Die Seele beschreibt die unsterbliche geistige Essenz eines Individuums. Das Konzept der Seele wurde von vielen Kulturen entwickelt und ist insbesondere für die Vorstellungen über das Leben nach dem Tod wichtig.
Die Ocampa nennen ihre Seele Comra. (VOY: Das Unvorstellbare)
Vulkanier haben ein Katra, das ihre gesamte Identität ausmacht. Das Katra kann bei Gedankenverschmelzungen auf andere Personen oder in Katrische Schreine übertragen werden und somit ganz real den Tod des Vulkaniers überleben und sogar später wieder in seinen Körper zurücktransferiert werden. (ENT: Der Anschlag; Star Trek III: Auf der Suche nach Mr. Spock)
Eine Kathera ist bei den Vulkaniern das Spiegelbild des seelischen Zustandes des Erbauers. (VOY: Tuvoks Flashback)
Klingonen glauben daran, dass ihre Seele nach dem Tod ins Sto'Vo'Kor oder Gre'thor kommt. (VOY: Die Barke der Toten)
2151 isst Commander Charles Tucker Pekannusstorte. T'Pol erklärt darauf, dass dieser Kuchen überwiegend aus Zucker besteht. Darauf erwidert Tucker, dass der viele Zucker zwar nicht gut für den Körper ist, allerdings der Seele gut tut. (ENT: Das Eis bricht)
2254 versuchen die Talosianer Christopher Pike und Vina zu verkuppeln. Dazu erzeugen sie eine Illusion, mit Vina als verführerische Tänzerin vom Orion. Ein illusorischer Mann fragt Pike daraufhin, ob Vina es nicht wert sei, dass ein Mann seine Seele verkaufen würde. (TOS: Der Käfig)
Die Skorr übertragen vor langer Zeit das Gehirnwellenmuster ihres religiösen Führers Alar in eine Skulptur aus Indurit. Somit konservieren sie seine Seele, die in der Folge als "Großseele der Skorr" bekannt wird. (TAS: Das gestohlene Gehirnwellenmuster)
2364 sieht der Ligonianer Lutan erstmals ein Hologramm und fragt, ob die Föderation in der Lage ist einen Menschen ohne eine Seele zu erschaffen. Tasha Yar informiert ihn anschließend, dass es kein Mensch, sondern ein Hologramm sei. (TNG: Der Ehrenkodex)
Legenden zufolge hat der Planet Haven die Fähigkeit Seelen und gebrochene Herzen zu heilen. (TNG: Die Frau seiner Träume)
2366 entschuldigt sich Data vor einem Violinenkonzert bei Jean-Luc Picard und Beverly Crusher, dass seinem Spiel die Seele fehle. Crusher und Picard ermutigen ihn zu spielen. (TNG: Die Macht der Paragraphen)
2369 wirft Vedek Winn Adami der Föderation vor, keine Seele zu besitzen. (DS9: Blasphemie)
2370 sagt Jadzia Dax Koloth, dass er das neue Gesicht ihres Wirts nicht mit einer neuen Seele verwechseln dürfe. (DS9: Der Blutschwur)
Die Vhnori bringen ihre Toten durch Subraumvakuolen auf Asteroiden in Delta-Quadranten, wo eine neurale Energie, gewissermaßen ihre Seele, in das Ringsystem eines Planeten übergeht. (VOY: Das Unvorstellbare)
2374 meint Dejaren zu B'Elanna Torres, dass ihm das serosianische Raumschiff wie seine Seele erscheine. (VOY: Der Isomorph)
Einem menschlichen Sprichwort zufolge ist das Auge eines Menschen der Spiegel seiner Seele. (VOY: Die Gabe)
2375 will Captain Kathryn Janeway Seven of Nine nicht auf eine Außenmission zu den Borg mitnehmen, da sie sich Sorgen um ihren Seelenzustand macht. (VOY: Das ungewisse Dunkel, Teil I)
Die künstliche Intelligenz der Denkfabrik ist eine Lebensform mit der Seele eines Künstlers und dem Geist eines Mathematikers. (VOY: Die Denkfabrik)
2376 meint der Doktor zu Tincoo, dass sie bei seinem Gesang auch seine Seele hört und dies das neue Hologramm nicht könne. (VOY: Der Virtuose)