Das Flottenmuseum ist ein Museum der Sternenflotte der Föderation in San Francisco auf der Erde, in der die Geschichte der Flotte dargestellt wird. In ihm werden unter anderem auch viele alte Raumschiffe der Sternenflotte den Besuchern zugänglich gemacht. (Star Trek: Treffen der Generationen)
Die Enterprise (NX-01) befindet sich im 24. Jahrhundert im Flottenmuseum. (ENT: Dies sind die Abenteuer)
Captain Jean-Luc Picard besucht einmal das Constitution-Klasse-Schiff im Flottenmuseum und erzählt Captain Montgomery Scott davon, als sich die beiden 2369 auf einer Holodecksimulation der Brücke der USS Enterprise (NCC-1701) befinden. (TNG: Besuch von der alten Enterprise)
In einer alternativen Zeitlinie befindet sich 2404 die USS Voyager im Flottenmuseum. (VOY: Endspiel, Teil I)