Wenige Wochen später transportiert die [[USS Honshu|USS ''Honshu'']] den Kriegsverbrecher Dukat zur [[Sternenbasis 621]], da er dort wegen seiner Taten vor Gericht gestellt werden soll. Zu der Zeit befindet sich auch Captain Sisko an Bord der ''Honshu''. Doch plötzlich taucht eine cardassianische Flotte auf und zerstört die ''Honshu''. Sisko und Dukat können jedoch mit einem Shuttle entkommen. Worf bekommt mit der ''Defiant'' den Auftrag nach Überlebenden der ''Honshu'' zu suchen. Der ''Defiant'' gelingt es einige Überlebende der ''Honshu'' zu bergen und an Bord zu beamen. Dukat und Sisko sitzen zu der Zeit auf der Oberfläche eines öden Planeten fest. Dukat versucht dort von Sisko Anerkennung zu erlangen, doch Sisko erkennt, dass Dukat wahnsinnig geworden ist. Sisko gelingt es zwar Dukat kurzzeitig zu überwältigen, doch Dukat gelingt es mit dem Shuttle zu fliehen und schwört in seinem Hass alles bajoranische Bajoranische zu vernichten. Sisko kann wenig später von der ''Defiant'' gerettet werden. Die ''Defiant'' begibt sich darauf in die Badlands, um dort einen Truppenkonvoi der Sternenflotte zu eskortieren. ({{DS9|Das Gute und das Böse}})

Zu der Zeit testet die Sternenflotte ein neue neues Schiff, welches speziell für taktische Einsätze entwickelt worden ist, die [[USS Prometheus (Prometheus-Klasse)|USS ''Prometheus'']]. Doch während eines Testfluges wird dieses Schiff von den Romulanern übernommen. Zu der Zeit schickt die im [[Delta-Quadrant]] en verschollene [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] ihr [[MHN]] über ein [[Hirogen-Kommunikationsnetzwerk]] auf die ''Prometheus''. Doch [[der Doktor]] findet nur tote Crewmitglieder vor und er erfährt, dass die Romulaner das Raumschiff übernommen haben. Der Doktor aktiviert das MHN der ''Prometheus'' und erfährt von diesem, dass sich die Föderation mit dem Dominion im Krieg befindet. Gemeinsam gelingt es beiden Hologrammen die Romulaner zu betäuben und die Kontrolle über das Schiff zu übernehmen. Doch als sie die Steuerung übernehmen wollen, melden die Sensoren, dass sich drei Warbirds der Romulaner nähern. Als sich zusätzlich ein Kampfverband der Sternenflotte der ''Prometheus'' nähert, kommt es zum Kampf zwischen der Sternenflotte und den Romulanern. Doch durch das Eingreifen beider Hologramme auf der ''Prometheus'' kann ein Warbird vernichtet werden und die anderen beiden Warbirds ziehen sich zurück. Darauf begibt sich ein Trupp der Sternenflotte auf die ''Prometheus'' und übernimmt wieder die Kontrolle über das Raumschiff. Der Doktor wird danach zurück in den Delta-Quadrant transferiert und berichtet, dass die Sternenflotte alles tun wird, um die ''Voyager'' nach Hause zu holen. ({{VOY|Flaschenpost}})

Der erste Jem'Hadar [[Kudak'Etan]] befiehlt Sisko und seinen Führungsoffizieren die ''Defiant'' zu reparieren. Doch dabei gerät Kudak'Etan in Konflikt mit seinen Zweiten [[Ixtana'Rax]], welcher die Crew sofort hinrichten will, da er befürchtet, dass diese die ''Defiant'' sabotieren. Inzwischen verlässt das winzige Runabout die Anomalie und fliegt in die ''Defiant'' hinein. Sisko versucht heimlich im Maschinenraum die Kontrolle über die ''Defiant'' zu übernehmen, doch er steht uner ständiger Beobachtung von Ixtana'Rax. Doch mit Hilfe der verkleinert verkleinerten Besatzung gelingt es Sisko die Kontrolle über die ''Defiant'' zu erlangen. Plötzlich entdeckt Ixtana'Rax das Vorhaben der Brückenoffiziere, als unerwartet das kleine Runabout die Jem'Hadar angreift. Es kommt zum Kampf und Sisko und seinen Brückenoffiziere gelingt es die Jem'Hadar zu töten. Nachdem Sisko wieder die vollständige Kontrolle über ''Defiant'' übernommen hat, wird das Runabout wieder auf seine normale Größe gebracht. ({{DS9|Das winzige Raumschiff}})

Inzwischen gelingt es der Sternenflotte Kontakt mit der ''Voyager'' über das Hirogen-Kommunikationsnetzwerk aufzunehmen. Die [[Liste von Crewmitgliedern der USS Voyager|Crew]] erfährt dadurch weitere schreckliche Details vom Dominion-Krieg und auch das , dass der Maquis vom Dominion ausgelöscht worden ist. Kurz darauf bricht allerdings der Kontakt zur ''Voyager'' wieder ab, da das Netzwerk der [[Hirogen]] zerstört worden ist. ({{VOY|Jäger}})

Wenige Wochen später wird Chief O'Brien vom [[Geheimdienst der Sternenflotte]] nach [[Farius Prime]] geschickt und soll dort das [[Orion-Syndikat]] unterwandern. O'Brien hat dort den Auftrag einen Verräter der Sternenflotte zu finden, welcher geheime Informationen an das Syndikat übergibt. Bei seiner Mission lernt O'Brien [[Liam Bilby]] kennen und dieser fängt mit der Zeit an O'Brien zu Vertrauenvertrauen. O'Brien findet schnell heraus , wer der Verräter in der Sternenflotte ist, allerdings findet O'Brien auch heraus, dass das Dominion mit dem Orion-Syndikat zusammen arbeitetzusammenarbeitet. Der Vorta Gelnon fordert vom Syndikat , den klingonischen Botschafter auf Farius Prime mit klingonischen Waffen zu töten. Es soll dann so aussehen , als sein ob ein feindliches klingonisches Haus für den Anschlag verantwortlich ist. Da es bekannt ist, dass der Botschafter gegen den Krieg mit dem Dominion ist, soll aus ihm ein Märtyrer werden und somit sollen sich mehr Klingonen seiner Sache anschließen. Das Dominion will damit erreichen, dass sich die Klingonen aus dem Krieg zurück ziehenzurückziehen, damit sie nur noch allein gegen die Föderation kämpfen. Doch der Geheimdienst der Sternenflotte warnt den Botschafter vor dem Attentat und als das Syndikat angreift , werden diese, darunter auch Bilby, getötet. ({{DS9|Ehre unter Dieben}})

Zu der Zeit hat die Sternenflotte einen cardassianischen Informanten , [[Lasaran]], welcher geheime Daten über das Dominion an die Sternenflotte übermittelt. Die beiden Sternenflottenoffiziere Worf und Dax bekommen den Auftrag eine geheime Botschaft von Lasaran zu empfangen und die beiden begeben sich mit einem Runabout zu dem Treffpunkt. Dort übermittelt Lasaran, dass er sich nach [[Soukara]] begibt um dort sich von den beiden abholen zulassenzu lassen, da Lasaran vermutet, dass er aufgeflogen ist. Worf und Dax begeben sich darauf nach Soukara, um sich mit Lasaran zu treffen. Damit sie nicht vom Dominion aufgespürt werden, landet das Runabout außerhalb des Sensorbereiches des Dominionstützpunkt Dominionstützpunktes und die beiden haben eine drei Tages Reise Dreitagereise durch den Urwald vor sich. Während die beiden sich durch den Urwald begeben , treffen sie auf eine Jem'Hadar Patrouille und bei dem Kampf wird Dax schwer verletzt. Worf beschließt darauf, seine Frau zurück zu lassen, um Lasaran zu retten. Doch schließlich entscheidet sich Worf, seine Frau zu retten und sie zurück zum Runabout zu bringen. Lasaran wartet vergeblich auf seine Rettung und versucht, zum Stützpunkt zurückzukehren. Dort wird dieser allerdings als Verräter vom Dominion getötet und der Geheimdienst der Sternenflotte verliert mit ihm einen wichtigen Informanten. ({{DS9|Wandel des Herzens}})

[[Datei:Vreenak schaut sich die Aufzeichnung an.jpg|thumb|Sisko presentiert präsentiert Vreenak die gefälschte Aufzeichnung.]]

Zu der Zeit werden an der [[Romulanische Neutrale Zone|Romulanischen Neutralen Zone]] immer wieder Patrouillen der Föderation von Jem'Hadar überfallen, die aus dem Romulanischen romulanischen Raum heraus angreifen, was anscheinend von den Romulanern geduldet wird. Captain Sisko beschließt zu der Zeit die Romulaner dazu zu bewegen, in dem den Dominion-Krieg einzutreten, um gegen das Dominion zu kämpfen.

Die Invasion von Betazed ist nun Ausschlagend ausschlagend für Sisko die Romulaner in den Krieg hin einzubeziehen. Sisko benötigt die Hilfe von Garak, um ein [[Optolytisches Datenstäbchen|cardassianisches Datenstäbchen]] zu fälschen, welches die Angebliche angebliche Invasion von Romulus durch das Dominion zeigt. Darauf lädt Sisko den romulanischen [[Senator]] [[Vreenak]] nach Deep Space 9 ein und präsentiert diesen diesem das Datenstäbchen. Vreenak sieht sich die Aufzeichnung über die Invasion von Romulus an und überprüft darauf das Datenstäbchen auf seine Echtheit. Doch Vreenak erkennt das , dass es sich hierbei um eine Fälschung handelt und Konfrontiert konfrontiert Sisko damit. Vreenak will diesen Betrug der Föderation seinem Volk überbringen, doch sein Schiff explodiert auf den Rückflug durch eine Bombe, welche Garak auf seinem Schiff versteckt hat.

In den Trümmern bergen die Romulaner das stark beschädigte Datenstäbchen mit der Aufzeichnung über die Invasion von Romulus. Das Datenstäbchen enthält einige Fehler, welche bei der Untersuchung des Vorfalls auf die Schäden durch die Explosion zurückgeführt werden. Zwei Tage später erklärt das Romulanische romulanische Sternenimperium dem Dominion offiziell den Krieg und greift noch am selben Tag fünfzehn Stützpunkte an der Cardassianischen cardassianischen Grenze an. ({{DS9|In fahlem Mondlicht}})

Der Ferengi -Sternenflottenoffizier Nog erhält von der Sternenflotte den Auftrag eine Botschaft an den großen Nagus Zek wegen einer Allianz zwischen der Föderation und den Ferengi zu überbringen. Die Föderation will damit erreichen, dass die Ferengi im Dominion-Krieg an der Seite der Föderation gegen das Dominion kämpfen. Nog begibt sich mit seinem Freund Jake Sisko in einem Runabout nach [[Ferenginar]], um diese Botschaft zu überbringen. Auf den Weg dorthin legen die beiden einen Zwischenstopp auf der [[Sternenbasis 257]] ein. Als die beiden mit ihrem Runabout die Station verlassen, nähert sich ein Geschwader Jem'Hadar-Angriffsjäger der Station und greift diese an. Doch ein Jem'Hadar-Angriffsjäger verfolgt das Runabout und Nog fliegt mit diesem in den Dominion-Raum. Als der Angriffsjäger das Runabout angreift, wird dieses von der ''Valiant'' gerettet. Nog und Jake Sisko werden an Bord des Kadettenschiffs gebeamt und lernen dort den Captain [[Tim Watters]] kennen. Watters hat sich als Aufgabe vorgenommen Daten über ein neues [[Jem'Hadar-Schlachtschiff]] zu sammeln. Doch nachdem die ''Valiant'' die Daten gesammelt hat, will Watters das Schlachtschiff der Jem'Hadar vernichten, obwohl dieses der ''Valiant'' weit überlegen ist. Bei dem Kampf gegen die Jem'Hadar wird die ''Valiant'' vernichtet und dabei wird die gesamte Crew getötet. Nur Jake Sisko, Nog und die Kadettin [[Dorian Collins]] können mit einer [[Fluchtkapsel]] entkommen und werden später von der ''Defiant'' gerettet. ({{DS9|Valiant}})

Kurz darauf greift die [[Zweite Flotte]] die Truppen des Dominion, die Betazed besetzt halten, dreimal an. Doch das Dominion schickt stets Verstärkungen und festigen festigt seine Position. ({{DS9|Der Klang ihrer Stimme}})