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→Dominion-Krieg
In dieser Zeit versucht Gowron mehr Ansehen im Reich zu erlangen. Er versucht, Martok zu diskreditieren und leitet deshalb sinnlose Angriffe auf das Dominion ein. Die Klingonen erleiden mehrere Niederlagen, für die Gowron General Martok verantwortlich macht. Worf wirft deshalb Gowron vor, unehrenhaft zu handeln und fodert ihm zum Kampf heraus. Worf tötet Gowron und wird daraufhin zum Kanzler ernannt. Worf gibt das Amt jedoch an Martok weiter und Martok wird der neue Kanzler der Klingonen. ({{DS9|Kampf mit allen Mitteln}})
Nachdem die Föderation und die Romulaner eine Möglichkeit gefunden haben, sich gegen die Breen-Waffe zu verteidigen, führt die Allianz einen Großangriff gegen das Dominion bei [[Cardassia Prime]] durch. Anfangs läuft die [[Schlacht um Cardassia]] schlecht für die Allianz. Erst nachdem sich die Cardassianer der Allianz angeschlossen haben, kann sie die Oberhand gewinnen. Bei Cardassia Prime werden die Flotten des Dominion und der Breen umzingelt und vernichtet. Das Dominion muss [[Kapitulation|kapitulieren]]. Die Klingonen sind bei der Unterzeichnung der Friedensverträge mit dem Dominion anwesend. ({{DS9|Das, was du zurückläßt, Teil II}})
Nach dem Dominion-Krieg erholen sich die Klingonen von den Anstrengungen des Krieges und rüsten ihre Flotte wieder auf. Der Frieden ist vorerst gesichert. Da die Klingonen eine Rasse von Kriegern sind, ist der nächste Konflikt jedoch nur eine Frage der Zeit … ({{DS9|Unter den Waffen schweigen die Gesetze}})