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Wenig später muss sie eine Warpkerndiagnose im Maschinenraum wiederholen, da Seven of Nine eigenmächtig Energie umgeleitet hat. Sie erkennt, dass sie selbst ähnliche Probleme hatte und meint, dass Seven of Nine diese ebenfalls bewältigen wird. Anschließend trifft sie sich mit Paris in einer Jeffriesröhre und vergnügt sich mit ihm. Dieses Verhalten setzt sich auch im Maschinenraum fort, wobei sie von Tuvok unterbrochen werden. Da sich viele Offiziere über das Verhalten von Torres und Paris beschweren, befiehlt Janeway ihnen ihre Beziehung diskreter zu führen. Nachdem einige Besatzungsmitglieder Transformationen erleiden, sucht sie mit dem Doktor nach der Ursache. Dabei entdecken sie einen Kontaminanten in der DNA, der künstlich geschaffen wurde. Sie erkennt, dass der Kontaminant phasenverschoben ist. Dadurch entdeckt sie Eindringlinge. Daraufhin wird sie von den [[Srivani]] verletzt, ihre Lungenbläschen stellen die Verarbeitung von Sauerstoff ein. In letzter Minute kann sie von Paris gerettet werden. Nachdem sich herausstellt, dass dieser Vorfall durch Experimente der Srivani ausgelöst wurde, können diese vertrieben werden. Anschließend verabredet sie sich mit Paris zu einem gemeinsamen Abendessen. ({{VOY|Verwerfliche Experimente}})
Gemeinsam mit Captain Janeway und einem Außenteam besucht sie die Heimatwelt der [[Mari]]. Als sie dort von einem Mann angerempelt wird, werden ihr einige Gedächtnisengramme gestohlen. Da Frane einen anderen Mari in Anwesenheit von Torres angreift und diese gewalttätige Gedanken hatte, wird sie von Chefermittlerin [[Nimira]] verhört und anschließend verhaftet. Die Mari wollen sie einer [[Engramatische Engrammatische Reinigung|engramatischen engrammatischen Reinigung]] unterziehen und sie anschließend freilassen. Janeway erreicht einen Zeitaufschub des Strafvollzugs, um weitere Untersuchungen durchführen zu können. Nachdem ein weiterer Mord auf dem Planeten geschieht, verstärken Tuvok und Nimira ihre Untersuchungen. Dazu macht Tuvok eine Geistesverschmelzung mit Torres. Er erkennt, dass [[Guill]] ihre Gedanken raubte. Als Nimira mit der engramatischen Säuberung beginnt, nimmt Janeway Kontakt mit Nimira auf. Tuvok und Janeway können diese überzeugen, dass nicht Torres Gedanke allein für den Vorfall verantwortlich war. Daraufhin wird diese freigelassen. Anschließend führt sie ein Gespräch mit Tuvok. ({{VOY|Gewalttätige Gedanken}})
Als die ''Voyager'' von zwei fremden Schiffen angegriffen wird, meldet sie, dass die Warpdiagnoseanordnung vom Schiff gebeamt wurde. Später streitet sie sich mit Seven of Nine im Kasino. Nachdem Janeway ihre Ausrüstung zurückholen kann, repariert sie alle Schiffssysteme. ({{VOY|Apropos Fliegen}})
Nachdem Neelix bei einer Außenmission, welche die Gewinnung von Protomaterie zum Ziel hat, schwer verletzt wird und wiederbelebt werden muss, entwickelt sie ein neues Transportverfahren, um diesem Effekt entgegenzuwirken. ({{VOY|Leben nach dem Tod}})
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