Diese Staffel befasst bildet einen großen Handlungsbogen, da sie sich fast ausschließlich mit den [[Xindi]]befasst. Die [[Enterprise (NX-01)|''Enterprise'' fliegt (NX-01)]] befindet sich in die der [[Delphische Ausdehnung|delphischen Ausdehnung]], um den Start einer [[Xindi-Superwaffe |Superwaffe]] der Xindi zu verhindern und somit die [[Erde]] vor der Vernichtung zu retten. Ebenfalls eine Rolle spielt hier der [[Temporaler Kalter Krieg|temporale kalte Krieg]]. Am Ende gelingt der [[Liste der Crew der Enterprise (NX-01)|Crew]] die Vernichtung der Superwaffe.

noch offen*Um die langsam abspringende Zuschauerzahl an die Sendung zu binden, produzierte man mit der 2. Staffel einen Bogen, dessen Handlung von einer Folge in die andere übergreift.