Da noch immer viele Systeme nicht funktionieren, muss sich O'Brien um die ganzen Reparaturen kümmern. Kira bemerkt die Erschöpfung von O'Brien, doch der Chief muss sich weiter um seine Arbeit kümmern. Wenig später beginnt O'Brien einige der [[Replikator]]en zu reparieren, allerdings aktiviert er versehentlich eine vom bajoranischen Widerstand versteckte Vorrichtung aus der cardasianischen Zeit, der einen [[Aphasie|Aphasie-Virus]] auf der Station verbreitet. Quark nutzt heimlich diesen Replikator, um wieder [[Speise]]n und [[Getränk]]e für seine Bar zu servieren und unbewusst sorgt Quark so für die Verbreitung des [[Virus]]. Durch den Virus werden die neuralen und visuellen Reize vom [[Gehirn]] falsch verarbeitet und immer mehr Personen infizieren sich mit den Virus. Bei Nachforschungen findet Kira das Gerät, welches den Virus im Replikatorsystem verbreitet. Bashir findet heraus, dass die Bajoraner das Gerät entwickelt haben. Kira findet heraus, dass [[Dekon Elig]] diesen Virus entwickelt hat. Doch da dieser bereits tot ist, wendet sich Kira an seinen Assistenten [[Surmak Ren]]. Aber dieser weigert sich Kira zu helfen. Kira begibt sich nach Bajor und beamt Surmak [[USS Yangtzee Kiang|an Bord des Runabouts]]. Doch dieser weigert sich noch immer Kira zu helfen. Allerdings gibt Kira ihn zu verstehen, dass er sich auch mit dem Erreger infiziert hat und nun keine Wahl mehr hat. Schließlich bricht auch bei Kira der Virus aus. Mit den Forschungen von Bashir findet Surmak ein [[Heilmittel]] und kann so den Virus behandeln. ({{DS9|Babel}})

Kurz darauf untersucht die ''Defiant'' ein [[Subraumkompressionsanomalie|Subraum-Kompressions-Phänomen]]. Diese Forschung soll bei der Erschaffung von [[Transwarpkanal|Transwarpkanälen]] helfen. Durch diese Anomalie werden allerdings auch Objekte [[Schrumpfen|verkleinert]]. Mit einem Runabout erforschen Bashir, Dax und O'Brien die Anomalie. Doch durch den Effekt der Anomalie werden das Runabout und dessen Crew ebenfalls geschrumpft. Kira findet es komisch die Leute zu schrumpfen und muss dabei lachen. Sisko und seine Crew überwachen auf der ''Defiant'' die Mission des Runabouts, als plötzlich die ''Defiant'' von den Jem'Hadar angegriffen und darauf übernommen wird. Dadurch bricht der Kontakt zwischen dem Runabout und der ''Defiant'' ab und das Runabout treibt in der Anomalie. Doch dem Runabout gelingt es einen Weg aus der Anomalie zu finden, doch es ist immer noch winzig klein. Da das Runabout keinen Kontakt zur ''Defiant'' herstellen kann, fliegt dieses durch den Impulsschacht in die ''Defiant'' hinein. Dort angekommen bemerken Bashir, Dax und O'Brien, dass die ''Defiant'' von den Jem'Hadar übernommen worden ist. Sisko und seine Crew versuchen währenddessen wieder heimlich die Kontrolle über die ''Defiant'' zu bekommen. Kira kümmert sich dabei um die Reparatur, lässt sich aber dabei Zeit und versucht die Jem'Hadar abzulenken. Dax und O'Brien erkennen, dass Sisko es nicht allein schafft und Hilfe benötigt. Es gelingt den beiden mit dem geschrumpften Runabout die Computerkontrolle frei zu schalten. Sisko gelingt es dadurch die Kontrolle über das Schiff wieder zu erlangen, doch dabei wird er von den Jem'Hadar entdeckt. Das Runabout greift darauf die Jem'Hadar an und es gelingt der Crew der ''Defiant'' wieder die Kontrolle über das Schiff vollständig zu erlangen. Nach der Rückeroberung der ''Defiant'' werden Bashir, Dax und O'Brien wieder auf ihre normale Größe gebracht. ({{DS9|Das winzige Raumschiff}})

Trotz des Krieges werden Kira, Sisko und sein Sohn nach B'hala eingeladen. Der Mönch zeigt den Drei einen Stein auf dem Willkommen Abgesandter steht. Sisko bekommt darauf Visionen, dass die [[Zeit der Abrechnung]] bevorsteht. Sisko nimmt den Stein auf die Station mit, um diese zu erforschen. Doch Kai Winn ist dagegen, dass Sisko dieses Artefakt auf die Station mit genommen hat. Sie reicht Proteste bei der Sternenflotte und beim Premierminister ein. Zu der Zeit kommt es zu Instabilitäten im Wurmloch, auf der Station und auf Bajor und Winn fühlt sich in ihrer Annahme bestätigt. Sisko bekommt darauf einen Wutausbruch und zerstört das Artefakt. Dabei entkommen ein Prophet und ein [[Pah-Geist]]. Kira wird vom [[~/Person/DS9/6x21/2|von einem Propheten ]] übernommen und Jake Sisko vom Pah-Geist[[Kosst Amojan]]. Beide beginnen sich zu bekämpfen und obwohl Siskos Sohn in den Kampf verwickelt ist, lässt er den Kampf zu, da es um die Zukunft von Bajor geht. Obwohl der Prophet im Körper dabei ist zu gewinnen, hält Winn hält den Kampf auf, indem sie die Station mit [[Chronotonpartikel]]n überflutet. Nach diesen Ereignis erholt sich Kira wieder und spricht Winn auf ihren fehlenden Glauben an. ({{DS9|Zeit der Abrechnung}})