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Die USS ''Enterprise'' macht sich auf den Weg zur [[Neutrale Zone|neutralen Zone]], um zu überprüfen, warum der Kontakt zu einigen [[Außenposten]] der Sternenflotte plötzlich abgerissen ist. Zwar kann der Angreifer, der dafür verantwortlich ist, nicht identifiziert werden, aber es wird ein Kontakt zu den [[Romulaner]]n hergestellt, die zuvor eine fast 200jährige Isolationspolitik betrieben haben. Dabei kann auch ein erster Blick auf den neuen [[Warbird]] der [[D'deridex-Klasse|''D'deridex''-Klasse]] geworfen werden, der bei der Mannschaft der ''Enterprise'' einen bleibenden Eindruck hinterlässt (''[[TNG]]: "[[Die neutrale Zone]]"'').
Im Jahr 2365 wird die ''Enterprise'' und deren Besatzung unfreiwillig das Versuchskaninchen eines mächtigen Wesens namens [[Nagilum]]. Es beabsichtigt, alle Varianten des Todes an der Mannschaft zu testen. Als sich Picard weigert, noch irgendeine Reaktion auf Nagilums Versuche zu zeigen, enthüllt das mächtige Wesen seine Existenz. Nur durch Picards Einfallsreichtum und Geschick kann sich das Schiff aus dieser Situation wieder befreien (''[[TNG]]: "[[Illusion oder Wirklichkeit]]"'').
[[Bild:IconiaPlanet.jpg|thumb|Die zerstörte Heimatwelt [[Iconia]]]]
Das Schwesternschiff der ''Enterprise'', die USS ''Yamato'' endeckt als erste den geheimnisvollen Planeten der [[Iconianer]], auf dem noch funktionierende Technologie existiert. Doch durch Einwirkung einer iconianischen [[Iconianische Sonde|Sonde]] wird die ''Yamato'' mit einem unbekannten Computervirus infiziert. Nachdem sie die USS ''Enterprise'' über ihre Entdeckung informiert haben, wird die ''Yamato'' durch einen Bruch der Versiegelung der [[Antimaterie]]-Kammer vollständig zerstört. Als Picard sich dazu entscheidet, den Planeten zu besuchen, entdeckt er noch ein funktionierendes [[Iconianisches Portal|Portal]] der Iconianer. Letztlich trifft er die Entscheidung, diese brisante Technologie zu zerstören und verlässt anschließend die Neutrale Zone wieder (''[[TNG]]: "[[Die Iconia-Sonden]]"'').
Picard und seine Mannschaft bekommen wieder einmal Besuch von dem allmächtigen Q. Dieses Mal möchte er unbedingt ein vollwertiges Mitglied der Crew werden. Als der Captain jedoch seine Bitte ablehnt, katapuliert Q die ''Enterprise'' mehrere tausend [[Lichtjahr]]e weit weg, direkt in die Flugbahn eines unbekannten Schiffes. Dieses Schiff entpuppt sich als ein Kubus der [[Borg]], die eine ungewöhnliche [[Kybernetik|kybernetische]] Spezies darstellen. Sie [[Beamen|beamen]] sich schließlich auf die ''Enterprise'' und scheinen ein großes Interesse an reiner Technologie an den Tag zulegen. Bei dem Versuch, die Borg daran zu hindern, weiter die Schiffssysteme zu analysieren, wird eine der Drohnen getötet. Daraufhin befiehlt der Captain, sich von dem gewaltigen Schiff zurückzuziehen, was aber leider misslingt. Als allen schließlich klar wird, dass die ''Galaxy''-Klasse an ihre Grenzen gestoßen ist, bittet Picard den allmächtigen Q um seine Hilfe. Kurz bevor die ''Enterprise'' zerstört wird, transportiert Q sie zurück in den [[Alpha-Quadrant]]en (''[[TNG]]: "[[Zeitsprung mit Q]]"'').
Der Wissenschaftler [[Paul Stubbs|Dr. Paul Stubbs]] kommt 2366 an Bord der USS ''Enterprise'', um Daten über den Zerfall eines [[Neutronenstern]]s zu sammeln. Währenddessen entwischen Wesley Crusher einige [[Naniten]], die schließlich in den [[Computer|Hauptcomputer]] des Schiffes eindringen und beginnen sich zu vermehren. Als gravierende Fehlfunktionen auf dem Schiff auftreten, kann eine Verbindung zu den Naniten hergestellt werden. Als sie schließlich eine eigene Intelligenz entwickelt haben, stellt sich Data zur Verfügung, um eine Kommunikationsverbindung zu etablieren. Kurze Zeit später können die Naniten aus dem Computer entfernt werden und der unbewohnte Planet [[Kavis Alpha IV]] wird zur neuen Heimat der Naniten-Zivilisation (''[[TNG]]: "[[Die Macht der Naniten]]"'').