Das Son'a-Kommando ist eine von Ru'afo und seinen Anhängern geschaffene Organisation, die gegründet wird, nachdem diese im 23. Jahrhundert von Ba'ku verbannt werden.
Die Offiziere des Son'a-Kommandos tragen Uniformen. Es gibt die Ränge des Ahdar und des Subahdar.
2375 geht das Son'a-Kommando eine geheime Allianz mit Admiral Dougherty von der Sternenflotte ein, mit dem Ziel die Ba'ku von ihrem Planeten umzusiedeln und die metaphasische Strahlung aus den Planetenringen zu sammeln. Als Captain Jean-Luc Picard und die Crew der USS Enterprise (NCC-1701-E) aufdecken, dass die Son'a sich nur für die Verbannung rächen wollen, löst Admiral Dougherty die Allianz auf. Ru'afo versucht noch die Ba'ku zu vernichten, kann jedoch gestoppt werden. (Star Trek: Der Aufstand)