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Während Janeway sich mit Neelix über die [[Baneaner]] und [[Numiri]] unterhält, hat er das Kommando über die Brücke und ruft den Captain hinzu, als sich ein Patroullienschiff der Numiri nähert. Als wenig später die Numiri die ''Voyager'' angreifen, lässt er Torres ein Maquis-Manöver anwenden, um die [[Numiri Patroullienschiff|Patroullienschiffe der Numiri]] kampfunfähig zu schießen. ({{VOY|Die Augen des Toten}})
Während sie mit Chakotay die erfolgreiche Abwehr des letzten Angriffs der Vidiianer bespricht, betritt Kes ihren Bereitschaftsraum und bringt ihr Kaffee. Janeway ahnt jedoch nicht, dass es sich hier um eine andere Kes handelt, welche aus der Zukunft stammt und die ''Voyager'' sogar an die Vidiianer verrät, damit Kes mit ihrem jüngeren Ich auf ihre Heimatwelt zurückkehren kann. Kes verschüttet daher absichtlich Kaffee, damit sie an sensible Daten gelangen kann. Während das Schiff durch ein Feld von Subraumvakuolen fliegt, fühlt sich Tuvok nicht wohl und sieht ein Schiff auf Abfangkurs, dass nicht vorhanden ist. Daher bittet er Chaktoay Chakotay um Ablösung, die dieser gewährt. Nachdem die Vidiianer versuchen das Schiff zu entern, lässt Tuvok Deck 3 evakuieren. Mit den interenen Sensoren findet er die Ursache einer Transmission zu den Vidiianern im hydroponischen Garten und erkennt, dass sich Kes dort zweimal aufhält. Im Kampf mit den Vidiianern lehnt er es ab, deren Schiff zu beschießen, um die ''Voyager'' nicht zu beschädigen. Mit Kim kann er die Greifarme des vidiianischen Schiffs zerstören. ({{VOY|Voller Wut}})
Nachdem die [[Sensor]]en der ''Voyager'' auf einem Planeten [[Element 247]] entdecken, leitet Chakotay das Außenteam, welches Proben dieses Elements sammeln soll. Dabei entdecken sie eine große Anzahl an Leichen. Chakotay empfiehlt daraufhin die Totenruhe zu wahren und die Leichname nicht zu scannen, sondern nur visuell zu analysieren. Nachdem sich eine Subraumvakuole bildet, lässt er dennoch scannen. Durch diese Vakuole kann Harry Kim nicht mit dem restlichen Außenteam hochgebeamt werden. Stattdessen wird der Körper von Ptera materialisiert, welche vom Doktor wiederbelebt werden kann. Nachdem Torres eine Möglichkeit findet, Kim mithilfe von Ptera zurückzuholen, weist er sie in den Gebrauch eines Subraumtransponders ein. ({{VOY|Das Unvorstellbare}})