Der Zweite Offizier ist in der Regel der stellvertretende Erste Offizier und übernimmt dessen Aufgaben in seiner Abwesenheit oder nach dessen Tod. So übernimmt er auch die Brücke sollte der Captain und der Erste Offizier abwesend sein.
Die übliche Vorgehensweise für Außenmissionen besagt, dass der Zweite Offizier das Außenteam begleitet (TNG: Gefahr aus dem 19. Jahrhundert, Teil I).