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| Geschlecht: | Männlich |
| Spezies: | Mensch |
| Geboren: | 2329 |
| Mutter: | unbek. |
| Vater: | Kolopak |
| Geschwister: | eine Schwester |
| Darsteller: | Robert Beltran, Douglas Spain (als Kind) |
Chakotay ist ein Mensch indianischer Herkunft. Mit bürgerlichem Namen heißt er Amal Kotay (VOY: "Arbeiterschaft, Teil I"). Mit 15 Jahren tritt er, gefördert von Captain Sulu, aber gegen den Willen seines Vaters Kolopak, in die Sternenflotten-Akademie ein. Dort machte er eine Ausbildung zum Anthropologen. (VOY: "Tattoo")
Maquis
Später verließ Chakotay die Sternenflotte und schloss sich dem Maquis an, weil er den Platz seines Vaters einnehmen wollte, der kurz zuvor im Kampf gegen die Cardassianer gestorben war. Durch seine Führungsstärke stieg er dort rasch auf und erhielt bald das Kommando über die SS Val Jean, ein Maquis-Raider. Zusammen mit seiner Crew wurde er dann 2371 vom Fürsorger in den Delta-Quadranten verschleppt. (VOY: "Der Fürsorger, Teil I").
Delta-Quadrant
Im Delta-Quadranten mussten seine Crew und die der Voyager nicht zuletzt aufgrund hoher Verluste an Menschenleben zusammenarbeiten, um einen Weg zurück in den Alpha-Quadranten zu finden.
Chakotay willigte ein, dass seine Crew auf der Voyager dienen soll. Er selbst bekam den Rang Lieutenant Commander (wurde jedoch, wie in der Sternenflotte üblich, nur mit "Commander" angeredet) und wurde erster Offizier.
Auf ihrer Heimreise zeigt er Captain Janeway, wie sie Kontakt zu ihrem Tierfreund aufnehmen kann.