[[Datei:Kirk belobigt Scott.jpg|thumb|left|Scott bekommt von Kirk eine Belobigung.]]

Als sich die ''Enterprise'' auf den Weg zum [[Planetoid]]en [[Babel (Planet)|Babel]] befindet soll Scott Spock und den verletzen Kirk vertreten. Als aber ein [[Orionisches Raumschiff|orionischen Raumschiff]] die ''Enterprise'' angreift, befiehlt Kirk Scott im Maschinenraum zu bleiben und Kirk übernimmt wieder selbst das Kommando, um die ''Enterprise'' zu schützen. Nachdem das orionischen Raumschiff vernichtet ist, setzt die ''Enterprise'' ihre Reise nach Babel fort. ({{TOS|Reise nach Babel}})

Einige Wochen später übergibt Kirk Scott wieder das Kommando über die ''Enterprise'', als dieser seinen Freund [[Tyree (Person)|Tyree]] besucht. Scott hat in dieser Zeit wieder das Kommando über die ''Enterprise''. Auf der Oberfläche wird Spock angeschossen und dabei schwer verletzt. Auf McCoys Befehl beamt Scott das Außenteam zurück auf die ''Enterprise''. Als Experte für vulkanische Medizin kümmert sich Doktor [[M'Benga]] um Spock. Kirk vermutet, dass die Klingonen den Bewohnern auf der Oberfläche mit Waffen versorgt haben. Um dies heraus zu finden beamen Kirk und McCoy auf die Oberfläche und Scott bekommt den Orbit zu verlassen, damit diese die ''Enterprise'' nicht entdecken. Inzwischen begibt sich Spock aufgrund seiner schweren Verletzungen in eine Art Trance um sich selbst zu heilen. Um aus seine Trance wieder vollständig zu erwachen, bitte Spock die [[Krankenschwester]] [[Christine Chapel]] ihn zu schlagen. Darauf beginnt Chapel Spock zu schlagen. In dem Moment kommt Scott hinzu und er versucht sie davon abzuhalten Spock zu schlagen, da er nicht versteht was hier vorgeht. Doch M'Benga greift schließlich ein und schlägt Spock aus seiner Trance. Darauf klärt M'Benga Scott über den ganzen Sachverhalt auf. Zur selben Zeit findet Kirk heraus, dass die Klingonen die Bewohner mit Waffen versorgen. Um ein Gleichgewicht der Kräfte zu bewahren, befiehlt Kirk Scott er soll 100 Steinschlossgewehre an Tyrees Volk liefern. ({{TOS|Der erste Krieg}})