Wenige Wochen später erfahren [[Odo]] und [[Lieutenant]] [[Jadzia Dax]] von einen Fremden namens [[Rurigan]], dass seine [[Heimatwelt]] [[Yadera Prime]] vom Dominion erobert worden ist. ({{DS9|Die Illusion}})

Aufgrund des aktiven Flugverkehrs durch das Wurmloch wird das Dominion auf die Besucher aus dem Alpha-Quadrant Quadranten aufmerksam. Das Dominion beginnt damit Informationen über den Alpha-Quadranten zu sammeln. Mit der Zeit erhält das Dominion Informationen über dort einheimische Spezies und ihrer Kulturen, aber auch über das politische Geschehen im Alpha-Quadrant, wie etwa die Einrichtung der [[Entmilitarisierte Zone|Entmilitarisierten Zone]] zwischen den [[Cardassianer]]n und der Föderation. Da das Dominion kein weiteres Eindringen in seinen Raum wünscht, beginnt das Dominion dem ein Ende zu setzen. ({{DS9|Der Plan des Dominion}})

Zu der Zeit befinden sich Commander Sisko, sein Sohn [[Jake Sisko|Jake]], [[Quark]] und sein Neffe [[Nog]] auf einem Planeten im Gamma-Quadranten, um diesen zu erforschen. Während Sisko und Quark am Abend auf eine Fremde, welche sich [[Eris]] nennt treffen, werden sie plötzlich von den Jem'Hadar angegriffen und entführt. Sisko, Quark und Eris sind nun Gefangene des Dominions und werden von den Jem'Hadar verhört. Währenddessen erscheint bei Deep Space 9 ein [[Jem'Hadar-Angriffsjäger]] und der Jem'Hadar [[Talak'talan]] beamt sich auf die [[Operations Center|OPS]] der Station. Talak'talan informiert die [[Führungsoffizier]]e darüber, dass das Dominion keine Einmischung mehr wünscht und die Durchreise durch das Wurmloch unterbinden will. Um dies zu bekräftigen übergibt Talak'talan eine Liste von Schiffen welche vom Dominion vernichtet worden sind und Talak'talan bestätigt auch, dass Neu Bajor von den Jem'Hadar ausgelöscht worden ist. Des weiteren bestätigt Talak'talan, dass sich Commander Sisko in der Gewalt des Dominons befindet. Darauf beamt sich Talak'talan von der Station.

Als Folge dieser Warnung, wird vorerst jeglicher Verkehr durch das Wurmloch in den Gamma-Quadranten eingestellt. Im Auftrag der Sternenflotte fliegt die [[USS Odyssey|USS ''Odyssey'']], unter dem [[Kommando]] von [[Captain]] [[Keogh]] in den Gamma-Quadrant, um Sisko, Quark und die Jungen zu retten. Die Führungsoffiziere von Deep Space 9 unterstützen die ''Odyssey'' mit den zwei [[Runabout]]s der [[USS Mekong|USS ''Mekong'']] und der [[USS Orinoco|USS ''Orinoco'']] bei dieser Befreiungsaktion. In der nähe des Planeten wird die Föderationsflotte von drei Jem'Hadar-Angriffsjägern angegriffen. Die ''Odyssey'' wird bei diesem Gefecht schwer beschädigt, da die feindlichen Schiffe mit ihren [[Polaronwaffe]]n in der Lage sind die [[Schutzschild|Schilde]] der Sternenflottenschiffe zu durchdringen. Inzwischen gelingt es Sisko, Quark und Eris den Jem'Hadar zu entkommen und sie werden an Bord eines der Runabouts gebeamt. Zur gleichen Zeit stürzt sich plötzlich unerwartet einer der Angriffsjäger in die ''Odyssey'' und diese wird dabei so stark schwer beschädigt, dass die ''Odyssey'' schließlich explodiert. Nach der Rückkehr in den Alpha-Quadranten enttarnt Quark Eris als [[Spion]]in des Dominions. Sisko erkennt den Plan des Dominions, dass Eris in den Alpha-Quadrant gelangen und diesen dort ausspionieren soll. Als Eris enttarnt wird, beamt sich diese mit den Worten an Sisko, dass er keine Ahnung hat was gerade begonnen hat, von Deep Space 9. Sisko plant darauf sich auf einen Angriff des Dominions vor zu bereiten. ({{DS9|Der Plan des Dominion}})

In den folgenden Wochen werden auf Deep Space 9 Simulation durchgeführt, wie schnell das Dominion die Station übernehmen kann. Doch die Ergebnisse fallen alle sehr schlecht aus. Zu der Zeit begibt sich Sisko, wegen der Gefahr des Dominions Bedrohung durch das Dominion zur [[Erde]]. Zum besseren Schutz [[von Bajor]]s und Deep Space 9 bekommt Sisko [[2371]] das experimentelle Kampfschiff [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'']] von der Sternenflotte zugewiesen. Die ''Defiant'' verfügt über eine [[Tarnvorrichtung]] der [[Romulaner]], die im Gegenzug mit allen gesammelten Informationen bezüglich des Dominion versorgt werdenwollen. Sisko bekommt von der Sternenflotte den Auftrag mit der ''Defiant'' in den Gamma-Quadrant zu fliegen, um Kontakt mit den [[Gründer]]n aufzunehmen. Da Quark bereits Verhandlungen mit den Karemma, einem Mitglied des Dominions durch geführt hat, zwingt ihn Sisko ihn auf dieser Mission zu begleiten, um so Kontakt mit den Dominion herstellen zu können. Mit Hilfe der Karemma erfährt Sisko von einer [[Kommunikation]]srelaisstation auf [[Callinon VII]], mit der die Karemma Kontakt mit den Gründern auf nehmen. Jadzia Dax und [[Chief]] [[Miles O'Brien]] beamen darauf auf die Relaisstation, werden dort allerdings gefangen genommen. Da sich mehre Jem'Hadar-Angriffsjäger dem Planeten nähren, ist Sisko gezwungen Dax und O'Brien auf den Planeten zurück zulassen. Wenig später wird die ''Defiant'' von drei Jem'Hadar-Angriffsjägern angegriffen und dabei schwer beschädigt. Die Jem'Hadar beamen sich an Bord und überwältigen dort die Crew. Nur [[Kira Nerys]] und [[Odo]] können mit einem [[Shuttle ]] entkommen. Odo steuert das Shuttle zu einem Planeten im [[Omarion-Nebel]]. Auf der Oberfläche trifft Odo zum ersten Mal auf seine Spezies. ({{DS9|Die Suche, Teil I}})

Zur selben Zeit befinden sich die Führungsoffiziere der ''Defiant'' in der Gewalt des Dominions. Die [[Gründer ]] versuchen in einer Simulation heraus zu finden, wie viel die Föderation für den Frieden bereit ist zu Opfern. In dieser Simulation will das Dominion die Kontrolle über Bajor übernehmen, aber Sisko und seiner seine Führungsoffiziere sind nicht bereit dies zu zulassen und sind sogar dazu bereit das Wurmloch zu verschließen, um eine [[Invasion]] des Dominions zu verhindern. Odo und Kira finden inzwischen heraus, dass Odos Spezies, bestehend aus [[Formwandler]]n, Sisko und seine Führungsoffiziere gefangen halten. Odo und Kira befreien darauf die Führungsoffiziere und diese erkennen, dass die vergangenen Ereignisse nur eine Simulation gewesen sind. Odo vermutet darauf, dass seine Spezies Mitglied des Dominions ist. Aber die Formwandler widerlegen diese Aussage sondern erwidern, dass sie das Dominion und somit ihre Gründer sind. Odo entschließt sich darauf nicht bei seinem Volk zu bleiben, sondern kehrt mit der ''Defiant'' in den Alpha-Quadrant zurück. ({{DS9|Die Suche, Teil II}})

Nach dem Scheitern der Friedensverhandlungen mit dem Dominion beginnt ein [[kalter Krieg]] zwischen der Föderation und dem Dominion. Es herrscht innerhalb des [[Föderationsraum]] eine große Furcht vor dem Dominion. Vor allem auf Deep Space 9 macht sich Angst breit, so dass immer mehr [[Familie]]n und [[Händler]] die Station verlassen. ({{DS9|Das Haus des Quark}})

Wenige Wochen später kauft Quark die [[Trümmer]] eines Schiffswracks aus dem Gamma-Quadrant. Allerdings befindet sich in dem Wrack ein [[Baby]], dessen Spezies unbekannt ist. Nach [[Doktor]] [[Julian Bashir]] ist das Baby gesund, zeigt allerdings einen erhöhten [[Stoffwechsel]] an. Doch das Baby entwickelt sich innerhalb von drei Tagen zu einem ausgewachsenen Jem'Hadar. Anhand diesen Jem'Hadar-Jungen findet Bashir heraus, dass die Dominion-Soldaten [[Genetik|genetisch]] gezüchtet werden und dass sie von einer [[Droge]] namens [[Ketracel-White]] abhängig sind, sobald sie ein gewisses Alter erreicht haben. Wie alle Jem'Hadar ist auch dieser sehr aggressiv, aber Odo versucht den Jungen zu helfen friedfertig zu werden. Als Odo allerdings damit scheitert, befiehlt die Sternenflotte Sisko, den Jungen zur [[Sternenbasis 201]] zu bringen, damit der Junge dort analysiert werden kann. Da Odo nicht will, dass der Junge als Versuchsobjekt endet oder sogar getötet wird, bringt Odo den Jungen in den Gamma-Quadrant zurück zum Dominionzurück. ({{DS9|Der Ausgesetzte}})

Nach dem Scheitern, mit dem Anschlag auf das bajoranische Wurmloch beginnt auch der romulanische [[Geheimdienst]] [[Tal Shiar]] gegen das Dominion aufzurüsten, und nach geheimen Verhandlungen mit [[Enabran Tain]], dem Leiter des Ordens, schließen sich beide Geheimdienste zusammen. Allerdings erfahren die Gründer von dem Vorhaben der Cardassianer und der Romulaner und sie schicken einen [[Wechselbalg]], in der Gestalt von [[Colonel]] [[Lovok]] zu den Romulanern. [[Lovok (Gründer)|Lovok]] fördert den Angriff auf die [[Heimatwelt der Gründer|Heimatplaneten der Gründer]], damit dort die Flotte der Cardassianer und der Romulaner in eine Falle des Dominions gerät.

Der Tal Shiar stattet die cardassianische Flotte mit Tarnvorrichtungen aus. Schließlich und schließlich steht eine Flotte von 20 Raumschiffen für den Angriff auf die Heimatwelt der Gründer bereit. Die beiden Geheimdienste wollen dort die [[Große Verbindung]] mit einem vernichtenden Schlag auszuschalten, damit das Dominion destabilisiert wird und somit keine Bedrohung mehr für den Alpha-Quadranten darstellt. ({{DS9|Der geheimnisvolle Garak, Teil I}})

Die Flotte enttarnt sich bei Deep Space 9 und Commander Sisko meldet darauf der Sternenflotte die Invasion auf das Dominion Kurz . Kurze Zeit später schickt Tain eine Erklärung über seinen Angriff und seine Ziele, an alle Großmächte im Alpha-Quadrant. Das cardassianische Zentralkommando will allerdings nichts mit diesen Angriff zu tun haben, da es sich hier um eine Operation des Obsidianischen Ordens handelt.

Als die Klingonen die cardassianischen Verteidigungslinien durchbrechen, beschließt Sisko die Mitglieder des Detapa-Rat vor den Klingonen nach Deep Space 9 in Sicherheit zu bringen. Die ''Defiant'' begibt sich in den von Klingonen besetzten cardasssianischen Raum. Die ''Defiant'' erreicht schließlich die schwer beschädigte [[Prakesh|''Prakesh'']], welche die Ratsmitglieder transportiert. Doch die ''Prakesh'' wird von mehren klingonischen Schiffen angegriffen. Sisko ist darauf gezwungen die Klingonen anzugreifen und während des Kampfs werden die Ratsmitglieder an Bord der ''Defiant'' gebeamt. Nachdem die Ratsmitglieder an Bord der ''Defiant'' befinden, fliegt diese zurück nach Deep Space 9. An Bord der ''Defiant'' führt Doktor Bashir einige Blutuntersuchungen durch und kann beweisen, dass die Ratsmitglieder keine Wechselbälger sind. Die ''Defiant'' kehrt zur Station zurück, doch dort wird diese von der klingonischen Flotte erwartet. Martok und Gowron fordern die Auslieferung der Ratsmitglieder, obwohl Sisko beweisen kann, dass diese keine Gründer sind. Doch Gowron fordert trotzdem die Auslieferung, als Sisko sich aber weigert, greifen die Klingonen Deep Space 9 an. Da man sich auf Deep Space 9 auf eine Invasion des Dominions vorbereitet hat, wurde die Station im vergangenen Jahr waffentechnisch aufgerüstet. Bei dem Kampf verlieren die Klingonen viele Schiffe, dennoch durchbrechen diese die [[Schutzschild|Schilde]] der Station. Die Klingonen beamen an Bord der Stationen, können dort aber von den Sicherheitskräften der Föderation und Bajoraner in Schacht gehalten werden. Als die Verstärkung der Sternenflotte eintrifft, fordert Sisko Gowron auf, den Angriff ab zu brechen. Sisko erinnert Gowrondaran, dass sie genau das tun was die Gründer wollen, jeder kämpft gegen jeden und das Dominion hat dann leichtes Spiel den Alpha-Quadrant zu übernehmen. Gowron sieht das schließlich ein und beendet den Angriff, obwohl Martok weiterkämpfen will. Gowron will zwar nicht, dass der Alpha-Quadrant in die Hände der Gründer fällt, kann aber auch nicht den Verrat der Föderation verzeihen. Die Klingonen ziehen sich zwar zurück, aber sie behalten die eroberten Territorien der Cardassianer. Die Gründer haben somit erreicht was wollten, die Allianz zwischen den Klingonen und der Föderation ist zerbrochen. ({{DS9|Der Weg des Kriegers, Teil II}})

Die Klingonen verwickeln nun den ganzen Quadranten in einen Krieg, sie greifen Außenposten der Föderation und sogar der Romulaner an und mit der Zeit schwächen sich die Großmächte im Alpha-Quadrant immer mehr. ({{DS9|Der Hippokratische Eid}})

Während einer Mission im Gamma-Quadrant stürzt ein Runabout von O'Brien und Bashir auf einen Planetenab. Dort werden die beiden von einer Gruppe abtrünniger Jem'Hadar gefangen genommen. Der Anführer [[Goran'Agar]] bittet Bashir sie von der Abhängigkeit von Ketracel-White zu befreien. Bashir versucht den Jem'Hadar zu Helfen und erfährt in dieser Zeit viel über die Struktur des Dominions. Obwohl Bashir den Jem'Hadar nicht helfen kann, lässt Goran'Agar Bashir und O'Brien wieder frei und die beiden kehren in den Alpha-Quadrant zurück. ({{DS9|Der Hippokratische Eid}})

Zu der Zeit werden auch seltsame Aktivitäten am bajoranischen Wurmloch beobachtet und die Föderation vermutet eine getarnte Flotte des Dominions. Die Föderation sieht eine große Bedrohung und nach dem Anschlag auf der Erde, werden Captain Sisko und Odo auf die Erde beordert, um die Formwandler auf der Erde auf zu spüren. Captain Sisko, Odo und [[Admiral]] [[Leyton]] versuchen die Sicherheit auf der Erde zu verbessern und ihnen gelingt es auch Jaresh-Inyo von ihren Plänen zu überzeugen. Es finden nun überall auf der Erde [[Bluttest ]]s bei Angehörigen der Sternenflotte statt, allerdings sieht Jaresh-Inyo die Gefahr, dass dadurch der Frieden auf der Erde gestört wird. Als Odo auf Commander [[Erika Benteen]] und Admiral Leyton trifft, bemerkt Odo plötzlich ein seltsames Verhalten an dem Admiral. Odo bemerkt, dass dies gar nicht Leyton ist, sondern ein Gründer, welcher Leytons Gestalt angenommen hat. Dem Gründer gelingt es allerdings zu entkommen, doch Odo ist verwundert über das ihm gegenüber gezeigte feindselige Verhalten, welches bisher nicht mit ihm und seinen Volk bestanden hat. ({{DS9|Die Front}})

Während eines Aufenthalts auf der Erde erklärt sich [[Odo]] bereit, sich von der [[Medizinisches Corps der Sternenflotte|medizinischen Abteilung der Sternenflotte]] genauer untersuchen zu lassen, um anhand der Untersuchungsergebnisse die Formwandler besser entdecken zu können. Bei dieser Gelegenheit infiziert [[Sektion 31]] ihn heimlich mit einem [[morphogener Virus|morphogenen Virus]]. Sie hoffen darauf, dass Odo im Laufe der Zeit erneut Kontakt zu der Großen Verbindung herstellt, wodurch auch alle anderen Gründer infiziert würden. ({{DS9|Ein Unglück kommt selten allein|Kampf mit allen Mitteln|Extreme Maßnahmen}})

Einige Zeit später kommt es zu einem kompletten Energieausfall auf der Erde. Sisko vermutet eine Sabotage der Gründer auf das Hauptenergierelais der Erde. Durch diesen Systemausfall ist die Erde wehrlos, da auch sämtliche Verteidigungssystem des Planeten ausgefallen sind. Admiral Leyton fordert Jaresh-Inyo auf, dass [[Kriegsrecht]] auf der Erde auf aus zu rufen und die Verantwortung des Planeten unter die Kontrolle der Sternenflotte zu legen. Jaresh-Inyo stimmt dem nur widerwillig zu und übergibt nun die Kontrolle an Leyton und wenig später werden Truppen der Sternenflotte überall auf die Erde gebeamt. ({{DS9|Die Front}})

Bei weiteren Untersuchungen deckt Sisko eine vollständige Machtübernahme der Erde von Leyton auf. Doch als Sisko dies Jaresh-Inyo präsentiert, täuscht Leyton vor, dass Sisko ein Wechselbalg ist und Sisko wird verhaftet. Doch mit Hilfe von Odo gelingt Sisko die Flucht. Auf Deep Space 9 wird eine Sabotage des Wurmlochs entdeckt, welche die seltsamen Aktivitäten des Wurmlochs erklärt. Die ''Defiant'' fliegt mit dem Beweis zur Erde, doch Leyton befiehlt die ''Defiant'' mit der [[USS Lakota|USS ''Lakota'']] an zu greifen. Captain Erika Benteen bekommt von Leyton die Information, dass sich an Bord der ''Defiant'' Gründer befinden. Es kommt im [[Weltraum]] zu schweren Gefechten zwischen beiden Schiffen und es gibt viele Verletzte und Tote. Zur selben Zeit gelingt es Sisko Leyton zu stellen. Sisko gelingt und ihm es mit einer Kommunikation schließlich auch Benteen davon zu überzeugen ihren Angriff ab zu brechen. Als Leyton erkennt, dass sein treuster Offizier ihn im Stich gelassen hat, gibt er schließlich auf. Trotz der Gefahr der Gründer werden die Truppen der Sternenflotte wieder abgezogen. ({{DS9|Das verlorene Paradies}})

Als sich Odos Zustand immer mehr Verschlechtert, hat Odo keine andere Wahl, er muss zurück zu seinem Volk, damit diese ihn helfen können. Die ''Defiant'' fliegt darauf in den Gamma-Quadrant und auch Garak fliegt auf bei dieser Mission mit, da er erfahren will, ob es Überlebende Cardassianer vom Angriff auf die Heimatwelt der Gründer gegeben hat. Garak bekommt während des Fluges, die Aufgabe sich um Odo zu kümmern. Die Gründer werden schnell auf die ''Defiant'' aufmerksam und die [[Gründerin]] beamt sich mit einigen Jem'Hadar an Bord der ''Defiant''. Sie erklärt sich bereit Odo zur neuen Heimatwelt der Gründer zu bringen. Als die Gründerin zu Odo kommt, kann diese ihn vorübergehend stabilisieren, aber sie erklärt ihm auch das er mit in seine Heimatwelt muss, um dort geheilt zu werden. Odo erfährt von der Gründerin, dass die Gründer ihn infiziert haben, damit er nach Hause kommt um dort für den Mord an einem anderen Gründer verurteilt zu werden.

Auf der ''Defiant'' versucht Garak heimlich einige [[Quantentorpedo]]s auf die Planetenoberfläche zu schießen, um so die Große Verbindung auszulöschen. Doch dieser wird von Worf aufgehalten und verhaftet. Während über Odo in der Großen Verbindung gerichtet wird, sieht Odo viele Bilder darunter auch von Gowron. Die Gründer verurteilen Odo schließlich ein [[Solid]] zu sein und er wird in eine Form gesperrt, die er nicht mehr verlassen kann. Auf Deep Space 9 erscheint eine weitere Botschaft von Gowron, dass er nun jedes Föderationsschiff angreifen lassen wird, welches sich im Archanis-Sektor befindet. Als Odo diese Botschaft sieht, erklärt er das Gowron ein Wechselbalg ist. ({{DS9|Das Urteil|Kampf mit allen Mitteln|Extreme Maßnahmen}})

Einige Zeit später steht Bajor kurz davor der Föderation bei zu treten. Auf Deep Space 9 wird dazu die Unterzeichnung geplant. Zu der Zeit bekommt Sisko von den [[Propheten ]] einige Visionen und auch Warnungen über die Zukunft. Sisko sieht einen Heuschreckenschwarm, welcher auf Bajor den [[Himmel (Planet)|Himmel]] verdunkelt, doch dieser fliegt plötzlich nach Cardassia. Sisko versteht diese Botschaft, Bajor darf noch nicht der Föderation beitreten, da es ansonsten Untergehen wird. Während der Unterzeichnung erklärt Sisko, dass Bajor noch nicht bereit ist der Föderation bei zu treten. Die Bajoraner hören auf ihren [[Abgesandter|Abgesandten ]] und wollen vorerst nicht der Föderation beitreten. ({{DS9|Heilige Visionen}})

Kurz darauf empfängt Deep Space 9 eine verschlüsselte cardassianische Botschaft aus dem Gamma-Quadrant. Garak erkennt, dass diese Botschaft von Enabran Tain stammt. und Sisko erlaubt Garak darauf Garak, dass dieser Tain im Gamma-Quadrant suchen darf. Bei dieser Suche begleitet Worf Garak in den Gamma-Quadrant. Doch während der Suche dringt das Runabout der beiden in den Raum des Dominions ein. Damit die beiden nicht entdeckt werden durchfliegt das Runabout einen [[Stellarer Nebel|Nebel]]. Doch dort trifft das Runabout auf eine Invasionsstreitmacht des Dominions, welche auf das Wurmloch zufliegt. Worf schickt noch schnell eine Botschaft zur Station, dass eine Invasion bevorsteht und darauf werden die beiden von den Jem'Hadar gefangen genommen und ins Internierungslager 371 gebracht.

Doch Sisko erreicht eine Botschaft von dem echten Bashir und darauf lässt dieser mit der ''Defiant'' die ''Yukon'' verfolgen. Bevor der Wechselbalg mit der ''Yukon '' in den [[Stern]] fliegen kann, wird diese mit dem [[Traktorstrahl]] der ''Defiant'' abgefangen und von dem Stern entfernt. Die Bombe explodiert und vernichtet das Runabout mit dem Wechselbalg an Bord. Plötzlich verschwinden auch die Signale der Dominion-Flotte und Sisko erkennt darauf die Falle des Dominions. Da es nun doch keinen Angriff gibt, zieht sich die Flotte der Föderation, Klingonen und Romulaner vorerst zurück. Da aber die Bedrohung durch die Cardassianer und des Dominions weiter vorhanden ist, bleibt eine klingonische Militärpräsenz unter der Führung von General Martok auf Deep Space 9 zurück. ({{DS9|Im Lichte des Infernos}})

Die Föderation erkennt die neue Dominion-Regierung, welche von Dukat auf Cardassia geführt wird nicht an. Wenige Wochen später läuft der Cardassianische [[Dissident]] [[Legat ]] [[Tekeny Ghemor]] zur Föderation über und beliefert diese mit wichtigen Informationen über die neue Dominion-Regierung auf Cardassia. Ghemor leidet jedoch am [[Yarim-Fel-Syndrom]] und liegt im sterben. Da Ghemor Kira am meisten Vertraut, begibt sich dieser nach Deep Space 9 und gibt ihr sämtliche Informationen über die Cardassianische Politik. Währenddessen fordert Dukat von Captain Sisko die Auslieferung von Ghemor. Doch Sisko weigert sich Ghemor auszuliefern. Darauf begibt sich Dukat in Begleitung eines neuen Klon von [[Weyoun 5|Weyoun]] nach Deep Space 9. Doch Ghemor weigert sich nach Cardassia zurück zu kehren, da er nichts mit dem Dominion zu tun haben will. Da Ghemor eine zu große Gefahr für Dukat ist, versucht Dukat Ghemor mit vergifteten [[Kanar]] zu töten. Doch Sisko kann dies verhindern und präsentiert Dukat den vergifteten Kanar. Dukat streitet dies allerdings ab und bezichtigt Sisko den Führer der cardassianischen Regierung zu beleidigen. Nachdem Ghemor gestorben ist, verbreitet Dukat die [[Propaganda]], dass Ghemor seine Taten bereut hat und die Dominion-Regierung akzeptiert hat. Dukat fordert von Sisko die Auslieferung des Leichnams von Ghemor, damit dieser für Dukats Propaganda ein Staatsbegräbnis auf Cardassia bekommt. Doch auch diesen Wunsch kann Sisko Dukat nicht erfüllen, da Kira Ghemor neben ihren Vater auf Bajor begraben hat. Weyoun und Dukat verlassen darauf die Station und kehren nach Cardassia Prime zurück. ({{DS9|Die Überwindung}})

Da das Dominion immer mehr Schiffe, Waffen und Jem'Hadar aus dem Gamma-Quadrant nach Cardassia schickt, beschließt Sisko dem ganzen ein Ende zu setzen. Mit der Genehmigung der Sternenflotte beginnt Sisko das Wurmloch dauerhaft zu [[Mine (Sprengkörper)|verminen]], um so zu verhindern, dass weitere Flotten und Nachschub des Dominion ungehindert in den Alpha-Quadranten gelangen können. Der Ferengi [[Rom]], Dax und O'Brien beginnen selbstreplizierende, getarnte [[Antimateriemine]]n zu entwickeln und mit der ''Defiant'' werden diese vor das dem Wurmloch positioniert. Währenddessen bereitet man sich auf Deep Space 9 auf einen Angriff des Dominions vor.

Als das Dominion von der Aktion Wind bekommt , wird Weyoun nach Deep Space 9 geschickt. Er fordert von Sisko, dass dieser die Minen entfernt oder das Dominion wird dies selbst erledigen. Als Sisko dies ablehnt, versucht Weyoun darauf einen scheinheiligen Kompromiss zu finden. Sisko soll die Minen entfernen, dafür schickt das Dominion nur noch zivile Konvois, welche den Cardassianern helfen sollen ihre Welt nach dem Krieg mit den Klingonen wieder aufbauen zu können. Doch Sisko glaubt Weyoun kein Wort und weiß, dass das Dominion angreifen wird.

Als Sisko sieht, dass die Schilde ausgefallen sind und das Dominion weitere Verstärkung in Bajoranischen Raum beordert befiehlt er die Evakuierung der Station. Sämtliches Personal Sternenflottenpersonal der Station wird auf die ''Defiant'' evakuiert und diese können zusammen mit Martoks Bird-of-Prey entkommen. Doch bevor die das Dominion die Station übernimmt wird die Station durch das Unterprogramm [[Sisko 197]] Sabotiert und schwer beschädigt. Dukat, Weyoun und Damar übernehmen die Station, doch in Siskos Büro findet Dukat Siskos [[Baseball]]. Dukat versteht Siskos Botschaft und weiß das Sisko zurück kehren wird. ({{DS9|Zu den Waffen!}})

Während Sisko die Station verteidigt und das Minenfeld aktiviert, schickt die Sternenflotte einen Kampfverband der Sternenflotte und der Klingonen über die Grenze der Cardassianischen Union. Dem Kampfverband gelingt es erfolgreich die cardassianischen [[Schiffswerft]]en im [[Orbit]] von [[Torros III]] zu vernichten. ({{DS9|Zu den Waffen!}})

Zu Beginn des Jahres [[2374]], erleiden in den ersten drei Monaten des Krieges die [[Flotten der Sternenflotte|Flotten der Föderation]] und der Klingonen schwere Verluste durch die Streitkräfte des Dominion und der Cardassianer. Die Flotte in der sich auch die ''Defiant'' befindet kann schwer beschädigt der Dominion-Flotte entkommen. Die Föderation greift zwar regelmäßig das Dominion an, muss aber letztendlich immer wieder vor den Jem'Hadar zurück ziehen. Bashir errechnet mit seinem genetisch verbesserten Gedächtnis, das die Föderation nur mit einer Wahrscheinlichkeit von 32,7% diesen Krieg gewinnen kann. Bei der Verteidigung des [[Tyra-System]]s wird die [[7. Flotte]] der Föderation fast vollständig vernichtet. Nur 14 von ursprünglich 112 Schiffen können entkommen.

Siskos Jem'Hadar-Angriffsjäger hat inzwischen das Vorratslager erreicht. Diese fordern Ketracel-White an und beamen leere Kanister und den Sprengsatz in das Vorratslager. Allerdings explodiert der Sprengsatz zu früh und Siskos Jem'Hadar-Schiff wird dabei schwer beschädigt. Die Mission ist zwar erfolgreich, das Vorratslager mit dem Ketracel-White wird zwar vernichten, allerdings da auch der Warpantrieb ausgefallen ist, sitzt Siskos Besatzung hinter den feindlichen Linien fest. ({{DS9|Zeit des Widerstands}})

Kurz darauf wird Siskos Angriffsjäger von zwei weiteren Jem'Hadar-Angriffsjäger verfolgt und bei einem Angriff schwer beschädigt. Sisko fliegt mit seinem Schiff in einem [[Dunkle-Materie-Nebel]] und stürzt dort auf einen Planeten. Mit einem [[Floß]] können Sisko und seine Mannschaft Vorräte vom Angriffsjäger, bevor dieses in einem See versinkt. Allerdings ist auf diesem Planet ein weiteres Jem'Hadar abgestürzt und der Vorta [[Keevan]] überlebt schwer verletzt mit einigen Jem'Hadar. Bei einer Erkundungsmission werden der Kadett [[Nog]] und Garak von den Jem'Hadar gefangen genommen und zu Keevan gebracht. Keevan erkundigt sich ob ein Arzt bei den Sternenflottenoffizieren befindet.

Zur gleichen Zeit wird Bajor vom Dominion mit 400 [[Facilitator]]en beliefert. Da Bajor keinen Kontakt zu anderen Welten hat, ist der Planet auf Hilfe vom Dominion angewiesen. Einige Bajoraner, darunter [[Vedek ]] [[Yassim]], sehen dies als erstes Zeichen einer neuen Besetzung des Planeten. Yassim hält auch Kira für einen Kollaborateur, da sie mit den Cardassianern und dem Dominion zusammen arbeitet. Yassim kündigt eine [[Demonstration ]] an um sich gegen das Dominion zu widersetzen. Bei dieser Demonstration [[Erhängen|erhängt]] sich Yassim. Durch dieses Ereignis werden Kiras Augen geöffnet und sie beginnt gemeinsam mit Odo einen [[Widerstand auf Deep Space 9 gegen das Dominion]] zu gründen.

Sisko versteht den Verrat von Keevan nicht und als am nächsten Tag die Jem'Hadar Sisko angreifen wollen, informiert Sisko Remata'Klan über Keevans Verrat. Doch Remata'Klan weiß darüber längst Bescheid, aber ein Jem'Hadar muss dem Vorta gehorchen. Darauf kommt es zum Kampf und die Jem'Hadar werden schnell niedergeschossen. Allerdings gibt es auch bei der Sternenflotte Verluste, Fähnrich [[Paul Gordon]] wird erschossen. Nach den Kämpfen kommt Keevan mit der Komunikationsanlage Kommunikationsanlage und er ergibt sich Sisko. ({{DS9|Entscheidungen}})

Inzwischen werden die Ketracel-White Vorräte immer knapper und es sieht so aus, als ob die Vorta die Kontrolle über die Jem'Hadar verlieren. Damar sieht in dieser Situation eine große Gefahr und schlägt vor die letzten Ketracel-White Vorräte zu Vergiften, um die Jem'Hadar zu eliminieren. Doch Rom stiehlt dieses [[Padd ]] und versteckt es in der Nähe der Jem'Hadar. Als die Jem'Hadar dieses Padd finden, stellen sie Damar im [[Quarks]] deswegen zu Rede und ein Streit. Es kommt zu Kämpfen zwischen den Cardassianern und den Jem'Hadar, wobei es einige Todesopfer gibt. Weyoun und Dukat gelingt es zwar den Streit zu schlichten und sie müssen weiterhin den Anschein wahren, dass sie noch immer Alliierte und Freunde sind. Kira und Jake Sisko und Rom sind sehr über diese Streitereien zufrieden, doch Odo ist verärgert, da er die Gefahr sieht, dass die Bajoraner so mit in den Konflikt mit hineingezogen werden. Kira beginnt langsam an Odos Loyalität zu zweifeln.

Doch trotz des Erfolges mit der Vernichtung der Phalanx sind die Föderation und die Klingonen weiter dem Dominion unterlegen und müssen sich immer aus den Kämpfen zurück ziehen. Die Moral der Truppen ist zu dieser Zeit auf dem absoluten Tiefpunkt und noch nicht einmal die Klingonen glauben mehr an einem Sieg. Doch währenddessen entwickelt Sisko Pläne für die Zurückeroberung von Deep Space 9 und er präsentiert diese dem Sternenflottenkommando. Sisko plant mit der [[2. Flotte|2.]], [[5. Flotte|5.]] und der [[9. Flotte]] zur Station zu fliegen, um diese zurück zu erobern. Da das Dominion ebenfalls eine große Flotte einsetzen muss, vermutet Sisko das so die Dominion-Flotten vorerst verstreut und das Vordringen in den Föderationsraum verlangsamt wird. Doch das Sternenflottenkommando ist skeptisch, da durch die Verlagerung der Föderations-Flotten die Erde dem Dominion schutzlos ausgeliefert ist.

Da Damar weitere Sabotageakte befürchtet schlägt dieser vor Kira, Jake Sisko und [[Leeta]] zu verhaften, da er vermutet, dass diese Rom unterstützen könnten. Damar schlägt auch vor Dukats Tochter [[Tora Ziyal]] zu verhaften, da diese gut mit Kira befreundet ist, aber Dukat lehnt dies ab. Kira, Leeta und Jake Sisko planen gerade die nächste Sabotage, um die Deaktivierung des Minenfelds zu verhindern, als diese von Damar verhaftet werden.

Weyoun sendet ein Signal in den Gamma-Quadrant, damit die Verstärkung durch das Wurmloch kommt. Sisko weiß nun nicht mehr was er tun soll und lässt die ''Defiant'' in das Wurmloch fliegen. Dort trifft die ''Defiant'' auf die Dominion-Flotte. Sisko bereitet sich auf die Niederlage vor, als plötzlich die [[Wurmlochwesen]] in den Krieg einmischen. Da die Wurmlochwesen nicht wollen das ihr [[Abgesandter]] stirbt, lassen sie die Dominion-Flotte im Wurmloch verschwinden, aber sie Fordern im Austausch von Sisko einen hohen Preis. Nachdem die Flotte im Wurmloch verschwunden ist , fliegt die ''Defiant'' zur Station zurück und greift diese an.

Da die Waffen der Station deaktiviert sind, kein Nachschub aus dem Gamma-Quadrant kommt und sich immer mehr Schiffe der Klingonen und der Föderation der Station nähern, evakuiert das Dominion die Station. Dukat will seine Tochter mitnehmen, doch diese gesteht ihm, dass sie auf der Station bei ihren Freunden bleiben will und sie gesteht auch, dass sie Kira befreit hat. Plötzlich taucht Damar auf und erschießt Ziyal, weil sie eine Verräterin an ihrem eigenen Volk ist. Dukat ist über den Tod seiner Tochter geschockt und bleibt auf der Station zurück. Währenddessen fliehen Damar, Weyoun und die Gründerin von der Station und das Dominion zieht sich mit ihren Flotten vorerst in den cardassianischen Raum zurück. Auf der Station werden Sisko und seine Crew schon freudig erwartet. Sisko begibt sich zur Arrestzelle in der sich Dukat befindet und dieser übergibt Sisko seinen Baseball als Zeichen für Siskos Sieg. ({{DS9|Sieg oder Niederlage}})

Nach der Eroberung von Deep Space 9 wird die Station zum Hauptquartier der 9. Flotte ernannt. und General Martok wird zum Kommandanten der 9. dieser Flotte ernannt. Die Sternenflotte feiert auch noch einer Woche nach der Rückeroberung der Station diesen großen Sieg. ({{DS9|Klingonische Tradition}})

Zur selben Zeit wird [[Ishka]], die Frau des großen Nagus Zek und die Mutter von Quark vom Dominion gefangen genommen. Quark bekommt mit seinem Bruder Rom vom Nagusden Auftrag, Ishka aus der Gewalt des Dominions wieder zu befreien. Quark beschließt seine Mutter mit einigen Ferengi zu befreien. Mit Hilfe von Rom, Nog, [[Gaila]], [[Leck]] und Brunt will Quark seine Mutter befreien. Da in dem Simulationen die Ferengi bei der Befreiung von Ishka versagen, beschließt Quark mit dem Dominion ein Tauschgeschäft durchzuführen. Dank des Einsatzes von Kira, bekommt Quark den Vorta Keevan von der Föderation ausgeliefert, damit dieser gegen Ishka ausgetauscht werden kann. Der Austausch soll auf der verlassenen cardassianischen Raumstation [[Empok Nor]] stattfinden und die Ferengi treffen dort auf den Vorta [[Yelgrun]]. Yelgrun fordert von Quark die Auslieferung von Keevan, damit dieser seine Mutter bekommt. Da die Ferengi Angst vor den Jem'Hadar haben, fordert Quark von Yelgrun, dass diese mit ihren Schiff die Station verlassen und Yelgrun zurück lassen. Yelgrun geht darauf ein, da ihm Keevan zu wichtig ist, allerdings will er zwei Jem'Hadar behalten. Yelgrun bemerkt, dass die Ferengi sehr gerissen sind und das diese vielleicht eines Tages Mitglieder des Dominions werden können.

Kurz vor der Übergabe wird Keevan allerdings durch einen Streit der Ferengis getötet und nun haben diese niemanden den sie Austauschen können. Mit [[Neuralstimulator]]en gelingt es jedoch Nog einige Reflexe an Keevans Körper auszulösen und die Ferengi versuchen auf die Art den Austausch durchzuführen. Yelgrun fällt zuerst darauf rein jedoch bemerkt er schnell den Betrug, doch die Ferengi schlagen zu und töten schnen schnell die beiden Jem'Hadar. Darauf nehmen die Ferengi Yelgrun gefangen. Die Mission ist ein voller Erfolg Ishka kann befreit werden und die Ferengi übergeben der Sternenflotte den Vorta Yelgrun. ({{DS9|Der glorreiche Ferengi}})

Wenige Wochen später transportiert die [[USS Honshu|USS ''Honshu'']] den Kriegsverbrecher Dukat zur [[Sternenbasis 621]], da er dort wegen seiner Taten vor Gericht gestellt werden soll. Zu der Zeit befindet sich auch Captain Sisko an Bord der ''Honshu''. Plötzlich Doch plötzlich taucht eine cardassianische Flotte auf und zerstört die ''Honshu''. Sisko und Dukat können jedoch mit einem Shuttle entkommen. Worf bekommt mit der ''Defiant'' den Auftrag nach Überlebenden der ''Honshu'' zu suchen. Der ''Defiant'' gelingt es einige Überlebende der ''Honshu'' zu bergen und an Bord zu beamen. Dukat und Sisko sitzen zu der Zeit auf Oberfläche eines öden Planeten fest. Dukat versucht dort von Sisko Anerkennung zu erlangen, doch Sisko erkennt, dass Dukat wahnsinnig geworden ist. Sisko gelingt es zwar Dukat kurzzeitig zu überwältigen, doch Dukat gelingt es mit dem Shuttle zu fliehen und schwört in seinem Hass alles bajoranische zu vernichten. Sisko kann wenig später von der ''Defiant'' gerettet werden. Die ''Defiant'' begibt sich darauf in die Badlands, um dort einen Truppenkonvoi der Sternenflotte zu eskortieren. ({{DS9|Das Gute und das Böse}})

Wenige Wochen später wird Chief O'Brien vom [[Geheimdienst der Sternenflotte]] nach [[Farius Prime]] geschickt und soll dort das [[Orion-Syndikat]] unterwandern. O'Brien hat dort den Auftrag einen Verräter der Sternenflotte zu finden, welcher geheime Informationen an das Syndikat übergibt. Bei seiner Mission lernt O'Brien [[Liam Bilby]] kennen und dieser fängt mit der Zeit an O'Brien zu Vertrauen. O'Brien findet schnell heraus wer der Verräter in der Sternenflotte ist, allerdings findet O'Brien auch heraus, dass das Dominion mit dem Orion-Syndikat zusammen arbeitet. Der Vorta Gelnon fordert vom Syndikat den klingonischen Botschafter auf Farius Prime mit klingonischen Waffen zu töten. Es soll dann so aussehen als sein ein feindliches klinonisches klingonisches Haus für den Anschlag verantwortlich ist. Da es bekannt ist, dass der Botschafter gegen den Krieg mit dem Dominion ist, soll aus ihm ein Märtyrer werden und somit sollen sich mehr Klingonen seiner Sache anschließen. Das Dominion will damit erreichen, dass sich die Klingonen aus dem Krieg zurück ziehen, damit sie nur noch allein gegen die Föderation kämpfen. Doch der Geheimdienst der Sternenflotte warnt den Botschafter vor dem Attentat und als das Syndikat angreift werden diese, darunter auch Bilby, getötet. ({{DS9|Ehre unter Dieben}})

Ungefähr zur selben Zeit zieht das Dominion eine große Streitmacht im [[Kalandra-Sektor]] zusammen. Die [[Zehnte Flotte]] hat den Auftrag den Planeten [[Betazed]] und seine Kolonien zu schützen, doch diese wird von der Invasionstreitmacht Invasionsstreitmacht des Dominions überrascht. Innerhalb von zehn Stunden gelingt es dem Dominion die planetare Verteidigung des Planeten zu durchbrechen und Betazed zu erobern. ({{DS9|In fahlem Mondlicht}})

Die Invasion von Betazed ist nun Ausschlagend für Sisko die Romulaner in den Krieg hin einzubeziehen. Sisko benötigt die Hilfe von Garak, um ein [[Optolytisches Datenstäbchen|cardassianisches Datenstäbchen]] zu fälschen, welches die Angebliche Invasion von Romulus durch das Dominion zeigt. Darauf lädt Sisko den romulanischen [[Senator]] [[Vreenak]] nach Deep Space 9 ein und präsentiert diesen das Datenstäbchen. Vreenak sieht sich die Aufzeichnung über die Invasion von Romulus an und überprüft darauf das Datenstäbschen Datenstäbchen auf seine Echtheit. Doch Vreenak erkennt das es sich hierbei um eine Fälschung handelt und Konfrontiert Sisko damit. Vreenak will diesen Betrug der Föderation seinem Volk überbringen, doch sein Schiff explodiert auf den Rückflug durch eine Bombe, welche Garak auf seinem Schiff versteckt hat.

Der Ferengi Sternenflottenoffizier Nog erhält von Sternenflotte den Auftrag eine Botschaft an den großen Nagus Zek wegen einer Allianz zwischen der Föderation und den Ferengi zu überbringen. Die Föderation will damit erreichen, dass die Ferengi im Dominion-Krieg an der Seite der Föderation gegen das Dominion kämpfen. Nog begibt sich mit seinem Freund Jake Sisko in einem Runabout nach [[Ferenginar]], um diese Botschaft zu überbringen. Auf den Weg dorthin legen die beiden einen Zwischenstopp auf der [[Sternenbasis 257]] ein. Als die beiden mit ihrem Runabout die Station verlassen, nährt sich ein Geschwader Jem'Hadar-Angriffsjäger der Station und greift diese an. Doch ein Jem'Hadar-Angriffsjäger verfolgt das Runabout und Nog fliegt mit diesem in den Dominion-Raum. Als der Angriffsjäger das Runabout angreift, wird dieses von der ''Valiant'' gerettet. Nog und Jake Sisko werden an Bord des Kadettenschiffs gebeamt und lernen dort den Captain [[Tim Watters]] kennen. Watters hat sich als Aufgabe vorgenommen Daten über ein neues [[Jem'Hadar-Schlachtschiff]] zu sammeln. Doch nachdem die ''Valiant '' die Daten gesammelt hat, will Watters das Schlachtschiff der Jem'Hadar vernichten, obwohl dieses der ''Valiant'' weit überlegen ist. Bei dem Kampf gegen die Jem'Hadar wird die ''Valiant'' vernichtet und dabei wird die gesamte Crew getötet. Nur Jake Sisko, Nog und die Kadettin [[Dorian Collins]] können mit einer [[Fluchtkapsel]] entkommen und werden später von der ''Defiant'' gerettet. ({{DS9|Valiant}})

Im vergangenen Monat Kurz darauf greift die [[Zweite Flotte]] die Truppen des Dominion, die Betazed besetzt halten, dreimal an. Doch das Dominion schickt stets Verstärkungen und festigen seine Position. ({{DS9|Der Klang ihrer Stimme}})

Inzwischen dringt der vom Pah-Geist besessene Dukat auf Deep Space 9 ein und setzt dort den Pah-Geist in einen [[Drehkörper]] frei. Bei dieser Aktion tut Dukat die zufällig anwesende Jadzia Dax tödlich verletzen. Der Pah-Geist dringt durch den Drehkörper in das Wurmloch ein und das Wurmloch scheint sich ins Nichts aufzulösen.

[[Datei:Waffenplattformen beschießen eigene Energiequelle.jpg|thumb|left|Die orbitalen Orbitalen Waffenplattformen greifen den eigenen Energiegenerator an.]]

Nach der Schließung des Wurmloches scheint sich das Blatt für die Föderationsallianz zu wenden, die Allianz wird wieder von den Dominion-Flotten zurück gedrängt und die Föderationsallianz ist wieder gezwungen defensiv zu kämpfen. Die Klingonen scheitern zu der Zeit bei einem Angriff auf die [[Monac-IV-Schiffswerft|Werften von Monac IV]]. Die Verluste belaufen sich etwa auf 30%. Das Dominion gibt das Chin'toka-System nicht auf und plant es zurückzuerobernzurück zu erobern. Um dies zu erreichen werden die Schiffswerften angewiesen, ihre Produktion um 15% zu erhöhen. Währenddessen sitzen die Truppen der Föderationsallianz, umzingelt von Dominion-Truppen im Chin'toka-System fest.

Zu der Zeit richten die Romulaner auf Deep Space 9 eine militärische Präsenz auf der Station ein, um so besser im Dominion-Krieg kämpfen zu können. Die militärischen Truppen werden von der Senatorin [[Kimara Cretak]] geleitet. Später bittet Cretak Colonel Kira, ob die Romulaner ein [[Krankenhaus ]] auf den bajoranischen [[Mond (Satellit)|Mond]] [[Derna]] errichten zu können und Kira leitet dies sofort weiter an die bajoranische Regierung. Diese stimmt zu und die Romulaner errichten ihre Anlage auf Derna. Zur selben Zeit gelingt es den Romulanern, trotz großer Verluste einen Angriff durch das Dominion auf das Chin'toka-System zu stoppen.

Zur selben Zeit protestiert auch die Föderation wegen der Waffenstationierung auf Derna, doch die Romulaner reagieren nicht darauf. Da die Waffen noch nicht aktiv sind, will Kira mit bajoranischen Schiffen eine Blockade von Derna errichten, damit die Romulaner keinen Nachschub mehr liefern können. Kira richtet die Blockade ein und vorerst versucht kein Schiff diese Blockade zu durchbrechen. Doch dann erhält Kira eine Botschaft von Ross und Cretak, dass sich 14 Warbirds dem Mond nähern. Da Ross die Allianz nicht gefährden will geht dieser vorerst auf die Foderung Forderung der Romulaner ein, dass diese Nachschub nach Derna schicken.

Die ''Rotarran'' erreicht schließlich die Werften von Monac IV und diese will in dem Stern eine starke [[Sonneneruption ]] auslösen, welche die Werft vernichten soll. Als sich die ''Rotarran'' dem Stern nähert, wird diese von einigen Jem'Hadar-Angriffsjäger angegriffen. In der [[Korona]] des Sterns kämpft die ''Rotarran'' gegen die Angriffsjäger. Doch mit Hilfe des Traktorstrahls gelingt es der ''Rotarran'' die Eruption auszulösen, welche die Angriffsjäger vernichtet. Die ''Rotarran'' entkommt der Eruption und die Crew kann erfolgreich ansehen wie die Eruption die Monac-IV-Schiffswerft vernichtet.

Einige Zeit später stirbt [[Weyoun 5]] bei einem [[Transporter]]unfall. Es wird spekuliert, dass es sich dabei möglicherweise um einen Anschlag gehandelt hat. Weyoun wird umgehend geklont, doch sein Nachfolger [[Weyoun 6]] zweifelt das Dominion an und beginnt mit der Föderation zu sympathisieren. Da das Dominion diesen Weyoun als fehlerhaft betrachtet wird ein neuer Klon [[Weyoun 7]] aktiviert und Weyoun 6 bekommt den Befehl sich zu töten. Doch Weyoun 6 weigert sich dies zu tun und flieht. Darauf nimmt Weyoun 6 heimlich Kontakt mit Odo auf. Ungefähr zur selben Zeit bricht bei den Gründern eine geheimnisvolle Krankheit aus und niemand findet ein Heilmittel gegen diese Krankheit. Weyoun 6 trifft sich kurz darauf mit Odo, welcher dies allerdings einen Trick von Weyoun hält. Doch als Weyoun Odo mit strategischen Informationen über das Dominion versorgt, fängt dieser an ihm zu glauben. Die beiden fliegen mit einem Runabout in das Föderationsterritorium, als sich plötzlich Damar und Weyoun 7 melden und Odo auffordern Weyoun 6 auszuliefern. Doch als sich Odo weigert Weyoun auszuliefern befiehlt Weyoun 7 einem Jem'Hadar-Angriffsjäger das Runabout anzugreifen. Mit Hilfe von Weyoun 6 gelingt es Odo jedoch den Jem'Hadar-Angriffsjäger zu vernichten. Von Weyoun 6 erfährt Odo auch, dass die Gründer unter einer geheimnisvollen Krankheit leiden. Später wird das Runabout von vier Jem'Hadar-Angriffsjäger verfolgt und Odo versucht mit dem Runabout in ein [[Asteroidengürtel|Asteroidenfeld ]] zu fliehen. Als Weyoun 6 erkennt, dass das Runabout den Jem'Hadar nicht entkommen kann, nimmt er Kontakt mit seinen Nachfolger auf und begeht Selbstmord, um so das Leben von Odo zu retten. Als Weyoun 7 sieht wie sein Vorgänger stirbt, befiehlt dieser den Jem'Hadar den Angriff auf das Runabout abzubrechen. ({{DS9|Verrat, Glaube und gewaltiger Fluß}})

General Martok plant kurz darauf einen Angriff mit nur fünf [[B'rel-Klasse|Bird-of-Prey]] zuerst auf die Sternenbasis auf der Oberfläche von [[Trelka V]], dann die [[Manora-Schiffswerft]], schließlich die [[Jem'Hadar-Brutstätte]] auf [[Sheva II]] und die Versorgungsdepots im [[Borias-Cluster]] durch zu führen. Anschließend soll die Neunte Flotte die Bird-of-Prey und ihre möglichen Verfolger im Kalandra-System empfangen. Die Klingonen beginnen mit den Angriff auf Trelka V und zwei cardassianische Schiffe greifen die Bird-of-Preys an, dabei wird einer der Bird-of-Preys vernichtet. Währenddessen greift Martok mit den anderen Schiffen die Station auf der Oberfläche an und dieser Angriff verwirrt die Cardassianer, doch diese Schlagen schnell zurück. Bei einem Angriff wird Martok verletzt und [[Kor]] übernimmt das Kommando, doch . Doch Kor greift weiter gegen den Willen von Martok die Station an. Der alte Kor hält die Cardassianer sogar für seinen alten Feind aus der Vergangenheit, die Föderation. Allerdings gelingt es Martok wieder das Kommando zu übernehmen und befiehlt den sofortigen Rückzug, um die Manora-Schiffswerft anzugreifen. Danach entzieht Martok Kor von seinem Posten. Während die Bird-of-Preys weiterfliegen, nährt sich eine Flotte von zehn Jem'Hadar-Angriffsjäger und verflogt die klingonische Flotte. Den Jem'Hadar gelingt es mit Langstrecken-[[Tachyonenscanner]] die Bird-of-Preys aufzuspüren und sie verfolgen diese. Da die Bird-of-Preys nicht rechtzeitig die verbündete Flotte erreicht, übernimmt Kor das Kommando über einen Bird-of-Prey und ihm gelingt es bei einem Kampf mit den Jem'Hadar diese lang genug aufzuhalten, dass die übrigen drei Bird-of-Preys die verbündete Flotte erreicht. Bei der Schlacht kommt Kor zwar ums Leben, aber er wird von den Klingonen als Held gefeiert. ({{DS9|Der Dahar-Meister}})

Da die Föderation durch den Dominion-Krieg immer mehr geschwächt wird, sucht die Sternenflotte weiter nach neuen Verbündeten beim Kampf gegen das Dominion. Die Föderation beginnt schließlich mit den [[Son'a]] zusammen zu arbeiten, obwohl bekannt ist, dass sie auch einige Ketracel-White-Anlagen besitzen und so für das Dominion diese Droge produzieren. Während der Allianz zwischen der Föderation und den Son'a wollen diese will sich die Föderation die [[metaphasische Strahlung]] des Planeten [[Ba'ku (Planet)|Ba'ku]] im [[Briar Patch]] zu nutzen machen, um den natürlichen Alterungsprozess zu stoppen. Allerdings wollen die Son'a zusammen mit dem Sternenflotten Admiral [[Matthew Dougherty]] die dort einheimischen [[Ba'ku]] zwangsumsiedeln.

Durch einen Zufall deckt Captain [[Jean-Luc Picard]] mit der ''Enterprise'' diesen Bruch der [[Oberste Direktive|ersten Direktive ]] auf. Picard will verhindern, dass die Ba'ku gegen ihren Willen umgesiedelt werden. Picard und ein Außenteam bleiben auf der Planetenoberfläche des Planeten, um dort die Zwangsumsiedlung zu verhindern. Währenddessen verlässt die ''Enterprise'' unter dem Kommando von Commander [[William Thomas Riker]] den Briar Patch, um den [[Föderationsrat ]] von diesem Vorfall zu berichten.

In den nächsten Wochen und Monaten verläuft der Krieg weiterhin schlecht für das Dominion. Dieses erleidet weiterhin Rückschläge gegen die Föderationsallianz und auch die geheimnissvolle geheimnisvolle Krankheit bricht immer weiter unter den Gründern aus und die Synthome Symptome verschlimmern sich immer mehr. Selbst die besten Ärzte der Vorta finden kein Heilmittel gegen die Krankheit. Aber um keine Schwäche versuchen die Gründer ihre Krankheit vor den Cardassianern zu verbergen. Die Föderation greift zu der Zeit einige [[Son'a-Posten]] an und Weyoun muss die Truppen verlagern, damit dieses wichtige Ketracel-White-Lager nicht vernichtet wird. Zu dieser Zeit beginnt die Gründerin, obwohl diese auch schwer krank ist, heimliche Verhandlungen mit den [[Breen]] aufzunehmen.

Die Breen beginnen mit dem Verhör von Worf und Dax. Inzwischen begeben sich die Gründerin, Weyoun und Damar zu einen geheimen Treffen mit den Breen. Allerdings weiß Damar nichts von diesem geheimen Treffen und Weyoun informiert ihn auch nicht darüber. Erst als als diese auf die Breen treffen , erfährt Damar die Wahrheit. Vor den Breen verkündet Weyoun die neue [[Dominion-Breen-Allianz ]] und von den Breen bekommt Weyoun zu diesen Anlass auch Geschenke, die beiden gefangenen Sternenflottenoffiziere Worf und Dax. ({{DS9|Bis daß der Tod uns scheide}})

Als Damar von der Niederlage bei Septimus III erfährt, stellt er Weyoun deswegen zu Rede, da sein Vorgänger ihm versprochen hat, sich um diese Angelegenheit zu kümmern. Doch Weyoun erwiederterwidert, dass Septimus III zu unbedeutend gewesen ist und sich darum zu kümmern. Damar ist verärgert, dass 500.000 Cardassianer umsonst für das Dominion gestorben sind. Darauf erkennt Damar, dass die Cardassianer für das Dominion nur noch unbedeutent unbedeutend sind. Damar lässt darauf die gefangenen Sternenflottenoffiziere Worf und Dax frei und verkündet, dass die Föderation nun einen Verbündeten auf Cardassia Prime hat. ({{DS9|Eine sonderbare Kombination}})

Worf und Dax kehren nach Deep Space 9 und berichten dort von der neuen Dominion-Breen-Allianz und auch das sie Hilfe von Damar erhalten haben. Zur selben Zeit beginnen die Breen einen [[Überfall auf die Erde|Angriff auf die Erde]]. Die Breen greifen mit ihren Schiffen das [[Hauptquartier der Sternenflotte ]] an, allerdings werden die meisten [[Breen-Kriegsschiff]]e von der Sternenflotte vernichtet, aber auf der Erde gibt es viele Todesopfer und den Breen gelingt es Angst auf der Erde zu schüren. Als Weyoun die Berichte von den Angriff auf die Erde sieht, ist dieser sehr begeistert.

[[Datei:Damar kündigt die Rebellion an.jpg|thumb|left|Damar ruft zum Wiederstand Widerstand gegen das Dominion aus.]]Da die Cardassianer nun vom Dominion wie Bürger zweiter Klasse behandelt werden und diese nur noch sinnlos für den Dominion-Krieg geopfert werden, zieht Damar entgültig endgültig einen Schlussstrich und legt sein Amt nieder. Damar gründet darauf heimlich den [[Cardassianische Rebellion|cardassianischen Widerstand]]. Gemeinsam mit seinen Freund Gul [[Rusot]] plant Damar einen ersten Angriff auf das Dominion. Mit einigen loyalen Truppen greifen die Cardassianer die Vorta-Klon-Einrichtungen auf [[Rondac III]] an. Die Truppen erleiden bei diesem Angriff hohe Verluste und ihnen gelingt es auch nicht den Planeten einzunehmen. Trotzdem gelingt es den Cardassianern die Klon-Einrichtung zu vernichten. Mit diesen Angriff setzt Damar ein Zeichen, vor allem gegen Weyoun, welchen Damar abgrundtief hasst, da es nun nicht mehr möglich ist die Vorta zu klonen und falls Weyoun nun stirbt, es keinen Nachfolger geben wird. Nach dem Angriff schickt Damar eine offene Botschaft an sein Volk in den er verkündet, dass alle Cardassianer Wiederstand Widerstand gegen das Dominion leisten sollen. ({{DS9|Im Angesicht des Bösen|Ein Unglück kommt selten allein}})

Da die Klingonen einen Weg gegen die Energiedämpfungswaffe gefunden haben, werden alle Schiffe in der klingonischen Flotte umgerüstet. Allerdings funktioniert diese Modifikation nicht bei den Schiffen der Föderation und Romulanerden Romulanern. Somit müssen die Klingonen allein gegen das Dominion kämpfen. Die Klingonen entsenden darauf eine Streitmacht aus 1.500 Schiffen, um die Dominion-Offensive in Schach zu halten. doch Doch die Situation ist aussichtslos, da die vereinten Streikräfte Streitkräfte der Cardassianer, Breen und des Dominion ihnen zwanzig zu eins überlegen sind.

Um weiter Zeit zu gewinnen beginnt die Sternenflotte Damars Wiederstandsgruppe Widerstandsgruppe zu Unterstützen, damit diese weiter das Dominion in Schacht halten. Die Sternenflotte entsendet zu seiner Unterstützung einige Güter, [[Replikator|Nahrungsrepliktoren]], Waffen und Personal, darunter: das ehemalige Mitglied des [[Bajoranischer Widerstand|Bajoranischen Widerstandes]] Colonel Kira Nerys, welcher im Rang eines Commanders kurzfristig das [[Offizier]]spatent der Sternenflotte verliehen wird, der Wechselbalg Odo und das ehemalige Mitglied des Obsidianischen Ordens Garak.

Zu der Zeit findet Julian Bashir heraus, dass auch odo Odo unter der Krankheit leidet, welche die Gründer tötet. Bashir versucht darauf ein Heilmittel zufindenzu finden, welches das Leben von Odo retten soll. Doch als Bashir sich an die Sternenflotte wendet, stellt sich diese stur, Daten über Odo Preis zu geben, da es sich bei Odo um einen Gründer handelt. Erst mit Siskos Hilfe kommt Bashir an die Daten heran. Doch schnell erkennt Bashir, dass diese Daten gefälscht sind und bei weiteren Untersuchungen findet Bashir heraus, dass Odo von der Sternenflotte bzw . Sektion 31 infiziert worden ist, um somit sein gesamtes Volk mit einer tödlichen Krankheit zu infizieren.

In den nächsten Wochen führt der cardassianische Wiederstand weitere Angriffe auf das Dominion durch. Mit Odos Hilfe gelingt es die die [[Tevak-Schiffswerft]] zu vernichtenund vernichten und einige weitere Wiederstandskämpfer Widerstandskämpfer vernichten einen Jem'Hadar-Angriffsjäger. Doch zu dieser Zeit verschlimmert sich immer weiter der Gesundheitszustand von Odo.

Zu der Zeit greifen die Klingonen auf Gowrons Befehl [[Avenal VII]] an, obwohl Gowron weiß, dass die Klingonen 1:6 eins zu sechs unterlegen sind und General Martok und Captain Sisko gegen diesen Angriff sind. Doch Martok muss diesen Angriff durchführen und wie erwartet verlieren die Klingonen diesen Kampf. Bei dem Kampf werden sieben klingonische Schiffe vernichtet und fünf weitere schwer beschädigt. Martok wird bei diesen Angriff schwer verletzt und Gowron macht schließlich Martok für das scheitern dieses Angriffes verantwortlich.

Das Dominion ist zwar erfreut über das scheitern der Klingonen, doch die Gründerin macht sich große Sorgen, wegen dem cardassianischen WiederstandWiderstand. Die Gründerin befiehlt darauf cardassianische Zivilisten in und um Millitärstationen des Dominion zu platzieren. Sie bezwecken damit, das cardassianische Volk gegen die Widerstandszelle aufzuhetzen. Als nächstes lässt die Gründerin Damars Familie aufspüren und diese werden hingerichtet. Desweiteren Des weiteren wird es den cardassianischen Truppen verboten, an Bord von Jem'Hadar-Schiffen Waffen zu tragen.

Als Damar vom Tod seiner Familie erfährt, ist ihm klar welche Verbrechen das Dominion, aber auch sein Volk begangen hat und Damar plant nun ein neues Cardassia aufzubauen. Der Wiederstand Widerstand dringt in eine cardassianische Reperatureinrichtung Reparatureinrichtung im [[Kelvas-System]] ein und dort gelingt es den Rebellen unter der Führung von Damar einen Jem'Hadar-Angriffsjäger zu stehlen, auf dem bereits eine Breen-Waffe installiert ist. Damar, Odo und Kira bringen den Angriffsjäger zur Sternenflotte, damit diese die Energiedämpfungswaffe genau untersuchen kann.

Nachdem Goworon einen weiteren sinnlosen Angriff aufauf auf [[Sarpedion V]] befiehlt, eine der am stärksten befestigten Stellungen der Cardassianischen Union, greift Worf ein und bezeichnet Gowron als Ehrlos, da Gowron sinnlos Schiffe und Krieger für seine Zwecke opfert. Gowron fordert darauf Gowron zu einem Zweikampf heraus und Worf gewinnt diesen Kampf, indem er Gowron tötet. Darauf hat Worf Anspruch auf die klingonische Kanzlerschaft, doch Worf gibt diese an Martok weiter, welcher fortan wieder das Kommando über die Streitkräfte der Klingonen hat.

Da es Bashir und O'Brien nicht gelungen ist ein Heilmittel zu finden, planen sie nun Sektion 31 nach Deep Space 9 zu locken, um dort den Agenten gefangen zunehmen und über diesen Weg an das Heilmittel zu gelangen. ({{DS9|Kampf mit allen Mitteln}})

Odo, Kira und Damar erreichen die Station und übergeben dort der Sternenflotte die Energiedämpfungswaffe der Breen und begeben sich danach zurück ins cardassianische Territorium, um weiter gegen das Dominion zu kämpfen. Odo liegt inzwischen im sterben und bleibt auf der Station zurück, aber Bashir kann nichts mehr für ihn tun. Um Odo zu retten, lockt Bashir schließlich [[Luther Sloan]] von Sektion 31 auf die Station und nimmt diesen Gefangen. Mit Hilfe [[Romulanischer Gedächtnisscanner|romulanischen Gedächtnisscanner]] will Bashir die Informationen über das Heilmittel erlangen, doch Sloan aktiviert ein implantat Implantat und begeht eher Selbstmord, als die Information über das Heilmittel preiszugeben. Doch Bashir und O'Brien dringen mit den romulanischen Gedächtnisscannern in Sloans Geist ein und können so an das Heilmittel für Krankheit der Gründer gelangen. Mit dem Heilmittel kann Odo schließlich geheilt werden. Inzwischen ist Sisko entsetzt, dass die Sternenflotte und die Födertion Föderation bereit ist [[Völkermord ]] zu begehen, um den Dominion-Krieg zu gewinnen. ({{DS9|Extreme Maßnahmen}})

In den nächsten Wochen bekommt Damars Rebellion Unterstützung von Truppen unter dem Kommando von Gul [[Revok]] und Legat [[Goris]]. Somit würden sich über 500.000 Mann Damars Rebellion anschließen. Darauf begibt sich Damar mit dem erbeuteten Jem'Hadar-Angriffsjäger nach Cardassia Prime um sich mit seinen neuen Truppen zu treffen. Damar, Kira und Garak beamen auf die Oberfläche und müssen ansehen wie die Verbündeten von den Jem'Hadar getötet werden und das Gul Revok den Wiederstand an das Dominion ausgelöscht verraten hat. Damar kann auch nicht zurückkehren, da auch der Jem'Hadar-Angriffsjäger im Orbit zerstört wird. Damar, Garak und Kira sind gezwungen bei [[Mila]], der ehemaligen Haushälterin von Garaks Vater zu verstecken. Dem Dominion gelingt es darauf alle Stützpunkte des Dominions cardassianischen Widerstands zu vernichten und Damar wird vom Dominion für Tod erklärt. Weyoun verbreitet diese wichtige Mitteilung an das gesamte cardassianisch Volk, dass die Rebellion vernichtet worden ist. Nach der Zerschlagung der Rebellion ernnent ernennt Weyoun Legat [[Broca]] zum neuen Führer der Cardassianischen Union. ({{DS9|In den Wirren des Krieges}})

[[Datei:Cardassiner greifen das Dominion anDamar hält Rede.jpg|thumb|left|Das Cardassianische Militär wechselt die SeitenDamar ruft sein Volk zum Widerstand gegen das Dominion auf.]]Doch die Cardassianer haben die Besetzung durch das Dominion statt. Nachdem Nach dem scheinbaren Tod von Damar entstehen in der Bevölkerung Legenden über den Helden Damar. Mila berichtet den Niedergeschlagenden Niedergenschlagenden Damar von dem was die Bevölkerung berichtet und Damar fasst darauf neuen Mut. Damar plant mit Hilfe von Kira und Garak einen Anschlag auf eine [[Jem'Hadar-Kaserne]]. Garak legt die Bombe wird , aber, von den Jem'Hadar erwischt. Plötzlich taucht wie aus dem Nichts Damar auf und fordert die Freilassung von Garak und als die Jem'Hadar ihn töten wollen, tötet Damar diese mit Hilfe von Kira. Danach explodiert die Bombe und zerstörrt zerstört die Kaserne. Als die Cardassianer sehen, dass Damar noch lebt fassen diese neuen Mut. Damar fordert die Bevölkerung auf an seiner Seite gegen das Dominion zu kämpfen und das Volk erwiedert erwidert seine Freiheitsrufe.

Durch die gestohlene Energiedämpfungswaffe ist die findet Sternenflotte nun in der Lage eine Möglichkeit diese Waffe abzuwehren und die Sternenflotte teilt ihr Wissen auch mit den Romulanern. Als die Gründerin dies erfährt zieht diese alle Truppen alle Truppen des Dominions, der Cardassianer und der Breen zurück in den cardassianischen Raum zurück. Die Gründerinwill Gründerin will damit ihre Truppen auf ein kleineres Gebiet kozentrierenkonzentrieren, um es den Feind schwerer zu machen sie anzugreifen. Die Gründerin spekuliert, dass die Föderation und ihre Verbündeten das Dominion nicht angreifen wirdwerden. Darauf befiehlt die Gründerin die Produktion der Schiffswerften und der Jem'Hadar zu erhöhen, um dann mit einer stärkeren Armee die Föderationsallianz anzugreifen.

Auch die Föderation bekommt den Rückzug des Dominions in den cardassianischen Raum mit[[Datei:Letzter Angriff. jpg|thumb|Die Romulaner wollen das Dominion im cardassianischen Raum einkesseln und dort gefangen halten. Doch Captain Sisko ist gegen diese StrategieFöderation, da er befürchtet, dass das Dominion die Produktion ihrer Schiffe und der Jem'Hadar erhöht und dann wieder angreifen. Sisko schlägt schließlich vor jetzt das Dominion anzugreifen Klingonen und die Klingonen stimmen zu. Nachdem auch die Romulaner zugestimmt haben wird die Invasion auf Cardassia geplantplanen den letzten Angriff. ({{DS9|In den Wirren des Krieges}})]]

Ende Auch die Föderation bekommt den Rückzug des Jahres kommt es auf Dominions in den cardassianischen Raum mit. Die Romulaner wollen das Dominion im cardassianischen Raum einkesseln und dort gefangen halten. Doch Captain Sisko ist gegen diese Strategie, da er befürchtet, dass das Dominion die Produktion ihrer Schiffe und der Jem'Hadar erhöht und dann wieder angreifen. Sisko schlägt schließlich vor das Dominion sofort anzugreifen und die Klingonen stimmen dem zu. Nachdem auch die Romulaner zugestimmt haben wird die [[Schlacht um Cardassia|Invasion auf Cardassia Prime]] zu Aufständen, so dass große Truppenverbände dorthin zurückverlegt werden, um sie mit aller Gewalt zu zerschlagen. Insgesamt sterben dabei 800 Millionen cardassianische Zivilistengeplant.({{DS9|In den Wirren des Krieges}})

Der Konflikt endet wenige Tage später Kurz darauf bricht die vereinigte Flotte der Föderation, der Klingonen und der Romulaner nach Cardassia auf, um in der entscheidenden Schlacht den Krieg endlich zu beenden. Auf Cardassia Prime überwachen Weyoun und die Gründerin die Flottenbewegungen der Föderationsallianz und die Gründerin koordiniert die Truppen der Jem'Hadar und der Breen, damit diese die Föderationsallianz angreifen. Für den Fall eines Sieges verspricht die Gründerin den Breen die Herrschaft über Romulus und der Erde. Plötzlich erscheint Legat Broca und berichtet, dass Damar wahrscheinlich noch am Leben ist.  [[Datei:Angriffsjäger bei Schlacht um Cardassia.jpg|thumb|left|Die Kämpfe um Cardassia.]] Auf Cardassia Prime planen Damar, Kira und Garak zusammen mit der Einnahme cardassianischen Bevölkerung den Aufstand. Es werden [[Streik]]s veranstaltet und auch die Energie und die Kommunikation auf dem Planet wird lahm gelegt. Durch diese Aktion verliert die Gründerin den Kontakt zu der Flotte, welche sich der Föderationsallianz entgegenstellen soll. Legat Broca berichtet der Gründerin, dass die cardassianische Bevölkerung auf dem ganzen Planeten Sabotageakte gegen das Dominion durchführt hat. Weyoun empfiehlt darauf das cardassianische Volk für diese Sabotage zu bestrafen und er lässt von den Jem'Hadar die cardassianische Stadt [[Lakarian City]] auslöschen und dabei werden 2 Millionen Männer, Frauen und Kinder getötet. Als Damar die Botschaft von Weyoun sieht beschließt er zusammen mit Kira und Garak das Hauptquartier des Dominions anzugreifen, um sich an Weyoun zu rächen. Doch dem Dominion gelingt es das Versteck von Damar ausfindig zu machen und ihn zusammen mit Kira und Garak zu verhaften.  Währenddessen trifft die Flotte der Föderationsallianz auf die Flotten des Dominions, der Breen und der Cardassianer. Es kommt zu schweren Gefechten und obwohl die Dominiontruppen keinen Kontakt nach Cardassia Prime durch haben, sind diese der Föderationsallianz überlegen. Bei den Gefechten werden immer mehr Schiffe der Föderationsallianz vernichtet und zu den Opfern gehört auch das Flaggschiff der Romulaner.  [[Datei:Cardassiner greifen das Dominion an.jpg|thumb|Das Cardassianische Militär wechselt die vereinten Streitkräfte Seiten.]] Legat Broca berichtet währenddessen der Gründerin, dass es ihm gelungen ist Damar, Kira und Garak zu verhaften. Die Gründerin befiehlt darauf die Verräter hinzurichten. Als die Jem'Hadar die drei hinrichten wollen, greifen [[Ekoor]] und seine Truppen die Jem'Hadar an und töten diese. Zusammen mit den Truppen von Ekoor will Damar das Hauptquartier des Dominions angreifen.  Die Schlacht verläuft immer schlechter für die Föderationsallianz diese haben bereit ein drittel ihrer Flotte verloren. Captain Sisko befiehlt sogar mit der neuen ''Defiant'' den Rückzug, da für ihn der Kampf aussichtslos erscheint. Doch plötzlich beginnen die cardassianischen Schiffe die Flotten des Dominions und der Breen anzugreifen. Zu der Zeit gelingt es der Gründerin auf Cardassia Prime wieder Kontakt mit ihren Truppen an der Front herzustellen. Mit Entsetzen muss sie mit ansehen, dass die Cardassianer endgültig das Dominion verraten haben. Die Gründerin befiehlt den Rückzug ihrer Flotten in den Orbit von Cardassia Prime, obwohl sie weiß, dass sie nun von der Föderationsallianz umzingelt sind. Für den Verrat befiehlt die Gründerin Weyoun, die gesamte cardassianische Bevölkerung zu töten. Das erste Opfer ist Legat Broca, obwohl er dem Dominion loyal gegenübersteht.  [[Datei:Damar stirbt.jpg|thumb|left|Damar stirbt für sein Volk.]] Die Flotte der Föderation, der Klingonen , der Romulaner und der Cardassianer erreichen, den Orbit von Cardassia Prime und stehen einer weiteren großen Flotte des Dominions und der Breen gegenüber. Die Föderation will die Orbitalen Geschütze angreifen, die Klingonen kümmern sich um die Schiffe der Breen und die Romulanerbekämpfen gemeinsam mit den Cardassianern die Schiffe der Jem'Hadar. Ihr voraus geht eine große Schlacht zwischen Doch Admiral Ross schätzt bei diesen Kämpfen sehr hohe Verluste der Allianz gegen Flotte.  Inzwischen gelingt es Damar mit seinen Truppen in das DominionHauptquartier des Dominions einzudringen, doch bei den Gefechten mit den Jem'Hadar kommt Damar ums Leben. Kira, Garak und Ekoor gelingt es die wenigen Jem'Hadar im Gebäude zu töten, in da die meisten zur Auslöschung der cardassianischen Bevölkerung abkommandiert worden sind. Den drei gelingt es Weyoun und die im sterben liegende Gründerin gefangen zunehmen. Nachdem Weyoun eine abfällige Bemerkung über Damar und Cardassia von sich gegeben hat, tötet Garak den letzten Klon von Weyoun. Obwohl sie weiß, dass sie verloren hat, will die Gründerin nicht kapitulieren. Sie will jeden Jem'Hadar und Breen bis aufs letzte kämpfen lassen, damit die Föderationsallianz trotz des Sieges die cardassianische Flotte aufgrund hohen Verluste an Leben beklagen muss. Nachdem Kira Kontakt mit der Übergriffe sich im Orbit befindenden ''Defiant'' aufgenommen hat, beamt sich Odo auf die Zivilbevölkerung gegen das Dominion wendetPlanetenoberfläche. Odo verbindet sich mit der Gründerin und heilt sie von ihrer Krankheit. Darauf kann Odo sie davon Überzeugen, den Krieg zu beenden. ({{DS9|Das, was du zurückläßt, Teil I|Das, was du zurückläßt, Teil II}}) {{Siehe auch|Schlacht um Cardassia}}

[[Datei:DominionFriedensvertrag.jpg|thumb|Die KapitulationDas offizielle ende des Dominion-Krieges.]]Offiziell endet der Odo kann die Gründerin davon überzeugen, dass die Föderation und ihre verbündeten keine Invasion in den Gamma-Quadranten planen. Die Gründerin erklärt sich bereit, die volle Verantwortung für den Krieg mit der Unterzeichnung eines Waffenstillstandsabkommens durch auf sich zu nehmen und dafür kehrt Odo in die Vertreter der beteiligten Parteien große Verbindung zurück und heilt sein Volk. Wenig später wird auf Deep Space 9der Dominion-Krieg offiziell für beendet erklärt. Die Gründerin unterzeichnet dort die erste Kapitulation des Dominions seit 10.000 Jahren und übergibt diese der Föderationsallianz, bei der Vertreter der Sternenflotte, der Klingonen und der Romulaner vertreten sind. ({{DS9|Das, was du zurückläßt, Teil III}}) Nachdem Krieg liegt die Cardassianische Union in Trümmern und es gibt mehrere hundert Millionen an Todesopfer zu beklagen. Durch den Tod von Damar ist die Cardassianische Union führerlos, aber nach der Meinung von Garak werden sich die Cardassianer von diesen schweren Verlusten erholen und ein neues Reich aufbauen. ({{DS9|Das, was du zurückläßt, Teil II}}) Nach Analysen von Sektion 31 wird das klingonische Imperium die nächsten zehn Jahre benötigen, um sich von den Folgen des Krieges zu erholen. ({{DS9|Unter den Waffen schweigen die Gesetze}}) Unter den Romulanern befinden sich die höchsten Verluste bei den Remanern, da diese von den Romulanern als Frontsoldaten in den blutigsten Schlachten eingesetzt worden sind. Im Verlauf der nächsten Jahre kühlt die Beziehung zwischen den Romulanern und der Föderation wieder ab. ({{Film|10}}) Die Föderation erholt sich schnell von den Verlusten des Kriegs. Die schweren Schäden, welche durch den Angriff der Breen auf die Erde entstanden sind, sind [[2376]] zum größten Teil wieder behoben. ({{VOY|Das Pfadfinder-Projekt}})