In [[Holographischer Umgebungssimulator|holographischen Umgebungssimulatoren]] schützen die Sicherheitsprotokollen vor allem vor Unfällen mit generierten Dinge, zum Beispiel Schüsse aus [[Projektilwaffe]]n, [[Phaser]] oder kämpfende Personen. Sie können nur durch einen [[Befehl]] zweier [[Offizier]]e oder eines [[Führungsoffizier]]s deaktiviert werden. Das Sicherheitsprotokoll kann auch dazu dienen, ein Programm so einzurichten, wie es der Autor wünscht . Als die [[USS Enterprise (NCC-1701-E)|''Enterprise'']] durch die [[Borg]] teilweise [[Assimilation|assimiliert]] wird, deaktiviert [[Jean-Luc Picard|Picard]] die Sicherheitsprotokolle des [[Holodeck]]s. Dadurch haben die Projektile der [[Thompson-Maschinenpistole]] eine tödliche Wirkung. ({{Quelle fehltfilm|8}}).