Der Mutara-Sektor ist eine Region im Weltraum, welche sich im Föderationsraum befindet. Der Sektor befindet sich im Beta-Quadrant. In dem Sektor befindet sich, nach der Entstehung des Genesis-Planeten, der Genesis-Sektor.
2257 verschwindet Spock mit seinem Shuttle im Mutara-Sektor. (DSC: Licht und Schatten)
Im Jahr 2285 kapert Khan Noonien Singh die USS Reliant auf dem Planeten Ceti Alpha V und startet das Genesis-Projektil im Mutara-Nebel, wodurch der Genesis-Planet geschaffen wird. (Star Trek II: Der Zorn des Khan)
Später gilt der Sektor als Sperrgebiet und der Genesis-Planet steht unter Quarantäne. Um in diesen Sektor zu gelangen braucht man viele Genehmigungen. Das einzige Schiff, das die Erlaubnis erhält, den Planeten zu untersuchen, ist die USS Grissom. Um den beim Gefecht mit der Reliant scheinbar getöteten Spock zu retten, stiehlt Admiral James T. Kirk die Enterprise aus dem Raumdock der Erde und bricht zum Mutara-Sektor auf. Während dessen wird die Grissom im Orbit des Genesis-Planeten von einem klingonischen Bird-of-Prey vernichtet. Kirk erklärt den Klingonen gegenüber, dass er deren Eindringen in den Mutara-Sektor als Verstoß gegen geltende Friedensverträge betrachtet. (Star Trek III: Auf der Suche nach Mr. Spock)