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Einige Zeit später erreicht die ''Enterprise'' eine Nachricht von einem Wesen namens [[Sargon]]. Sargon bittet Kirk, dass sich dieser und ein Außenteam auf die Oberfläche beamen und dort findet das Außenteam den Geist von Sargon in einer Kugel vor. Auf der Oberfläche übernimmt Sargon kurz den Körper von Kirk, um wieder eine kurzzeitige körperliche Existenz zu spühren. Darauf gibt Sargon Kirk wieder frei und äußert die Bitte das er, [[Thalassa]] und [[Hanoch]] die Körper von Kirk, Spock und [[Ann Mulhall]] übernehmen dürfen, damit sie so Androidenkörper für ihre Geister bauen können. Die Drei offiziere stimmen dem zu und Sargon, Thalassa und Hanoch übernehmen deren Körper. Doch Hanoch will keinen Androidenkörper, da ihm der Körper von Spock gefällt. Hanoch manipuliert im Körper von Spock Chapel und diese gibt Kirk ein Gift, damit Sargon im Körper von Kirk stirbt. Chapel spritzt unbewusst Kirk das Gift und Kirks Körper stirbt scheinbar mit Sargon. Doch Sargons Geist konnte sich retten und auch Kirk kann gerettet werden. Da Hanoch zu einer großen Gefahr wird ist Kirk gezwungen die Kugeln zu vernichten, damit Hanch nicht darin zurück kehren kann. Auch die Kugel in der sich Spocks Geist befindet wird vernichtet und Spock kommt dabei scheinbar ums Leben, doch diser rettet sich in den Körper von Chapel. Kirk tötet scheinbar den Körper von Spock und Hanoch verlässt den Körper und lösst sich dabei auf. Spocks Bewusstsein kehrt darauf aus Chapels Körper in seinen eigenen Körper zurück. Sargon sieht am Ende ein, dass er und seine Gefährtin Thalassa keinen Körper brauchen und die beiden verlassen die ''Enterprise'' als Energiewesen. ({{TOS|Geist sucht Körper}})
Als nächstes bekommt die ''Enterprise'' den Auftrag nach Kirks ehemaligen Geschichtsprofessor John Gill auf den Planeten [[Ekos]] zu suchen. Dieser hat dort den Auftrag die [[Kultur]] auf den Planeten zu beobachten. Als die Enterprise den Planeten erreicht, wird diese von einer Thermonuklearen Rakete angegriffen, obwohl die Ekosianer diese Waffe von ihren Entwicklungsstand noch nicht haben dürften. Dies bereitet Kirk Sorgen und er beamt mit Spock auf die Oberfläche. Zur Sicherheit lassen die beiden sich [[Subdermaler Transceiver]] injezieren. Als Kirk und Spock auf den Planeten beamen, stellen sie fest dass [[Nazi]]s auf diesen Planten herrschen und John Gill ihr Führer ist. Kirk und Spock Um nicht aufzufallen müssen die beiden sich als Nazis verkleiden um zu John Gill zu gelangenaus geben. Doch beide werden schnell enttarnt und ins Gefängnis gesperrt. Dort stellen sie festwerden die beiden ausgepeitscht und verhört, allerdings Schweigen Kirk und Spock auf die Fragen. Plötzlich kommt der Parteivorsitzende [[Eneg]] hinzu und erklärt dem SS-Offizier, dass er mit Bestrafung aufhören soll, da die beiden nicht gestehen und er befiehlt, dass John Gill von einem beide erstmal eingesperrt werden. Dort treffen Kirk und Spock auf [[Isak]], einen [[Zeoner|Zeonisten]] vom Nachbarplanet [[Zeon]]. Isak erklärt den beiden, dass die Ekosianerdie Zeonisten hassen und diese ausrotten wollen. Mit Hilfe der [[Rubindium|Rubindium-Kristalle]] namens aus dem Transponder und der Energie einer [[MelakonGlühbirne]] manipuliert wirdkönnen Kirk und Spock einen Energiestrahl erzeugen und zusammen mit Isak aus der Zelle ausbrechen. Die wahre Macht auf Drei fliehen in den Planten hat Melakon Untergrund wo sich eine Untergrundbewegung der Zeonisten befindet. Da Gill unter Drogen setztder Führer des Planeten ist, damit dieser bekannt gibtbegeben Kirk und Spcok mit Hilfe der Untergrundbewegung ins Hauptquartier. Dort finden die beiden herraus, dass Ekos Gill zwar für die Nachbarwelt Nazibewegung verantwortlich ist, aber der Ekosianer [[ZeonMelakon]] angreiftihn unter Drogen setzt und so heimlich über den Planeten regiert. Melakon ist auch für den Hass auf die Zeonisten verantwortlich. Unter den Einfluss von Drogen verkündet Gill den Angriff auf Zeon. Während die Rede kurz unterbrochen wird, versucht Kirk gelingt es Gill dazu wieder zur Vernuft zu bringen die Ekosianer vor und er setzt auch Stimulanzien, damit Gill wieder zu Sinnen kommt. Gill verkünder darauf dass der Angriff auf Zeon abgebrochen wird und das Melakon zu warnenfür diese schrecklichen Ereignisse verantwortlich ist. Melakon kann zwar Gill töten, wird dann aber darauf auch getötet. Die Ekosianer brechen den Angriff auf Zeon ab und beginnen so zu leben wie es Gill ursprünglich geplant hat in Frieden mit den [[Zeoner|Zeonisten]]Eneg, welcher ebenfalls zum Untergrund gehört verspricht eine friedliche Koexistenz zwischen beiden Welten. ({{TOS|Schablonen der Gewalt}})
[[Datei:Kirk und Tracey.jpg|thumb|Kirk und Tracey kämpfen gegeneinander.]]
Einige Zeit später wird die ''Enterprise'' ausgewählt, den neuen Computer [[M5]] von Dr. Doktor [[Richard Daystrom]] zu testen. Dieser Computer hat die Aufgabe die Mannschaft eines Schiffes und auch deren Captain zu ersetzen. Die ersten Tests von M5 sind erfolgreich und Kirk merkt schnell, dass er nun überflüssig ist. Aber M5 Kirk depremiert dies sehr da er sich nun überflüssig fühlt, doch McCoy spricht Kirk wieder Mut zu. Doch mit der Zeit kann kann bald nicht mehr zwischen Simulation und Wirklichkeit unterscheiden und er greift mehre den Erzfrachter [[Woden|''Woden'']] an. Kirk will den Computer abschlaten lassen, doch M5 lässt sich nicht deaktivieren und vernichtet den unbemannten Frachter. Kirk will weiter M5 deaktiveren lassen, doch der Computer aktiviert ein Kraftfeld und Kirk kommt nicht mehr an den Computer ran. Als Scott darauf die Energieversorgung unterbrechen will, verbindet sich M5 direkt mit den Warpkern und tötet dabei ein Besatzungsmitglied von Kirk. M5 hat nun die vollständige Kontrolle über die ''Enterprise'' und Kirk kann nichts dagegen tun. Zur selben Zeit nähert sich [[Commodore]] [[Robert Wesley]] mit seiner Flotte um einen Übungskampf gegen die ''Enterprise'' zu führen. Wesley ahnt nicht, dass die ''Enterprise'' unter der vollständigen Kontrolle von M5 steht und er beginnt den Übungskampf. Die ''Enterprise'' greift mit ihren ganzen Waffen die ungeschützten Schiffe an und Kirk muss hilflos mit ansehen wie der Sternenflotte anComputer weiter angreift. Wesley erteilt nun den Befehl die ''Enterprise'' zu vernichten. Inzwischen versucht Daystrom mit M5 Kontakt aufzunehmen und Kirk erkennt dabei, dass Daystrom seine Denkstruckturen in den Computer eingebaut hat. Als Daystrom erkennt, dass sein Projekt mit M5 gescheitert ist, erleidet dieser einen Nervenzusammenbruch. Kirk gelingt nimmt darauf Kontakt mit M5 auf und es aber M5 glingt ihm den Computer davon zu überzeugenÜberzeugen, dass sein Verhalten falsch ist und M5 deaktiviert sich. Kirk kann den Kampf mit den anderen Schiffen beenden und das M5 Projekt wird abgebrochen. ({{TOS|Computer M5}})
Kurz darauf bekommt die ''Enterprise'' den Auftrag nach der verschollenen [[USS Exeter (NCC-1672)|USS ''Exeter'']] zu suchen. Die ''Enterprise'' findet das Schiff im Orbit von [[Omega IV]]. Kirk beamt mit einem Außenteam an Bord und stellt fest, dass die gesamte Crew tot ist. Durch eine Aufzeichnung des Schiffarztes Doktor [[Carter]], dass ein Virus vom Planeten die Crew getötet hat und ein Übeleben nur auf der Planetenoberfläche möglich ist. Darauf beamt Kirk auf den Planeten und trifft dort auf den Captain [[Ronald Tracey]]. Dieser und dieser berichtet, dass seine Crew durch einen [[Virus]] getötet wurdeer als einzigster von der ''Exeter'' überlebt hat. McCoy beginnt auf der Oberfläche nach der Ursache der Krankheit zu finden. Plötzlich erscheint Tracy und bedroht das Außenteam. Nur er habe dadurch, Tracy nimmt Kontakt mit der ''Enterprise'' auf und erklärt Sulu dass er auf dem Planten geblieben das Außenteam infiziert ist überlebtund das Bewusstsein verloren hat. Kirk ist nun der Gefangene von Tracey und Tracey glaubt, dass erklärt Kirk das man auf diesem Planet unsterblich werden kann und bricht deswegen aus diesen Grund die Oberste Direktivegebrochen hat. Doch Kirk greift Tracey an und Kirk wird darauf in eine Gefängniszelle mit wilden [[Yang]]s gesperrt. Dort muss Kirk um sein Überleben kämpfen. Dort kann Kirk die Yangs überzeugen das er auf ihrer Seite ist nun gezwungen Tracey zu verhaftenund hilft diesen beim ausbruch. Doch die Yangs schlagen Kirk darauf nieder und fliehen. Aber Tracey wehrt sichMcCoy findet inzwischen herraus, später kommt dass man mit der Zeit immun gegen den Virus wird und das es zu einem Kampf zwischen den beiden Captains vor keine Unsterblichkeit auf dem Planeten gibt. Doch Tracey glaubt Kirk nicht und als die Yangs das Dorf der versammelten [[Yang|BevölkerungKohm]]s übernehmen provoziert Tracey weiter. Kirk erkennt das die Yangs ähnlich sind wie seine Vorfahren und sie auf der selben Seite stehen, doch Tracey erklärt den Yangs das Kirk in Wirklichkeit ihr Feind ist. Die Yangs lassen Kirk und Tracey in einem Kampf Gut gegen Böse kämpfen, da diese der Meinung sind dass das Gute immer gewinnt den . Nach einem harten Kampf siegt Kirk über Tracey und sie beginnen Kirk zu glauben. Kirk wird frei gelassen und verhaftet darauf Tracey. ({{TOS|Das Jahr des roten Vogels}})
[[Datei:Kirk und Elaan.jpg|thumb|left|Kirk hat seine Probleme mit Elaan.]]
Kirks bekommt als nächstes den Auftrag, Kontakt mit den [[Melkotianer]]n aufzunehmen. Aber diese weigern sich den Kontakt mit der ''Enterprise'' aufzunehmen. Als Trotz der Warnung beamt Kirk mit einem Außenteam auf den [[Melkot|Planeten der Melkotianer]]. Doch da Kirk es weiterhin versuchtnicht auf die Warnung der Melkotianer gehört hat, wollen die Melkotianer Kirk und sein Außenteam auf den Planeten hinrichten. Das Außenteam soll in einem Duell hingerichtet werden und eine Illusion der Stadt [[Tombstone]] entsteht. Kirk und sein Außenteam übernehmen die Rolle der [[Clanton-Bande]], welche [[19. Jahrhundert|1881]] bei einem Duell getötet wurden. Alle Versuche Kirk und seine Offiziere versuchen mehrfach aus der Stadt zu fliehen scheitern, doch die Melkoten verhindern dies. Kirk darauf den Bewohnern und den Earps in der Stadt klar zu machen, dass er nicht Clanton ist, doch keiner glaubt ihm. #da die Earps mit ihren Waffen Kirks Außenteam überlegen ist, versucht Kirk die Earps mit einem starken Gift zu betäuben. Aber auch das Gift zeigt keine Wirkung. Schließlich beginnt das Duell und das Außenteam wird gezwungen daran teil zu nehmen. Spock erkennt dass es sich hier alles um eine Illusion handelt und dass die Waffen in Wirklichkeit gar nicht töten können. Spock kann dem Außenteam mit Hilfe einer [[Geistesverschmelzung]] suggerieren, dass alles nur eine Illusion ist. Als das Duell beginnt sind Kirk und seine Männer gegen die Waffen immun. Als die Waffen keine Wirkung zeigen, kommt es zu einem Faustkampf zwischen Kirks Männern und ihren Feinden. Als Kirk seinen Feinden Gnade gewährt, bemerken die Melkotianer, dass die Föderation friedlich ist und der Kontakt findet am Ende doch statt. ({{TOS|Wild West im Weltraum}})
[[Datei:Kirk und Miramanee.jpg|thumb|Kirk und seine Frau Miramanee.]]
Auf den Planeten [[Amerind]] verliert Kirk durch die Einwirkung eines [[Obelisk]] sein Gedächtnis. Der Obelisk hat die Aufgabe den Planeten vor [[Asteroid]]en zu schützen. Kirk wird von dort lebenden [[Indianer]]n gefunden und wird wegen sein teilweise noch vorhanden Wissen zum [[Medizinmann]] ernannt. Kirk lebt als [[Kirok]] auf den Planeten und heiratet die Tochter des Häuptlings [[Miramanee]]. Nach der erfolglosen Suche nach Kirk, versucht Spock mit Hilfe der ''Enterprise'' zu verhindern, dass ein Asteroid auf den Planeten stürzt. Spock scheitert aber. In der Zwischenzeit werden die ersten Auswirkungen des Asteroiden auf den Planeten deutlich und Kirk soll im Obelisk dafür sorgen dass die Katastrophen aufhören. Aber Kirk gelingt dies nicht und die Bewohner halten Kirk für einen Schwindler. Sie beginnen ihn und Miramanee zu [[Steinigung|steinigen]]. Spock und McCoy beamen auf den Planeten und finden das schwer verletzte Paar. Spock kann den Obelisk aktivieren und den Planeten retten. McCoy kann zwar Kirk heilen aber Miramanee stirbt mit ihrem ungeborenen Kind. ({{TOS|Der Obelisk}})
Einige Wochen später ist Kirk von starken Selbstzweifeln geplagt und er gesteht sich Fehler ein in seinem Kommandostil. McCoy gibt Kirk darauf einen Ratschlag und baut damit Kirk wieder auf. ({{TOS|Spock unter Verdacht}})
Als sich Kirk durch den M5-Computer als Captain überflüssig fühlt spricht McCoy seinem Freund Mut zu, dass kein Computer einen Menschen ersetzen kann. ({{TOS|Computer M5}})
Kirk verfasst für Spock und McCoy ein [[Testament]], falls er stirbt. 2268 bekommt McCoy dieses zu Gesicht als Kirk in der Interphase verschwindet und für tot erklärt wird. Als Kirk wieder an Bord der ''Enterprise'' auftaucht, leugnen Spock und McCoy sich das Testament angesehen zu haben. ({{TOS|Das Spinnennetz}})