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McCoy versucht schließlich, illegal zu dem zum Sperrgebiet erklärten [[Planet]]en [[Genesis (Planet)|Genesis]] zu gelangen, wird jedoch von der Sicherheit gestellt und in eine psychiatrische Anstalt der [[Sternenflotte]] gebracht. Scotty wird zu seinem Leidwesen zur neuen USS ''Excelsior'' versetzt und soll dort den Einbau eines [[Transwarp]]antriebs überwachen.
Währenddessen sind [[Saavik]] und [[David Marcus]] an Bord der [[USS Grissom|USS ''Grissom'']] nach Genesis zurückgekehrt, um den neu entstandenen Planeten zu untersuchen. Sie stellen dabei fest, dass Spocks [[Sarg]] leer ist. Wenig später finden sie ein vulkanisches Kind, das von Saavik als Spock indentifiziert identifiziert wird. David erklärt Spocks Zustand mit einem Nebeneffekt der Entstehung des Planeten, welcher zur Regeneration von Spocks Körper führte. David erkennt außerdem, dass der Planet sich rapide verändert und zu zerbrechen droht.
Als der [[Klingone|klingonische]] Captain [[Kruge]] von dem Genesis-Torpedo erfährt, beschließt er, die aus seiner Sicht "ultimative Waffe" an sich zu bringen und beschließt nach Genesis zu fliegen. Dort trifft er auf die ''Grissom'', die von seinem Kanonier zerstört wird. Da Kruge jedoch Gefangene nehmen wollte, exekutiert er ihn kurzerhand. Sein erster Offizier bemerkt jedoch, dass sich noch Saavik und David auf dem Planeten befinden, so dass sich Kruge mit einem [[Landetrupp]] auf die Oberfläche begibt, um die drei gefangenzunehmen.
*'''Sarek''': "Sie haben ihm seine Zukunft geraubt."<br/> '''Kirk''': "Ich sah keine Zukunft."
* '''Kirk''' (beim Anblick der abstürzenden Enterprise): "Mein Gott Pille, was habe ich getan?" <br />'''McCoy''': "Was du immer tust, was du tun mußtestmusstest, was dir entspricht. Trotz aller Verluste weiter ums Überleben zu kämpfen!"
*'''Sarek''': "Vergib mir, T'lar. Ich bin mir meiner Logik nicht sicher, da es sich hier um meinen Sohn handelt."