Zur selben Zeit beginnt das Dominion den [[Kepla-Sektor]] zu erobern. Zu dieser Zeit befindet sich das Raumschiff [[USS Valiant (NCC-74210)|USS ''Valiant'' (NCC-74210)]], welches als [[Schulschiff]] speziell für die Elitekadetten von Red Squad dient in dieser Region. Nach der Eroberung des Sektors durch das Dominion sitzt die ''Valiant'' hinter den feindlichen Linien fest. Bei einem Kampf mit einem cardassianischen Kriegsschiff werden alle Offiziere geötetgetötet. Das Kriegsschiff der Cardassianer wird zwar vernichtet, allerdings haben nun die Kadetten das Kommando über die ''Valiant''. ({{DS9|Valiant}})

Nach der neunten Angriffswelle der Föderation, lässt Dukat einige Geschwarder Geschwader die Jägern und verfolgen und öffnet somit ein Loch in der Dominion-Formation. Sisko sieht nun seine Chance die Formation zu durchbrechen und die Flotte dringt in diese Loch vor, als plötzlich sämtliche Kommunikation zwischen den Sternenflottenschiffen abbricht. Die Sternenflotte ist in die Falle von Dukat geraten.

Zu der Zeit hat die Sternenflotte einen cardassianischen Informanten [[Lasaran]], welcher geheime Daten über das Dominion an die Sternenflotte übermittelt. Die beiden Sternenflottenoffiziere Worf und Dax bekommen den Auftrag eine geheime Botschaft von Lasaran zu empfangen und die beiden begeben sich mit einem Runabout zu dem Treffpunkt. Dort übermittelt Lasaran, dass er sich nach [[Soukara]] um dort sich von den beiden abholen zulassen, da Lasaran vermutet, dass er aufgeflogen ist. Worf und Dax begeben sich darauf nach Soukara, um sich mit Lasaran zu teffentreffen. Damit sie nicht vom Dominion aufgespührt aufgespürt werden, landet das Runabout außerhalb des Sensorbereiches des Dominionstützpunkt und die beiden haben eine drei Tages Reise durch den Urwald vor sich. Während die beiden sich durch den Urwald begeben treffen sie auf eine Jem'Hadar Patroulie Patrouille und bei dem Kampf wird Dax schwer verletzt. Worf beschließt darauf seine Frau zurück zu lassen, um Lasaran zu retten. Doch schließlich entscheidet sich Worf seine Frau zu retten und bringt sie zurück zum Runabout zu bringen. Lasaran wartet vergeblich auf seine Rettung und versucht zum Stützpunkt zurück zukehren. Dort wird dieser allerdings als Verräter vom Dominion getötet und der Geheimdienst der Sternenflotte verliert mit ihm einen wichtigen Informanten. ({{DS9|Wandel des Herzens}})

Die Invasion von Betazed ist nun Auschlagend Ausschlagend für Sisko die Romulaner in den Krieg hineinzubeziehenhin einzubeziehen. Sisko benötigt die Hilfe von Garak, um ein [[Optolytisches Datenstäbchen|cardassianisches Datenstäbchen]] zu fälschesfälschen, welches die Angebliche Invasion von Romulus durch das Dominion zeigt. Darauf lädt Sisko den romulanischen [[Senator]] [[Vreenak]] nach Deep Space 9 ein und präsentiert diesen das Datenstäbchen. Vreenak sieht sich die Aufzeichnung über die Invasion von Romulus an und überprüft darauf das Datenstäbschen auf seine Echtheit. Doch Vreenak erkennt das es sich hierbei um eine Fälschung handelt und Konfrontiert Sisko damit. Vreenak will diesen Betrug der Föderation seinem Volk überbringen, doch sein Schiff explodiert auf den Rückflug durch eine Bombe, welche Garak auf seinem Schiff versteckt hat.

Das Dominion festigt wenig später seine Stellungen im Kalandra-Sektor und versucht so, eine Versorgungslinie zwischen dem [[Betazed|betazoiden Raum]] und dem Argolis-Cluster herzustellen. Falls ihnen das so gelingt, so sind sie dazu in der Lage einen Angriff gegen [[Vulkan]] auszuführen. Daher plant die Sternenflotte, ihnen in der Nähe des [[Tibor-Nebel]]s den Weg abzuschneiden. Zu diesem Zweck wird die siebente Flotte eingesetzt, welche zuvor große Verluste bei [[Sybaron]] erlitten hat. Außerdem zwingen die Romulaner das Dominion sich aus dem [[Benzar-System]] zurückzuziehen. Bei den Kämpfen setzten die Romulaner an den Frontlinien die [[Remaner]] ein, wechle welche blutige Gefächte Gefechte mit dem Truppen des Dominions führen. ({{DS9|Zeit der Abrechnung}}; {{Film|10}})

Der Ferengi Sternenflottenoffizier Nog erhält von Sternenflotte den Auftrag eine Botschaft an den großen Nagus Zek wegen einer Allianz zwischen der Föderation und den Ferengi zu überbringen. Die Föderation will damit erreichen, dass die Ferengi im Dominion-Krieg an der Seite der Föderation gegen das Dominion kämpfen. Nog begibt sich mit seinem Freund Jake Sisko in einem runabout Runabout nach Ferenginar, um diese Botschaft zu überbringen. Auf den Weg dorthin legen die beiden einen Zwischenstopp auf der [[Sternenbasis 257]] ein. Als die beiden mit ihrem Runabout die Station verlassen, nährt sich ein Geschwader Jem'Hadar-Angriffsjäger der Station und greift diese an. Doch ein Jem'Hadar-Angriffsjäger verfolgt das Runabout und Nog fliegt mit diesem in den Dominion-Raum. Als der Angriffsjäger das Runabout angreift, wird dieses von der ''Valiant'' gerettet. Nog und Jake Sisko werden an Bord des Kadettenschiffs gebeamt und lernen dort den Captain [[Tim Watters]] kennen. Watters hat sich als Aufgabe vorgenommen Daten über ein neues [[Jem'Hadar-Schlachtschiff]] zu sammeln. Doch nachdem die Valiant die Daten gesammelt hat, will Watters das Schlachtschiff der Jem'Hadar vernichten, obwohl dieses der ''Valiant'' weit überlegen ist. Bei dem Kampf gegen die Jem'Hadar wird die ''Valiant'' vernichtet und dabei wird die gesamte Crew getötet. Nur Jake Sisko, Nog und die Kadettin [[Dorian Collins]] können mit einer [[Fluchtkapsel]] entkommen und werden später von der ''Defiant'' gerettet. ({{DS9|Valiant}})

Ende 2374 verändert die Föderation ihre Strategie, anstatt eines Verteidigungskrieges, will die Föderation nun mit seinen Verbündeten ins Terretorium Territorium des Dominions eindringen und dieses Offensiv bekämpfen. Zu der Zeit ziehen die Cardassianer Schiffe aus dem [[Chin'toka-System]] ab und schicken diese an die [[Romulanischer Raum|romulanische Front]], so dass zur Verteidigung des Systems nur fünf Jem'Hadar-Geschwader zurückbleiben. Die Sternenflotte und die Klingonen entdecken wenig später einen Schwachpunkt des Dominion und versuchen die Romulaner davon zu überzeugen, dass dies vermutlich die beste Gelegenheit für einen Offensivschlag wäre. Doch die Cardassianer installieren zu der Zeit ein Netzwerk aus [[Orbitale Waffenplattform|orbitalen Waffenplattformen]], welche das Chin'toka-System verteidigen sollen.

Inzwischen dringt der vom Pah-Geist bessene besessene Dukat auf Deep Space 9 ein und setzt den Pah-Geist in einen [[Drehkörper]] frei. Bei dieser Aktion tut Dukat die zufällig anwesende Jadzia Dax tödlich verletzen. Der Pah-Geist dringt durch den Drehkörper in das Wurmloch ein und das Wurmloch scheint sich ins Nichts aufzulösen.

Nach der Schließlung Schließung des Wurmloches scheint sich das Blatt für die Föderationsallianz zu wenden, die Allianz wird wieder von den Dominion-Flotten zurück gedrängt und die Föderationsallianz ist wieder gezwungen deffensiv defensiv zu kämpfen. Die Klingonen scheitern zu der Zeit bei einem Angriff auf die [[Monac-IV-Schiffswerft|Werften von Monac IV]]. Die Verluste belaufen sich etwa auf 30%. Das Dominion gibt das Chin'toka-System nicht auf und plant es zurückzuerobern. Um dies zu erreichen werden die Schiffswerften angewiesen, ihre Produktion um 15% zu erhöhen. währendessen Währenddessen sitzen die Truppen der Föderationsallianz, umzingelt von Dominion-Truppen im Chin'toka-System fest.

Zu der Zeit richten die Romulaner auf Deep Space 9 eine militätische militärische Präsenz auf der Station ein, um so besser im Dominion-Krieg kämpfen zu können. Die militärischen Truppen werden von der Senatorin [[Kimara Cretak]] geleitet. Später bittet Cretak Colonel Kira, ob die Romulaner ein Krankenhaus auf den bajoranischen Mond [[Derna]] errichten zu können und Kira leitet dies sofort weiter an die bajoranische Regierung. Diese stimmt zu und die Romulaner errichten ihre Anlage auf Derna. Zur selben Zeit gelingt es den Romulanern, trotz großer Verluste einen Angriff durch das Dominion auf das Chin'toka-System zu stoppen.

Die ''Rotarran'' erreicht schließlich die Werften von Monac IV und diese will in dem Stern eine starke Sonnenerruption Sonneneruption auslösen, welche die Werft vernichten soll. Als sich die ''Rotarran'' dem Stern nähert, wird diese von einigen Jem'Hadar-Angriffsjäger angegriffen. In der [[Korona]] des Sterns kämpft die ''Rotarran'' gegen die Angriffsjäger. Doch mit Hilfe des Traktorstrahls gelingt es der ''Rotarran'' die Erruption Eruption auszulösen, welche die Angriffsjäger vernichtet. Die ''Rotarran'' entkommt der Erruption Eruption und die Crew kann erfolgreich ansehen wie die Erruption Eruption die Monac-IV-Schiffswerft vernichtet.

Die Warbirds kommen zwei Stunden früher als erwartet und Ross und Cretak fordern Kira auf ihre Blockade aufzulösen, ansonsten feuern die Warbirds auf die Blockade, doch auch Kira will nicht nachgeben. Zur selben Zeit gelingt es Captain Sisko auf dem Planeten [[Tyree (Planet)|Tyree]] Kontakt zu den Propheten herzustellen und dadurch wird auch der Pagh-Geist aus dem Wurmloch vertrieben und dieser wird darauf vernichtet. Als die Bajoraner das wiedererscheinen wieder erscheinen des Wurmlochs sehen fassen sie noch mehr Mut sich der romulanischen Flotte zu stellen. Doch plötzlich ziehen die Romulaner ihre Flotten unerwartet wieder ab. Kira erhält von Ross die Botschaft, dass er Cretak aufgefordert hat die Waffen von Derna abzuziehen und vorallem vor allem Kiras Mut hat ihn beeindruckt. Kurz darauf kehrt auch Captain Sisko auf die Station zurück. ({{DS9|Schatten und Symbole}})

Einige Zeit später stirbt [[Weyoun 5]] stirbt bei einem [[Transporter]]unfall. Es wird spekuliert, dass es sich dabei möglichweise möglicherweise um einen Anschlag handeltgehandelt hat. Er Weyoun wird umgehend geklont, doch sein Nachfolger [[Weyoun 6]] zweifelt das Dominion an und beginnt mit der Föderation zu sympathisieren. Da das Dominion diesen Weyoun als fehlerhaft betrachtet wird ein neuer Klon [[Weyoun 7]] aktiviert und Weyoun 6 bekommt den Befehl sich zu töten. Doch Weyoun 6 weigert sich dies zu tun und flieht, er . Darauf nimmt darauf Weyoun 6 heimlich Kontakt mit Odo auf. Ungefähr zur selben Zeit bricht bei den Gründern eine geheimnissvolle geheimnisvolle Krankheit aus und niemand findet ein Heilmittel gegen diese Krankheit. Weyoun 6 trifft sich kurz darauf mit Odo, welcher dies allerdings einen Trick von Weyoun hält. Doch als Weyoun Odo mit strategischen Informationen über das Dominion versorgt , fängt dieser an ihm zu glauben. Die beiden fliehen fliegen mit einem Runabout in das Föderationsterritorium, als sich plötzlich Damar und Weyoun 7 melden und Odo auffordern Weyoun 6 auszuliefern. Doch als sich Odo weigert Weyoun auszuliefern befiehlt Weyoun 7 einem Jem'Hadar-Angriffsjäger das Runabout anzugreifen. Mit Hilfe von Weyoun 6 gelingt es Odo jedoch den Jem'Hadar-Angriffsjäger zu vernichten. Von Weyoun 6 erfährt Odo auch, dass die Gründer unter einer geheimnissvollen geheimnisvollen Krankheit leiden. Später wird das Runabout von vier Jem'Hadar-Angriffsjäger verfolgt und Odo versucht mit dem Runabout in ein Asteroidenfeld zu fliehen. Als Weyoun 6 erkennt, dass das Runabout den Jem'Hadar nicht entkommen kann, nimmt er Kontakt mit seinen Nachfolger auf und begeht Selbstmord, um so das Leben von Odo zu retten. Als Weyoun 7 sieht wie sein Vorgänger stirbt, befiehlt dieser den Jem'Hadar den Angriff auf das Runabout abzubrechen. ({{DS9|Verrat, Glaube und gewaltiger Fluß}})

General Martok plant kurz darauf einen Angriff mit nur fünf [[B'rel-Klasse|Bird-of-Prey]] zuerst auf die [[Sternenbasis]] auf der Oberfläche von [[Datei:Klingonen greifen Trelka V]], dann die [[Manora-Schiffswerft]], schließlich die [[Jem'Hadar-Brutstätte]] auf [[Sheva II]] und die Versorgungsdepots im [[Borias-Cluster]]. Anschließend solle die Neunte Flotte die Bird-of-Prey und ihre möglichen Verfolger im Kalandra-System empfangenan. jpg|thumb|Die Klingonen beginnen mit den Angriff auf Trelka V und zwei cardassianische Schiffe greifen die Bird-of-Preys an, dabei wird einer Basis der Bird-of-Preys vernichtet. Währenddessen greift Martok mit den anderen Schiffen die Station Cardassianer auf der Oberfläche Trelka V an und dieser Angriff verwirrt die Cardassianer, doch diese Schlagen schnell zurück. Bei einem Angriff wird Martok verletzt und [[Kor]] übernimmt das Kommando, doch Kor greift weiter gegen den Willen von Martok die Station an. Der alte Kor hält die Cardassianer sogar für seinen alten Feind aus der Vergangenheit, der Föderation. Doch Martok gelingt es wieder das Kommando zu übernehmen und befiehlt den sofortigen Rückzug, um die Manora-Schiffswerft anzugreifen. Danach entzieht Martok Kor von seinem Posten. Während die Bird-of -Preys weiterfliegen, nährt sich eine Flotte von zehn Jem'Hadar-Angriffsjäger und verflogt die klingonische Flotte. Den Jem'Hadar gelingt es mit Langstrecken-[[Tachyonenscanner]] aufzuspühren und verfolgt diese. Da die Bird-of-Preys nicht rechtzeitig die verbündete Flotte erreicht, übernimmt Kor das Kommando über einen Bird-of-Prey und ihm gelingt es bei einm Kampf mit den Jem'Hadar diese lang genug aufzuhalten, dass die übrigen drei Bird-of-Preys die verbündete Flotte erreicht. Bei der Schlacht kommt zwar Kor ums Leben, er wird aber von den Klingonen als Held gefeiert. ({{DS9|Der Dahar-Meister}})

General Martok plant kurz darauf einen Angriff mit nur fünf [[Datei:ARB'rel-Klasse|Bird-of-Prey]] zuerst auf die Sternenbasis auf der Oberfläche von [[Trelka V]], dann die [[Manora-Schiffswerft]], schließlich die [[Jem'Hadar-Brutstätte]] auf [[Sheva II]] und die Versorgungsdepots im [[Borias-Cluster]] durch zu führen. Anschließend soll die Neunte Flotte die Bird-of-Prey und ihre möglichen Verfolger im Kalandra-System empfangen. Die Klingonen beginnen mit den Angriff auf Trelka V und zwei cardassianische Schiffe greifen die Bird-of-Preys an, dabei wird einer der Bird-558of-BPreys vernichtet. Währenddessen greift Martok mit den anderen Schiffen die Station auf der Oberfläche an und dieser Angriff verwirrt die Cardassianer, doch diese Schlagen schnell zurück. Bei einem Angriff wird Martok verletzt und [[Kor]] übernimmt das Kommando, doch Kor greift weiter gegen den Willen von Martok die Station an.jpg|thumb|Der Kampf alte Kor hält die Cardassianer sogar für seinen alten Feind aus der Vergangenheit, die Föderation. Allerdings gelingt es Martok wieder das Kommando zu übernehmen und befiehlt den sofortigen Rückzug, um ARdie Manora-Schiffswerft anzugreifen. Danach entzieht Martok Kor von seinem Posten. Während die Bird-of-Preys weiterfliegen, nährt sich eine Flotte von zehn Jem'Hadar-Angriffsjäger und verflogt die klingonische Flotte. Den Jem'Hadar gelingt es mit Langstrecken-558[[Tachyonenscanner]]die Bird-of-Preys aufzuspüren und sie verfolgen diese. Da die Bird-of-Preys nicht rechtzeitig die verbündete Flotte erreicht, übernimmt Kor das Kommando über einen Bird-of-Prey und ihm gelingt es bei einem Kampf mit den Jem'Hadar diese lang genug aufzuhalten, dass die übrigen drei Bird-of-Preys die verbündete Flotte erreicht. Bei der Schlacht kommt Kor zwar ums Leben, aber er wird von den Klingonen als Held gefeiert. ({{DS9|Der Dahar-Meister}})

Bei der Schlacht um [[Datei:Der Kampf ist entbrannt.jpg|thumb|left|Der Kampf um AR-558entbrennt.]] kämpfen Bodentruppen der Sternenflotte und des  In den folgenden Wochen versucht das Dominion immer wieder das Chin'toka-System zurück zu erobern. Die ''Defiant'' begibt sich in einem zermürbenden Kampf um dieser Zeit in das Kampfgebiet zu einer Versorgungsmission. Der Ferengi Quark begleitet, im Auftrag des großen Nagus Zek, diese Mission, damit die Kontrolle Ferengi-Allianz weitere Informationen über den Kriegsverlauf von der Föderation erhält. Da sich auf den Planeten [[AR-558]] im Chin'toka-System ein wichtiges [[Subraumkommunikation|Subraumkommunikationsrelais]] des Dominionbefindet, versucht das Dominion alles, welches man seitens um die Kontrolle über diesen Planeten und das System zu erlangen. Auf AR-558 hat die Sternenflotte hohe Verluste von den 150 stationierten Soldaten haben nur 43 die letzten fünf Monate überlebt. Die Jem'Hadar verminen den Planeten mit Subraumsprengminen welche [[Houdini]]s genannt werden und diese töten auch viele Angehörige der Sternenflotte bereits erobert hatte. Als die ''Defiant'' den Planet erreicht folgt ein weitere Angriff der Jem'Hadar, um das Subraumkommunikationsrelais zu erobern. Captain Sisko und ein Außenteam bleiben auf der Oberfläche zurück, um die Truppen auf der Oberfläche zu unterstützen. Da die Jem'Hadar die Sensoren auf der Oberfläche stören, muss die Sternenflotte das Lager selbst aufspüren. Da der Ferengi Nog ein gutes Gehör hat, gelingt es ihm mit einigen weiteren Soldaten das Lager aufzuspüren. Doch die Patrouille wird von den Jem'Hadar angegriffen und es gibt Tote und Verletzte. Zur selben Zeit gelingt es einem Trupp der Sternenflotte die Houdinis zu entschärfen und Captain Sisko plant diese Minen nun gegen die Jem'Hadar einzusetzen. Kurz darauf beginnen die Jem'Hadar die Basis der Sternenflotte zu stürmen. Einige der Jem'Hadar werden durch die Houdinis getötet, aber kurz darauf kommt es zu einem blutigen Kampf zwischen der Sternenflotte und den Jem'Hadar. Der Sternenflotte gelingt es zwar die Stellung zu halten und die Jem'Hadar zu töten, allerdings erleidet die Sternenflotte hohe Verluste. ({{DS9|Die Belagerung von AR-558}}) Währenddessen kommt es zu weiteren Verhandlungen zwischen der Föderation und dem Dominion, aber kurz darauf brechen weitere Kämpfe aus bei dem auch die USS ''Enterprise'' (NCC-1701-E) eingreifen muss. ({{Film|9}}) Da die Föderation durch den Dominion-Krieg immer mehr geschwächt wird, sucht die Sternenflotte weiter nach neuen Verbündeten beim Kampf gegen das Dominion. Die Föderation beginnt schließlich mit den [[Son'a]] zusammen zu arbeiten, obwohl bekannt ist, dass sie auch einige Ketracel-White-Anlagen besitzen und so für das Dominion diese Droge produziert. Während der Allianz zwischen der Föderation und den Son'a wollen diese die [[metaphasische Strahlung]] des Planeten [[Ba'ku (Planet)|Ba'ku]] im [[Briar Patch]] zu nutzen machen, um den natürlichen Alterungsprozess zu stoppen. Allerdings wollen die Son'a zusammen mit dem Sternenflotten Admiral [[Matthew Dougherty]] die dort einheimischen [[Ba'ku]] zwangsumsiedeln. Durch einen Zufall deckt Captain [[Jean-Luc Picard]] mit der ''Enterprise'' diesen Bruch der ersten Direktive auf. Picard will verhindern, dass die Ba'ku gegen ihren Willen umgesiedelt werden. Picard und ein Außenteam bleiben auf der Planetenoberfläche des Planeten, um dort die Zwangsumsiedlung zu verhindern. Währenddessen verlässt die ''Enterprise'' unter dem Kommando von Commander [[William Thomas Riker]] den Briar Patch, um den Föderationsrat von diesem Vorfall zu berichten.  Doch der Anführer der Son'a [[Ru'afo]] will seine Pläne in die Tat umsetzen, da die Son'a die metaphasische Strahlung benötigen, um zu Überleben. Als Ru'afo alles Leben auf der Planeten vernichten will, erkennt nun auch Admiral Dougherty die große Gefahr, welche von den Son'a ausgeht und er versucht diese aufzuhalten. Doch es ist zu spät Ru'afo beendet die Allianz mit der Föderation und tötet Dougherty. Darauf will Ru'afo die ''Enterprise'' vernichten lassen. Doch der ''Enterprise'' gelingt es die [[Son'a-Schlachtschiff]]e zu vernichten. Später stellt sich heraus, dass die Son'a auch zum Volk der Ba'ku gehören und in der Vergangenheit aus ihrer Heimat verbannt wurden. Die Son'a wollen sich an den Ba'ku für ihre Verbannung rächen. Doch Picard und seiner [[Liste von Crewmitgliedern der USS Enterprise (NCC-1701-E)|Crew]] gelingt es die Son'a aufzuhalten ihre Pläne durchzuführen. Bei diesen Kämpfen kommt auch Ru'afo ums Leben. Nach diesen Ereignissen kehren einige der Son'a wieder in ihre alte Heimat zurück und werden von den Ba'ku freundlich aufgenommen. Andere Son'a schließen sich dem Dominion an und unterstüzen diese mit der Produktion von Ketracel-White beim Kampf gegen die Föderation. ({{Film|9}})