Der Musterpuffer ist der Teil eines Transporters, in dem die Transportermuster der transportierten Personen oder Gegenstände bis zur Rematerialisierung gespeichert werden.
2295 stellt Montgomery Scott den Musterpuffer der abgestürzten USS Jenolan auf Selbstdiagnose, um sich selbst und seinen Kameraden Matt Franklin darin zu speichern. Da einer der Induktoren versagt, verschlechtert sich das Signal von Franklin bis zur Rettung 2369 um 53 %, sodass eine Rematerialisierung nicht mehr möglich ist. (TNG: Besuch von der alten Enterprise)
2372 kann Harry Kim den Transport von B'Elanna Torres und der Automatischen Einheit 3947 auf ein Pralor-Raumschiff nicht mehr verhindern, da sich ihre Muster bereits im Musterpuffer befinden. (VOY: Prototyp)
Nachdem Tuvix bei einem Transporterunfall entstanden ist, stellt Hogan bei einer Diagnose fest, dass die Musterpuffer des Transporters einwandfrei funktionieren. (VOY: Tuvix)
Nach der Explosion der USS Orinoco im Jahre 2373 drohen während eines Beamvorgangs auch einige Crewmitglieder von Deep Space 9 im Musterpuffer verloren zu gehen. Ihre Muster werden deshalb in einen Speicher umgeleitet, der groß genug ist, sie aufzunehmen. Die Muster werden auf der Quantumebene gespeichert. Es zeigt sich, dass die physikalischen Daten auf eine Holosuite transferiert werden und nun ein Teil des Programms Julian Bashir, Geheimagent sind. (DS9: Unser Mann Bashir)
2373 führt Captain Benjamin Lafayette Sisko eine Feineinstellung der Musterpuffer in den Replikatorsystemen der USS Defiant (NX-74205) durch, während sich das Schiff im Anflug auf Ajilon Prime befindet, um sich von den Gedanken über seinen Sohn Jake abzulenken. (DS9: Die Schlacht um Ajilon Prime)
Im gleichen Jahr dringen Makroviren durch die Musterpuffer in die Systeme der USS Voyager ein. (VOY: Makrovirus ?)
2374 registriert Harry Kim eine Überladung im Musterpuffer der USS Voyager, als man versucht eine Probe von Atmosphärengasen eines Planeten der Y-Klasse zu beamen. (VOY: Dämon)
2375 richtet Mulcahey die Musterpuffer der Transporter der USS Voyager neu aus, um einen Nottransport eines Außenteams bewerkstelligen zu können. (VOY: Die Drohne)
Als Chakotay Valerie Archer ausspioniert, erzählt er ihr eine Geschichte von einer Fehlfunktion eines Transporters, wodurch seine Uniform im Musterpuffer landete und er nur mit seinem Kommunikator rematerialisiert wurde. (VOY: In Fleisch und Blut)