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Die ''Voyager'' Crew kann zwar die Angriffe der Fremden abwehren, doch es gibt Verletzte und Tote. Nach diesen Angriff beginnt Janeway die ''Equinox'' zu verfolgen, sie will Ramson und seine Crew für den Verrat an der Sternenflotte bestrafen. Auf der ''Equinox'' wird der Doktor von der Crew aktiviert und dieser behandelt Seven of Nine. Als die ''Equinox'' erkennt, dass Seven of Nine den Warpantrieb mit Codes gesperrt hat, will Ramson diese Codes von Seven of Nine, doch diese weigert sich Ramson die Codes zu geben. Darauf deaktiviert Ramson die [[Ethische Subroutine|Ethischen Subroutinen]] des Doktors, damit er die Informationen aus Seven of Nines Gehirn extrahieren kann. Der Doktor fängt darauf an an Seven of Nine zu experimentieren. Währenddessen erreicht die ''Voyager'' die ''Equinox'' und greift diese an. Inzwischen macht sich Ramson schwere Vorwürfe für seine Taten und er will sich Janeway ergeben. Doch Lieutenant [[Maxwell Burke]] meutert gegen seinem Captain und setzt den Angriff auf die ''Voyager'' fort. Doch Ramson gelingt die Flucht und er beamt einen Teil seiner Crew, darunter auch den Doktor und Seven of Nine an Bord der ''Voyager''. An Bord der ''Voyager'' löscht der Doktor das Programm des MHNs der ''Equinox''. Währenddessen greifen die Fremden die ''Equinox'' an und töten Burke und die anderen meuternden Crewmitglieder und Ramson übernimmt wieder das Kommando über die ''Equinox''. Ramson will an Bord der ''Equinox'' bleiben, als diese Explodiert und nach der Zerstörung der ''Equinox'' verschwinden die Fremden Angreifer wieder. Nach der Mission modifiziert der Doktor sein Programm, damit niemand mehr so leicht seine Ethischen Subroutinen löschen kann. ({{VOY|Equinox, Teil II}})

Auf einem [[Markonianischer Außenposten|Markonianischen Außenposten]] trifft Seven of Nine auf ehemaligen Borgdrohnen, welche ebenfalls aus dem Kollektiv befreit worden sind. Doch trotzdem sind diese drei noch immer miteinander durch einen Interlink verbunden. Die drei sind als Drohnen mit Seven of Nine in der Vergangenheit zusammen gewesen und bitte diese sie von dieser Verbindung zu befreien. Der Doktor findet allerdings keine Möglichkeit die Drei von einander zu trennen. Schließlich verbindet sich Seven of Nine mit den drei ehemaligen Drohnen und bei dieser Verbindung stellt sich heraus, dass Seven of Nine für diese Verbindung verantwortlich ist. Da der Doktor nun die Ursache für diese Verbindung weiß, kann er den Interlink trennen, doch dies würde die drei innerhalb weniger Wochen töten, andereseits durch eine Rückkehr ins Borg-Kollektiv würde die drei retten. Der Doktor will das Leben retten und will die drei zu den Borg zurück bringen, doch Seven of Nine macht dem Doktor klar, dass Überleben nicht Alles ist und das die drei lieber kurz in Freiheit leben sollen als bei den Borg. Der Doktor akzeptiert diese Entscheidung und trennt die Verbindung der Drei ehemaligen Drohnen. ({{VOY|Überlebensinstinkt}})

Bei einem Shuttle wird Torres schwer Verletzt und erlebt eine Nahtoderfahrung, doch der Doktor kann sie retten. Doch bei dieser Nahtoderfahrung sieht Torres, wie ihre Mutter [[Miral]] auf der [[Barke der Toten]] auf dem Weg nach [[Gre'thor]] befindet. Um ihre Mutter zu retten lässt sich Torres mit der Erlaubnis von Janeway vom Doktor nochmals in einem Nahtoten Zustand versetzten. Dort gelingt es Torres ihre Mutter zu retten und sie erlangt schließlich ihr Bewußtsein zurück. ({{VOY|Die Barke der Toten}})

In den nächsten Wochen fühlt sich der Doktor unterfordert und er bitte Captain Janeway, dass er falls wenn die Kommandoffiziere ausfallen, er das Kommando über die ''Voyager'' übernehmen darf. Doch Janeway lehnt den Vorschlag des Doktors ein [[Notfall-Kommando-Hologramm]] ab und der Doktor ist sehr Entäuscht darüber, da er sich nach Anerkennung aus der Crew sehnt. Zu dieser Zeit testet der Doktor [[Tagtraum|Tagträume]] und durchlebt seine in seiner Phantasie viele Erlebnise. In seinen Träumen, wird der Doktor von der Crew anerkannt, die Frauen flirten mit ihm, er übernimmt sogar das Kommando über die ''Voyager'' und rettet diese vor den Borg. Zu der Zeit befindet sich ein Schiff der [[Hierarchie]] und beginnt die ''Voyager'' zu überwachen und die Crew überlegt sich, ob sie die ''Voyager'' überfallen sollen. Bei der Überwachung der ''Voyager'' entdeckt [[Devro]] eine Transmission und diese sind die Tagträume des Doktors und erhält diese Daten für echt. Anhand dieser Tagträume plant die Hierarchie einen Angriff auf die ''Voyager''. Währenddessen verliert der Doktor die Kontrolle über seine Tagträume und er kann nicht mehr zwischen Traum und Wirklichkeit unterscheiden. Der Doktor will sogar in den Warpkern springen, da er in seinem Tagtraum glaubt, dass er so die ''Voyager'' retten kann. Um den Doktor zu retten werden die Tagträume aufs Holodeck projeziert und dabei sehen Kim, Seven of Nine und Janeway die heimlichen Phantasien des Doktors. Janeway sieht auch in einer Phantasie, dass der Doktor nur zum Wohl der Crew lebt und auch hofft nur einmal dafür Annerekennung zu bekommen. Nach ein paar Stunden Arbeit gelingt es Torres das Programm des Doktors zu reparieren. Währenddessen erkennt Devro, dass er nur Tagträume gesehen hat und aufgrund der Fehlinformation von der Hierarchie bestraft wird. Um dies zu verhindern, nimmt Devro heimlich Kontakt mit dem Doktor auf und informiert ihn über den Angriff der Hierarchie. Der Doktor soll dafür wie in der Simulation als Kommandant auftreten. Die ''Voyager'' bereitet sich mit dieser Information auf den Angriff der Hierarchie vor. Doch der Doktor ist als Kommandant sehr unsicher und die Hierarchie greift die ''Voyager'' an und diese ist im Kampf gegen die Hierarchie unterlegen. Doch plötzlich wendet der Doktor einen Trick aus seinem Tagtraum an und die Hierarchie Mitglieder fallen auf den Trick rein und ziehen sich zurück. Nach seiner Erfolgreichen Mission bekommt der Doktor von Janeway eine Auszeichnung und sie erklärt, dass sie den Doktor auch als Notfall-Kommando-Hologramm mit einsetzen wird. ({{VOY|Dame, Doktor, As, Spion}})

Wenige Wochen später kauft Tom Paris von einem Händler namens [[Abaddon]] ein Shuttle, welches Paris später [[Alice (Shuttle)|''Alice'']] nennt. Doch das Shuttle übernimmt mit seinem Interphase die Kontrolle über Paris und dieser verlässt mit dem Shuttle die ''Voyager''. Bei einer Untersuchung findet der Doktor heraus, dass auch Abaddon unter dem Einfluss des Shuttles steht. Später überwacht der Doktor Torres, als sich diese ebenfalls mit einem Interphase mit dem Shuttle und Paris verbindet und diesen so aus der Kontrolle von ''Alice'' befreit. ({{VOY|Alice}})

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2373 gerät das Programm des Doktor in eine Feedback-Schleife, da sich der Doktor Vorwürfe macht, dass er sich Entscheiden muss wen er rettet. Der Doktor rettet bei der Operation Fähnrich Kim, aber Fähnrich Jetal kann er darauf nicht mehr retten. Um dem Doktor zu helfen, lässt Janeway die Erinnerungen des Doktors an diesen Vorfall löschen. Zwei Jahre später gerät das Programm wieder wegen diesem Problem in eine Feed-Backschleife. Janeway will wieder diese Erinnerung löschen lassen. Doch Seven of Nine will dies nicht zulassen, da der Doktor ein Recht dazu hat diese Erfahrung zu verarbeiten. Doch Janeway sieht zu dieser Zeit im Doktor nur ein fehlerhaftes Computerprogramm, doch Seven of Nine macht ihr klar, dass der Doktor eine eigenständige Persönlichkeit ist. Janeway lässt darauf den Doktor diese Erfahrung verarbeiten und kümmert sich auch mit um ihren Freund, damit er über diese schwierige Zeit hinwegkommt. ({{VOY|Verborgene Bilder}})

==== Reginald Barclay ====

=== Späte Heimkehr der Voyager ===

== Chronologie ==

== Zitate ==

{{Dialogzitat|Der Doktor|Bitte nennen Sie die Art des medizinischen Notfalls.}} ({{S|VOY}})

{{Dialogzitat|Der Doktor|Es ist bereits 6 Uhr. Der frühe Vogel bekommt den Gagh.}} ({{VOY|Die Drohne}})

{{Dialogzitat|Der Doktor|Eine tägliche Injektion und die Raumkrankheit rennt davoon.|Crewman|?!?|Der Doktor|Versuchen Sie mal komisch zu sein nach der Behandlung von 37 Fällen.}} ({{VOY|Zeitschiff „Relativity“}})

=== "''Ich bin Arzt …''" ===