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→Eine Station am Wurmloch: Typo
Die sechste Staffel beginnt mit sechs zusammenhängenden Folgen, die von der Rückeroberung von Deep Space Nine erzählen. Es werden auch wieder aufwändige Raumschlachten gezeigt; am Ende kann die Station zurückerobert werden. In der nächsten Folge {{e|Klingonische Tradition}} wurde die erste [[Hochzeit]] zweier Hauptcharaktere gezeigt. Aber die [[Ehe]] von Worf und Dax sollte nur von kurzer Dauer sein: Bald darauf gab Terry Farrell bekannt, am Ende der Staffel die Serie zu verlassen. So kam es, dass man Jadzia Dax in der letzten Folge der Staffel {{e|Tränen der Propheten}} sterben ließ.
Farrell wurde durch [[Nicole deBoer]] ersetzt, welche [[Ezri Dax]] spielte. Sie wurde in der Folge {{e|Das Gesicht im Sand}} in die Serie eingeführt. Langsam nährte näherte sich auch diese Serie dem Ende. Für das Finale dachten sich die Produzenten Ira Steven Behr und [[Ronald D. Moore]] etwas ganz Besonderes aus. Die Serie sollte nicht mit einem Zweiteiler wie TNG enden, sondern es wurde ein Zehnteiliges Finale für die Serie gesendet, welches nicht nur das Ende des Dominionkrieges zeigte, sondern alle wichtigen Handlungsstränge zu einem Ende führte, die während der Serie aufgebaut worden waren.
Nach einigen Anlaufproblemen fand die Serie doch noch einen Platz im [[Herz]]en der Fans und am 02. Juni 1999, nach sieben Jahren, lief die [[Das, was du zurückläßt, Teil II|letzte Episode]] über den Äther.