens Frau Keiko 2371 für ein Jahr auf Bajor arbeitet, verbringen die beiden Freunde ihre gesamte Freizeit. O'Brien und Bashir werden beste Freunde mit vielen gemeinsamen Hobbys. Sie spielen zusammen Racquetball, DartDarts, verbringen die gemeinsame Zeit in der Holosuite oder im Quarks. Nachdem Keiko O'Brien 2372 nach Deep Space 9 zurückkehrt bemerkt sie die tiefe Freundschaft zwischen ihren Mann und Bashir. ({{DS9|Das Haus des Quark|Die Übernahme}})

Ende des Jahres hilft Bashir bei der Behandlung Garak, nachdem sein Implantat ausgefallen ist. Als Garak unter Entzugserscheinungen leidet, beschwert sich Garak über sein Leben und vorallem vor allem das seine einzige Abwechslung das wöchentliche Essen mit dem naiven Bashir ist. Bashir bedauert es, dass Garak so denkt, doch trotzdem begibt sich Bashir zu Enabran Tain, damit dieser Garak hilft. Durch die Hilfe von Tain, Bashir Garak behandeln und dieser bedankt sich bei Bashir für seine Bemühungen. ({{DS9|Das Implantat}})

Als Garak unerlaubt in Bashirs Geheimagentenprogramm eindringt und miterlebt, wie es Julian gelingt, alle Führungsoffiziere durch den Einsatz seiner [[Fantasie]] zu retten, merkt er, dass dieser sich von einem naiven jungen Abenteurer zu einem creativen kreativen Offizier entwickelt hat. Er lernt aus dieser Erfahrung mit seinem Freund, wie das Schwelgen in der Fantasie den Geist kreativ macht. ({{DS9|Unser Mann Bashir}})