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=== Die Infiltration der Gründer ===
[[Datei:Bashir und Goran'Agar.jpg|thumb|Julian Bashir versucht, Goran'Agar zu helfen.]]
Während einer Mission im Gamma-Quadrant stürzt ein Runabout von O'Brien und Bashir auf einen Planeten ab. Dort werden die beiden von einer Gruppe abtrünniger Jem'Hadar gefangen genommen. Der Anführer [[Goran'Agar]] bittet Bashir, sie von der Abhängigkeit von Ketracel-White zu befreien. Bashir versucht, den Jem'Hadar zu helfen und erfährt in dieser Zeit viel über die Struktur des Dominions. Obwohl Bashir den Jem'Hadar nicht helfen kann, lässt Goran'Agar Bashir und O'Brien wieder frei, und die beiden kehren in den Alpha-Quadrant Quadranten zurück. ({{DS9|Der Hippokratische Eid}})
Auf Bitten der Karemma begibt sich die ''Defiant'' einige Wochen später in den Gamma-Quadrant. Der karemmanische Handelsminister [[Hanok]] beschwert sich bei Captain Sisko über die hohen [[Steuer]]n und Gebühren der Föderation, bei deren Geschäften, doch es stellt sich heraus, dass Quark für diese Steuern verantwortlich ist. Da es den Karemma offiziell verboten ist, mit der Föderation Handel zu betreiben, tun diese es über die Ferengi. Als den Jem'Hadar dies aber bekannt wird, greifen sie die Karemma an, um diese zu bestrafen. Doch Sisko startet mit der ''Defiant'' einen Gegenangriff auf die Jem'Hadar-Angriffsjäger. Die Karemma fliehen in die [[Atmosphäre]] eines [[Klasse J|Klasse-J-Gasriesen]], werden jedoch von den Jem'Hadar verfolgt. Daraufhin folgt auch die ''Defiant'' in den Gasriesen und es kommt zum Kampf, bei der die ''Defiant'' schwer beschädigt wird. Sisko wird bei diesem Angriff schwer verletzt, und Worf übernimmt das Kommando über das Schiff. Bei einem Angriff dringt ein Torpedo in die ''Defiant'' ein, welcher allerdings nicht detoniert. Dieser Torpedo wird aber gemeinsam von Hanok und Quark entschärft. Währenddessen gelingt es Worf, den Jem'Hadar-Angriffsjäger zu vernichten und die Karemma zu retten. ({{DS9|Das Wagnis}})
[[Datei:Defiant zieht die Yukon.jpg|thumb|Die ''Defiant'' verhindert die Zerstörung der bajoranischen Sonne.]]
Inzwischen gelingt es Garak Kontakt mit dem Runabout aus dem Internierungslager herzustellen und dieser aktiviert das Transporter Signal des Runabouts. Dadurch können Worf, Garak, Bashir, Martok und eine Romulanerin auf das Runabout fliehen und in den Alpha-Quadrant zurück kehrenzurückkehren. Zur gleichen Zeit erwartet die Flotte bei Deep Space 9 den Angriff des Dominions. Der Wechselbalg in Gestalt von Bashir übernimmt währenddessen die [[USS Yukon|USS ''Yukon'']]. Der Gründer stattet das Runabout mit einer Bombe aus und fliegt damit auf die [[Bajoranische Sonne|bajoranische Sonne]] zu, um diese zu vernichten. Die daraus entstehende [[Druckwelle]] würde dann Deep Space 9 und die Flotten der Föderation, Klingonen und Romulaner vernichten.
Doch Sisko erreicht eine Botschaft von dem echten Bashir und darauf lässt dieser mit der ''Defiant'' die ''Yukon'' verfolgen. Bevor der Wechselbalg mit der ''Yukon'' in den [[Stern]] fliegen kann, wird diese mit dem [[Traktorstrahl]] der ''Defiant'' abgefangen und von dem Stern entfernt. Die Bombe explodiert und vernichtet das Runabout mit dem Wechselbalg an Bord. Plötzlich verschwinden auch die Signale der Dominion-Flotte und Sisko erkennt darauf die Falle des Dominions. Da es nun doch keinen Angriff gibt, zieht sich die Flotte der Föderation, Klingonen und Romulaner vorerst zurück. Da aber die Bedrohung durch die Cardassianer und des Dominions weiter vorhanden ist, bleibt eine klingonische Militärpräsenz unter der Führung von General Martok auf Deep Space 9 zurück. ({{DS9|Im Lichte des Infernos}})
=== Ein Krieg droht ===
[[Datei:Jem'Hadar auf Athos IV.jpg|thumb|left|Die Jem'Hadar greifen den Maquis auf Athos IV an.]]
Die Föderation erkennt die neue Dominion-Regierung, welche von Dukat auf Cardassia geführt wird nicht an. Wenige Wochen später läuft der Cardassianische [[Dissident]] [[Legat]] [[Tekeny Ghemor]] zur Föderation über und beliefert diese mit wichtigen Informationen über die neue Dominion-Regierung auf Cardassia. Ghemor leidet jedoch am [[Yarim-Fel-Syndrom]] und liegt im sterben. Da Ghemor Kira am meisten Vertraut, begibt sich dieser nach Deep Space 9 und gibt ihr sämtliche Informationen über die Cardassianische Politik. Währenddessen fordert Dukat von Captain Sisko die Auslieferung von Ghemor. Doch Sisko weigert sich Ghemor auszuliefern. Darauf begibt sich Dukat in Begleitung eines neuen Klon von [[Weyoun 5|Weyoun]] nach Deep Space 9. Doch Ghemor weigert sich nach Cardassia zurück zu kehrenzurückzukehren, da er nichts mit dem Dominion zu tun haben will. Da Ghemor eine zu große Gefahr für Dukat ist, versucht Dukat Ghemor mit vergifteten [[Kanar]] zu töten. Doch Sisko kann dies verhindern und präsentiert Dukat den vergifteten Kanar. Dukat streitet dies allerdings ab und bezichtigt Sisko den Führer der cardassianischen Regierung zu beleidigen. Nachdem Ghemor gestorben ist, verbreitet Dukat die [[Propaganda]], dass Ghemor seine Taten bereut hat und die Dominion-Regierung akzeptiert hat. Dukat fordert von Sisko die Auslieferung des Leichnams von Ghemor, damit dieser für Dukats Propaganda ein Staatsbegräbnis auf Cardassia bekommt. Doch auch diesen Wunsch kann Sisko Dukat nicht erfüllen, da Kira Ghemor neben ihren Vater auf Bajor begraben hat. Weyoun und Dukat verlassen darauf die Station und kehren nach Cardassia Prime zurück. ({{DS9|Die Überwindung}})
[[Datei:Winn und Weyoun.jpg|thumb|Kai Winn verhandelt mit Weyoun über einen Nichtangriffspakt.]]
[[Datei:Schlacht von Torros III.jpg|thumb|left|Ein gemischter Kampfverband der Föderation und Klingonen auf dem Rückweg vom Angriff auf die cardassianischen Schiffswerften.]]
Als Sisko sieht, dass die Schilde ausgefallen sind und das Dominion weitere Verstärkung in Bajoranischen Raum beordert, befiehlt er die Evakuierung der Station. Sämtliches Sternenflottenpersonal der Station wird auf die ''Defiant'' evakuiert und kann zusammen mit Martoks Bird-of-Prey entkommen. Doch bevor das Dominion die Station übernehmen kann, wird die Station durch das Unterprogramm [[Sisko 197]] sabotiert und schwer beschädigt. Als Dukat, Weyoun und Damar die Station übernehmen, findet Dukat Siskos [[Baseball]], den dieser auf seinem Schreibtisch zurückgelassen hat. Dukat versteht Siskos Botschaft und weiß, dass Sisko zurück kehren zurückkehren wird. ({{DS9|Zu den Waffen!}})
{{Siehe auch|Schlacht von Deep Space 9 (2373)}}