Als Tuvok zusammenbricht, versuchen der Doktor und Kes ihm zu helfen. Da durch eine verborgene Erinnerung – auch [[T'lokan-Schisma]] genannt – eine Erkrankung im Gehirn ausgelöst wird, kann der Doktor nichts für Tuvok tun. Um diese Erkrankung zu behandeln und diese Erinnerung zu finden, beschließt Tuvok eine Geistesverschmelzung mit einer vertrauten Person durchzuführen. Janeway erklärt sich dazu bereit und der Doktor überwacht gemeinsam mit Kes diese Geistesverschmelzung. Während dieser Verschmelzung entdeckt der Doktor, dass Tuvok sich mit einem Virus infiziert hat, der diese Erinnerung auslöst. Mit starker [[Thoron]]strahlung kann der Virus abtötet und Tuvok geheilt werden. ({{VOY|Tuvoks Flashback}})
Durch Nach der Flucht aus dem [[Akritirianisches Hochsicherheitsgefängnis|akritirianischen Hochsicherheitsgefängnis]] kümmert sich Kes um die Überlastung seines Programm verliert der Doktor sein Gedächtnis. Die Lösung wäre schnell gefunden - ein Reinitalisierung seines Programmesbeiden Verletzten Paris und Kim. ({{VOY|Das bedeutete jedochHochsicherheitsgefängnis}}) Einige Wochen später werden Paris und Torres auf einem Shuttle von einer fremden Spezies, dass alles auf Null gestellt werden würdedie sich der [[Schwarm (Spezies)|Schwarm]] nennt, alle Erinnerungen wären verlorenangegriffen und verletzt. Paris wird dabei schwer verletzt. Bei der Behandlung bemerkt der Doktor immer mehr Erinnerungslücken und er bittet Kes setzt sich für ihn ein - um Hilfe. Als der Doktor Paris operieren will, hat er vergessen, wie er wäre sonst nicht mehr der Manndiese Operation durchführen muss, doch dank der er jetzt istHilfe von Kes gelingt es dem Doktor dennoch Paris erfolgreich zu operieren. Man versucht allesTorres untersucht das Programm des Doktors und stellt fest, aber dass es im Programm des Doktors zu einer [[B'Elanna TorresKaskadenüberladung]] kommt nicht voran, die sein Programm überlastet und beginnt seine [[Speicherkreise]] zu löschen. Kes macht sich große Sorgen um den Um das Programm des Doktors zu retten, wäre ein kompletter Neustart des Programms nötig, allerdings würde damit der Doktordie Erfahrungen, es wird immer schlimmer. Da aber die ''Voyager'' zur gleichen Zeit von fremden Wesen angegriffen wirder in den letzten zwei Jahren gesammelt hat, hat niemand Zeit für das MHNverlieren. Torres versucht darauf auf Kes’ Bitten einen anderen Weg finden den Doktor zu retten. Zusammen mit Torres aktiviert auf dem Holodeck das [[Diagnoseprogramm Alpha-11 der Jupiter-Station]] gelingt es , das speziell für die Wartung und Reparatur des MHNs erschaffen wurde. Doch auch dieses Programm kann dem Doktor nicht helfen und empfiehlt auch den kompletten Neustart des Programms des Doktors. Das Diagnoseprogramm untersucht weiter den Doktor, um eine Möglichkeit zu finden den Doktor zu retten. Dabei findet das Diagnoseprogramm viele unnötige Unterprogramme des Doktors, wie etwa Freundschaften zur Crew, Hobbys und Musik. Das Programm versteht nicht wofür der Doktor dies alles benötigt, doch Kes erklärt ihm das der Doktor dies alles benötigt um sich zu einer eigenständigen Person zu entwickeln. Mit der Zeit finden Kesund das Diagnoseprogramm eine gemeinsame Lösung, um den Zerfall Doktor zu retten. Da das Diagnoseprogramm die selbe [[Holomatrix]] wie der Doktor hat, will Kes die Matrix des Diagnoseprogramms in die Matrix des Doktors transplantieren. Durch die [[MatrixTransplantation]] der Matrix des Diagnoseprogramms in die des Doktors geht zwar das Diagnoseprogramm verloren, aber der Doktor zu stoppenkann gerettet werden. Er verliert jedoch einen Teil seiner Der Doktor wird wieder aktiviert und muss langsam beginnen seine Erinnerungenzu sammeln. ({{VOY|Der Schwarm}})
[[Datei:Neuer_Meister_entführt_Kes.jpg|thumb|left|Der böse Doktor entführt Kes]]
Kes lernt den Nachdem die [[Mikhal-TravelerFerengi]] [[ZahirArridor]] kennen und verliebt sich in ihn. Sie überlegt[[Kol]], an Bord der ''Voyager'' gekommen sind, schlagen sie Fähnrich [[Murphy (Sicherheitsoffizier)|Murphy]], ob der sie in Arrest bringen soll nieder und fliehen mit ihm fliegen sollihrem [[Ferengi-Shuttle|Shuttle]] durch das [[Barzan-Wurmloch]]. Der Doktor und Kes sehnt sich nach ein wenig Abenteuerbehandeln darauf Murphys Verletzungen. ({{VOY|Das Wurmloch}}) Als sie Torres durch eine [[Telepathie|telepathische]] Verbindung mit Captain Janeway darüber spichtder [[Enaraner]]in [[Jora Mirell]] zusammenbricht, kann diese ihren Wunsch gut verstehen, denn bis jetzt kennt wird sie von Kes gefunden und von Kes nur das Leben auf der ''Voyager''die Krankenstation gebracht, damit diese dort behandelt wird. ({{VOY|Das Erinnern}}) Während eines Landurlaubs auf [[Nicani]] ist Kes verbringt viel Zeit mir Zahir und vernachlässigt ihren Dienst, worüber der Doktor nicht sehr begeistert ist. In dieser Zeit experimentiert der Doktor mit seiner von einen [[PersönlichkeitSchrein]]faziniert und geht unerlaubt hin. Unabsichtlich speichert er auch Dort wird sie von einer Energieentladung getroffen und fällt sie ins [[Neuer Meister|böse WesenszügeKoma]] in seiner Matrix. Der Doktor greift Zahir an und entführt später auch kann jedoch nichts für Kes tun. Um Keshelfen zu können, durchläuft Janeway ein Ritual, um Antworten darauf zu erhalten, als warum die Mönche dort ohne Schaden durch den Schrein gehen können. Die gesammelten Biodaten werden vom Doktor ausgewertet und er sich zusammen mit entwirft eine Behandlung. Diese schlägt aber fehl und Kes stirbt beinahe. Bei einem zweiten Ritual des Captains wird ihr klar, dass sie, so unlogisch es klingt, Kes noch einmal in den Abgrund stürztdiesen Schrein bringen muss, kann man um sie zu retten. Der Captain trägt Kes in letzter Minute an Bord [[Beamen|beamen]]das Feld des Schreins und Kes erholt sich wieder. ({{VOY|CharakterelementeDas Ritual}})
[[Datei:Kes_wird_von_Kraftfeld_verletzt.jpg|thumb|left|Kes wird von dem Kraftfeld verletzt]]
Kes entdeckt bei einer Führung auf dem Planeten der Nicani einen leuchtenden [[Schrein]]. Sie ist sehr fasziniert davon, und möchte ihn sich näher anschauen. Neelix will sie noch davon abhalten, aber sie geht immer näher heran und plötzlich wird sie von einem [[Kraftfeld]] zurückgeworfen und bleibt [[Bewusstlosigkeit|bewusstlos]] liegen. Auf der Krankenstation weiß der Doktor nicht, wie er Kes behandeln soll, da es nicht erlaubt ist, das Kraftfeld näher zu untersuchen. Um Kes helfen zu können, durchläuft Captain Janeway ein Ritual, um Antworten darauf zu erhalten, warum die Brüder dort ohne Schaden durch das Feld gehen können. Die gesammelten Biodaten werden vom Doktor ausgewertet und er entwirft eine Behandlung. Diese schlägt aber fehl und Kes stirbt beinahe. Bei einem zweiten Ritual des Captains wird ihr klar, dass sie, so unlogisch es klingt, Kes noch einmal diesem Feld aussetzen muss, um sie zu retten. Der Captain trägt Kes in das Feld und Kes wird wieder ganz gesund. ({{VOY|Das Ritual}})
Als die Voyager durch einen [[Unfall]] ins [[Jahr]] [[1995]] geschleudert wird, überwacht Kes mit Neelix zusammen die [[Fernseher|Fernsehkanäle]] der [[Erde]]. Sie sind ist fasziniert von einer [[Seifenoper]] die sie verfolgen. Harry kann nicht verstehen, was sie daran toll finden, denn man kann ja selbst nicht mitspielen. Sie entdecken später in einer Nachrichtensendung, dass die Voyager während ihres Tieffluges entdeckt worden ist. ({{VOY|Vor dem Ende der Zukunft, Teil I}})
[[Datei:Kes_bekämpft_die_fremde_Macht_in_ihr.jpg|thumb|left|Kes und Tieran in einer Vision]]
Der [[Ilari]][[ Tieran]] stirbt auf der Krankenstation, aber er kann vor seinem Tod noch sein Bewusstsein in Kes übertragen. Er übernimmt die Kontrolle und bringt zuerst den Botschafter der Ilari um, dann stiehlt sie ein Shuttle und macht sich auf den Weg zu den Truppen. Gemeinsam mit ihnen stürzen sie die Regierung und ermorden den [[Autark]]. Tieran im Körper von Kes übernimmt die Macht. Aber Kes macht es ihm nicht leicht, mit allen Mittel kämpft sie gegen ihn und kann auch immer wieder kurz durchbrechen. Tieran weigert sich jedoch, den Wirt zu wechseln, weil er Kes' mentalen Fähigkeiten begeistert ist. Tuvok versucht, Kes mit einem medizinischen Gerät aus den Fängen von Tieran zu retten, doch es misslingt ihm und er wird gefangen genommen. Bei einem Verhör gelingt es ihm, über eine [[Gedankenverschmelzung]] kurz mit Kes zu sprechen. Er bestärkt sie in, ihrem Kampf durchzuhalten. Einige Zeit später gelingt es der Voyagercrew die Halle einzunehmen und Tieran zu töten, dessen Geist aber zuvor noch zu [[Ameron]] gewechselt ist. Kes macht sich starke Vorwürfe, dass durch sie so viele Leute gestorben sind. Auch merkt sie, dass ihre Beziehungen und ihr Denken durch diese Vorfälle stark beeinflusst worden sind. Tuvok macht ihr klar, dass dies normal ist. Erfahrungen beeinflussen uns ganz wesentlich. Aber er sagt auch, dass sie sich keine Vorwürfe machen darf. Nur weil sie sich geweigert hat, Tieran zu gehorchen, konnte er besiegt werden. ({{VOY|Der Kriegsherr}})
Kes lernt den [[Mikhal-Traveler]] [[Zahir]] kennen und verliebt sich in ihn. Sie überlegt, ob sie mit ihm fliegen soll. Kes sehnt sich nach ein wenig Abenteuer. Als sie mit Captain Janeway darüber spicht, kann diese ihren Wunsch gut verstehen, denn bis jetzt kennt Kes nur das Leben auf der ''Voyager''. Kes verbringt viel Zeit mir Zahir und vernachlässigt ihren Dienst, worüber der Doktor nicht sehr begeistert ist. In dieser Zeit experimentiert der Doktor mit seiner [[Persönlichkeit]]. Unabsichtlich speichert er auch [[Neuer Meister|böse Wesenszüge]] in seiner Matrix. Der Doktor greift Zahir an und entführt später auch Kes, als er sich zusammen mit ihr in den Abgrund stürzt, kann man sie in letzter Minute an Bord [[Beamen|beamen]]. ({{VOY|Charakterelemente}})
{{Alternative Zeitlinie|Am Ende ihres Lebens mit 9 Jahren entwickelt der Doktor eine biotemporale Kammer, die ihr Leben verlängern soll, allerdings werden dadurch [[Chroniton]]en, die sich noch in ihrem [[Blut]] befinden, reaktiviert und Kes beginnt eine Reise rückwärts durch die [[Zeit]]. Immer wieder springt sie in unregelmäßigen Zeitabständen in eine frühere Zeit ihres Lebens.