Später kommt es zu einem weiteren Kampf zwischen der ''Reliant'' und der ''Enterprise'' im [[Mutara-Nebel]]. Sulu steuert das Schiff durch den Nebel und es kommt immer wieder zu Gefechten mit der ''Reliant''. Da die Phaserausrichtung im Nebel nicht funktioniert, muss Sulu manuell auf die ''Reliant'' feuern. Das Schiff wird Kampfunfähig geschossen und Khan aktiviert darauf das gestohlene [[Genesis-Projektil]]. Sulu versucht aus dem Nebel zu steuern, doch der Warpantrieb funktioniert nicht. Spock gelingt es jedoch den Warpantrieb zu reparieren, doch dabei opfert dieser sein Leben. Sulu kann darauf die ''Enterprise'' in Sicherheit fliegen. Sulu nimmt darauf an der Gedenkfeier für Spock teil, während Spocks Sarg auf den neu entstanden Planeten [[Genesis (Planet)|Genesis]] geschossen wird. ({{Film|2}})

Nach Spocks Tod steuert Sulu die schwer beschädigte ''Enterprise'' zurück zur Erde und bringt das Schiff ins [[Raumdock der Erde]]. Während Kirk die schweren Verluste der letzten Zeit verarbeitet, übernimmt Sulu das Kommando über die ''Enterprise''. Während die ''Enterprise'' im Raumdock andockt, betrachtet Sulu ehrfürchtig die neue USS ''Excelsior''. Auf der Erde gedenkt Kirk zusammen mit Sulu, Chekov und Uhura an die Toten der letzten Mission. Zur selben Zeit erleidet Doktor McCoy Wahnvorstellungen und sein Zustand verschlechtert sich mit der Zeit. Es stellt sich heraus, dass McCoy die [[Katra]] von Spock in sich trägt und Kirk muss Spocks Leichnam vom Planeten [[Genesis (Planet)|Genesis]] bergen, damit er beide retten kann. Zu dieser Zeit ist Genesis von der Sternenflotte jedoch zur verbotenen Zone erklärt worden. Nachdem McCoy versucht hat, allein nach Genesis zu gelangen, wird er verhaftet. McCoy soll in eine Klinik verlegt werden. Kirk begibt sich darauf zu einem Besuch von McCoy und er befreit diesen. Sulu kümmert sich um den Sicherheitsmann und überwältigt diesen.

Auf der Planetenoberfläche muss Sulu mit ansehen, wie die Überreste in der Atmosphäre des Planeten verglühen. Später findet Kirk mit seinen Männern Spock zu finden. Kirk gelingt es Kruge zu töten und seine Männer gelingt es den Bird-of-Prey zu übernehmen. Als der Bird-of-Prey den Planeten verlässt, hat Sulu mit der klingonischen Technologie zu kämpfen Doch schließlich gelingt es Sulu den Bird-of-Prey auf Vulkan zu landen. Auf Vulkan führt die hohe Priesterin [[T'Lar]] das Ritual [[Fal-Tor-Pan]] durch und überträgt Spocks Katra aus den Körper von McCoy wieder in den Körper von Spock zurück. Nach diesen Ereignissen ist Sulu erfreut Spock wieder zu sehen. ({{Film|3}})

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[[Datei:Kirk und seine Offiziere auf Vulkan.jpg|thumb|Sulu auf Vulkan.]]