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Als Spock den Tod der ganzen [[USS Intrepid#USS Intrepid (2260er)|''Intrepid'']]-Besatzung spürt, erfährt er einen [[Telepathie|telepathischen]] Schock. Die ''Enterprise'' wird daraufhin beauftragt herauszufinden, wodurch die ''Intrepid'', ein nur mit Vulkaniern besetztes Raumschiff, vernichtet wurde. Bei der anschließenden Suche treffen sie auf eine riesige [[Weltraumamöbe]]. Spock dringt allein in einem [[Shuttle]] in die Amöbe ein, mit Hilfe der ''Enterprise'' kann die Amöbe unschädlich gemacht werden ({{TOS|Das Loch im Weltraum}}).
Das Computersystem [[M5]], entworfen von dem berühmten [[Richard Daystrom|Dr. Richard Daystrom]], soll an Bord der ''Enterprise'' beweisen, dass es aufgrund seiner überlegenen Technik der [[Multitronik]], der Weiterentwicklung der [[Duotronik]], in der Lage ist, ein Raumschiff vollständig allein zu führen. Mit einer Minimalbesatzung von 20 Mann, darunter Kirk, Spock und McCoy startet M5 die Mission, doch dem Computer unterlaufen schweren schwere Fehleinschätzungen und die Crew schafft es nur knapp M5 wieder zu deaktivieren ({{TOS|Computer M5}}).
Zusammen mit Captain Kirk erhält Spock den geheimen Spionageauftrag, eine [[Tarnvorrichtung]] von den Romulanern zu stehlen. Spocks Aufgabe dabei besteht darin, den Standort der Tarnvorrichtung an Bord des romulanischen [[Raumschiff]]es herauszufinden. Dies gelingt ihm, indem er mit der [[Unbenannte Romulaner#Romulanischer Commander (2268)|Kommandantin]] flirtet ({{TOS|Die unsichtbare Falle}}).