Im Warpkern wir die Materie mit der sonst streng getrennten Antimaterie vermischt. Dabei kommt es zur Annihilation (Zerstrahlung) der M/AM. Die Reaktion wird durch die Dilithiumkristalle stabilisiert. Der Warpkern ist also der Zentralreaktor, der praktisch die Energie für das ganze Schiff erzeugt und den Warpantrieb ermöglicht.