Änderungen
→Delta-Quadrant
Im Delta-Quadranten müssen er und seine Crew mit [[Liste von Crewmitgliedern der USS Voyager|der]] der [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] wegen hoher Verluste an Menschenleben und der Zerstörung des Maquisschiffes durch die [[Kollision]] mit einem [[Kazon]]-Kreuzer zusammenarbeiten, um einen Weg zurück in den [[Alpha-Quadrant]]en zu finden.
Chakotay willigt ein, dass seine Crew auf der ''Voyager'' dienen soll, eine andere Wahl hat er kaum. Er selbst wird [[Erster Offizier]] auf der ''Voyager''. Er ist der einzige Marquis, der in seiner Vergangenheit Starfleet- und Kommando-Erfahrung hat ({{VOY|Die Parallaxe}}). Janeway zumindest erwähnt das, als Chakotay mit Captain Janeway ihr die Position des Chefingenieur bespricht und [[B'Elanna|B'Elanna Torres]] vorschlägt
{{alt|In einer [[Alternative Zeitlinie|alternativen Zeitlinie]] übernimmt Chakotay [[2378]], nachdem [[Captain]] [[Kathryn Janeway|Janeway]] zu Beginn des [[Jahr der Hölle|Jahres der Hölle]] getötet worden ist, das Kommando über die ''Voyager'' und wird zu ihrem [[Captain]]. ({{VOY|Temporale Sprünge}})}}