Als Chakotay, Kim und Tuvok auf dem [[Holodeck]] von einer unbekannten [[photon]]ischen [[Energie]]quelle selbst in Energie umgewandelt worden sind, schickt Janeway den Doktor auf das Holodeck, um die drei zu retten. Auf dem Holodeck läuft das Programm über die Legende von [[Beowulf]]. Zu der Zeit legt sich der Doktor auch einen Namen zu und nennt sich fortan Schweitzer. In dem Programm trifft er auf die [[Schildjungfer]] [[Freya]], die ihn zum [[König]] [[Hrothgar]] führt. Dort allerdings fordert [[Unferth]] den Doktor zum Kampf heraus. Der Doktor ist allerdings im Kampf unterlegen. Da der Doktor aber seine Materie selbst kontrollieren kann, durchdringt das Schwert von Unferth den Doktor, ohne dass dem Doktor etwas geschieht. Darauf hat der Doktor den Respekt des Königs bekommen und überall wird er als der Held Schweitzer verehrt. Freya beginnt darauf Interesse an dem mutigen Held Helden Schweitzer zu zeigen und beginnt ihn zu [[Kuss|küssen]]. Der Doktor wartet danach auf die Photonische photonische Energie, welche die im Holoprogramm als [[Ungeheuer]] [[Grendel]] dargestellt wird. Plötzlich greift diese das Energiewesen den Doktor an und dieser kann er muss mit einem Nottransport auf die Krankenstation gebeamt werden, allerdings fehlt dem Doktor ein Arm. Der Doktor bekommt einen neuen Arm programmiert. Inzwischen findet Janeway heraus, dass es sich bei dieser Photonischen photonischen Energie um eine Lebensform handelt. Da die ''Voyager'' bereits eine Probe gesammelt hat, bekommt der Doktor den Auftrag auf dem Holodeck diese Energieprobe an Grendel zurück zu bringen, damit Chakotay, Kim und Tuvok wieder frei gelassen freigelassen werden. Auf dem Holodeck wird der Doktor wieder von Unferth angegriffen, doch Freya verteidigt den Doktor. Dabei wird Freya sie von Unferth getötet. Der Doktor kehrt aufs Schloss zurück und ihm gelingt es Grendel die Energieprobe zu übergeben. Darauf gibt das Energiewesen, Chakotay, Kim und Tuvok wieder frei. Der Doktor bekommt nach dieser Mission ein Lob vom Captain, welcher der auch ins [[Logbuch]] eingetragen wird. Nach diesen Ereignissen nennt sich der Doktor nicht mehr Schweitzer, da ihn dieser Name zu sehr an den Verlust von Freya erinnert. ({{VOY|Helden und Dämonen}})

[[Datei:Janeway überträgt ihre Kommandocodes.jpg|thumb|Janeway überträgt ihre Kommandocodes auf den Doktor. ]]

Während einer Außenmission in einem [[Dunkle-Materie-Nebel]] wird Chakotay im [[Shuttle]] verletzt und verliert sein Bewusstsein. Der Doktor kann vorerst nichts für Chakotay tun, da dieser Hirntod Chakotay hirntot ist und . Aber der Doktor versucht Chakotays Körper am Leben zu erhalten. Als die ''Voyager'' diesen Vorfall untersuchen und in diesen Nebel fliegen will, komm es zu merkwürdigen Vorkommnissen an Bord. Paris ändert mehrmals den Kurs, ohne das dass er sich dieser daran erinnern kann. Darauf lässt sich Paris vom Doktor untersuchen, aber dieser der Doktor findet nichts vor. Später zeigt Torres ein ähnliches Verhalten wie Paris und deaktiviert den [[Warpkern]], ohne davon zu wissen. Als der Doktor Torres darauf untersucht, findet er heraus, dass Torres und Paris von einem fremden Wesen kontrolliert worden sind. Da das fremde Wesen nur Personen übernehmen kann, überträgt Janeway zur Sicherheit ihre [[Kommandocode]]s auf den Doktor. Doch später ist das Programm des Doktors deaktiviert worden und kann nicht mehr aktiviert werden. Es stellt sich heraus, dass eine fremde Macht aus dem Nebel Kontrolle über Tuvok übernommen hat, damit die ''Voyager'' in den Nebel fliegt. Der Geist von Chakotay hat währenddessen versucht über Paris und Torres dies zu verhindern. Nachdem Tuvok von dem fremden Wesen befreit worden ist, kann auch der Doktor wieder aktiviert werden. Dem Doktor gelingt es auch Chakotay zu behandeln, so das er wieder sein Bewusstsein erlangt. ({{VOY|Bewußtseinsverlust}})

[[Datei:Der Doktor und Kes überwachen die Gelpacks.jpg|thumb|left|Der Doktor und Kes überwachen die Erhitzung der bioneuralen Gelpacks.]]

Um Paris und Torres aus der Gewalt der Vidiianer zu befreien, verändert der Doktor das Aussehen von Chakotay, damit dieser er wie ein Vidiianer aus siehtaussieht. Später gelingt es Chakotay die beiden zu retten, doch durch die Technik wurde Torres Torres’ [[Klingone|klingonische]] [[DNS]] entfernt und eine zweite rein klingonische Torres erschaffen. Die klingonische Torres wird bei der Flucht getötet und um . Um die menschliche Torres vor einen Gendefekt zu befahrenbewahren, implantiert der Doktor wieder ihre klingonische DNS in die menschliche Torres. ({{VOY|Von Angesicht zu Angesicht}})

Einige Zeit später kommt der [[Haakonianer|haakonianische]] [[Wissenschaftler]] [[Ma'Bor Jetrel]] an Bord der ''Voyager'', um Neelix zu untersuchen, ob dieser an [[Metremia]] erkrankt ist. Bei seiner Untersuchung stellt dieser er fest, das Neelix an dieser Krankheit erkrankt ist. Jetrel ist an Bord der ''Voyager'' von der modernen Technologie fasziniert, vor allem über den Doktor, ein Hologramm welches , das sich selbst deaktivieren kann. Später deaktiviert Jetrel den Doktor, um sein Experiment zur Rettung der Opfer von [[Rinax]] in Ruhe durch zu führendurchzuführen. Aber Jetrels Experiment scheitert. Jetrel gibt darauf zu, dass Neelix nicht erkrankt ist, er wollte mit dieser Lüge nur an Bord der ''Voyager'' gelangen, um sein Experiment durch zu führendurchzuführen. Kurz darauf stirbt Jetrel an Metremia. ({{VOY|Dr. Jetrels Experiment}})

Als die [[Bioneurales Gelpack|bioneuralen Gelpacks]] an Bord der ''Voyager'' ausfallen, bringt Torres eines der Gelpacks auf die Krankenstation, damit der Doktor die organischen Komponenten untersucht. Der Doktor findet heraus, dass die Gelpacks mit [[Bakterie]]n infiziert sind. Der Doktor versucht die Bakterie Bakterien in den Gelpack abzutöten, aber er scheitert. Schließlich findet der Doktor die Lösung, durch : Durch [[Fieber]], beziehungsweise durch Hitze können die Gelpacks behandelt werden. Durch diese Behandlung werden die Bakterien in den Gelpacks abgetötet und die Gelpacks sind wieder voll funktionsfähig. ({{VOY|Erfahrungswerte}})

Während sich der Doktor auf dem Holodeck befindet, gerät sein Programm in eine [[Feedback|Feedback-Schleife]], welche die langsam seine Speicherbänke zerstört. Der Doktor befindet sich in einer Simulation und glaubt nun, dass die ''Voyager'' von den Kazon erobert worden ist. Darauf erscheint plötzlich ein [[Reginald Barclay (Hologramm 2371)|Hologramm von Reginald Barclay]], welches das versucht dem Doktor zu erklären, dass dieser er in Wirklichkeit Doktor Lewis Zimmerman istsei, welcher einer der eine Simulation der ''Voyager'' im Delta-Quadrant Quadranten nachspielt. Barclay versucht dem Doktor dies zu Beweisenbeweisen, in dem indem er die Simulation von vorn beginnt und versetzt dem Doktor zu seiner ersten Aktivierung, als der Fürsorger die ''Voyager'' in den Delta-Quadrant Quadranten gezogen hat. Langsam fängt der Doktor an Barclay Barclays Behauptungen zu glauben. Barclay erklärt dem Doktor, um diese Simulation zu beenden, muss dieser der Doktor die ''Voyager'' vernichten. Doch plötzlich erscheint Chakotay und warnt den Doktor die Voyagersimulation zu beenden, da dies sein Programm schwer beschädigt wird beschädigen würde, und er warten muss , bis er aus der Simulation befreit werden kann. In der Simulation erscheint Kes plötzlich als Ehefrau vom Doktor des Doktors und versucht ihn von Barclays Version zu überzeugen. Als der Doktor kurz davor ist seinen Verstand zu verlieren, kann der Doktor aus der Simulation befreit werden und er kehrt auf die Krankenstation zurück. ({{VOY|Das Holo-Syndrom}})

Als Kes ein seltsames Verhalten zeigt, bringt Neelix sie auf die Krankenstation. Doch während der Doktor Kes untersuchen will, wird er von dem störenden Neelix genervt. Schließlich reicht es dem Doktor und er wirft diesen ihn aus der Krankenstation. Darauf beschwert sich Neelix über den Doktor beim Captain. Inzwischen erkennt Kes ihren Zustand und bemerkt, dass sie das [[Elogium]] durchlebt. Darauf gerät sie in Panik und sperrt sich in das Büro des Doktors und dieser kann erkann nichts tun außer Janeway zu sich zu rufen. Kes erklärt, dass sie sich nun in der Phase ihres Lebens befindet, in dem sie ein Kind bekommen kann. Doch diese Phase findet nur einmal im Leben der Ocampa statt. Doch Kes und Neelix beschließen ein Kind zu bekommen und Kes bittet den Doktor als Vorbereitung das [[Rolissisin]]-Ritual durch zu führendurchzuführen. Später wird Kes ihr Kes’ Elogium abgebrochen, da dieses es durch den Einfluss fremder Wesen künstlich erzeugt worden sind. ({{VOY|Elogium}})

Der Doktor nimmt an der Geburtstagsparty von Kes auf dem Holodeck teil. Doch während der Feier flirtet, – sehr zum zu seinem Leidwesen des Doktors, – [[Sandrine]] mit ihm und der Doktor er versucht sich ihr immer wieder zu entziehen. Zu der Zeit gerät die ''Voyager'' in einen [[Verzerrungsring]], welcher der die ''Voyager'' in ein [[Labyrinth]] verwandelt. Die Offiziere wollen sich auf ihre Posten begeben, doch diese Verlaufen sie verlaufen sich an Bord. Auch der Doktor versucht sich auf die Krankenstation zu transferieren . doch dies klappt nicht und Sandrine macht sich darauf wieder an den Doktor ran. Doch nach dem nachdem sich der Doktor heftig mit ihr gestritten hat, gibt Sandrine ihre Flirt versuche Flirtversuche schließlich auf. Währenddessen gerät Janeway in Kontakt mit dem Verzerrungsring und verliert ihr Bewusstsein. Der Doktor versucht sie darauf zu behandeln. Zur gleichen Zeit wird die komplette ''Voyager'' von den demn Ring verschlungen. Durch den Verzerrungsring findet ein Datenaustausch statt. Nachdem die ''Voyager'' den Verzerrungsring verlassen hat, wird der ursprüngliche Zustand des Schiffes wieder hergestellt. ({{VOY|Die Raumverzerrung}})

Ende 2371 behandelt der Doktor den verletzten [[Fred Noonan]]. Noonan glaubt, dieser glaubt er müsse sterben, doch dem Doktor gelingt es seine Verletzungen zu behandeln. ({{VOY|Die 37er}})

Anfang [[2372]] wird das Shuttle von Chakotay von den Kazon angegriffen. Als die ''Voyager'' die Trümmer findet, untersucht der Doktor diese Trümmer nach menschlichen Überresten, allerdings findet dieser er keine. Später gelingt es der Crew Chakotay aus der Gewalt der Kazon zu befreien. ({{VOY|Der Namenlose}})

Einige Wochen später, gehen langsam die Nahrungsvorräte an Bord aus und es gibt nur einen Planeten, welcher der dafür geeinigt ist die Nahrungsvorräte aufzufüllen. Da der Planet sehr unwirtlich ist, wird dieser von der Crew [[Höllenplanet]] genannt. Da der Doktor nicht an den Sitzungen der Führungsoffiziere teilnehmen kann, hört er zu dieser Zeit heimlich bei diesen Gespräche zu. Er schaltet sich bei einen einem dieser Gespräche dazu, um zu erklären das , dass er bereits eine [[Salbe]] für das Außenteam angefertigt hat, da die Atmosphäre des Planeten sehr unwirtlich ist. Als Janeway dies mit bekommtmitbekommt, dass der Doktor regelmäßig heimlich zuhört, verbietet sie ihm dies zu tun. ({{VOY|Der Höllenplanet}})