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Ein paar Wochen später wird Hogan wie die übrige Besatzung der ''Voyager'' durch ein [[Subraumdivergenzfeld]] verdoppelt. Ohne es zu ahnen, dass es eine zweite ''Voyager'' gibt, wird die erste ''Voyager'' durch [[Proton (Partikel)|Proton]]enausstöße schwer beschädigt. Torres, [[Harry Kim]] und Hogan versuchen einige [[Hüllenbruch|Hüllenbrüche]] zu versiegeln. Dabei wird Hogan durch eine [[Explosion]] verletzt, als [[Kes]] ihm zu Hilfe eilen will, verschwindet sie durch einen Riss auf die andere ''Voyager''. Darauf bringt Torres ihn auf die [[Krankenstation]]. Der Hogan auf der anderen ''Voyager'' wird durch einen Angriff der [[Vidiianer]] oder bei der darauf folgenden [[Selbstzerstörung]] der ''Voyager'' getötet. ({{VOY|Die Verdopplung}})
Einige Zeit darauf bedient bedient er den [[Transporter]], als durch einen [[Transporterunfall|Unfall]] Neelix und [[Tuvok]] zu [[Tuvix]] verschmelzen. Kurze Zeit später vertritt er Neelix in der [[Küche]] mit mehren Crewmitgliedern. Aber dort herrscht schnell Chaos. Als Tuvix dieses Chaos sieht, verjagt er alle, darunter auch Hogan aus der Küche und sorgt wieder für Ordnung. ({{VOY|Tuvix}})
Im Lauf der Zeit scheint sich seine Antipathie gegen Janeway gelegt zu haben. Als Janeway und Chakotay auf einen [[Planet]] wegen einer ansteckenden [[Krankheit]] zurück bleiben müssen, setzt sich Hogan mit der übrigen Besatzung bei Tuvok für die Beiden ein, damit Tuvok ein Heilmittel von den Vidiianern besorgt, obwohl Janeway ihm das verboten hat. Tuvok geht auf die bitten der Cre schließlich ein und bekommt von den Vidiianern ein Heilmittel für Janeway und Chakotay. ({{VOY|Entscheidungen}})