Aber auch auf der der [[Sternenflottenakademie]] ist der junge Bashir sportlich sehr aktiv. Bashir spielt dort aktiv [[Racquetball]]. Bashir wird Teamcaptain der Racquetballmannschaft der Akademie. Bashir wird sogar Sektorenmeister. Bashir gewinnt dieses entscheidene entscheidende Spiel gegen einen Vulkanier. ({{DS9|Rivalen}})

Während seiner Zeit auf der Akademie verliebt sich Bashir in [[Palis Delon]]. Ihr Vater leitet eine medizinische Abteilung in [[Paris]] und bietet Bashir den Posten als Chef der Chirugie Chirurgie an. Bashir überlegt lange diesen Posten anzunehmen und die Sternenflotte zu verlassen. Schließlich entscheidet sich Bashir dafür die Sternenflotte abzuschließen und lehnt das Angebot ab. Kurz darauf trennen sich Bashir und Delon. ({{DS9|Das Harvester-Desaster}})

Bei seiner Abschlußprüfung Abschlussprüfung hat Bashir einige Probleme. Er braucht sehr lange um seine Augaben Aufgaben zu lösen und gehört mit zu den letzten, welche die Prüfung abschließen. Aber trotz dieser Mühen besteht Bashir die Abschlußprüfung Abschlussprüfung erfolgreich. Bashir wäre auch fast Klassenbester geworden, aber er verwechselt während der Abschlußprüfung Abschlussprüfung eine [[präganglionische Faser]] mit einem [[postganglionischer Nerv|postganglionischen Nerv]]. Diese Frage hat Bashir aber absichtlich falsch beantwortet, damit er nicht den Abschluß Abschluss als Klassenbester abschließt. ({{DS9|Q - Unerwünscht|Ferne Stimmen|Die Erforscher}})

Nach seinem Abschluß Abschluss an der Sternenflottenakademie, lässt sich Bashir im [[Rang]] eines [[Lieutenant Junior Grade]] auf den neuen Sternenflottenaußenposten auf Deep Space 9 versetzen. Er möchte auf diesem entlegenden entlegenen Außenposten neue Abenteuer erleben. [[2369]] wird er mit einem [[Weitere Schiffe der Oberth-Klasse|Föderationsraumschiff]] zur Station gebracht. Auf den Flug zur Station lernt er [[Jadzia Dax]] kennen, diese wird ebenfalls nach Deep Space 9 versetzt. Er freundet sich mit ihr an und will sich gleich mit ihr verabreden. Auf der Station zeigt ihr [[Major]] [[Kira Nerys]] die [[Krankenstation]]. Obwohl die Krankenstation schwer beschädigt ist, ist Bashir davon begeistert. Genau sowas hat sich Bashir erhofft, dass er sich was neues Aufbauen kann und den armen [[Bajoraner]]n helfen kann. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil I}})

Nach einer Expedition in den Gamma-Quadrant, wird eine junge Frau namens [[Vash]] mit nach Deep Space 9 gebracht. Die [[Offizier]]e an Bord der Station können sich nicht erklären, wie sie ohne das Wissen von den Wurmloch in den Gamma-Quadrant gekommen ist. Bashir untersucht sie nach Krankheiten, aber er stellt fest, dass sie gesund ist. Bashir zeigt ein Intresse Interesse an ihr. Es stellt sich heraus, dass Vash mit [[Q]] zusammen im Gamma-Quadrant gewesen ist. Bashir besucht Vash in ihrem [[Quartier]] und will sich darauf im Replimat mit ihr verabreden. Q erscheint heimlich hinter Bashir und schneidet Grimassen ohne das es Bashir bemerkt. Kurz darauf wartet Bashir auf Vash im Replimat. Da erscheint Q als [[Kellner]] und will ihm die Verabredung ausreden. Als sich Bashir dies nicht ausreden lässt, wird Bashir durch den Einfluss von Q müde und legt sich schlafen. Bashir verschläft die darauf folgenden Ereignisse die beinah zur Vernichtung der Station geführt hätten. ({{DS9|Q - Unerwünscht}})

Bei einer Expedition in den Gamma-Quadrant wird eine fremde Technologie mitgebracht. Bashir hält dieses Gerät für einen medizinischen [[Scanner]] und möchte diesen untersuchen. Zu der Zeit dockt die [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-D)]] an Deep Space 9 an. Da die Station noch nicht über die geeigneten Mittel verfügt, untersucht Bashir das Gerät an Bord der ''Enterprise''. Er untersucht es unerlaubt auf der Krankenstation und [[Lieutenant Commander]] [[Data]] stellt ihn deswegen zur Rede. Bashir entschuldigt sich bei ihm und Data unterstützt Bashir darauf bei seiner Forschung. Bashir ist von Data fasziniert und erkundigt sich über Datas persönliche Funktionsweise. Bei den Experiment mit dem Gerät geht aber etwas schief und Data wird von einem Strahl getroffen und verliert sein BewußtseinBewusstsein. In diesem Zustand träumt Data zum ertenmalersten Mal. Bashir ist von diesen Ereignissen begeistert und hilt hilft Data diesen Zustand zu verstehen. Data erlaubt Bashir dafür einen Bericht von diesen Ereignissen für das [[Kybernetik-Journa]]l der Sternenflotte zu schreiben. ({{TNG|Der Moment der Erkenntnis, Teil I}})

Während einer Mission mit der [[USS Rio Grande|USS ''Rio Grande'']] erhalten Bashir und Kira einen [[Notruf]] von einem [[Kobliade|kobliadischen]] [[Frachter]]. Die beiden gehen den Notruf nach. Bashir hilft den Kobliaden, aber [[Ty Kajada]] warnt Bashir davor den Verbrecher [[Rao Vantika]] zu helfen. Als Arzt hilft er ihm aber trotzdem. Bashir kann nicht mehr viel für ihn tun und Vantika stirbt. Bashir bemerkt nicht, dass Vantika seinen Geist in seinen Köper transferiert. Vantika hat nun die Kontrolle über Bashirs Körper. Mit Hilfe von [[Quark]] und einigen Mittelsmännern gelingt es Vantika im Köper von Bashir die Kontrolle über den Deuridium-Frachter [[Norkova|''Norkova'']], der sich bei Deep Space Nine befindet, zu übernehmen. Mit einem modifizierten Traktorstrahl, den Commander Benjamin Sisko auf den den [[Frachter]] schießt, gelingt es Sisko Vantika aufzuhalten. Bashir erlangt kurzeitig kurzzeitig die Kontrolle über seinen Köper Körper und Bashir und stopt stoppt darauf den Frachter. Bashir wird auf Deep Space 9 zurück gebeamt und wird von Vantika befreihtbefreit. Die Übereste Überreste von Vantika werden durch Kajada vernichtet. ({{DS9|Der Parasit}})

Nur wenige Wochen später kommte kommt eine Delegation der [[Wadi]] an Bord von Deep Space 9. Bashir bekommt mit Sisko Ärger, da dieser keine [[Galauniform]] dabei hat. Aber die Wadi wollen nur ins [[Quarks]] um dort zu spielen. Als Quark die Wadi beim [[Dabo]] betrügt wollen die Wadi mit Quark ein neues Spiel spielen. Das Spiel heißt [[Chula]]. Sisko, Kira, Bashir und Dax sind die Spielfiguren in dem Spiel, aber Quark weiß zu Anfangs nichts davon. Bashir wacht in einem Raum auf und denkt, dass es sich um einen Albtraum handelt. Bashir schreit laut los, um so aus seinem Traum wach zu werden. Durch die Schreie von Bashir finden die anderen ihn. Bashir wird nun klar, dass es sich nicht um einen Traum handelt. Die vier Offiziere müssen das Spiel nun spielen und mehre Aufgaben lösen. Eine davon ist die [[Chandra]], die durch ein [[Kraftfeld]] springt. Bashir findet einen Lösungsansatz aber dieser Funktioniert nicht ganz. Erst Dax findet die Lösung. Danach werden die Offiziere in einen Raum geführt, indem giftiges Gas austritt. Bashir findet hier die Lösung und trinkt das [[Getränk]] der Wadi und kann die anderen damit retten. Währenddessen bemerkt Quark, dass seine Spielfiguren die vier Offiziere sind. Der nächste Spielzug verläuft schlecht für Quark, eine Figur er verliert eine Figur. Im Spiel löst sich Bashir vor den Augen der anderen auf. Am Ende verliert Quark das Spiel und die vier Offiziere erscheinen wieder gesund im Quarks. ({{DS9|Chula - Das Spiel}})

Nach einem Zwischenfall auf der [[Holosuite]] wird der [[Miradorn|Zwillingsmiradorn]] [[Ro-Kel]] erschossen. Doktor Bashir kann darauf nur noch den Tod feststellen. Später identifiziert Bashir für Odo ein Amulett des [[Rakhari]] [[Croden]]. Es stellt fest, dass es ähnlichkeiten Ähnlichkeiten zwischen dem Amulett und der [[Spezies]] von Odo gibt. Odo vermutet darauf, dass das Amulett ein Hinweis für seine [[Heimatwelt]] ist. ({{DS9|Der Steinwandler}})

Kurz darauf besucht [[Kai]] [[Opaka]] die Station. Sisko lädt die Kai zu einem Flug durch das Wurmloch in den Gamma-Quadrant ein. Bashir und Kira begleiten die beiden. Im Gamma-Quadrant erhält die [[USS Yangtzee Kiang|USS ''Yangtzee Kiang'']] einen Notruf. Sisko geht diesem Notruf nach. Im Orbit des [[Mond (Satellit)|Mondes]], von dem der Notruf stammt, wird die ''Yangtzee Kiang'' angegriffen und stürzt ab. Auf der Oberfläche kann Bashir nur noch den Tod der Kai feststellen. Die Überlebenden Offiziere werden in einem Konflikt zwischen den [[Ennis]] und den [[Nol-Ennis]] verwickelt. Es stellt sich heraus, dass die beinen beiden Verfeindeten Gruppen durch [[Mikrobe]]n wiederbelebt werden. Auch die Kai wird durch die Mikroben wiederbelebt. Aber Bashir stellt bei seinen Forschungen fest, dass die Mikroben nur auf diesem Mond überleben können. Die drei Offiziere werden später gerettet. Kai Opaka bleibt auf dem Mond zurück um den Ennis und den Nol-Ennis bei der Beendigung ihres Konfliktes zu helfen. ({{DS9|Die Prophezeiung}})

Nach diesen Ereignissen wird Doktor Bashir in ein Dorf nach Bajor gerufen. Die Dorfbewohner benötigen dringend die Hilfe des Arztes. [[Chief]] [[Miles O'Brien]] soll Bashir nach Bajor fliegen. Der Chief möchte nicht mit Bashir zusammen fliegen, aber Sisko befiehlt es ihm. Auf den Flug nach Bajor wechselt O'Brien kein Wort mit Bashir. Schließlich bricht Bashir das [[Eis]] und fängt ein Gespräch mit O'Brien an. Bashir bietet O'Brien an ihn "Julian" zu nennen. Auf Bajor erfährt Bashir, dass er in dem Dorf den [[Sirah (Titel)|Sirah]] retten mußmuss, damit der Sirah das Dorf vor dem [[Dal'Rok]] retten kann. Aber Bashir kann nichts mehr für den Sirah tun, als dieser zum letzten mal das Dorf vor dem Dal'Rok rettet, stirbt der Sirah. Der Sirah ernennt kurz vor seinem Tod O'Brien zu seinem Nachfolger. Bashir unterstützt O'Brien als Sirah, obwohl sich O'Brien sehr unwohl in seiner Rolle fühlt. [[Hovath]] der eigentlich der neue Sirah werden sollte, ist auf O'Brien eifersüchtig und versucht diesen sogar zu töten. Aber O'Brien und Bashir können ihn aufhalten. Die beiden erfahren von Hovath, dass die Bewohner ihm nicht mehr vertrauen, nachdem dieser einmal versagt hat. Am nächsten Abend muss O'Brien als Sirah das Dal'Rok aufhalten, aber ihm gelingt das nicht. Bashir erkennt sofort, dass es sich um eine List des alten Sirah handelt. O'Brien soll als Sirah versagen, damit die Bewohner Hovath wieder vertrauen. Hovath kann das Dorf retten und wird neuer Sirah. Bashir und O'Brien kehren darauf nach Deep Space Nine zurück. ({{DS9|Die Legende von Dal'Rok}})

Einige Zeit später erscheint eine fremde Anomalie bei Deep Space 9. Zu dieser Zeit hat Bashir wieder ein Date mit Dax. Bashir wird aber wieder von ihr abgewiesen. Als Bashir sich später in seinem Quartier befindet, erscheint Dax und will ihn [[Kuss|küssen]]. Bashir hält dies erst für einen Scherz, aber er gibt sich ihr hin. Die beiden werden wenige Augenblicke später auf die [[Operations Center|OPS]] gerufen. Dort befinden sich Phantasiegestalten darunter auch [[Rumpelstilzchen]] und [[Buck Bokai]]. Dax soll darauf die Anomalie analysieren, als plötzlich eine zweite Dax erscheint. Es stellt sich heraus, dass die eine Dax eine Phantasiegestalt von Bashir ist. Dax nimmt das aber Bashir nicht übel, schließlich ist sie auch mal ein junger Mann gewesen. Später stellt sich heraus, dass eine Fremde Spezies aus dem Gamma-Quarant Quadrant in Form dieser Phantasiegestalten in Kontakt mit der Föderation getreten ist und das die Anomalie auch nur ein Produkt der Phantasie gewesen ist. ({{DS9|Macht der Phantasie}})

Nach diesen Ereignissen werden die [[Führungsoffizier]]e von Deep Space 9 durch eine [[Telepathie|telepatische]] [[Matrix]] der [[Saltah'na]] infiziert. Es kommt durch den Einfluss der Matrix zu einem Machtkampf zwischen Kira und Sisko auf der Station. Die Offiziere stellen sich entweder auf die Seite von Sisko oder Kira. Obwohl auch Bashir infiziert ist, verhält sich dieser in diesem Konflikt neutral. Auch Odo bemerkt diese Vorgänge und berichtet dieses Bashir. Bashir beginnt nach einem Heilmittel zu suchen. Er findet schließlich nach langer Forschung ein Gegenmittel. Odo lockt darauf die infizierten Offiziere in die [[Andockschleuse|Andockschleuse 4]]. Dort aktiviert Odo Bashirs Programm, welches die fremde Matrix bekämpft. Die Offiziere werden von der Matrix befreiht befreit und Odo lässt diese Matrix in den [[Weltraum]] entweichen. ({{DS9|Meuterei}})

Gegen Ende des Jahres behandelt Bashir den Cardassianer [[Aamin Marritza]] gegen die Synthome Symptome des [[Kalla-Nohra-Syndrom]]. Marritza gibt sich zu dieser Zeit als [[Gul]] [[Darhe'el]] aus, um eine Strafe für die GreultatenGräueltaten, welche die Cardassianer den Bajoranern angetan haben, zu verbüßen. Aber auch durch Bashirs Nachforschungen stellt sich heraus, dass Marritza nicht der Verbrecher Darhe'el ist und Marritza wird freigesprochen. ({{DS9|Der undurchschaubare Marritza}})

Anfang [[2370]] behandelt Bashir [[Li Nalas]], nachdem er und einige Bajoraner von Kira und O'Brien aus einem Cardassianischen [[Arbeitslager]] befreiht befreit worden sind. Zu der Zeit wird die [[Allianz für globale Einheit]] auf Bajor und Deep Space Nine aktiv. Diese Organistaion Organisation wird auch <q>Der Kreis</q> genannt und hat das Ziel Bajor von allen Nichtbajoranern zu befreihenbefreien. Einige Mitglieder der Kreises greifen kurz darauf Quark an. Bashir behandelt den verletzten Quark. In der Zwischenzeit übernimmt Li Nalas den Posten von Major Kira ein und Kira wird nach Bajor versetzt. Die Freunde von Kira, darunter auch Bashir verabschieden sich von ihr und wünschen Kira alles gute. Auf Bajor wird Kira vom Kreis entführt und gefoltert. Sisko startet darauf eine Befreihungsaktion Befreiungsaktion und fliegt nach Bajor. Es kommt zu kämpfen im Versteck des Kreises und Bashir findet die schwerverletzte schwer verletzte Kira und kann an mit ihr an Bord des Runabout [[beamen]]. Dem Kreis gelingt es die [[Regierung]] von Bajor zu Übernehmen. Die Föderation wird aufgefordert sich von Deep Space 9 zurückzuziehen. Sisko hat mit Hilfe von Odo rausgefundenherausgefunden, dass der Kreis von den Cardassianern mit Waffen beliefert wird. Sisko will verhindern, dass die Cardassianer wieder Bajor übernehmen. Sisko bleib deswegen mit einigen Offizieren auf Deep Space 9 zurück um die Übernahme des Kreises zuverhindernzu verhindern. Kira und Dax bringen währenddessen den Beweis nach Bajor, dass die Bajoraner von den Cardassianern beliefert werden. Es kommt auf der Station zu einigen Kämpfen und die Sternenflotten Offiziere sorgen für genügend Ablenkung. Es gelingt ihnen genügend Zeit zu verschaffen, dass Kira und Dax den Beweis überbringen können. Als die Bajoraner sehen, dass die Cardassianer hinter alldem stecken, wird der [[Putsch]] des Kreises beendet und die Föderationsangehörigen kehren nach Deep Space 9 zurück. Trotz des Sieges Siegs wird Li Nalas von [[Colonel]] [[Day Kannu|Day]] erschossen. Bashir kann nichts für ihn tun. ({{DS9|Die Heimkehr|Der Kreis|Die Belagerung}})

Kurz darauf wird Deep Space 9 aufgrund eines [[Plasmasturm]]s vollständig evakuiert. Nur eine Notbesatzung, darunter auch Bashir bleibt zurück. Auch Quark bleibt wegem wegen seinem Latinum auf der Station zurück. Quark versucht weiter Geschäfte zu machen und hat mit einem Söldner namens [[Yeto]] Kontakt. Quark manipuliert für ihn die [[Andockrampe]]n. Kurz darauf erhält die Station einen Notruf von einem Schiff und Sisko lässt es an die Station andocken. Aufgrund von Quarks manipulation Manipulation können die Söldner, welche von dem Trill [[Verad]] angeführt werden, bewaffnet auf die Station eindringen. Bashir wird gezwungen Odo in einem Behälter zu sperren und in die [[Stasiskammer]] einzuschließen. Später wird Bashir gezwungen den [[Trill-Symbiont|Symbiont]] von Jadzia zu entfernen und in Verad reinzusetzeneinzusetzen. Die Operation verläuft zwar erfolgreich, aber aufgrund des Verlustes des Symbionten liegt Jadzia im sterben. Bashir tut alles um sie am Leben zu erhalten. Quark, der wie die anderen Offiziere gefangen gehalten wird erkennt seinen Fehler und das er für den Tod von Jadzia verantwortlich sein wird. Er greift den Klingonen [[T'Kar]] an und wird beim Angriff leicht verletzt. Auf der Krankenstation tut Quark, als ob er schwer verletzt ist und so gelingt es ihm und Bashir den Klingonen Yeto zu überwältigen und Odo zu befreihenbefreien. Odo und Sisko gelingt es schließlich Verad und seine Söldner aufzuhalten. Im letzten Moment kann Bashir Jadzia ihren Symbiont zurückgeben und sie wird gerettet. ({{DS9|Der Symbiont}})

Als sich Bashir und Garak im Replimat treffen wird Garak von einem cardassianische Jungen [[Rugal]] angegriffen. Der Junge ist eine Cardassianische Kriegswaise, welche auf Bajor zurückgeblieben ist. Plötzlich meldet sich [[Gul]] [[Dukat]] und zeigt große Intresse großes Interesse an den dem Jungen. Garak vermutet, dass da etwas mit Rugal nicht stimmt. Bashir und Garak forschen wegen den Kriegswaisen auf Bajor nach. In der zwischenzeit Zwischenzeit stellt sich heraus, dass Rugal der Sohn von [[Kotan Pa'Dar]] ist. Garak und Bashir finden heraus, dass Dukat hinter einer Konspiration steckt, welche Kotan Pa'Dar entmachten soll. Rugal ist das Opfer dieser Konspiration und verschwindet während der [[Cardassianische Besetzung von Bajor|Cardassianischen Besetzung von Bajor]] und wird für tot erklärt. Später soll er nach Dukat als Kriegswaise auftauchen und Kotan Pa'Dar als verantwortungslosen Vater darstellen. Damit hätte Kotan Pa'Dar seine Position in der Regierung verloren. Als Bashir Dukat dieses alles vorwürftvorwirft, verlässt Dukat den Raum und gibt somit indirekt seine Schuld zu. Rugal kehrt zu seinem Vater nach Cardassia zurück. ({{DS9|Die Konspiration}})

Bashir und O'Brien arbeiten lange zusammen um alles für [[Melora Pazlar]], welche von einem Planeten mit niedriger [[Schwerkraft]] stammt, auf Deep Space Nine vorzubereiten. Melora Pazlar will aufgrund ihr Behinderung in normaler Schwerkraft keine Hilfe von Fremden. Da Bashir ihr Helfen will, ist sie auch zu ihm anfangs feindseeligfeindselig. Bashir findet kurz darauf eine Methode, wie sie sich auch bei normaler Schwerkraft bewegen kann. Sie stimmt dieser Behandlung zu. Melora Pazlar macht fortschritte Fortschritte und kann sich mit der Zeit normal bewegen. In der Zeit wo Bashir Melora Pazlar behandelt, kommen sich die beiden näher. Die beiden verabreden sich im [[Klingonisches Restaurant|klingonischen Restaurant]]. Später küssen sich die beiden in dem [[Quartier]] von Melora. Melora Pazlar entscheidet sich später die Behandlung abzubrechen, da sie so nicht mehr auf ihrer [[Heimatwelt]] leben kann. Kurz darauf verlässt Melora Pazlar wieder die Station. ({{DS9|Das Melora-Problem}})

Um sich mit O'Brien besser anzufreunden lädt Bashir ihn zu einem Racquetballmatch ein. O'Brien nimmt an, aber verliert gegen den überlegenen Bashir. O'Brien fühlt sich in seiner [[Ehre]] verletzt und fordert Bashir einige weitere Male heraus. Obwohl O'Brien weiterhin verliert versucht er weiter gegen den Arzt zu spielen. Bashir macht sich inzwischen Sorgen um den Chief, da er nicht mehr der jüngste ist. Um O'Brien nicht zu überfordern gelingt es Bashir mit einigen Tricks die Spiele vorzeitig abzubrechen. Zu der Zeit befindet sich der [[El-Aurianer]] [[Martus Mazur]] an Bord der Station. Dieser besitz besitzt ein außerirdischen [[Glücksspiel]]gerät. Zu der Zeit weiß niemand, dass seine Spielgeräte das Glück jeder Person auf der Station beeinflusst. Mazur eröffnet ein sein eigenes Lokal und beginnt wird somit einen direkter Konkurenz mit Konkurrent von Quark. Um sein Geschäft wieder aufzuleben aufleben zulassen lässt Quark ein Racquetballmatch zwischen Bashir und O'Brien veranstalten. Quark nimmt die Wetteinsätze auf den Sieger entgegen, um aber selbst zu gewinnen versucht Quark Bashir mit einem Trank außer Gefecht zu setzen. Bashir durschaut durchschaut aber Quark und Spiel zwischen O'Brien und Bashir findet ohne Quarks manipulation Manipulation statt. Obwohl Bashir wieder überlegen ist, scheint Bashir in diesem Spiel nur Pech zu haben, während O'Brien jeden Ball trifft. Anhand dieses Spiels finden die Führungsoffiziere heraus, dass die Glücksspielgeräte von Mazur für den ganzen Zustand verantwortlich ist. ({{DS9|Rivalen}})

Bashir behandelt Jadzia Dax, [[Mora Pol]] und [[Weld Ram]], nach dem diese durch den Einfluss eines [[Gas]]es auf [[L-S VI]] verletzt worden sind. Später wird Mora Pol von einer unbekannten Kreatur, während er sich auf der Krankenstation befindet, angegriffen. Bashir wird auch von der Kreatur angegriffen, als er Mora Pol verteidigt. Später stellt sich heraus, dass Odo diese Kreatur ist. Durch den Einfluss des Gases von L-S VI verwandelt sich Odo unbewußt unbewusst in diese Kreatur. ({{DS9|Metamorphosen}})

Kurz darauf werden Bashir und O'Brien von den [[T'Lani]] und [[Kelleruner]]n, gebeten bei der Vernichtung einer [[biologische Waffe|biologischen Waffe]], genannt [[Harvester]], zu helfen. Nach einer Woche harter Arbeit gelingt es den Wissenschaftlern diese Waffe zu vernichten. Nachdem die Harvester fast vollständig vernichtet worden ist, werden die Forscher angegriffen und getötet. Bashir und O'Brien gelingt es im letzten Moment zu entkommen und auf den Planeten [[T'Lani III]] zu beamen. Die Botschafter der T'Lani und der Kelleruner erklären die beide Offiziere für Tod und schicken eine Botschaft nach Deep Space Nine. Auf dem Planeten hat sich O'Brien mit der Harvester infiziert und drot droht zu sterben. Bashir tut alles um seinen Freund zu retten und versucht eine Nachricht nach Deep Space Nine zu schicken, in der Hoffnung dass beide gerettet werden. Sisko glaubt, dass an der Botschaft der T'Lani und der Kelleruner etwas faul ist und fliegt zu dem Planeten T'Lani III. Auf der Oberfläche werden Bashir und O'Brien von den Botschafter beider Völker gefunden. Diese wollen sie töten, da die beiden über die Harvester bescheid wissen. Im letzten Moment könne beide gerettet werden und werden von Sisko an Bord des Shuttles gebeamt. Die T'Lani und die Kelleruner greifen das Shuttle zwar an, aber Sisko kann entkommen. Nachdem Bashir und O'Brien fast gestorben währen, bemerken sie das dieses Erlebniss Erlebnis sie zusammen geschweißt hat und die beiden werden Freunde. ({{DS9|Das Harvester-Desaster}})

Einige Zeit später befinden sich Bashir und Garak im Replimat und unterhalten sich. Plötzlich tauchen drei Cardassianer auf. Bashir fällt an Garak auf, dass dieser sich sehr für sie interesiertinteressiert. ({{DS9|Profit und Verlust}})

Einige Wochen später wird der cardassianische [[Frachter]] ''[[Bok'Nor]]'' vom Maquis bei Deep Space 9 vernichtet. Sisko und Gul Dukat leiten einige Untersuchungen zu diesem Anschlag. Sisko will den Maquis in den [[Badlands]] aufspühren aufspüren und nimmt dafür auch Bashir mit. Auf einen Planeten werden sie vom Maquis gefangen genommen. Aber sie werden kurz darauf wieder freigelassen. Später ist Sisko gezwungen einige Schiffe des Maquis aufzuhalten. Es kommt zu einem Kampf im [[Weltraum]]. Mit O'Brien befindet sich Bashir auf der [[USS Mekong|USS ''Mekong'']] und greift die Maquis Schiffe an. Am Ende gelingt es der Sternenflotte den Maquis vorläufig aufzuhalten. ({{DS9|Der Maquis, Teil I|Der Maquis, Teil II}})

Bashir und Kira helfen wenige Wochen später bei der Einrichtung eines Krankenhauses auf [[Neu Bajor]] im Gamma-Quadrant. Als die beiden durch das Wurmloch zurückfliegen, gelangen die beiden durch einen Unfall in das [[Spiegeluniversum]]. Die beiden werden dort gefangengenommen gefangen genommen und zur Raumstation [[Terok Nor (Spiegeluniversum)|Terok Nor]] gebracht. Da Bashir ein Terraner ist muß muss er in die Erzverarbeitung, welche unter der Aufsicht von [[Odo (Spiegeluniversum)|Odo]] steht. Kira wird währenddessen zur [[Intendant]]in [[Kira Nerys (Spiegeluniversum)|Kira]] gebracht. Bashir hat schwer unter Odo zu leiden. Dort freundet Bashir sich mit [[Miles O'Brien (Spiegeluniversum)|Miles "Smiley" O'Brien]] an. Als eine Leitung bricht, nutzen Bashir und die anderen Terraner das Chaos zur Flucht, dabei erschießt Bashir Odo. Mit Hilfe von [[Benjamin Sisko (Spiegeluniversum)|Benjamin Sisko]] aus dem Spiegeluniversum, können die Terraner, Kira und Bashir fliehen. Schließlih gelingt es Bashir und Kira wieder in unser Universum zurück zu kehren. ({{DS9|Die andere Seite}})

Als Ende 2370 Sisko, sein Sohn Jake, Quark und [[Nog]] von dem [[Dominion]] gefangen genommen worden sind, hilft Bashir bei der befreihungBefreiung. Zusammen mit der [[USS Odyssey|USS ''Odyssey'']] fliegen die drei Runabouts in den Gamma-Quadrant um diese aufzuspührenaufzuspüren. Zwar gelingt es Sisko und die anderen zu befreihenbefreien, aber die Schiffe werden in Kämpfe mit [[Jem'Hadar-Angriffsjäger]]n verwickelt. Als die Föderationsschiffe fliehen wollen fliegt ein Angriffsjäger in die ''Odyssey'' und vernichtet diese. Die Runabouts gelangen sicher in den Alpha-Quadrant. ({{DS9|Der Plan des Dominion}})

Nach dem Angriff auf die ''Odyssey'' ist sich die Föderation der Gefahr durch das Dominion bewußtbewusst. Auf Deep Space 9 bereiten sich die Offiziere auf eine [[Invasion]] des Dominions vor. Commander Sisko bekommt für Deep Space 9 die [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'' (NX-74205)]] zugeteilt. Sisko hat den Auftrag Kontakt mit den [[Gründer]]n des Dominions aufzunehmen. Die ''Defiant'' ist für diese Mission mit einer [[Romulaner|romulanischen]] [[Tarnvorrichtung]] ausgestattet. Bashir begleitet Sisko mit in den Gamma-Quadrant. Bei der Mission wird die ''Defiant'' von den [[Jem'Hadar]] angegriffen. Bei den Kampf übernimmt Bashir die [[Conn]], aber schließlich wird die ''Defiant'' von den Jem'Hadar übernommen. Nur Kira und Odo können entkommen. Die ''Defiant'' wird zur [[Heimatwelt der Gründer]] gebracht. Die Gründer erzeugen für die Bewußtlosen Bewusstlosen Offiziere eine Illusion, was geschehen wird wenn das Dominion Fuß im Alpha-Quadrant fasst. In dieser Simulation versuchen die Offiziere dieses Eindringen zu Verhindern. Bashir und die anderen Offiziere werden schließlich von Odo und Kira befreihtbefreit, welche sich ebenfalls auf dem Planeten befinden. Es stellt sich schließlich heraus, dass Odos Volk die Gründer des Dominions sind. Die ''Defiant'' kehrt nach Deep Space Nine zurück. ({{DS9|Die Suche, Teil I|Die Suche, Teil II}})

Nach diesen Ereignissen ist die Angst vor einer Invasion des Dominions auf Deep Space 9 groß und immer mehr Personen verlassen die Station. [[Keiko O'Brien]] muß muss ihre [[Schule]] schließen, da kaum noch Kinder an Bord sind. Chief Miles O'Brien macht sich Sorgen um seine Frau und berät sich mit Julian Bashir über dieses Problem. Bashir empfiehlt seinen Freund, dass Keiko wieder ihren alten Beruf als [[Biologie|Biologin]] ausführen mußmuss, um wieder glücklich zu sein. Der Chief hört auf den Ratschlag und Keiko nimmt an einer Expedition auf Bajor teil. ({{DS9|Das Haus des Quark}})

Wenige Wochen später leidet Jadzia Dax unter starken [[Halluzination]]en und sie verliert mehrmals ihr BewußtseinBewusstsein. Ihre [[Isoboramin]]werte sinken und Jadzia droht daran zu sterben. Bashir tut alles um sie zu retten, aber es gelingt ihm nicht. Dax muß muss auf ihre Heimatwelt [[Trill (Planet)|Trill]] gebracht werden, um dort behandelt zu werden. Bashir kümmert sich auch um Trill um Dax. Es stellt sich heraus, dass es Probleme mit einen der Wirte von Dax. Die Erinnerungen von [[Joran Belar]] worden im [[Dax (Symbiont)|Dax-Symbiont]] unterdrückt. Schließlich werden die unterdrückten Erinnerungen in Dax freigesetzt und Jadzia wird gerettet. ({{DS9|Das Equilibrium}})

Als Kira nach Cardassia entführt worden ist, hilft Bashir Sisko bei Suche nach ihr. Bashir und Sisko gelingt es Garak zu überzeugen mit nach Cardassia zu fliegen und Kira zu befreihenbefreien. ({{DS9|Die zweite Haut}})

Kurz darauf kauft Quark die Trümmerteile eines im Gamma-Quadranten abgestürzten Raumschiffs. In diesen Trümmern befindet sich ein [[Baby]]. Quark bringt das Kind zu Bashir und dieser untersucht es. Das Baby entwickelt sich innerhalb von wenigen Stunden in einen Teenager. Bashir wundert sich über die entwicklungEntwicklung, aber er stellt fest das dies bei seiner Spezies normal zu sein scheint. Innerhalb von wenigen Stunden wächst der Junge heran und es stellt sich heraus, dass es sich um einen Jem'Hadar handelt. Dieser greift Bashir an, aber Odo kann ihn unter Kontrolle bringen. Odo versucht zwar den Jem'Hadar zu zähmen, aber der Jem'Hadar will nichts anderes als kämpfen und töten. Odo sieht schließlich ein, dass er den Jem'Hadar nicht helfen kann und bringt ihn zurück zu seinen Volk. ({{DS9|Der Ausgesetzte}})

Bei der Löschung einiger Programme in der [[Erzaufbereitungsanlage]] aktiviert O'Brien ausversehen aus Versehen das [[Antirebellionsprogramm]] der Cardassianer. Deep Space Nine wird durch [[Kraftfeld]]er abgesichert und Bashir und die anderen Offiziere sitzen auf der OPS fest. Als die nächste Stufe des Programm gestartet wird, droht [[Neurozingas]] in den [[Habitatring]] auszuströmen aus zuströmen und dort alle Personen zu töten. Dax versucht dies zu verhindern und deaktiviert die [[Lebenserhaltungssystem]]e. Dabei wird sie verletzt und Bashir behandelt sie. Durch die deaktivierung Deaktivierung der Lebenserhaltungssysteme wird die nächste Stufe des Programms aktiviert und die [[Selbstzerstörung]] von Deep space Space 9 wird eingeleitet. Als man diese versucht zu deaktivieren wir die nächste Stufe aktiviert und die Offiziere werden von einem [[Phaser]] beschossen. Schließlich kommt Dukat an Bord und deaktiviert den Phaser. Durch Dukats Arroganz, verliert er seine Kommandocodes für Deep Space 9 und ihm gelingt weder die Selbstzerstörrung Selbstzerstörung abzuschalten noch die Flucht. Sisko und O'Brien gelingt es schließlich die Energie, welche für die Vernichtung der Station vernatwortlich verantwortlich ist umzuleiten und können so das Programm deaktivieren. ({{DS9|In der Falle}})

Trotz der Gefahr durch das Dominion führt die Föderation weitere Forschungsmissionen im Gamma-Quadranten durch. Plötzlicht tauchtPlötzlich, während einer Mission, taucht ein Planet aus dem Nichts herausauf. Die Bewohner des Planeten rufen die ''Defiant'' und laden die Offiziere auf ihren Planeten [[Meridian]] ein. Bashir gefällt der Planet sehr. Jadzia Dax verliebt sich auf dem Planeten in [[Deral]]. Um auf Meridian bleiben zu können, nachdem der Planet in die andere Dimension wechselt, muß muss Bashir die Moleküle von Dax ändern. Aber dies funktionert funktioniert nicht und der Planet verschwindet ohne sie. Im letzten Moment kann Dax auf die ''Defiant'' gebeamt werden. ({{DS9|Meridian}})

Als die Führungsoffiziere mit der ''Defiant'' die Erde besuchen, kommt es zu einem Transporterunfall. Sisko, Dax und Bashir werden in die Vergangenheit gebeamt. Bashir und Sisko erwachen in [[San Francisco]] im Jahr [[2024]]. Die beiden werden von zwei Aufsehern gefunden und da sich die beiden nicht Ausweisen können werden Sisko und Bashir in eine [[Schutzgebiet|Schutzzone]] gebracht. In diesen Schutzgebieten leben zu dieser Zeit, Arbeitslose und Behinderte, die dort versorgt werden sollen. In Wirklichkeit herrscht in diesen Gebieten große Armut. Sisko und Bashir versuchen aus dieser Schutzone Schutzzone zu entkommen, aber dies gelingt ihnen nicht. Die beiden gelingt es dort ansässige Kleidung zu bekommen und sich mit einigen Einwohnern der Schutzone Schutzzone anzufreunden. Eines Abends wird Bashir von [[B.C. Coleridge]] angegriffen. Bashir wird darauf von [[Gabriel Bell]] verteidigt. Coleridge tötet Bell, raubt ihn dann aus und verschwindet. Sisko bemerkt, dass durch diesen Mord die [[Zeitlinie]] verändert worden ist. Kurz darauf brechen Unruhen in den Schutzonen Schutzzonen aus, damit die Zeitlinie erhalten bleibt übernimmt Sisko die Rolle von Gabriel Bell. ({{DS9|Gefangen in der Vergangenheit, Teil I}})

B.C. Coleridge hat Geiseln genommen, aber Sisko in der Rolle von Bell beschützt diese. Bashir kümmert sich um das medizinische Wohlbefinden der Geiseln. In der Zwischenzeit nehmen die Aufstände immer mehr in den Schutzonen Schutzzonen zu. Sisko und einigen Bewohnern gelingt es mit der Hilfe von Dax Kontakt zur Öffentlichkeit aufzunehmen und ihre Lage zu schildern. Aber das [[Militär]] greift trotzdem hart durch, die Soldaten stürmen die Schutzone Schutzzone und es gibt viele Tote. Dem Militär gelingt es die Geiseln zu befreihenbefreien, dabei wird aber Sisko angeschossen. Bashir kann ihn behandeln, da seine Verletzung nicht schwer ist. Als Dank für den Schutz werden Sisko und Bashir freigelassen, dafür aber für Tot erklärt. Sisko und Bashir können die Zeitlinie damit wieder herstellen und dieses Ereigniss Ereignis geht als [[Bell-Aufstand]] in die Geschichte ein. Mit Hilfe von Kira und O'Brien gelangen die drei Offiziere zurück ins 24. Jahrhundert. ({{DS9|Gefangen in der Vergangenheit, Teil II}})

Bashir wird kurz darauf für den [[Carrington Award]] nominiert. Bashir ist damit die jüngste Person, welche jemals für diesen Preis nominiert worden ist. Aber Bashir ist nicht begeistert über diese Auszeichnung, da er sich ebenfalls zu jung für diesen Preis hält. Seine Freunde versuchen ihn in der Zwischenzeit zu ermutigen diesen Preis anzunehmen. Als die Verleihung stattfindet warten alle gespannt wer den Preis bekommt. Schließlich bekommt Doktor [[Henri Roget]] den Preis und Bashir ist ein wenig entäuschtenttäuscht, dass er doch nicht gewonnen hat. ({{DS9|Das Motiv der Propheten}})

Einige Zeit später erscheint Quark mit einem [[Letheaner]] namens [[Altovar]]. Dieser möchte von Bashir [[biomimetisches Gel]] kaufen. Da dies aber illegal ist, verweigert Bashir den Verkauf. Später greift Altovar Bashir auf der Krankenstation an und versucht ihn zu töten. Er setzt Bashir außer Gefecht und stiehlt das Gel. Altovar wird kurz wird kurz darauf von Odo festgenommen. Bashir überlebt wie durch ein Wunder den Kampf. Bashir kommt in der Krankenstation wieder zu BewußtseinBewusstsein. ({{DS9|Ferne Stimmen}})

Nach einem gemeinsamen Essen mit Garak kommt es zu einem Anschlag auf Garaks Geschäft. Garak wird dabei verletzt und Bashir eilt sofort seinem Freund zur Hilfe. Odo leitet die Ermittlung, wer diesen Anschlag beganngen begangen hat. Odo findet heraus, dass Garak selbst für diesen Anschlag verantwortlich gewesen ist. Garak will dadurch verhindern, dass er vom ehemaligen Chef des Obsidianischen Orden Enabran Tain getötet wird. Odo und Garak versuchen darauf Tain aufzuspührenaufzuspüren. Bashir verabschiedet sich von seinen Freund und Garak beginnt mit seiner Suche nach Tain. Odo und Garak werden kurz darauf von den Romulanern und Cardassianern gefangengenommengefangen genommen. Die beiden Spezies planen einen Angriff auf das Dominion und Tain leitet diese Operation. Zu der Zeit bemerkt Bashir, der mit O'Brien zusammen Mittag ißtisst, dass Garak ihn sehr fehlt. Gleichzeitig fliegt die Flotte der Cardassianer und der Romulaner durch das Wurmloch in den Gamma-Quadrant. Bashir beteiligt sich an der Rettung von Garak und Odo, er fliegt mit der ''Defiant'' in den Gamma-Quadrant. Die Romulaner und Cardassianer geraten in eine Falle des Dominions und die Flotte wird vollständig vernichtet. Odo und Garak gelingt es im letzten Moment zu entkommen und sie werden auf die ''Defiant'' gebeamt. Bashir behandelt die beiden darauf. Der ''Defiant'' gelingt es der Dominionflotte zu entkommen und in den Alpha-Quadrant zurück zufliegen. ({{DS9|Der geheimnisvolle Garak, Teil I|Der geheimnisvolle Garak, Teil II}})

Wenige Wochen später erfährt Bashir, dass seine ehemalige Studienkollegin Elizabeth Lense von der ''Lexington'' nach Deep Space 9 kommt. Bashir ist ganz Aufgeregt, aber als sie ihn sieht beachtet Lense ihn nicht. Bashir ist ziemlich entäuscht enttäuscht darüber. Zusammen mit O'Brien betrinkt er sich und er ist sehr wütent wütend auf Lense. Aber O'Brien rät ihm Lense anzusprechen, Bashir tut dies dann auch. Es stellt sich heraus, dass Lense damals auf der Akademie mit dem [[Andorianer]] [[Erib]] verwechselt hat. Darauf verbringen die beiden ihren Abend im Quarks. ({{DS9|Die Erforscher}})

Wenige Wochen später hat O'Brien eine Glücksträhne Glückssträhne beim Dart und Quark setzt Wetten auf ihn. O'Brien gewinnt jedes Spiel. Als O'Brien gegen den Vulkanier [[Syvar]] spielt, kugelt er sich die Schulter aus. Bashir muss O'Brien operieren. O'Brien muss sein Spiel aufgeben und verliert. Als später Bashir spielt hofft Quark auf eine Glücksträhne Glückssträhne von Bashir und er setzt nun auf ihn. ({{DS9|Shakaar}})

Während der [[Zhian'tara]] von Jadzia Dax nimmt Bashir Verbindung mit [[Torias Dax]] auf. Torias teilt seine Lebenserfahrung im Köper Körper von Bashir an Jadzia Dax mit. ({{DS9|Facetten}})

Ende des Jahres nimmt Bashir an der Feier zur [[Beförderung]] von Captain Sisko teil. Später fliegt Bashir mit der ''Defiant'' zur [[Tzenkethi]]-[[Heimatwelt]]. Sisko hat den Auftrag einen Krieg zwischen der Föderation und den Tzenkethi zu verhindern. Aber auf der ''Defiant'' befindet sich ein Saboteur, welcher das Schiff sabotiert. O'Brien verdächtigt zuerst Bashir, da er diesen in den [[Jefferies-Röhre]]n gesehen hat. Bashir bestreitet dies aber. Später stellt sich heraus, dass ein [[Gründer]] für die Sabotage verantwortlich ist und auch Bashirs Gestalt angenommen hat. Der Gründer versucht einen Krieg zwischen der Föderation und den Tzenkethi auszulöschen, damit sie so leichter den Alpha-Quadrant erobern können. Der Gründer sperrt kurz darauf Bashir ein und setzt in Bashirs Gestalt Jadzia Dax außer Gefecht. Später kann der Gründer entarnt enttarnt werden, als der echte Bashir wieder auftaucht. Am Ende gelingt es Odo den Gründer aufzuhalten, indem er ihn tötet. Dadurch bleibt der Frieden zwischen der Föderation und den Tzenkethi erhalten. ({{DS9|Der Widersacher}})

Anfang [[2372]] wird Bashir zum vollen Lieutenant befördetbefördert. Nach dem Ereignis mit dem Gründer auf der ''Defiant'' werden Übungen auf Deep Space 9 durchgeführt um getarnte Gründer aufzuspührenaufzuspüren. Alle Führungsoffiziere nehmen an dieser Übung teil. Odo stellt den Gründer da und ihm gelingt es die Offiziere mehrmals auszutricksen. Bashir läuft sogar in eine Falle von Odo und die Übung wird darauf beendet. Plötzlich erscheint eine klingonische Flotte bei Deep Space Nine welche von [[General]] [[Martok]] angeführt wird. Die Klingonen kommen darauf zu Besuch auf die Station. O'Brien und Bashir befinden sich zu der Zeit im Quarks. Quark ist der erste der bemerkt, dass etwas nicht stimmt. Für Klingonen ist es zu ruhig in der Bar. Er teilt dies den beiden mit, aber O'Brien und Bashir machen sich zu anfang Anfang nichts daraus. Später wird Garak von den Klingonen angegriffen und Bashir muß muss diesen behandeln. Aufgrund des seltsamen Verhaltens fordert Captain Sisko darauf [[Lieutenant Commander]] [[Worf]] an. Worf findet heraus, dass die Klingonen einen Angriff gegen die Cardassianer planen. Die Föderation stellt sich aber gegen diesen Angriff, darauf kündigen die Klingonen das [[Khitomer-Abkommen]] und die Klingonen beginnen mit der Invasion. Sisko lässt die Cardassianer über Garak warnen. ({{DS9|Der Weg des Kriegers, Teil I}})

Die Führer der Cardassianischen Regierung fliehen von Cardassia und sie bitten Sisko um Hilfe. Sisko fliegt mit der ''Defiant'' in den cardassianischen Raum um sich dort mit den Cardassianischen Führen zu treffen. Auf den Weg dort hin trifft die ''Defiant'' auf die überreste Überreste der Cardassianischen Flotte, welche von den Klingonen angegriffen worden ist. Bashir will den verwundeten Helfen, aber Worf und Sisko lehen lehnen dies ab, da es sich um eine Falle der Klingonen handeln könnte. Die ''Defiant'' erreicht das Schiff der Cardassianer, aber diese werden von den Klingonen angegriffen. Die ''Defiant'' greift die Klingonen an und es gelingt Sisko die Cardassianer an Bord der ''Defiant'' zubeamen. Die ''Defiant'' flieht zurück nach Deep Space 9 und dort wird das Schiff bereits von der klingonischen Flotte erwartet. Die Klingonen greifen die Station an und Bashir bereitet sich auf der Krankenstation auf die Verletzten vor. Bashir muß muss auch einige Klingonenangriffe abwehren. Bashir gelingt es sogar Odo vor einem Klingonenangriff zu retten. Schließlich können die Klingonen von der Station zurückgedrängt werden und die Klingonen ziehen sich schließlich zurück. Zwar haben die Klingonen den Angriff auf die Station abgebrochen aber nun herrscht Krieg zwischen der Föderation und den Klingonen. ({{DS9|Der Weg des Kriegers, Teil II}})

Wenige Wochen später führen Bashir und O'Brien einige Biountersuchungen auf [[Merik III]] im Gamma-Quadrant durch. Auf den Rückflug nach Deep Space Nine erhält ihr Schiff einen Notruf und die beiden Offiziere gehen diesen nach. Als sie auf dem Planeten landen, von dem der Notruf stammt, werden die beiden von den Jem'Hadar gefangen genommen. Als ihr Anführer [[Goran'Agar]] heraus findet, dass Bashir ein Arzt ist lässt er Bashir und O'Brien am Leben. Goran'Agar bittet Bashir ihn bei Forschung zu Helfen. Bashir soll den Jem'Hadar bei der Befreihung vom [[Ketracel-White]] helfen. Bei der zusammenarbeit Zusammenarbeit mit Goran'Agar bemerkt Bashir, dass dieser kein normaler Jem'Hadar ist und Bashir ist bereit ihm zuhelfenzu helfen. Aber O'Brien sieht in Goran'Agar nur einen normalen Jem'Hadar und er versucht zu fliehen. Als die Jem'Hadar O'Brien einfangen, verschont Goran'Agar ihn. Die anderen Jem'Hadar sehen nun auch in Goran'Agar schwäche und bedrohen nun auch ihn. Bashir, O'Brien können mit Hilfe von Goran'Agar zu ihrem Schiff fliehen. Aber Goran'Agar bleibt bei seinen Männern auf den Planeten zurück. ({{DS9|Der Hippokratische Eid}})

Einige Zeit später befindet sich die ''Defiant'' im Gamma-Quadrant um mit den Karemma zu verhandeln. Plötzlich wird die ''Defiant'' von den Jem'Hadar angegriffen. Sisko lässt das Schiff in einem [[Gasriese]]n fliegen um dem Dominion zu entkommen. Bei den Kämpfen wird die ''Defiant'' schwer beschädigt. Als sich ein Riss in der Hülle bildet muß muss die Krankenstation evakuiert werden. Als Bashir die evakuierung Evakuierung leitet kommt es zu einer Explosion und Dax wird verletzt. Bashir kann Dax noch rechtzeitig in eine Jefferies-Röhre bringen, bevor das schützende [[Kraftfeld]] um die [[Schiffshülle]] nachlässt. Die beiden sitzen in der Röhre fest, der [[Sauerstoff]] reicht nur für wenige Stunden und es wird immer kälter. Dax lehnt sich an Bashir an, damit die beiden sich gegenseitig wärmen. Für Bashir geht damit indrekt indirekt ein Wunsch in erfüllungErfüllung, er hat sich immer gewünscht mit Dax in eine Notsituation zu kommen, bei der sie dann zusammen kommen. Worf gelingt es in der Zwischenzeit die Dominionschiffe zu vernichten. Ein paar Stunden später können Dax und Bashir gerettet zu werden. ({{DS9|Das Wagnis}})

Bashir befindet sich mit im Quarks als der [[Dahar-Meister]] [[Kor]] seine Geshichten Geschichten erzählt, aber Bashir hält diese für übertrieben. ({{DS9|Das Schwert des Kahless}})

Nachdem die Gründer einen Anschlag auf der Erde verübt haben, ist Bashir in schlechter Stimmung. Er macht sich Sorgen um seine Bekannten, welche auf der Erde leben. Auf der Erde findet Captain Sisko heraus, dass Amiral [[Leyton]] einen [[Militärputsch (2372)|Militärputsch]] plant. Sisko beordert die ''Defiant'' zur Erde, welche Beweise für den Putch von Leyton hat. Leyton will das verhindern und lässt die ''Defiant'' [[USS Lakota|USS ''Lakota'']] angreifen. Es gibt tote und Verletzte an Bord der ''Defiant'' und Bashir muß muss diese behandeln. Schließlich bricht die ''Lakota'' den Angriff auf die ''Defiant'' ab, als ihr Captain den Verrat von Leyton erkennt. Schließlich ist Leyton gezwungen zurück zutretenzurückzutreten. ({{DS9|Die Front|Das verlorene Paradies}})

Einige Zeit später rettet Bashir das Leben von [[Rom]]. Quark hat seinen Bruder nicht medizinisch Behandeln lassen und an seiner Krankheit währe Rom fast gestorben. Nachdem Quark seinen Angestellten den Lohn kürzt kommt es zu einem [[Streik]] im Quarks. Die Angestellten Kämpfen um ihre Forderungen nach mehr Lohn. Bashir und O'Brien wetten vor der Bar wer den Streik unterstüzt unterstützt oder die Bar besucht. Als Worf unerwartet die Bar besucht wollen die beiden ihn aufhalten. Es kommt zu einer kleinen Rangelei in der Bar und Bashir wird von Worf über den Tisch geworfen. Darauf werden die drei in eine [[Arrestzelle]] gebracht. Zur Strafe für dieses Verhalten läßt Sisko die drei über Nacht dort. In der Zwischenzeit geht Quark auf die Foderungen Forderungen seines Bruders ein und der Streik wird beendet. ({{DS9|Der Streik}})

Als Keiko O'Brien nach einem Jahr auf Bajor nach Deep Space 9 zurück zieht, hilft Bashir O'Brien beim Aufräumen seines Quartiers. Da O'Brien sich nun um seine Familie kümmern muß muss hat er nun weniger Zeit für seinen besten Freund Bashir. Anstatt mit O'Brien verbringt Bashir seinen Dartabend mit Morn, aber das ist nicht das gleiche wie mit O'Brien. Auch Keiko bemerkt, dass es ihrem Mann schlecht geht bringt sie die beiden mit einem Trick wieder zusammen und die beiden treffen sich darauf wieder in der Holosuite. ({{DS9|Die Übernahme}})

Durch die [[Argrathi]] wird das Gedächtnis von O'Brien verändert. Der Chief glaubt nun das er 20 Jahre im Gefängniss Gefängnis der Argrathi gefangen gewesen ist. Bashir versucht alles um diese Erinnerung zu löschen, aber ihm gelingt das nicht. O'Brien hat Probleme in sein normales Leben zurück zukehren. Er hat Streit mit seiner Familie und auch mit seinem Freund Bashir. Schließlich plant O'Brien einen [[Selbstmord]] und er will sich mit dem Phaser erschießen. Bashir kann gerade noch dazwischen gehen und dies verhindern. O'Brien berichtet Bashir schließlich von seinen Erfahrungen die ihn in dem Gefängnis so belastet haben. Bashir hilft dann O'Brien, dass er wieder ein normales Leben führen kann. ({{DS9|Strafzyklen}})

Bashir und die anderen Führungsoffiziere werden zur [[Hochzeit]] von Lwaxana Troi und Odo eingeladen. Die Gäste ahnen aber nicht, dass diese Hochzeit nur stattfindet, damit Lwaxana Troi ihr ungeborenens ungeborenes Kind, welches von [[Jeyal]] stammt, behalten kann. Später muß muss Bashir auch Jake Sisko behandeln, der aufgrund des Einflusses von [[Onaya]] im sterben liegt. ({{DS9|Die Muse}})

Garak lädt kurz darauf Bashir zu einem [[Springball]]-[[Spiel]] ein. Die beiden schauen intersiert interessiert dem Spiel zu, bis sich Garak mehr für [[Tora Ziyal]] interesiert. ({{DS9|In eigener Sache}})

Gegen Ende des Jahres greift ein Trupp abtrünniger Jem'Hadar Deep Space 9 an. Bashir kümmert sich um die Verletzte. Aber durch den Angriff gibt es viele Tote. Die ''Defiant'' nimmt in der zwischenzeit Zwischenzeit die Verfolgung der Abtrünnigen Jem'Hadar auf. ({{DS9|Die Abtrünnigen}})

Als sich Bashir mit Kira und Dax im Gamma-Quadrant befindet, erhält ihr Schiff einen Notruf. Der Notruf stammt von den [[Teplaner]]n und ist über 200 Jahre alt. Bashir sieht, dass die Bevölkerung an einer unheilbaren Krankheit namens [[Quickening]] leidet. Bashir bietet sofort seine Hilfe an um ein [[Heilmittel]] gegen die Krankheit zu finden. Aber keiner will sich Helfen lassen, da die Bevölkerung die Hoffnung auf ein Heilmittel schon lange aufgegeben hat. Einzig [[Ekoria]] will sich helfen lassen. Bashir und Dax forschen nach dem Heilmittel und machen auch mit der Zeit auch fortschritte Fortschritte bei der Forschung. Schließlich erklären sich weitere Teplaner bereit sich von Bashir helfen zu lassen. Aber die Teplaner reagieren allergisch auf die Energiefelder der Föderation und viele der Patienten von Bashir sterben Qualvoll auf grund aufgrund dieser Allergischen Reaktion. Nur Ekoria bleibt darauf bei Bashir. Aber Bashir gibt es auf ein Heilmittel zu finden, aber Ekoria bittet ihm zu bleiben. Bashir verspricht ihr zu bleiben und auch bei der Geburt ihres Kindes zu helfen. Bashir forscht weiter und er probt einige Medikamente an Ekoria aus. Aber aufgrund der Krankheit liegt Ekoria im bald darauf im sterben. Bashir gelingt es noch rechtzeitig die Geburt einzuleiten. Zu seiner Verwunderung ist ihr Baby völlig gesund. Ekoria kann ihren Sohn noch kurz sehen und stirbt. Bashir hat zwar kein Heilmittel, dafür einen Impfstoff gefunden und kann so den Teplanern helfen. ({{DS9|Hoffnung}})

Bei einer weiteren Mission im Gamma-Quadrant kommt es zu einem Unfall und Keiko O'Brien wird verletzt. Um ihr ungeborenes Kind zu retten, implantiert er den [[Embryo]] in den Köper Körper von Major Kira. Zu der Zeit glaubt Quark, dass er am [[Dorek-Syndrom]] leidet und sterben wird. Er will seine Überreste verkaufen und der einzige Käufer ist der [[Liquidator]] [[Brunt]]. Als sich aber herraus stellt das herausstellt dass Quark nicht sterben wird muß , muss Quark seinen Vertrag mit Brunt brechen. Aufgrund des Vertragbruches Vertragsbruches konfisziert Brunt den gesamten Besitz von Quark. Aber Bashir und die Bewohner von Deep Space 9 helfen Quark bei der Wiedereinrichtung seiner Bar. ({{DS9|Quarks Schicksal}})

Ende des Jahres leidet Odo an einer unbekannten Krankheit. Aufgrund der Krankheit hat er große Mühe seine Form zu halten. Auch Bashir kann ihn nicht helfen. Sisko bleibt nichts anderes übrig und muß muss Odo in den Gamma-Quadrant zu den Gründern zu bringen. Auf der ''Defiant'' kümmern sich Bashir und Garak um Odo. Schließlich treffen die Jem'Hadar und die [[Gründerin]] auf die ''Defiant''. Die Gründerin bringt die ''Defiant'' zur [[Heimatwelt der Gründer]]. Sisko, Bashir begleiten Odo mit auf die Oberfläche. Dort wird Odo der Prozess gemacht, weil Odo ein Jahr zuvor einen Gründer getötet hat. Zur Strafe wird Odo in einem [[Solid]] umgewandelt und darf dann den Planeten verlassen. Auch Bashirs untersuchungen Untersuchungen ergeben, dass Odo nun ein Humanoid ist. Aufgrund der Erfahrung mit den Gründern, glaubt Odo das der [[Klingonischer Kanzler|klingonische Kanzler]] [[Gowron]] ein Gründer ist. ({{DS9|Das Urteil}})

Sisko bekommt Anfang [[2373]] den Auftrag die Klingonen zu infiltrieren und Gowron als Gründer zu entarnenenttarnen. Um dies zu erreichen, verändert Bashir durch [[Plastische Chirurgie|plastische Chirurgie]] das Aussehen von Sisko, Worf, Odo und O'Brien zu verändern, damit sie wie Klingonen aussehen. Die Mission der vier verläuft darauf erfolgreich, zwar stellt sich herrausheraus, dass Gowron kein Gründer ist, dafür wird General Martok als [[Martok (Gründer)|Gründer]] entarnt. Nach der erfolgreichen Mission stellt Bashir das normale Aussehen der vier wieder her. ({{DS9|Die Apokalypse droht}})

Kurz darauf bestellt Bashir bei Quark einige [[regalianische Flohspinne]]n. Bashir will aus dem Gift der [[Spinne]]n ein Mittel, welche Kira bei ihrer Schwangerschaft erleichtern soll, herstellen. Aber Quark nutzt diesen Auftrag um selbst Waren zu schmuggeln. Aber Odo verhaftet Quark und auch Bashir, dadurch das er Quark den Auftrag gegeben hat. Bashir ist sehr verägert verärgert über Quark und kommt zusammen mit ihn vorläufig in den Arrest. ({{DS9|Das Schiff}})

Seit Kira wegen ihrer Schwangerschaft bei den O'Briens eingezogen ist, kommt es häufig zu Streiterein Streitereien zwischen O'Brien und Kira. Auch Bashir hört manchmal bei diesen Streitereien zu und spricht darauf O'Brien an. Später behandelt er Quark und Grilka und ebend so , ebenso Dax und Worf, welche sich beim [[Sex]] einige Verletzungen zugezogen haben. ({{DS9|Gefährliche Liebschaften}})

Als Keiko O'Brien auf Bajor die [[Feuerhöhle]]n besucht, kümmern sich Bashir und Miles O'Brien um ihre [[Pflanze]]n. Aber das geht schief und ein [[Idranischer Hybrid|Idranischer Hybrid]] vertrocknet den beiden. Bashir entschuldigt sich später bei ihr. Bashir ahnt zu dieser Zeit nicht, dass Keiko O'Brien von einem [[Pah-Geist]] bessen besessen ist und ihren Mann erpressen tuterpresst. Um seine Macht zu beweisen stürzt der Pah-Geist sie von der Oberen Ebene auf das Promenadendeck. Bashir behandelt ihre Verletzungen. Später gelingt es O'Brien seine Frau von dem Pah-Geist zu befreihenbefreien. ({{DS9|Die Erpressung}})

Als die Cardassianer den Bajoranern den [[Drehkörper der Zeit]] übergeben, stiehlt der ehemalige klingonische Agent [[Arne Darvin]] diesen und reist damit in die Vergangenheit. An Bord der [[Raumstation K-7]] plant Darvin [[James T. Kirk]] umzubringen. Die ''Defiant'' befindet sich ebenfalls durch den Drehköper Drehkörper in der Vergangenheit. Sisko und seine Crew realisieren, dass sie sich im [[2268]] befinden. Sisko und seine Leute versuchen Darvin auf der Raumstation K-7 und auf der [[USS Enterprise (NCC-1701)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701)]] zu finden. Um nicht aufzufallen ziehen Sisko und seine Crew die [[Sternenflottenuniform (2265-2270)|Uniformen]] dieser Zeit an und beginnen mit der Suche nach Darvin. Bashir und O'Brien beginnen mit der Suche auf der ''Enterprise''. Aber gleich dort haben sie Probleme mit der Technologie dieser Zeit, den beiden gelingt es nicht den [[Turbolift]] zu bedienen. Erst durch die Hilfe von Lieutenant [[Watley]] gelangen sie aufs richtige Deck. Später treffen beide wieder auf Watley. Als sie ihren Namen nennt, glaubt Bashir das sie seine Urgroßmutter ist und das Bashir durch die Zeit gereist ist um sein eigener Urgroßvater ist. Aber O'Brien redet ihm dies aus. Später treffen die beiden in der Bar auf K-7 auf Worf und Odo. Die beiden haben einen Hinweis auf Darvin gefunden.

Zur selben Zeit kommt es zu einer Schlägerei zwischen den Klingonen und der [[Liste der Crew der USS Enterprise (NCC-1701)|Enterprisecrew]] in der Bar. Auch Bashir und O'Brien werden in diese Schlägerei verwickelt. Worf und Odo gelingt es Darvin in Gewahrsam zu nehmen, während Bashir und O'Brien von der Sicherheit in Gewahrsam genommen werden. An Bord der ''Defiant'' erfährt Sisko den Plan von Darvin, er will Kirk mit einer Bombe, welche er in einem [[Tribble]] versteckt hat töten. Bashir und O'Brien werden in der zwischenzeit Zwischenzeit von Kirk verhört aber die beiden werden darauf wieder freigelassen. Auf dem Gang findet Bashir einen Tribble, aber O'Brien zeigt ihm, dass es noch mehr Tribbles an Bord der ''Enterprise'' gibt. Sie bekommen von Sisko nach dem vermeintlichen Tribble zu suchen. Die Crew sucht verzweifelt nach dem Tribble mit der Bombe. Schließlich finden Dax und Sisko den Tribble mit der Bombe und beamen diesen von Bord. Damit bleibt die Zeitlinie erhalten und die ''Defiant'' kehrt darauf ins 24. Jahrhundert zurück. ({{DS9|Immer die Last mit den Tribbles}})

Nach diesen Ereignissen machen Bashir, [[Leeta]], Dax, Worf und Quark Urlaub auf [[Risa]]. Bashir und Leeta sind nach Risa gereist um dort ihre Beziehung freundschaftlich zu beenden. Aber eine [[Essentialisten-Bewegung]] störrt stört ihren Urlaub. Sie manipulieren mit Hilfe von Worf das [[Wetterkontrollsystem]] und es gibt die nächsten Tage nur [[Regen]]. Aber später können die Essentialisten vertrieben werden. Als das Wetter wieder angenehm auf Risa ist, vergnügt sich Bashir auf Risa mit [[Jamaharon]]. ({{DS9|Die Reise nach Risa}})

Bashir behandelt kurz darauf Sisko, Dax, Garak und Odo. Die vier werden Bewußtlos Bewusstlos in einem Shuttle aufgefunden, als diese nach Deep Space 9 zurückgekehrt sind. Die vier befinden sich durch Odo in einer [[Große Verbindung|Verbindung]]. Schließlich können die vier dank Odo aus der Verbindung befreiht befreit werden und erwachen auf der Krankenstation. ({{DS9|Die Schuld}})

Bashir reist kurz darauf zu einer medizinischen [[Konferenz]] auf [[Meezan IV]]. Er legt sich dort eines Abends zum Schlafen ins [[Bett]] und wacht später im [[Internierungslager 371]] auf. Das Dominion ersetzt ihn unterdessen durch einen [[Julian Bashir (Gründer)|Wechselbalg]], welcher zurück nach Deep Space 9 reist. Bashir verbringt mehre Wochen im Internierungslager 371 und freundet sich dort mit dem echten General [[Martok]] an. Nachdem sich Bashir über die Essensrationen beschwert hat, kommt Bashir für fünf Tage in [[Isolationshaft]]. Als er aus der Isolationshaft entlassen wird, ist Bashir überrascht auf Garak und Worf zu treffen, die ebenfalls vom Dominion gefangengenommen gefangen genommen worden sind. Um festzustellen das keiner ein Wechselbalg ist, macht Bashir mit den anderen einen Bluttest. Auch Enabran Tain ist ein Gefangener im Lager. Bashir ist dabei, als Tain stirbt und Tain sich von Garak verabschiedet. So erfährt Bashir das Tain Garaks Vater ist. Garak, Worf, Martok und Bashir beginnen darauf mit der Planung der Flucht aus dem Internierungslager. ({{DS9|Die Schatten der Hölle|Inquisition}})

Garak bekommt den Auftrag den [[Subraumtransmitter]] zu manipulieren um Kontakt mit dem Shuttle aufnehmen zu können, damit Garak und die anderen fliehen können. Garak arbeitet in einem Schacht hinter der Wand an dem Transmitter. Bashir bemerkt das Garak an [[Klaustrophobie]] leidet. Bashir verordnet Garak einige Pausen, damit sich Garak von diesem Stress erholen kann. Bashir muss aber auch Worf behandeln, welcher nach Kämpfen mit den Jem'Hadar in der [[Jem'Hadar-Arena]] Verletzungen zugezogen hat. Als Garak weiter am Transmitter arbeitet, kommen die Jem'Hadar und wollen ihn zur [[Hinrichtung]] abholen. Bashir versucht die Jem'Hadar abzulenken und wird von Ihnen angegriffen. Schließlich finden die Jem'Hadar Garaks Schacht hinter der Wand. Plötzlich geift greift ein [[Breen]] die Jem'Hadar an und verschafft Garak die nötige Zeit um den Transmitter zu aktivieren. Bashir und die anderen Gefangenen können so aus dem Internierungslager entkommen und in den Alpha-Quadrant zurückkehren. Zur selben Zeit hat das Dominion mit der [[Invasion]] des Alpha-Quadrants begonnen und Cardassia hat sich dem Dominion angeschlossen. Das Dominion will Deep Space 9 und das Bajoranische-System durch die Explosion deren Sonne vernichten. Bashir warnt Deep Space 9 vor dem Wechselbalg. Die ''Defiant'' beginnt darauf mit der Verfolgung des Shuttles mit dem Wechselbalg. Das Shuttle fliegt auf die [[Bajoranische Sonne]] zu, um diese zu vernichten. Im letzten Moment gelingt es der ''Defiant'' das Shuttle aufzuhalten und dieses zu vernichten. Bashir, Worf, Martok und Garak kehren darauf nach Deep Space 9 zurück. Dort ist vorallem vor allem O'Brien entsetzt, dass er den Wechselbalg vier Wochen lang für Bashir gehalten hat. ({{DS9|Im Lichte des Infernos}})

Kurz darauf wählt Doktor [[Lewis Zimmerman]] Julian Bashir als Vorlage für sein neues [[Medizinisch-Holographisches Langzeitprogramm]]. Zimmerman kommt nach Deep Space 9 und entwickelt dort sein neues Programm. Das MHL bekommt das Aussehen und auch die Persönlichkeit von Bashir. Um soviel über Bashir zu erfahren befragt Zimmerman die Freunde und Kollegen von Bashir. Obwohl Bashir Zimmerman gebeten hat seine Eltern nicht zu befragen, lädt Zimmerman diese trotzdem auf die Station ein. Bashir hat Probleme mit seinen Eltern und möchte eigentlich den Kontakt mit ihnen vermeiden. Vorallem hat Bashir Angst, dass seine Eltern verraten könnten das er genetisch aufgewertet worden ist. Zimmerman testet sein MHL an Bashirs Eltern. Diese ahnen nicht, dass es sich nur um ein Hologramm handelt und geben ihm gegenüber zu, nicht zu verraten das Bashir genetisch aufgewertet worden ist. So erfahren Zimmerman und O'Brien Bashirs Geheimnis. Da genetische Aufwertung verboten ist, rechnet Bashir damit das er unehrenhaft aus der Sternenflotte entlassen wird. Aber Richard Bashir stellt sich der Sternenflotte und nimmt die ganze Schuld der genetischen Manipilation Manipulation von Julian Bashir auf sich. Julian Bashir darf sein Offizierspatent behalten, während Richard Bashir für zwei Jahre in die Strafkolonie nach [[Neuseeland]] kommt. Durch diese Ereignisse versöhnt sich Julian Bashir wieder mit seinen Eltern. ({{DS9|Dr. Bashirs Geheimnis}})

Als der Cardassianer [[Tekeny Ghemor]] an Bord der Station kommt, behandelt Bashir ihn wegen dem tödlichen [[Yarim-Fel-Syndrom]]. Aber Bashir kann nicht mehr viel für ihn tun. Da Kira Ghemor am nächsten steht, begleitet sie den sterben. Bevor Ghemor stirbt gibt er noch wichtige Informationen an Kira über die Cardassianer weiter. Nachdem Ghemor gestorben ist, stellz stellt Bashir den Totenschein aus. ({{DS9|Die Überwindung}})

Einige Zeit später muß muss Bashir General Martok behandeln, welcher sich beim Training in der Holosuite verletzt hat. Nachdem Worf und Dax vorübergehend auf die [[IKS Rotarran|IKS ''Rotarran'']] muß muss Bashir einige Aufgaben von Worf übernehmen. So ist Bashir vorübergehend für die Geheimdienstberichte auf der Station zuständig. ({{DS9|Martoks Ehre}})

Während einer Mission im Gamma-Quadrant will Dax einen [[Gaia|unbekannten Planeten]] erforschen. Ein den Planeten umgebendes [[Energiefeld]] verhindert [[Scan]]s aus größerer Entfernung und so fliegt die ''Defiant'' mit modifizierten [[Schilde]]n durch das Feld hindurch. Bei dem Durchflug durch das Energiefeld bekommt Major Kira eine [[Energie]]entladung ab und wird leicht verletzt. Bashir behandelt darauf Kira. Aber er kann für Kira nicht viel tun, er muß muss Kira nach Deep Space Nine bringen um sie dort zubehandelnzu behandeln. Auf der Oberfläche des Planeten trifft die Crew der ''Defiant'' auf die eigenen Nachfahren. Die Mannschaft erfährerfährt, dass die ''Defiant'' durch die Energiebarriere ins 22. Jahrhundert zurückgeschleudert wird und auf den Planeten abstürzt. Dort beginnt die Crew eine Siedlung aufzubauen. Bashir erfährt, dass er mit [[Angie Kirby]] zusammen kommt und mit ihr Kinder haben wird. Bashirs Nachfahren sind ebenfalls Ärzte und Bashir ist sehr stolz auf seinen Nachlass. Da man nicht will, dass die Siedlung aus der Geschichte ausgelöscht wird, läßt lässt Sisko den Kurs der ''Defiant'' auf die berechneten Korodinaten Koordinaten setzen, damit das Schiff in die Vergangenheit geschleudert wird. Aber der Odo aus dieser Zeit hat die Flugroute der ''Defiant'' verändert damit das Schiff im 24. Jahrhundert bleibt. Er will mit dieser Aktion verhindern das Kira in der Vergangenheit aufgrund ihrer Verletzungen stirbt. Die Siedlung wird aus der Geschichte ausgelöscht und die ''Defiant'' kehrt nach Deep Space Nine zurück. ({{DS9|Kinder der Zeit}})

Bashir muß muss Quark behandeln, nachdem dieser von Morn verletzt worden ist. Quark hat Morn erzählt, dass das Dominion Deep Space 9 angreifen wird. Darauf hat Morn Panik bekommen und hat einen Barhocker auf Quark beworfengeworfen. ({{DS9|Glanz des Ruhms}})

Schließlich wird Siskos Schiff vom Dominion entdeckt und Angegriffen. Sisko gelingt es zwar zu entkommen, aber das Schiff stürzt auf einen Planeten. Während des Angriffs worde wurde Jadzia Dax verletzt und auf der Planetenoberfläche kümmert sich Bashir um ihre Verletzungen. Währenddessen erkunden Nog und Garak die Gegend, als sie plötzlich von Jem'Hadar gefangen genommen werden. Die Jem'Hadar und ihr Vorta [[Keevan]] sind ebenfalls auf dem Planeten gestrandet. Keevan ist schwer verletzt und verlangt für die Freilassung von Nog und Garak Sisko und einen Arzt als Austausch. Sisko stimmt den Gefangenenaustausch zu, um seine Männer zu retten. Sisko und Bashir werden zu Keevan gebracht und dort muss Bashir den schwerverletzten Keevan behandeln. Da Keevan kaum noch Ketracel-White Vorräte hat und bald nicht mehr seine Jem'Hadar kontrollieren kann, verrät Keevan diese an Sisko. Keevan will damit erreichen, dass er so gerettet wird. Bei den darauffolgenden Kampf werden alle Jem'Hadar getötet und Kevean liefert sich freiwillig an Sisko aus. ({{DS9|Entscheidungen}})

Nach der Rückeroberung der Station planen Worf und Jadzia Dax ihre [[Klingonische Hochzeit|Hochzeit]]. Worf fragt seine Freunde, ob sie an dem [[Kal'Hyah]]-Ritual teilnehmen. Bashir denkt sofort an eine Junggesellenabschiedsparty und sagt sofort zu. Aber in Wirklichkeit handelt es sich um eine harte Prüfung für die Ausdauer. So muß Bashir vier Tage in der Hitze fasten. Während der Prüfung des Blutes schläft Bashir vor erschöpfung Erschöpfung ein. Worf fragt darauf wer sich als erstes freiwillig meldet, um sich seine Adern aufschneiden zu lassen. Als O'Brien bemerkt, dass Bashir schläft, treten O'Brien, Sisko und [[Alexander Rozhenko]] einen Schritt zurück. Somit ist Bashir ohne es zu ahnen der erste Freiwillige für diese Prüfung. Später müssen Bashir und O'Brien über glühende Kohlen hängen. Durch einen Streit von Worf und Dax wird die Hochzeit abgesagt. Bashir und O'Brien freuen sich, dass sie endlich wieder was essen dürfen. Als die beiden gerade bei Quark was essen wollen, hält sie Sisko davon ab, da die Hochzeit nun doch statt findet. Auf der Hochzeit dürfen die Teilnehmer der Kal'Hyah darauf das Paar symbolisch verprügeln. Während der Hochzeit fragt Bashir Martok wann er endlich zuschlagen darf. Als die Hochzeit abgeschlossen ist, dürfen Bashir und O'Brien endlich auf Worf einschlagen, für das Leiden, welches die beiden während des Kal'Hyah ertragen mußtenmussten. ({{DS9|Klingonische Tradition}})

[[Bild:Bashir und die Mutanten.jpg|thumb|left|Julian Bashir und die gentisch genetisch aufgewerteten Menschen führen Berechnungen durch.]]

Bashir bekommt kurz darauf den Auftrag um eine Gruppe [[Augment|gentisch genetisch aufgewerteten Menschen]] zu kümmern und bei der resozialisierung Resozialisierung zu helfen. Er soll ihnen zeigen, dass auch gentisch genetisch aufgewerteten Menschen ein normales Leben führen können. So trifft Bashir auf [[Jack (24. Jahrhundert)|Jack]], [[Lauren]], [[Patrick]] und [[Sarina Douglas]]. Als diese eine Aufzeichnung von [[Damar]] sehen, erkennen diese Menschen sofort die Hintergründe über ihn und das Dominion. Bashir erkennt das Potential dieser Menschen und gibt ihnen weiter Berichte und Pläne über den Dominion-Krieg. Mit ihren strategischer Analysen helfen sie Sisko bei den Verhandlungen mit dem Dominion. Eine weitere Analyse ergibt, dass die Föderation den Dominion-Krieg verlieren wird. Bashir ist entmutigt und versucht Sisko zu überreden, dass die Föderation kapituliert um soviele so viele Leben wie möglich zu retten. Aber Sisko will dies nicht zu lassen. Als Jack, Lauren und Patrick Angriffspläne der Föderation an das Dominion übergeben wollen, ist Bashir dagegen. Bashir will zwar so wenig wie möglich Verluste in dem Krieg haben, aber er will kein Verräter sein. Jack fesselt darauf Bashir. Jack will sich danach mit [[Weyoun 5|Weyoun]] und Damar treffen. Bashir wird aber von Sarina Douglas befreiht und kann Jack aufhalten. Durch diese Aktion sieht Bashir ein, dass trotz der Berechnungen eine einzelne Person den Verlauf der Geschichte verändern kann. Darauf verabschiete verabschiedete sich Bashir von den Vier in Freundschaft und hofft diese wieder zu sehen. ({{DS9|Statistische Wahrscheinlichkeiten}})

Als Morn scheinbar ums Leben gekommen ist, besucht Bashir die Gedenkfeier von Morn. Da Bashir die [[Lurianer|lurianischen]] Bräuche kennt, bringt er zu Ehren von Morn ein [[Getränk]] mit, damit Morn dieses symbolisch mit ins Nachleben nehmen kann. Später stellt sich herrausheraus, dass Morn seinen tod nur vorgetäuscht hat. ({{DS9|Wer trauert um Morn?}})

Als Sisko zusammen bricht behandelt Bashir ihn. Sisko hat wieder Visionen von den Propheten. Bashir stellt fest, dass Sisko die selben Symptome hat, wie 2373 als Sisko schon einmal Visionen von den Propheten bekommen hat. Sisko verliert kurz sein Bewustsein Bewusstsein und erlebt in dieser Zeit das Leben des [[Benny Russell]]. Nach wenigen Minuten erwacht Sisko wieder auf der Krankenstation. ({{DS9|Jenseits der Sterne}})

Kurz darauf untersucht die ''Defiant'' ein [[Subraum-Kompression]]s-Phänom. Diese Forschung soll bei der Erschaffung von [[Transwarpkanal|Transwarpkanälen]] helfen. Durch die Anomalie werden auch Objekte [[Schrumpfen|verkleinert]]. Mit einem Runabout erforschen Bashir, Dax und O'Brien die Anomalie. Durch den Effekt der Anomalie werden auch sie verkleinert. Sisko und seine Crew überwachen auf der ''Defiant'' die Mission des Runabouts, als plötzlich die ''Defiant'' von den Jem'Hadar angegriffen und darauf übernommen wird. Das Rounabout fliegt zwar aus der Anomalie, ist aber immer noch winzig klein. Durch einen Impulsschacht gelangt das kleine Schiff in die ''Defiant'' hinneinhinein. Dort angekommen bemerken Bashir, Dax und O'Brien, dass die ''Defiant'' von den Jem'Hadar übernommen worden ist. Sisko versucht währenddessen wieder heimlich die Kontrolle über die ''Defiant'' zu bekommen. Auch die Crew des Runabout versucht bei der Rückeroberung der Defiant zu helfen. Bashir und O'Brien werden ins Computersystem der ''Defiant'' gebeamt und schalten in ihrer winzigen Größe die Kontrolle der ''Defiant'' frei. Das Rounabout greift einige der Jem'Hadar an und es gelingt der Crew der ''Defiant'' wieder die Kontrolle über das Schiff zu erlangen. Nach der Rückeroberung der ''Defiant'' werden Bashir, Dax und O'Brien wieder auf ihre normale Größe gebracht. ({{DS9|Das winzige Raumschiff}})

Nachdem O'Brien nach Deep Space 9 zurück gekehrt ist, gelingt es O'Brien Bashir davon zu überzeugen Quark beim [[Tongo]] herraus zufordernherauszufordern. Quark ist ein sehr guter Spieler, aber O'Brien glaubt, dass Bashir mit seinem genetisch Aufgewerteten Intellekt Quark schlagen kann. Schließlich willigt Bashir ein und fodert fordert Quark zu einem Tongospiel herrausheraus. Anfangs führt Bashir bei dem Spiel bis Quark plötzlich anfängt über Jadzia Dax und ihre Beziehung zu Worf zu erzählen. Da Bashir sie noch immer liebt ist er schließlich abgelenkt und wird in ein tiefes Gespräch mit Quark über Dax verwickelt. Durch die Ablenkung macht Bashir einen Fehler und Quark gewinnt das Spiel. ({{DS9|Wandel des Herzens}})

Bashir wird für eine medizinischen [[Konferenz]] auf [[Casperia Prime]] eingeladen und Bashir freut sich sehr auf diese Konferenz. Bevor er aufbricht behandelt er die ausgerenkte Schulter von O'Brien. Bashir legt sich schlafen und wird kurz darauf geweckt. Obwohl Bashir um diese Uhrzeit aufstehen wollte, kommt ihm die Nacht ziemlich kurz vor. Er und sämtliche Führungsoffiziere werden auf die OPS gerufen. Dort angekommen erfährt Bashir, dass er nicht nach Casperia Prime fliegt, sonderen sondern an einer Befragung von [[Vizedirektor]] [[Luther Sloan]] aus der [[Abteilung für Interne Angelegenheiten]] des [[Sternenflottengeheimdienst]]es teilnimmt. Sloan befragt später Bashir vorallem vor allem wegen der Gefangenschaft beim Dominion ein Jahr zuvor. Die Befragung verläuft freundlich und Bashir ist erleichteterleichtert, dass er es hinter sich hat. Später meldet sich O'Brien bei Bashir, er werwähnterwähnt, dass Solan Bashir Verdächtigt ein Spion des Dominions zu sein. Kurz darauf wird Bashir wieder von Sloan verhört, aber diesmal ist der Ton schärfer. Solan wirft Bashir vor für das Dominion arbeitet. Bashir wird von Sloan verhaftet und in den Arrest gebracht. Sisko verspricht Bashir, ihn wieder rauszuholenherauszuholen. Als Bashir sich in der Arrestzelle befindet, wird er plötzlich fortgebeamt und er wird von Weyoun empfangen. Weyoun freut sich seinen besten Spion wieder zuhabenzu haben, aber Bashir streitet dies ab. Schließlich wird Bashir von der Crew der ''Defiant'' gerettet. Als sich Bashir wieder an Bord der ''Defiant'' befindet, glaubt ihn keiner mehr, selbst Sisko hält Bashir für einen Spion des Dominions. Als Bashir ausversehen aus Versehen O'Briens Schulter berührt, hat dieser keine Schmerzen und er spricht O'Brien auf seine Schulter an. Schließlich merkt Bashir das etwas faul ist und er stellt O'Brien eine Fangfrage, auf die O'Brien herrein herein fällt. Bashir will bei dem Spiel nicht mehr mitmachen und er bemerkt, dass er sich auf einem [[Holodeck]] befindet. Plötzlich erscheint Solan und klärt Bashir auf. Solan wollte mit diesem Programm die Loyalität von Bashir testen. Solan will Bashir für [[Sektion 31]], einem inoffiziellem [[Geheimdienst]] der Sternenflotte rekrutieren. Da diese Organisation illegal ist, lehnt Bashir ab und er wird nach Deep Space 9 zurück gebracht. Nach dem Julian Bashir dem Führungsstab von Deep Space 9 Bericht erstattet, schlägt Captain Sisko vor, weitere Versuche zu aktzeptierenakzeptieren, um so als Spion in der Sektion 31 zu dienen. ({{DS9|Inquisition}})

Während der [[Zeit der Abrechnung]] zwischen den Propheten und den Pah-Geistern, bemerkt Bashir die ersten Anzeichen als er sich mit seinen Freunden unterhält und die Station plötzlich erschüttert wird. Später findet der Kampf zwischen den Propheten und den Pah-Geist in den Köper Körper von Kira und Jake Sisko auf dem Promenadendeck auf Deep Space 9 statt, aber Kai Winn hält den Kampf auf, indem sie die Station mit [[Chronotonpartikel]]n überflutet. Bashir behandelt darauf die leicht verletzte Kira und Jake Sisko. ({{DS9|Zeit der Abrechnung}})

Bashir behandelt Quarks Mutter, nachdem sie durch einen Streit mit Quark einen Herzanfall bekommen hat. Da Quarks Mutter dadurch außer Gefecht gesetzt worden ist, muß muss Quark für die darauf folgende Verhandlungen ihre Rolle übernehmen. Um dies zu bewerkstelligen führt Bashir bei Quark eine Geschlechtsumwandlung durch, damit Quark eine Frau wird. Nachdem Quark als [[Lumba]] die Verhandlungen durchgeführt hat, macht Bashir die Geschlechtsumwandlung rückgängig. ({{DS9|Die Beraterin}})

Nachdem [[Molly O'Brien]] durch ein Zeitportal auf [[Golana]] in Vergangenheit versetzt worden ist, versucht die Crew der ''Defiant'' sie zu retten. Es gelingt ihr zwar, aber in der zwischenzeit Zwischenzeit hat Molly zehn Jahre auf Golana verbracht und ist dort erwachsen geworden. Da sie dort allein ohne Gesellschaft aufgewachsen ist, reagiert sie auf Fremde panisch. Bashir untersucht Molly und erklärt sie für köperlich körperlich gesund, aber sie hat schwierigkeiten Schwierigkeiten sich der Gesellschaft anzupassen. Da sich Molly O'Brien nicht anpassen kann bringen ihre Eltern sie zum ein Zeitportal auf Golana, damit sie in der Vergangenheit leben kann. Als Molly durchs Portal tritt, trifft sie auf ihr jüngeres Ich und schickt das Kind wieder zu ihren Eltern zurück. ({{DS9|Das Zeitportal}})

Während eine Konvoi Mission der ''Defiant'' ist Bashir ziemlich überarbeitet, er schreibt viele Missionsberichte. Zu der Zeit erhält die ''Defiant'' einen Notruf von Captain [[Lisa Cusak]]. Sie ist auf einen Klasse L Planeten abgestürzt und droht an einer [[Kohlendioxid]]vergiftung zu sterben. Während die ''Defiant'' zu dem Planeten fliegt, um sie zu retten unthält unterhält sich Lisa Cusak mit der Besatzung der ''Defiant''. Sie unterhält sich auch mit Bashir, aber Bashir ist aufgrund seiner Arbeit desinteresiertdesinteressiert, um mit ihr zu reden. Als dies Captain Cusak bemerkt, gibt sie vor von einem Monster gefressen zu werden und so bekommt sie die vollständige Aufmerksamkeit von Bashir. Bashir vertraut sich mit der Zeit Lisa Cusak an und redet viel mit ihr. Als die ''Defiant'' den Planeten endlich erreicht, gehört Bashir zu dem Außenteam, welches auf die Planetenoberfläche fliegt. Auf der Oberfläche findet das Außenteam den Leichnam von Captain Cusak. Cusak ist bereits seit mehren Jahren tot, aber aufgrund der ZeitbarierreZeitbarriere, welche den Planeten umgibt konnte die ''Defiant'' mit Cusak kontakt Kontakt aufnehmen. Auf Deep Space 9 veranstaltet man eine Gedenkfeier zu Ehren von Captain Cusak. Bei der Feier hält Bashir eine Rede und erklärt dort, obwohl er Lisa Cusak nicht persönlich gekannt hat, hat sie ihm sehr viel bedeutet. ({{DS9|Der Klang ihrer Stimme}})

Ende 2374 teilt Jadzia Dax Bashir und Quark mit, dass sie und Worf sich ein Baby wünschen. Als dies Bashir und Quark erfahren depremiert deprimiert sie das sehr, da die beiden noch immer die Hoffnung haben, dass die Ehe von Worf und Dax nicht lange hält. Die beiden begeben sich ins Vics und blasen dort Trübsal. Aber Vic Fontaine rät den beiden sich von Jadzia Dax zu lösen, da es keinen Sinn macht ihr nach zurennennachzurennen. Bashir bedankt sich bei Vic für den Rat. Als Dax später erfährt, dass sie und Worf genetisch kompatibel sind und ein Baby bekommen können, bedankt sie sich bei Bashir für alles und das er ein guter Freund ist. Später befindet sie sich im bajoranischen Tempel, als sie plötzlich, von dem mit einem Pah-Geist besessenen Dukat, angegriffen wird. Dukat verletzt sie schwer. Bashir gelingt es zwar den Dax-Symbionten zu retten, aber Jadzia stirbt aufgrund ihrer schweren verletzungen. ({{DS9|Tränen der Propheten}})

Nach dem Tod von Jadzia Dax verläßt verlässt Captain Sisko für einige Zeit die Station. Währenddessen trauert Worf um seine Frau. In dieser Zeit führt die ''Defiant'' häufig Konvoimissionen durch. Dies bedrückt Worf umso mehr, da seine Frau nicht ehrenvoll gestorben ist, wird sie nach den klingonischen Sitten nicht ins [[Sto'Vo'Kor]] gelangt. Durch die Konvoimissionen, hat Worf auch keine möglichkeiten Möglichkeiten ihre Ehre in einem glorreichen Kampf wieder herzustellen, damit ihre Seele ins Sto'Vo'Kor gelangen kann. Auch Bashir und O'Brien bemerken, dies und versuchen Worf zu helfen. Mit Hilfe von General Martok kann Worf an einer gefährlichen Schlacht teilnehmen. Mit der IKS ''Rotarran'' plant Martok die Schiffswerft des Dominion im Orbit von [[Monac IV]] angreifen. Als Freunde von Jadzia Dax wollen auch Bashir, O'Brien und auch Quark Worf auf dieser Mission begleiten. Während der Mission ist Worf verägert verärgert über Bashir, O'Brien und Quark, da er eifersüchtig auf die drei ist. Obwohl die drei auch Freunde von Dax gewesen sind, will Worf diese Mission allein für Jadzia Dax durchführen. Als Worf deswegen die drei anbrüllt, nimmt sich Martok ihn zur Brust und gibt ihn zu verstehen, dass sein Verhalten falsch ist und auch Jadzia Dax Freunde das Recht haben ihre Ehre wieder herzustellen. Später entschuldigt sich Worf bei den drei für sein Verhalten und erklärt ihnen wieviel Bashir, O'Brien und Quark für Jadzia Dax bedeutet haben. Die Mission verläuft erfolgreich der ''Rotarran'' gelingt es die Schiffswerften des Dominions zu vernichten. Dieser Sieg wird Jadzia Dax gewidmentgewidmet, damit ihre Seele ins Sto'Vo'Kor gelangen kann. Nach diesen Ereigniss kehrt Captain Sisko auf die Station zurück und bringt [[Ezri Dax]], den Nachfolgenden Wirt von Jadzia Dax mit. ({{DS9|Das Gesicht im Sand|Schatten und Symbole}})

Als Bashir Ezri Dax kennen lernt, ist dieser sofort faziniert fasziniert von ihr. Er freundet sich schnell mit ihr an und beginnt auch mit ihr zu flirten. Als Worf dies bemerkt bedroht er sofort Bashir und sagt ihm, dass er sich von Dax fernhalten soll. Worf hat zu der Zeit Probleme mit Ezri Dax, da in ihr ein Teil von seiner Frau lebt. Worf will nicht, dass Bashir durch das flirten mit Ezri Dax das Andenken seiner Frau zerstörrtzerstört. Zu der Zeit behandeln Ezri Dax und Bashir Garak, da dieser an schweren klaustrophobischen Anfällen leidet. Während dessen spricht O'Brien mit Worf und seinen Streit mit Bashir. Ezri Dax findet schließlich die Ursache von Garaks klaustrophobischen Anfällen. Worf gelingt es endlich Ezri Dax zu akzeptieren und er entschuldigt sich für sein Verhalten. ({{DS9|Nachempfindung}})

Ein ehemaliger Rivale von der Sternenflottenakademie fordert Captain Sisko zu einem [[Baseball]]spiel herrausheraus. Sisko will den vulkanischen Captain [[Solok (Captain)|Solok]] und seine Crew besiegen. Siskos Crew ist den Vulkaniern unterlegen mit Außnahme Ausnahme von Worf und den genetisch verbesserten Bashir. Sisko und seine Crew trainirentrainieren, um die Vulkanier zu besiegen. Bashir muss nach dem Trainig Training die Verletzungen, welche häufig durch den ungeschickten Rom entstanden sind, zu behandeln. Nachdem Sisko Rom aus dem Team schmeißt weigern sich Bashir und die anderen weiter für Sisko zu spielen. Erst als [[Kasidy Yates]] ihnen von der Feindschaft zwischen Sisko und Solok erzählt sind alle bereit für Sisko zu gewinnen. Obwohl Sisko und seine Crew das Spiel gegen die Vulkanier verlieren, begreift Sisko, dass nicht der Sieg sondern der Spass Spaß an diesem Sport zählt. Selbst Rom darf deswegen, im nachhinein Nachhinein an diesem Spiel teilnehmen. Nach dem Spiel feiern Sisko und seine Freunde ihren Erfolg und das dies Solok nicht versteht erfeut erfreut Sisko um so mehr. ({{DS9|Wettkampf in der Holosuite}})

Bashir gelingt es mit der Zeit ein Heilmittel zu finden, um die genetisch aufgewertete Sarina Douglas aus ihrer Isolation herauszuhelfen. Als dies Jack, Patrick und Lauren erfahren bringen diese, als Sternenflottenoffiziere verkleidet, Sarina nach Deep Space 9. Auch Nog fällt auf die vermeintlichen Offiziere rein, aber Bashir erkennt die drei sofort und bringt diese in einem Frachtraum, wo sie vorübergehend wohnen werden. Die Operation an Sarina verläuft erfolgreich und sie beginnt ihre Außenwelt wahrzunehmen. Aus dem stummen Mädchen wird eine lebhafte junge Frau. Bashir und sie verbringen ihre Freizeit zusammen. Bashir stellt Sarina auch seinen Freunden vor. Sarina fügt sich wieder erfolgreich in die Gesellschaft ein. Während der Zusammenarbeit mit Sarina verliebt sich Bashir in sie und die beiden küssen sich. Aber Sarina erwiedert erwidert seine Gefühle nicht, da sie aber nicht weiß wie sie sich verhalten soll kehrt Sarina in ihren alten Zustand zurück. Als Bashir von Jack, Patrick und Lauren erfährt, dass er dafür verantwortlich ist, lässt Bashir Sarina gehen. Sarina verabschiedet sich bald darauf von Bashirwährend Bashir während er seiner neuen Lieben nachtrauert. ({{DS9|Sarina}})

Als Nog den Schreibtisch von Catain Sisko vorrübergehend vorübergehend eintauscht, versucht O'Brien einen neuen zu besorgen, aber Bashir erwähnt nur, dass dieser neue Schreibtisch überhaupt keine ähnlichkeit Ähnlichkeit mit dem alten Schreibtisch von Captain Sisko hat. ({{DS9|Verrat, Glaube und gewaltiger Fluß}})

Einige Zeit später versuchen O'Brien und Bashir Worf von der Schlacht von Alamo und vorallem vor allem von dieser Legende zu berichten. ({{DS9|Der Dahar-Meister}})

Einige Zeit später wird Bashir mit beauftragt Versorgungsgüter nach [[AR-558]] zu liefern und Captain Sisko dorthin zu begleiten. Dieser Planet wird schwer vom Dominion umkämpft. Bevor Bashir zur Front aufbricht, läßt lässt er sich noch einige Musikstücke von Vic Fontaine mitgeben. Auf den Weg dorthin wird die ''Defiant'' von den Jem'Hadar angegriffen. Aber die ''Defiant'' geht aus der Schlacht siegreich hervor. Auf AR-558 verteidigt die Föderation eine wichtige Kommunikationsanlage, welche gegen das Dominion eingesetzt wird. Auf der Planeten setzten die Jem'Hadar [[Houdini]]s, kleine [[Subraum]][[Mine (Sprengkörper)|sprengminen]] gegen die Föderation ein. Fähnrich Nog bekommt den Auftrag auf der Oberfläche, das Jem'Hadar Lager auskundschaften. Da er mit seinem Gehör die Jem'Hadar besser auskundschaften kann. Bei dieser Mission wird Nog angegriffen und am Bein schwer verletzt. Bashir behandelt ihn zwar sofort, aber er kann das Bein von Nog nicht mehr retten und es muss amputiert werden. Während der Behandlung von Nog spielt Bashir die Lieder von Vic Fontaine ab. Nog gefällt diese Musik und erkundigt sich bei Bashir von wem das Lied stammt. Bashir erklärt Nog, dass die Musik von Vic stammt. Später wird die Kommunikationsanlage von den Jem'Hadar angegriffen. Auch Bashir nimmt an dem Kampf mit teil und befindet sich an vorderster Front. Ein Jem'Hadar greift Bashir an und tötet ihn fast, aber durch einen gezielten Schuß Schuss von Sisko wird Bashir gerettet. Obwohl es viele Verluste bei der Sternenflotte gegeben hat, verläuft die Schlacht siegreich und die Jem'Hadar werden auf AR-558 besiegt. ({{DS9|Die Belagerung von AR-558|Leben in der Holosuite}})

Nach dem Verlust seines Beins hat Nog Probleme sich in seiner Welt einzugliedern. Nog hat zwar eine gut funktionierende ProteseProthese, aber er leidet seelische Qualen. Nog geht nicht mehr zu den Therapiesitzungen von Bashir und Dax. Schließlich zieht sich Nog in die Holosuite zurück und lebt dort zusammen mit Vic Fontaine. Nogs Freunde machen sich zwar sorgen, dass Nog in einem der kindischen Holoprogramme von Bashir lebt, aber Ezri Dax meint, dass dies Nog bei seiner Behandlung hilft. Fontaine hilft Nog bei seiner Behandlung und Nog kehrt kurz darauf in sein wirkliches Leben zurück. ({{DS9|Leben in der Holosuite}})

Als Quark bemerkt, dass Bashir wieder mit Dax flirt ist dieser schlimm eifersüchtig auf ihn. Kurz darauf betet Quark zum [[Fiskus]] und bittet das Bashir die Station verläßtverlässt, damit er chancen Chancen bei Dax hat. ({{DS9|Die Tarnvorrichtung}})

Nach einer erfolgreichen Schlacht feiert Bashir mit Lieutenant [[Hector Ilario]] und seinen Freunden eine erfolgreich Kampf gegen das Dominion. Am nächsten Tag wird Ilario ermordet und Bashir untersucht den Leichnam. Als weitere Crewmitglieder auf Deep Space 9 ermordet werden, leiten Dax und Odo die untersuchungenUntersuchungen, während Bashir weiterhin die unangenehme Aufgabe der Autopsie der Leichname hat. Später findet Dax herrausheraus, dass Lieutenant [[Chu'lak]] für die Morde verantwortlich ist. ({{DS9|Freies Schußfeld}})

Durch ein kleine Spielerei von Felix, wird das Programm von Vic Fontaine verändert und Vics Casino wird von der [[Mafia]] übernommen. Um das Programm wieder in den Normalzustand zu bringen, muss man die Mafia aus dem Casino vertreiben. Vics Freunde wollen dies bewerkstellenbewerkstelligen, indem sie das Casino der Mafia ausrauben. Bashir muss hier bei für eine Ablenkung sorgen. Am Ende gelingt es das Casino der Mafia auszurauben und Vics Programm kehrt in seine ursprüngliche Version zurück. ({{DS9|Badda-Bing, Badda-Bang}})

Aufgrund seiner Erfahrungen mit den Biogenen Waffen des Dominions wird Bashir zu einer Konferenz auf [[Romulus]] eingeladen. Vor seinem Abflug wird Bashir von Luther Sloan besucht, welcher ihm für eine Mission für Sektion 31 beauftragt. Admiral Ross fliegt ebenfalls zu der Konfrenz Konferenz und Bashir informiert ihn über Sloan und sein Vorhaben auf Romulus. Ross empfiehlt ihm erstmal mit Sloan zusammen zuarbeiten. Die [[USS Bellerophon (NCC-74705)|USS ''Bellerophon'']] bringt Bashir, Admiral Ross und die Föderationsdelegation nach Romulus. An Bord der ''Bellerophon'' informiert Sloan Bashir über seine wahre Mission. Bashir soll für Sektion 31 feststellen, ob der Vorsitzende des [[Romulaner|romulanischen]] [[Geheimdienst]]es [[Tal Shiar]] [[Koval]] an dem unheilbaren [[Tuvan-Syndrom]] erkrankt ist. Auf der Konfrenz Konferenz trifft Bashir schließlich auf Koval. Bashir kann aber nichts an ihm feststellen. Als Bashir Sloan schließlich durch Admiral Ross verhaften lassen will, erkrankt der Admiral plötzlich. Bashir ist schließlich auf sich allein gestellt und da er niemanden trauen kann wendet er sich an die romulanische Senatorin [[Kimara Cretak|Cretak]]. Als später Bashir auf Romuls Romulus wieder auf Koval trifft, bringt er Bashir plötzlich in einen Verhörraum. Koval glaubt Bashir sei ein Föderationsagent, welcher ihn töten will. Bashir wird sogar vor dem romulanischen Senat gebracht und dort gesteht Bashir, dass Sektion 31 geplant hat Koval zu töten. Bashir erklärt auch das Sektion 31 eine illegale Organisation ist. Da Cretak Bashir bei dieser Verschwörung geholfen hat wird diese verhaftet. Plötzlich bringt Koval den schwer verletzten Sloan hinein. Koval erzählt, dass Sloan ursprünglich für den [[Geheimdienst der Sternenflotte]] gearbeitet habe und die Sektion 31 erfunden hat, damit er Koval ungestraft töten kann. Bashir wird darauf freigesprochen und darf zur ''Bellerophon'' zurück, während Sloan durch einen Kampf mit einer romulanischen Wache getötet wird. Zurück auf der ''Bellerophon'' stellt Bashir Admiral Ross zur Rede, da er nicht daran glaubt, dass Sloan tatsächlich tot ist. Ross räumt ein, dass Sloan kurz vor dem Phasertreffer weggebeamt werden sollte, wisse aber nichts über dessen Verbleib. Außerdem bestätigt er, dass Koval eigentlich für Sektion 31 arbeitet, man deswegen auf ihn angewiesen ist. Nachdem Bashir nach Deep Space 9 zurück gekehrt ist taucht Sloan plötzlich wieder auf und dankt Bashir für seine Hilfe. ({{DS9|Unter den Waffen schweigen die Gesetze}})

Bashir reagiert eifersüchtig, als erfährt, dass Ezri Dax mit Captain [[Boday]] ausgegangen ist. Da Jadzia Dax kurzzeitig ein Verhältniss Verhältnis mit ihm gehabt hat vermutet Bashir, dass Ezri Dax auch ein Verhältniss Verhältnis mit ihm beginnen will. Später begibt sich Dax auf die Suche nach Worf, da er in den Badlands vermisst wird. ({{DS9|Im Ungewissen}})

Worf und Dax gelingt es mit der Hilfe von Damar dem Dominion zu entkommen. Auf Deep Space 9 angekommen, berichten die beiden von der neuen [[Dominion-Breen-Allianz]]. Bashir freut sich, dass Dax sicher zur Station zurück gekehrt ist. Währenddessen beginnen die Breen mit einem [[Überfall auf die Erde|Angriff auf die Erde]] und es kommt zu einer Wende im Dominion-Krieg. Auf der Station bereitet man sich ebenfalls auf einen Angriff vor. Um sich von dem Stress abzulenken spielen O'Brien und Bashir an einem [[Modell|Modell des Alamo]] um sich mit dem Ausdenken neuer Strategien bei der Schlacht von Alamo abzulenken. Worf und Dax beobachten die beiden dabei. Worf findet das Verhalten der beiden kindisch, während Dax es süss süß findet, wie sich Bashir mit dem Modell beschäftigt. Beim Spiel mit dem Modell verliert Bashir die Figur des [[Travis]], dies verärgert O'Brien etwas. Später nimmt Bashir an Bord der ''Defiant'' an der [[Dritte Schlacht von Chin'toka|dritten Schlacht von Chin'toka]] teil. Die Breen beginnen das [[Chin'toka-System]] anzugreifen und es kommt zu einer großen Niederlage der [[Föderationsallianz]]. Während der Schlacht wird die ''Defiant'' zerstört und Bashir bringt die verletzte Kira von Bord der ''Defiant''. Nach der Schlacht beginnt Damar mit der [[Cardassianische Rebellion|cardassianische Rebellion]] gegen das Dominion. ({{DS9|Im Angesicht des Bösen}})

Nach der Niederlage von Chin'toka versucht die Föderation Damars Rebellion zu unterstützen. Kira, Odo und Garak werden zu Damar geschickt, um ihn zu unterstützen. Bevor Odo aufbricht, bittet Bashir ihn um eine Probe seiner [[Morphogene Matrix|morphogenen Matrix]], da er mit dieser [[Synthetisches Organ|synthetische Organe]] herstellen will. Während seiner Forschung macht er sich Sorgen, dass Dax wieder mit Worf zusammen kommt. Als Dax gerade zu Bashir kommt, um ihre Gefühle ihm gegenüber offenbart, stellt Bashir fest, dass Odo an den [[Morphogener Virus|morphogenen Virus]] leidet, welcher sein Volk tötet. Bashir teilt dies Odo mit und beginnt sofort mit der Forschung an einem Heilmittel für Odo. Obwohl er die [[Sternenflotten-Medizin]] um Unterstützung bittet, bekommt er keine Hilfe von ihnen. Erst mit Hilfe von Sisko bekommt Bashir sämtliche informationenInformationen, von der Sternenflotte, die er benötigt. Aber Bashir stellt fest, dass die Daten gefälscht sind und vermutet, dass Sektion 31 hinter der Krankheit der Gründer steckt. ({{DS9|Ein Unglück kommt selten allein}})

Die nächsten Wochen forscht Bashir erfolglos nach einem Heilmittel gegen Odos Krankheit, aber er ist erfolglos. Auch hat er keinen Erfolg dabei Sektion 31 aufzuspührenaufzuspüren, um so an ein Heilmittel zu gelangen. Bashir arbeitet bis zur völligen köperlichen körperlichen Erschöpfung. Schließlich versucht Bashir mit einem Trick Sektion 31 auf die Station zu locken. Bashir gibt der Sternenflotte bekannt, dass er ein Heilmittel für die Krankheit der Gründer gefunden hat und hofft das Sektion 31 den Köder schließlich schluckt. ({{DS9|Kampf mit allen Mitteln}})

Bashirs Trick geht schließlich auf und eines Nachts taucht Sloan auf und fordert das Heilmittel von ihm. Da Bashir mit Sloans erscheinen gerechnet hat, gelingt es ihm Sloan gefangen zu nehmen. Sloan bemerkt den Trick mit Bashirs Heimittel und gibt zu, überrascht zu sein. Bashir und O'Brien versuchen mit [[Romulanischer Gedächtnisscanner| romulanischen Gedächtnisscanner]] in seinen Geist einzudringen, um so an die Informationen für das Heilmittel zu gelangen. Aber mit Hilfe einer [[Neurodepolarisationsvorrichtung]] begeht Sloan Selbstmord und er droht innerhalb einer Stunde zu sterben. Mit Hilfe einer [[Multitronischer engrammatischer Übersetzer|multitronischen engramatischen Übersetzers]] dringen die beiden in das Gehirn und den Geist von Sloan ein, um so an die Information zu gelangen. Bashir und O'Brien wissen das sie nur wenige Zeit haben, um an die Informationen in Sloans Geist herran zu kommen heranzukommen und Sloan tut alles um dies zu verhindern. Schließlich gelingt es den beiden die Information zu bekommen. Sloan versucht Bashir mit in den Tod zu reißen und bietet ihn noch viele weitere Informationen über Sektion 31 an. Bashir kann dieser Falle nicht wiederstehen widerstehen und will noch mehr Information, aber O'Brien kann Bashir davon überzeugen den sterbenden Geist von Sloan zu verlassen. Den beiden gelingt es noch rechtzeitig Sloan zu verlassen und mit dem Heilmittel gelingt es Bashir Odo zu heilen. ({{DS9|Extreme Maßnahmen}})

Bashir hat auch weiterhin auch Probleme seine Gefühle gegenüber Ezri Dax zu offenbaren. Er weiß zwar mittlerweile, dass sie doch nicht mit Worf zusammen ist, aber die beiden gehen sich regelmäßig aus dem Weg. Als sie sich zufällig in einem Korridor begegnen sprechen sie schließlich darüber und beschließen nur Freunde zu bleiben. Doch bei einer weitern Begenung weiteren Begegnung im Turbolift ändern die beiden ihre Meinung und beginnen sich zu küssen. ({{DS9|In den Wirren des Krieges}})

Nachdem Bashir und Dax ein Paar geworden sind fliegen beide zusammen mit der neuen ''Defiant'' in die [[Schlacht um Cardassia]]. Auf den Weg dorthin erfährt Bashir, dass sein Freund Deep Space 9 verlassen wird und zur Erde zurückkehren wird. Es beginnt darauf eine lange harte Schlacht, welche mit Hilfe der übergelaufenden übergelaufenen Cardassianer gewonnen wird. Während des Kampfes macht sich Bashir vorallem vor allem um Ezri Dax Sorgen, er hat Angst sie bei dem Gefecht zu verlieren. Bashir muss auch den verletzen O'Brien behandeln und es gibt auch weitere Tote und Verletzte an Bord der ''Defiant''. Die Schlacht verläuft Siegreich, die Föderation gewinnt zusammen mit den Klingonen, den Romulanern und den Cardassianern den Krieg gegen das Dominion und die Breen. Auf Cardassia verabschiedet sich Bashir, nach der Erfolgreichen Schlacht von seinen Freund Garak, der auf Cardassia bleiben will. Auf Deep Space 9 wird der Friedensvertrag mit dem Dominion unterzeichnet. Danach findet eine Abschiedsfeier für Personen, welche in nächster Zeit Deep Space 9 verlassen werden, im Vics statt. Nachdem Sisko durch einen Sieg über die Pah-Geister im Wurmloch, als der Abgesante Abgesandte lebt, übernimmt Kira das Kommando über die Station. Bashir verabschiedet sich sich von seinen Freund O'Brien und verspricht mit ihm in Kontakt zu bleiben. Danach beginnt für Bashir ein neues Leben zusammen mit Ezri Dax auf Deep Space 9. ({{DS9|Das, was du zurückläßt, Teil I|Das, was du zurückläßt, Teil II}})

Julian Bashirs Eltern heißen [[Amsha Bashir|Amsha]] und [[Richard Bashir]]. Er ist das einzige Kind der beiden. Julian Bashir hat meinen seinen Eltern Probleme dadurch das sie ihn genetisch aufwerten ließ. Julian störrt auch vorallemvor allem, dass sein Vater ständig die Arbeit wechselt und nichts festes hat. Erst 2373 versöhnt sich die Familie wieder. ({{DS9|Dr. Bashirs Geheimnis}})

2370 tolleriert toleriert O'Brien mittlerweile Bashir, obwohl er ihn noch immer für Arrogant hält. Als die beiden zusammen Racquetball spielen, geht ihn Bashirs Verhalten wieder ziemlich auf die Nerven. Später im selben Jahr befinden sich die beiden sich aufgrund eines Konflikt zwischen den T'Lani und der Kelleruner in Lebensgefahr. Die werden aber gerettet und Aufgrund dieser gemeinsamen Erfahrung werden die beiden Freunde. ({{DS9|Rivalen|Das Harvester-Desaster}})

Die Freundschaft der beiden Männer ist so eng, dass O'Brien Bashir gesteht, obwohl er seine Frau Feiko Keiko O'Brien über alles liebt, mag O'Brien Bashir lieber als seine Frau. Bashir gibt darauf dieses Kompliment an seinem Freund zurück. ({{DS9|Extreme Maßnahmen}})

Bashir lernt Elim Garak anfang Anfang 2369 kennen. Da Bashir noch ziemlich naiv ist misstraut er den Schneider und hält ihn für einen Spion. Aber nach den ersten gemeinsamen Abenteuer werden die beiden Freunde und treffen sich einmal die Woche zum Essen. ({{DS9|Die Khon-Ma|Das Implantat }})

Die beiden philosophieren häufig beim Essen, diskutieren über Literatur, Kunst Kultur und auch über aktuelle Ereignisse. Bald wird aus dem wöchentlichen ein tägliches gemeinsames Essen. Bashir genießt diese Diskussionen vor allem versucht er alles über Garaks Vergangenheit herraus zufinden herauszufinden und Garak denkt sich für Bashir immer neue Lügen und Halbwahrheiten für den Arzt. Als sich Garak 2371 auf eine Mission befindet speißt speist Bashir statt mit Garak mit O'Brien. Obwohl der Chief Bashirs bester Freund ist bemerkt Bashir, dass er nicht das gleiche ist mit O'Brien als mit Garak essen zu gehen, da ihm die Diskussionen fehlen. ({{DS9|Der geheimnisvolle Garak, Teil I|Der geheimnisvolle Garak, Teil II}})

Die beiden versöhnen sich aber bald wieder. Ende 2375 bleibt Garak auf Cardassia, um dort mitzuhelfen seine Welt wiederaufzubauenwieder aufzubauen. Bashir bedauert, dass er einen guten Freund verliert und wünscht für Garaks Zukunft alles gute. ({{DS9|Das, was du zurückläßt, Teil II}})

Gegen Ende 2369 sieht es so aus, als ob sich Jadzia Dax in Julian Bashir verliebt hat. Später stellt sich herraus, dass die Jadzia Dax, welche Bashir geküsst hat in Wirklichkeit eine Phantasie Gestallt Gestalt ist, welche aus dem Gamma-Quadrant stammt. ({{DS9|Macht der Phantasie}})

Bashir flirtet weiter mit Dax, aber er erkennt, dass sie seine Gefühle nicht erwiedert erwidert und er gibt es schließlich auf ihr nach zu laufen. Mit der Zeit werden Jadzia Dax und Julian Bashir gute Freunde. Obwohl die beiden eine tiefe Freundschaft verbindet, liebt Bashir Dax noch immer. ({{DS9|Metamorphosen}})

2372 kommt Worf nach Deep Space 9. Mit der Zeit verlieben sich Worf und Dax. Die beiden heiraten schließlich 2374. Bashir fällt es schwer die beiden zusammen zu sehen und er redet auch oft mit Quark über sie, da Quark die selben Gefühle für Dax wie er hat. Bashir hofft insgeheim, dass die Ehe zwischen Worf und Dax zerrbrichtzerbricht. ({{DS9|Klingonische Tradition|Wandel des Herzens|Tränen der Propheten}})

Als Ende 2374 Dax Bashir berichtet, dass sie und Worf sich ein Baby wünschen, zerbricht dies sämtliche Hoffnungen das Worf und Dax irgendwann doch wieder trennen könnten. Deperemiert setzen sich Quark und Bashir ins Vics. Aber Vic Fontaine rät den beiden sich von Jadzia Dax zu lösen, da es keinen Sinn macht ihr nach zurennennachzurennen. Später trifft Dax auf Bashir und sie bedankt sich, dass er ein guter Freund. Kurz darauf wird Jadzia Dax von Gul Dukat getötet. ({{DS9|Tränen der Propheten}})

Erzri Dax gesteht Bashir später, dass wenn Worf nicht auf die Station gekomme gekommen währe, hätte sich Jadzia Dax in Bashir verliebt, da sie ihn sehr gemocht hat. ({{DS9|Nachempfindung}})

[[Melora Pazlar]] ist die erste [[Elaysianer]]in in der [[Sternenflotte]]. 2370 kommt sie an Bord nach Deep Space Nine. Da Pazlar von einem Planeten mit niedriger schwerkraft Schwerkraft stammt, ist sie in einer normalen Umgebung auf einem Rollstuhl angewiesen. Bevor sie an Bord der Station kommt bereitet sich Bashir auf sie vor und studiert ihre Krankengeschichte. Als die beiden sich kennen lernen, ist Bashir begeistert von ihr, aber Melora Pazlar will keinen Hilfe von dem Arzt. Aber Bashir gelingt es ihr Vertrauen zu gewinnen. Mit Hilfe der [[Neuromuskuläre Anpassung]], welche von Doktor [[Nathaniel Teros]] entwickelt wurde, will Bashir Melora Pazlar von ihrem Rollstuhl zu befreihenbefreien. Die Behandlung verläuft gut und Pazlar kann ihre ersten Schritte in einer normaler Umgebung durchführen. Während der Behandlung verlieben sich beide ineinander. Als Pazlar bemerkt, dass sie durch diese Behandlung nie wieder auf ihre Heimatwelt zurück kann, bricht sie die Behandlung wieder ab. Später verlässt sie Deep Space Nine und Bashir und Pazlar trennen sich. ({{DS9|Das Melora-Problem}})

Trotz der Trennung besitzt Leeta noch immer Bashirs Teddy Kukalaka. Ende 2373 muß muss Nog den Teddy im Auftrag von Bashir stehlen, damit er seinen Teddy wieder bekommt. ({{DS9|Die Karte}})

2374 lernt Bashir sie kennen, als dieser mit einer Gruppe gentisch genetisch aufgewerteten Menschen im Rahmen eines Projektes, zusammen arbeitet. Die Arbeit mit der Gruppe schreitet gut vorranvoran, nachdem die vier sich von Bashir verabschieden beginnt Bashir mit der Forschung nach einem Heilmittel um sie zu heilen. ({{DS9|Statistische Wahrscheinlichkeiten}})

Schließlich gelingt es Bashir 2375 ein Heilmittel zu finden und nach der Operation wird Sarina Douglas aus ihrer Isolation befreihtbefreit. Bashir hilft ihr sich in die normale Welt zu intigrierenintegrieren. Die beiden verbringen viel Zeit zusammen und Bashir verliebt sich in sie. Die beiden beginnen sich zu küssen. Aber Sarina erwiedert erwidert seine Gefühle nicht, da sie aber nicht weiß wie sie sich verhalten soll kehrt Sarina in ihren alten Zustand zurück. Als Bashir erfährt, dass er dafür verantwortlich ist, lässt Bashir Sarina gehen. Sarina Douglas beginnt kurz darauf ihr neues Leben, während Bashir seiner neuen Lieben achtrauertnachtrauert. ({{DS9|Sarina}})

Als Bashir sie kennen lernt, freundet er sich sofort mit ihr an und beginnt auch mit ihr zu flirten. Als Worf dies bemerkt bedroht er sofort Bashir und sagt ihm, dass er sich von Dax fernhalten soll. Worf hat zu der Zeit Probleme mit Ezri Dax, da in ihr ein Teil von seiner Frau lebt. Worf will nicht, dass Bashir durch das flirten mit Ezri Dax das Andenken seiner Frau zerstörrtzerstört. Später entschuldigt sich Worf bei Bashir und akzeptiert das Verhältniss Verhältnis zwischen den beiden. ({{DS9|Nachempfindung}})

2370 spielt Bashir mit O'Brien Racquetball, um sich mit diesen besser anzufreunden. O'Brien nimmt an, aber verliert gegen den überlegenen Bashir. O'Brien fühlt sich in seiner Ehre verletzt und fordert Bashir einige weitere Male heraus. Obwohl O'Brien weiterhin verliert versucht er weiter gegen den Arzt zu spielen. Bashir macht sich inzwischen Sorgen um den Chief, da er nicht mehr der jüngste ist. Um O'Brien nicht zu überfordern gelingt es Bashir mit einigen Tricks die Spiele vorzeitig abzubrechen. Später werden die Racquetballspiele durch die Glücksspielgeräte von Martus Mazur beinflusst beeinflusst und es scheint das O'Brien regelmäßig gewinnt. Aber auch nach dem die Geräte deaktiviert worden sind spielen die beiden in ihrer Freizeit weiter Racquetball. ({{DS9|Rivalen}})

Als 2373 herraus heraus kommt, dass Bashir genetisch aufgewertet ist, muss Bashir drei Schritte hinter O'Brien stehen, damit die beiden unter gleichen Bedingungen spielen können. ({{DS9|Dr. Bashirs Geheimnis}})

Ende 2374 beginnen Bashir und O'Brien die Schlacht von Alamo nach zu spielen. Bei diesem Programm verteidigen die beiden als [[Davy Crockett]] und [[Travis]] mit einer 200 Mann Armee [[Alamo]]. Da der Feind mit 2000 Mann überlegen ist verlieren die beide ständig die Schlacht. Bashir und O'Brien versuchen mit ihren gegebenen Mitteln die Schlacht zu gewinnen. Das Programm wird für die beiden zur Leidenschaft und ist den beiden heilig. Die beiden spielen dieses Programm stets zusammen und lassen keinen anderern anderen an der Schlacht mit teilnehmen. Als Lieutenant Hector Ilario und Ezri Dax die beiden fragen ob sie mitspielen dürfen, verweigern die beiden ihnen den Zugang zu ihrem Programm. Seit O'Brien Ende 2375 Deep Space 9 verlassen hat, spielt Bashir das Programm nicht mehr, da er dieses Programm nur mit seinem Freund zusammen gespielt hat. ({{DS9|Tiefes Unrecht|Im Angesicht des Bösen|Das, was du zurückläßt, Teil II}})

In einer [[Alternative Zeitlinie|Alternativen Zeitlinie]] wird Captain Sisko 2372 durch einen Unfall in den [[Subraum]] gezogen. 2373 taucht Sisko wieder auf und Bashir untersucht ihn darauf. Aber Bashir kann nicht verhindern, dass Sisko wieder in den Subraum gezogen wird. In der Zwischenzeit verschlechtert sich die Beziehung zwischen den Klingonen und der Föderation immer mehr und schließlich verlässt die Sternenflotte Deep Space Nine. Jake Sisko versucht mehre male seinen Vater zurück zuholenzurückzuholen, aber es gelingt ihm nicht. [[25. Jahrhundert|2422]] versuchen Jake Sisko, Jadzia Dax, Julian Bashir und Captain Nog Sisko aus dem Subraum zu befreihenbefreien. Bashir ist in dieser Zeit bereits zum Commander befördert worden. Auf der ''Defiant'' wird der Unfall, durch den Sisko in den Subraum gezogen worden ist nachzustellennachgestellt. Aber auch dies misslingt Jake und ihm gelingt es nicht seinen Vater zu retten. Schließlich findet Jake heraus, dass sein Tod seinen Vater retten kann. Beim letzten Besuch von seinen Vater tötet sich Jake und Benjamin Sisko wird zu dem Moment des Unfalls zurück geschleudert. Sisko kann diesen Unfall verhindern und diese [[Zeitlinie]] wird aufgelöst. ({{DS9|Der Besuch}})

Während der erforschung Erforschung eines Planeten wird die ''Defiant'' 2373 durch eine Energiebarriere in die Vergangenheit zurück geschleudert und stürzt im 22. Jahrhundert auf den Planeten ab. Da es keine Möglichkeit auf Rettung gibt, gründet die Crew der ''Defiant'' eine Siedlung auf dem Planeten, welche sie nun Gaia nennen. Bashir hat in dieser Zeit eine Beziehung mit Angie Kirby. Bashir hat mit ihr mehre Kinder und die Nachfahren sind bis ins 24. Jahrhundert als Mediziner tätig. Durch den Einfluss von Odo stürzt die ''Defiant'' nicht auf diesen Planeten und bleibt im 24. Jahrhundert. Die Siedlung wird aus fer der Geschichte gelöscht. ({{DS9|Kinder der Zeit}})

{{Dialogzitat||als Quark seinen schweren Koffer durch die Leitungen schiebt|Bashir|Quark, los, vergessen Sie es.|Quark|Das kann ich nicht, das ist alles was ich habe. Mein persönlicher Almanach und mein Familienalbum|Bashir|Sie ist voller goldgepresstem Gold gepresstem Latinum, das wissen sie genau.|Quark|Wer sagt das?|Bashir|Ihre Mutter, und zwar an dem Tag, an dem sie geboren wurden.||geht erbost auf Bashir los|Quark|Mach niemals Witze über eine Ferengimutter. Verhaltensregel Nummer 31.}} ({{DS9|Die Belagerung}}){{Dialogzitat|Bashir (gibt auf Dax nachzulaufen)|Sie genießt es. Es scheint so, als ob sie eine Art perversen Spass Spaß daran findet. Ich werde ihr in Zukunft nicht mehr nachlaufen. Wir werden ja sehen.}} ({{DS9|Metamorphosen}})

{{Dialogzitat||Bashir zu O'Brien als er glaubt, dass er sein eigener Urgroßvater ist|Bashir|Ich kann es kaum erwarten, Ihr Gesicht zu sehen wenn Ihnen auf Deep Space 9 bewußt bewusst wird das ich nie existiert habe.}} ({{DS9|Immer die Last mit den Tribbles}})