Trilithium wird zur Produktion von Waffen verwendet. Die Romulaner forschten im 24. Jahrhundert an einer waffenmäßigen Verwendung des Trilithiums, jedoch scheiterten sie daran das Trilithium stabil zu halten. Dr. Tolian Soran schaffte es jedoch 2371 Trilithium-Torpedos herzustellen und verwendete diese, um die Sonne des Amargosa Systems zu zerstören. Das Trilithium verhindert nukleare Reaktionen, wodurch die Kernfusion innerhalb einer Sonne gestoppt werden kann.
Die Duras-Schwestern Lursa und B'Etor wollten diese Waffe verwenden um das klingonische Reich zurückzuerobern ("Star Trek: Treffen der Generationen").
Trilithium-Harz fällt als Nebenprodukt der Warpantriebe auf Föderationschiffen an.
Aus Paralithium kann durch eine Umwandlung Trilithium hergestellt werden (VOY: "Das Hochsicherheitsgefängnis").